EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCPOG00000003981 (Gene tree)
Gene ID: 100730865
Gene Symbol: RPP38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Cavia_porcellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3494 bases
Position: chrDS562996.1:69304-72797
Accession: 100730865
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPOP00000014693	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	6.8e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPOT00000004025	RPP38-201	1182	XM_005000133	ENSCPOP00000014693	284 (aa)	XP_005000190	H0VVG7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	76.408	ENSG00000152464	RPP38	100	77.381	Homo_sapiens
ENSCPOG00000003981	RPP38	87	45.098	ENSAPOG00000001240	rpp38	97	43.885	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	75.704	ENSAMEG00000018832	RPP38	100	75.704	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPOG00000003981	RPP38	93	41.481	ENSACIG00000011592	rpp38	98	43.662	Amphilophus_citrinellus
ENSCPOG00000003981	RPP38	93	42.509	ENSAOCG00000017293	rpp38	97	42.808	Amphiprion_ocellaris
ENSCPOG00000003981	RPP38	93	44.853	ENSAPEG00000002315	rpp38	97	45.126	Amphiprion_percula
ENSCPOG00000003981	RPP38	95	44.404	ENSATEG00000000731	rpp38	98	44.404	Anabas_testudineus
ENSCPOG00000003981	RPP38	92	49.810	ENSAPLG00000002054	RPP38	96	50.909	Anas_platyrhynchos
ENSCPOG00000003981	RPP38	73	49.545	ENSACLG00000016958	rpp38	99	44.521	Astatotilapia_calliptera
ENSCPOG00000003981	RPP38	73	49.091	ENSACLG00000016962	rpp38	99	44.178	Astatotilapia_calliptera
ENSCPOG00000003981	RPP38	89	40.392	ENSAMXG00000025023	rpp38	99	40.283	Astyanax_mexicanus
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	70.070	ENSBTAG00000007702	RPP38	100	70.070	Bos_taurus
ENSCPOG00000003981	RPP38	99	72.857	ENSCAFG00000024373	RPP38	99	72.857	Canis_familiaris
ENSCPOG00000003981	RPP38	99	72.857	ENSCAFG00020008008	RPP38	99	72.857	Canis_lupus_dingo
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	69.014	ENSCHIG00000012484	RPP38	100	69.014	Capra_hircus
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	87.324	ENSCLAG00000010194	RPP38	100	87.324	Chinchilla_lanigera
ENSCPOG00000003981	RPP38	94	75.188	ENSCSAG00000019055	RPP38	100	75.352	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	79.225	ENSCHOG00000004335	RPP38	100	79.225	Choloepus_hoffmanni
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	68.421	ENSCGRG00001001395	Rpp38	100	69.123	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	68.421	ENSCGRG00000017441	Rpp38	100	69.123	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPOG00000003981	RPP38	88	42.322	ENSCSEG00000001721	rpp38	94	44.074	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPOG00000003981	RPP38	95	43.463	ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.750	Cyprinodon_variegatus
ENSCPOG00000003981	RPP38	95	45.956	ENSDARG00000040350	rpp38	97	45.620	Danio_rerio
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	75.352	ENSDNOG00000040314	RPP38	100	75.352	Dasypus_novemcinctus
ENSCPOG00000003981	RPP38	99	65.000	ENSDORG00000009783	Rpp38	100	64.437	Dipodomys_ordii
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	71.127	ENSETEG00000002839	RPP38	100	71.127	Echinops_telfairi
ENSCPOG00000003981	RPP38	99	73.929	ENSEASG00005019783	RPP38	98	73.404	Equus_asinus_asinus
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	70.423	ENSEEUG00000014677	RPP38	100	70.423	Erinaceus_europaeus
ENSCPOG00000003981	RPP38	89	44.086	ENSELUG00000010160	rpp38	95	43.493	Esox_lucius
