EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCPOG00000005326 (Gene tree)
Gene ID: 100718492
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cavia_porcellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9064 bases
Position: chrDS562880.1:10682518-10691581
Accession: 100718492
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPOP00000004790	SYF2	PF08231.12	3.2e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPOT00000005383	SYF2-201	2132	XM_005004290	ENSCPOP00000004790	244 (aa)	XP_005004347	H0V572

Gene Model

Click here to download ENSCPOG00000005326's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCPOG00000005326's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPOG00000005326	SYF2	99	93.802	ENSG00000117614	SYF2	98	93.802	Homo_sapiens
ENSCPOG00000005326	SYF2	90	84.932	ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.252	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPOG00000005326	SYF2	95	93.191	ENSAMEG00000010115	-	97	93.191	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPOG00000005326	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPOG00000005326	SYF2	90	82.192	ENSACIG00000023688	syf2	88	82.192	Amphilophus_citrinellus
ENSCPOG00000005326	SYF2	97	80.083	ENSAOCG00000022046	syf2	98	82.251	Amphiprion_ocellaris
ENSCPOG00000005326	SYF2	87	79.817	ENSAOCG00000010912	syf2	69	78.733	Amphiprion_ocellaris
ENSCPOG00000005326	SYF2	97	80.083	ENSAPEG00000018858	syf2	93	80.083	Amphiprion_percula
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	100	78.571	Anabas_testudineus
ENSCPOG00000005326	SYF2	82	88.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	Anas_platyrhynchos
ENSCPOG00000005326	SYF2	84	84.804	ENSACAG00000013653	-	100	84.804	Anolis_carolinensis
ENSCPOG00000005326	SYF2	68	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.033	ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.033	Aotus_nancymaae
ENSCPOG00000005326	SYF2	90	81.735	ENSACLG00000019916	syf2	99	77.637	Astatotilapia_calliptera
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	77.049	ENSAMXG00000004051	syf2	100	77.049	Astyanax_mexicanus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.469	ENSBTAG00000001651	SYF2	99	95.299	Bos_taurus
ENSCPOG00000005326	SYF2	85	50.476	WBGene00019402	syf-2	99	46.983	Caenorhabditis_elegans
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.443	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.443	Callithrix_jacchus
ENSCPOG00000005326	SYF2	91	88.288	ENSCAFG00000030331	-	94	89.091	Canis_familiaris
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.870	ENSCAFG00000012895	-	100	91.870	Canis_familiaris
ENSCPOG00000005326	SYF2	65	96.855	ENSCAFG00020021094	-	84	96.855	Canis_lupus_dingo
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.870	ENSCAFG00020021091	-	100	91.870	Canis_lupus_dingo
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	92.653	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.653	Capra_hircus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	92.213	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.213	Carlito_syrichta
ENSCPOG00000005326	SYF2	81	100.000	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	100.000	Cavia_aperea
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.443	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	93.443	Cebus_capucinus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.033	ENSCATG00000026917	SYF2	100	93.033	Cercocebus_atys
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	96.721	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	96.721	Chinchilla_lanigera
ENSCPOG00000005326	SYF2	99	92.593	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	92.593	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPOG00000005326	SYF2	71	77.011	ENSCHOG00000005273	-	96	77.011	Choloepus_hoffmanni
ENSCPOG00000005326	SYF2	92	88.393	ENSCPBG00000025073	SYF2	92	87.336	Chrysemys_picta_bellii
ENSCPOG00000005326	SYF2	86	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSCPOG00000005326	SYF2	86	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	79.508	ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.508	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	89.754	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	89.754	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPOG00000005326	SYF2	80	95.408	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	99	73.840	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPOG00000005326	SYF2	90	82.192	ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.311	Cyprinodon_variegatus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	77.049	ENSDARG00000004706	syf2	100	77.049	Danio_rerio
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	92.245	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	92.245	Dasypus_novemcinctus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.803	ENSDORG00000001274	Syf2	100	91.803	Dipodomys_ordii
ENSCPOG00000005326	SYF2	93	56.522	FBgn0033556	CG12343	99	56.522	Drosophila_melanogaster
ENSCPOG00000005326	SYF2	88	78.140	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.293	Echinops_telfairi
ENSCPOG00000005326	SYF2	81	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	92.653	ENSEASG00005004224	-	100	92.653	Equus_asinus_asinus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	81.148	ENSEASG00005004232	-	100	81.148	Equus_asinus_asinus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.061	ENSECAG00000012023	-	100	93.061	Equus_caballus
