EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCPBG00000026239 (Gene tree)
Gene ID: 101949092
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chrysemys_picta_bellii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 82089 bases
Position: chrKK088188.1:3354250-3436338
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPBP00000037891	CRM1_C	PF08767.11	4.7e-135	1	1
ENSCPBP00000037888	CRM1_C	PF08767.11	5.4e-135	1	1
ENSCPBP00000037891	Xpo1	PF08389.12	6.8e-41	1	1
ENSCPBP00000037888	Xpo1	PF08389.12	7.5e-41	1	1
ENSCPBP00000037888	IBN_N	PF03810.19	3.3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPBT00000044428	XPO1-201	4950	XM_005305641	ENSCPBP00000037888	1071 (aa)	XP_005305697	UPI0003889ED0
ENSCPBT00000044431	XPO1-202	4517	-	ENSCPBP00000037891	996 (aa)	-	UPI000388C2C5

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
cpic03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
cpic03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	ENSG00000082898	XPO1	100	99.441	Homo_sapiens
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.639	ENSAPOG00000004984	-	100	96.639	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	90.745	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.745	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.534	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.534	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	96.915	ENSACIG00000010818	-	100	96.915	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	93.085	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.085	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.639	ENSAOCG00000010121	-	100	96.639	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	92.250	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	92.250	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.639	ENSAPEG00000007038	-	100	96.639	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000026239	XPO1	97	92.894	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.894	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	91.877	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.877	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.639	ENSATEG00000008816	-	100	96.639	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.907	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	99.907	Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.720	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.720	Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.506	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.452	ENSACLG00000015192	-	100	96.452	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	93.404	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	93.404	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	94.174	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	94.174	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.919	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.919	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.627	Bos_taurus
ENSCPBG00000026239	XPO1	99	51.941	WBGene00002078	xpo-1	99	51.941	Caenorhabditis_elegans
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.506	Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.627	Canis_familiaris
ENSCPBG00000026239	XPO1	97	99.691	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	99.598	Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.627	Capra_hircus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.627	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000026239	XPO1	57	95.035	ENSCAPG00000006454	-	100	95.035	Cavia_aperea
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.133	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	98.133	Cavia_porcellus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	79.499	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.685	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.741	ENSCATG00000032674	XPO1	100	98.404	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.346	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.346	Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.506	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPBG00000026239	XPO1	83	99.741	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.741	Choloepus_hoffmanni
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	81.285	ENSCING00000024562	-	100	81.285	Ciona_intestinalis
ENSCPBG00000026239	XPO1	99	80.299	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.299	Ciona_savignyi
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	94.304	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.227	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.319	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.319	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.319	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.319	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	95.745	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.745	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.545	ENSCVAG00000016788	-	100	96.545	Cyprinodon_variegatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	91.597	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.597	Cyprinodon_variegatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	97.292	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	97.292	Danio_rerio
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	93.277	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.511	Danio_rerio
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.720	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.720	Dasypus_novemcinctus
ENSCPBG00000026239	XPO1	92	96.193	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.193	Dipodomys_ordii
ENSCPBG00000026239	XPO1	99	71.134	FBgn0020497	emb	99	71.134	Drosophila_melanogaster
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	98.339	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.339	Echinops_telfairi
ENSCPBG00000026239	XPO1	97	79.979	ENSEBUG00000012580	-	100	88.531	Eptatretus_burgeri
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.627	Equus_asinus_asinus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.627	Equus_caballus
ENSCPBG00000026239	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	95.532	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.532	Esox_lucius
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	93.255	ENSELUG00000014306	-	99	93.255	Esox_lucius
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.627	Felis_catus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.627	Ficedula_albicollis
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	97.759	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.759	Fukomys_damarensis
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	91.877	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.877	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	90.570	ENSGMOG00000019063	-	100	90.570	Gadus_morhua
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	93.091	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	93.091	Gadus_morhua
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.907	ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.907	Gallus_gallus
ENSCPBG00000026239	XPO1	98	96.020	ENSGAFG00000003355	-	99	96.020	Gambusia_affinis
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	92.979	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.979	Gambusia_affinis
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	91.783	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.783	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.359	ENSGACG00000002743	-	100	96.359	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.907	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.907	Gopherus_agassizii
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.506	Gorilla_gorilla
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.545	ENSHBUG00000020037	-	100	96.545	Haplochromis_burtoni
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	92.437	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.437	Haplochromis_burtoni
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.253	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	99.253	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.253	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	99.253	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	95.745	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.745	Hippocampus_comes
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	97.012	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	97.012	Ictalurus_punctatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	94.211	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	Ictalurus_punctatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.440	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.440	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.346	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.346	Jaculus_jaculus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	91.877	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.877	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.078	ENSKMAG00000016218	-	100	96.078	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.639	ENSLBEG00000005740	-	100	96.639	Labrus_bergylta
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	90.466	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.466	Labrus_bergylta
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	77.747	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.747	Latimeria_chalumnae
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	97.199	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.199	Lepisosteus_oculatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.440	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	99.440	Loxodonta_africana
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.506	Macaca_fascicularis
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.506	Macaca_mulatta
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.506	Macaca_nemestrina
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.744	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.744	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	92.157	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	92.157	Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.545	ENSMAMG00000010568	-	100	96.545	Mastacembelus_armatus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.452	ENSMZEG00005018158	-	99	95.918	Maylandia_zebra
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	92.437	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.437	Maylandia_zebra
ENSCPBG00000026239	XPO1	73	99.587	ENSMGAG00000001496	-	100	99.587	Meleagris_gallopavo
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.319	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	98.319	Mesocricetus_auratus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	ENSMICG00000027770	XPO1	100	99.627	Microcebus_murinus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.599	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	98.599	Microtus_ochrogaster
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	96.585	ENSMMOG00000008001	-	99	96.585	Mola_mola
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	93.085	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	93.085	Mola_mola
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.506	Monodelphis_domestica
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	96.172	ENSMALG00000007085	-	100	96.172	Monopterus_albus
ENSCPBG00000026239	XPO1	94	92.136	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	92.136	Monopterus_albus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.693	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.693	Mus_caroli
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.786	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	98.786	Mus_musculus
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ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.786	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	98.786	Mus_spretus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	99.627	Mustela_putorius_furo
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.533	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	99.533	Myotis_lucifugus
ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.440	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	99.440	Nannospalax_galili
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