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	71.831	ENSFCAG00000022449	RPP38	100	71.831	Felis_catus
ENSCPOG00000003981	RPP38	92	51.136	ENSFALG00000014804	RPP38	94	52.174	Ficedula_albicollis
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	86.268	ENSFDAG00000018669	RPP38	100	86.268	Fukomys_damarensis
ENSCPOG00000003981	RPP38	95	44.710	ENSFHEG00000013741	rpp38	99	45.000	Fundulus_heteroclitus
ENSCPOG00000003981	RPP38	92	51.894	ENSGALG00000008794	RPP38	92	52.555	Gallus_gallus
ENSCPOG00000003981	RPP38	58	50.000	ENSGACG00000009258	rpp38	97	50.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPOG00000003981	RPP38	73	48.636	ENSHBUG00000010937	rpp38	97	43.706	Haplochromis_burtoni
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	82.746	ENSHGLG00000012144	RPP38	100	82.746	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPOG00000003981	RPP38	89	42.745	ENSIPUG00000022879	rpp38	97	44.000	Ictalurus_punctatus
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	73.239	ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.239	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	76.140	ENSJJAG00000007523	Rpp38	100	75.789	Jaculus_jaculus
ENSCPOG00000003981	RPP38	88	43.609	ENSKMAG00000003986	rpp38	93	43.110	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPOG00000003981	RPP38	92	45.487	ENSLBEG00000006853	rpp38	94	46.209	Labrus_bergylta
ENSCPOG00000003981	RPP38	95	48.958	ENSLACG00000006502	RPP38	99	48.515	Latimeria_chalumnae
ENSCPOG00000003981	RPP38	97	48.070	ENSLOCG00000018347	rpp38	100	46.980	Lepisosteus_oculatus
ENSCPOG00000003981	RPP38	100	77.113	ENSLAFG00000000509	RPP38	100	76.761	Loxodonta_africana
ENSCPOG00000003981	RPP38	94	74.812	ENSMMUG00000007679	RPP38	100	75.000	Macaca_mulatta
ENSCPOG00000003981	RPP38	91	47.925	ENSMAMG00000012774	rpp38	92	47.925	Mastacembelus_armatus
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ENSCPOG00000003981	RPP38	73	49.545	ENSMZEG00005003200	rpp38	99	44.521	Maylandia_zebra
ENSCPOG00000003981	RPP38	92	51.515	ENSMGAG00000008217	RPP38	92	52.190	Meleagris_gallopavo
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ENSCPOG00000003981	RPP38	94	72.556	ENSOCUG00000024367	-	100	72.887	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPOG00000003981	RPP38	90	41.852	ENSORLG00000009219	rpp38	96	42.336	Oryzias_latipes
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ENSCPOG00000003981	RPP38	100	71.479	ENSPTIG00000007188	RPP38	100	71.479	Panthera_tigris_altaica
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ENSCPOG00000003981	RPP38	100	70.877	ENSPEMG00000008375	Rpp38	100	72.281	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSCPOG00000003981	RPP38	90	42.701	ENSPREG00000017744	rpp38	94	42.435	Poecilia_reticulata
ENSCPOG00000003981	RPP38	99	76.868	ENSPPYG00000002113	RPP38	99	77.143	Pongo_abelii
ENSCPOG00000003981	RPP38	94	74.812	ENSPVAG00000007155	RPP38	100	75.000	Pteropus_vampyrus
ENSCPOG00000003981	RPP38	73	49.545	ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.406	Pundamilia_nyererei
ENSCPOG00000003981	RPP38	89	42.688	ENSPNAG00000010633	rpp38	99	41.727	Pygocentrus_nattereri
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ENSCPOG00000003981	RPP38	96	53.597	ENSSPUG00000008560	-	98	53.214	Sphenodon_punctatus
ENSCPOG00000003981	RPP38	93	43.796	ENSSPAG00000020387	rpp38	97	44.086	Stegastes_partitus
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ENSCPOG00000003981	RPP38	100	75.088	ENSUMAG00000012382	RPP38	100	75.439	Ursus_maritimus
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