EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCPBG00000027227 (Gene tree)
Gene ID: 101936687
Gene Symbol: CAPRIN2
Alias: C1QDC1|EEG1|FLJ11391|FLJ22569|RNG140|caprin-2
Full Name: caprin family member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Chrysemys_picta_bellii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 64724 bases
Position: chrKK088226.1:941487-1006210
Accession: 21259
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPBP00000039551	Caprin-1_C	PF12287.8	1.6e-113	1	1
ENSCPBP00000039554	Caprin-1_C	PF12287.8	1.1e-109	1	2
ENSCPBP00000039554	Caprin-1_C	PF12287.8	1.1e-109	2	2
ENSCPBP00000039546	Caprin-1_C	PF12287.8	1.3e-109	1	2
ENSCPBP00000039546	Caprin-1_C	PF12287.8	1.3e-109	2	2
ENSCPBP00000039556	Caprin-1_C	PF12287.8	9.5e-104	1	2
ENSCPBP00000039556	Caprin-1_C	PF12287.8	9.5e-104	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPBT00000046359	CAPRIN2-202	4203	XM_005308738	ENSCPBP00000039551	1225 (aa)	XP_005308795	UPI00046C0B52
ENSCPBT00000046364	CAPRIN2-204	3953	-	ENSCPBP00000039556	1141 (aa)	-	-
ENSCPBT00000046354	CAPRIN2-201	4314	XM_005308737	ENSCPBP00000039546	1262 (aa)	XP_005308794	UPI00046C2ABB
ENSCPBT00000046362	CAPRIN2-203	4194	XM_008164205	ENSCPBP00000039554	1222 (aa)	XP_008162427	UPI00046BF962

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	39.636	ENSCPBG00000012511	CAPRIN1	94	40.468

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	99	67.105	ENSG00000110888	CAPRIN2	100	90.476	Homo_sapiens
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	55	41.418	ENSG00000135387	CAPRIN1	97	42.857	Homo_sapiens
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	81	43.807	ENSAPOG00000019808	caprin2	96	45.425	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	50	41.026	ENSAPOG00000004726	caprin1a	89	41.026	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	40.702	ENSAPOG00000010508	caprin1b	91	41.237	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	100	64.810	ENSAMEG00000009118	CAPRIN2	95	64.696	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.791	ENSAMEG00000008137	CAPRIN1	89	43.866	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	39.446	ENSACIG00000017913	caprin1b	89	42.537	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	50	39.711	ENSACIG00000005383	caprin1a	87	45.000	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	84	39.704	ENSACIG00000005589	caprin2	99	39.704	Amphilophus_citrinellus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	83	40.678	ENSAOCG00000013014	caprin2	100	41.926	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	40.959	ENSAOCG00000004574	caprin1b	90	41.176	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	50	40.074	ENSAOCG00000003017	caprin1a	89	41.026	Amphiprion_ocellaris
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	40.959	ENSAPEG00000001227	caprin1b	90	41.176	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	50	40.074	ENSAPEG00000008548	caprin1a	89	41.026	Amphiprion_percula
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	37.455	ENSATEG00000007707	caprin1a	94	38.182	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	40.364	ENSATEG00000015675	caprin1b	88	41.818	Anabas_testudineus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	40.316	ENSAPLG00000006975	CAPRIN1	97	40.316	Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	100	74.196	ENSAPLG00000006703	CAPRIN2	99	76.995	Anas_platyrhynchos
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	42.537	ENSACAG00000013621	CAPRIN1	90	42.537	Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	100	64.051	ENSACAG00000012953	CAPRIN2	100	64.500	Anolis_carolinensis
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.045	ENSANAG00000032811	-	97	42.041	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	99	70.791	ENSANAG00000035460	CAPRIN2	98	70.791	Aotus_nancymaae
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	50	40.441	ENSACLG00000026749	caprin1a	89	41.176	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	83	41.435	ENSACLG00000015175	-	100	42.081	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	41.818	ENSACLG00000007463	caprin1b	88	42.705	Astatotilapia_calliptera
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	82	44.345	ENSAMXG00000007266	caprin2	94	45.541	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	50	46.193	ENSAMXG00000006601	caprin1a	84	45.794	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	55	39.161	ENSAMXG00000005142	caprin1b	97	37.667	Astyanax_mexicanus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.418	ENSBTAG00000016744	CAPRIN1	89	42.379	Bos_taurus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	100	66.580	ENSBTAG00000019373	CAPRIN2	100	82.519	Bos_taurus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.045	ENSCJAG00000010542	CAPRIN1	89	43.123	Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	100	65.274	ENSCJAG00000001080	CAPRIN2	99	70.994	Callithrix_jacchus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.791	ENSCAFG00000007104	CAPRIN1	88	43.866	Canis_familiaris
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	100	65.144	ENSCAFG00000010713	CAPRIN2	100	64.865	Canis_familiaris
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.791	ENSCAFG00020004525	CAPRIN1	96	43.866	Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	98	64.192	ENSCAFG00020018961	-	100	63.906	Canis_lupus_dingo
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.418	ENSCHIG00000017561	CAPRIN1	97	39.130	Capra_hircus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	98	64.905	ENSCHIG00000026352	CAPRIN2	100	64.680	Capra_hircus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	50	40.816	ENSTSYG00000033857	-	92	40.816	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	52	37.453	ENSTSYG00000028754	-	91	37.453	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	96	78.199	ENSTSYG00000008590	CAPRIN2	97	86.649	Carlito_syrichta
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	38.039	ENSCAPG00000000035	CAPRIN1	92	40.234	Cavia_aperea
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	98	63.149	ENSCPOG00000006625	CAPRIN2	100	78.746	Cavia_porcellus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.418	ENSCPOG00000015734	CAPRIN1	91	43.494	Cavia_porcellus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	99	71.197	ENSCCAG00000027709	CAPRIN2	100	76.938	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	37.918	ENSCCAG00000022482	-	92	39.630	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.045	ENSCCAG00000020172	-	97	42.041	Cebus_capucinus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	100	64.140	ENSCATG00000031463	CAPRIN2	100	77.132	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.418	ENSCATG00000038427	CAPRIN1	89	43.866	Cercocebus_atys
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	98	62.651	ENSCLAG00000001513	CAPRIN2	100	80.139	Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	54	41.418	ENSCLAG00000015468	-	97	39.614	Chinchilla_lanigera
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	100	63.736	ENSCSAG00000007446	CAPRIN2	100	64.437	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	100	63.444	ENSCHOG00000008931	CAPRIN2	95	62.743	Choloepus_hoffmanni
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ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	99	71.197	ENSCANG00000035343	CAPRIN2	96	71.197	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	40.672	ENSCSEG00000013073	caprin1b	87	40.672	Cynoglossus_semilaevis
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ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	52	37.681	ENSDARG00000054272	caprin1b	88	39.130	Danio_rerio
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ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	67	78.509	ENSDORG00000012639	Caprin2	100	78.509	Dipodomys_ordii
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ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	100	70.994	ENSFCAG00000007004	CAPRIN2	96	70.994	Felis_catus
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ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	98	62.289	ENSFDAG00000020134	CAPRIN2	100	62.700	Fukomys_damarensis
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	72	47.458	ENSFHEG00000004435	caprin2	97	41.337	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	37.545	ENSFHEG00000020227	caprin1a	81	54.348	Fundulus_heteroclitus
ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	39.493	ENSFHEG00000009076	caprin1b	77	56.522	Fundulus_heteroclitus
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ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	53	36.462	ENSGMOG00000008955	caprin1a	95	36.462	Gadus_morhua
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