ENSCPOG00000005326	SYF2	95	94.397	ENSECAG00000010440	-	97	94.397	Equus_caballus
ENSCPOG00000005326	SYF2	75	78.689	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	78.689	Erinaceus_europaeus
ENSCPOG00000005326	SYF2	95	80.591	ENSELUG00000003465	syf2	99	80.591	Esox_lucius
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.870	ENSFCAG00000010324	-	85	91.870	Felis_catus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.870	ENSFCAG00000043095	-	100	91.870	Felis_catus
ENSCPOG00000005326	SYF2	84	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	92	81.739	Ficedula_albicollis
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	95.082	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	95.082	Fukomys_damarensis
ENSCPOG00000005326	SYF2	90	68.182	ENSFHEG00000007238	syf2	97	68.182	Fundulus_heteroclitus
ENSCPOG00000005326	SYF2	88	83.721	ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	Gadus_morhua
ENSCPOG00000005326	SYF2	92	87.500	ENSGALG00000013639	SYF2	100	80.159	Gallus_gallus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	73.770	ENSGAFG00000019435	syf2	97	73.770	Gambusia_affinis
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	82.569	ENSGACG00000007305	syf2	99	77.178	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPOG00000005326	SYF2	92	88.839	ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.773	Gopherus_agassizii
ENSCPOG00000005326	SYF2	99	94.215	ENSGGOG00000012796	SYF2	98	94.215	Gorilla_gorilla
ENSCPOG00000005326	SYF2	94	78.541	ENSHBUG00000020477	syf2	100	78.541	Haplochromis_burtoni
ENSCPOG00000005326	SYF2	93	84.581	ENSHGLG00000004304	-	100	82.377	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	94.672	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	94.672	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	94.672	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	94.672	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	77.869	ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.869	Hippocampus_comes
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	78.689	ENSIPUG00000019859	syf2	100	78.689	Ictalurus_punctatus
ENSCPOG00000005326	SYF2	60	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPOG00000005326	SYF2	82	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	77.869	ENSKMAG00000013856	syf2	100	77.869	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPOG00000005326	SYF2	90	83.562	ENSLBEG00000014425	syf2	100	77.869	Labrus_bergylta
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	85.321	ENSLACG00000012064	SYF2	92	85.321	Latimeria_chalumnae
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	79.098	ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.098	Lepisosteus_oculatus
ENSCPOG00000005326	SYF2	75	64.674	ENSLAFG00000030814	-	100	64.674	Loxodonta_africana
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.837	ENSLAFG00000023150	-	100	91.837	Loxodonta_africana
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.033	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	93.033	Macaca_fascicularis
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	92.623	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	92.623	Macaca_mulatta
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.033	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	93.033	Macaca_nemestrina
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.033	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.033	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	81.567	ENSMAMG00000010403	syf2	98	76.230	Mastacembelus_armatus
ENSCPOG00000005326	SYF2	95	77.311	ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.311	Maylandia_zebra
ENSCPOG00000005326	SYF2	82	88.945	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	Meleagris_gallopavo
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	89.754	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	89.754	Mesocricetus_auratus
ENSCPOG00000005326	SYF2	82	97.487	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.393	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	91.393	Microtus_ochrogaster
ENSCPOG00000005326	SYF2	90	80.365	ENSMMOG00000002396	syf2	92	80.365	Mola_mola
ENSCPOG00000005326	SYF2	92	87.665	ENSMODG00000013951	-	99	87.665	Monodelphis_domestica
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	76.735	ENSMALG00000010706	syf2	100	77.143	Monopterus_albus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.164	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	90.164	Mus_caroli
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.164	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	90.164	Mus_musculus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.164	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	90.164	Mus_pahari
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.164	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	90.164	Mus_spretus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.650	ENSMPUG00000015801	-	100	90.650	Mustela_putorius_furo
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.870	ENSMPUG00000015802	-	100	91.870	Mustela_putorius_furo
ENSCPOG00000005326	SYF2	94	95.197	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	95.197	Myotis_lucifugus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	92.276	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.276	Nannospalax_galili
ENSCPOG00000005326	SYF2	95	72.034	ENSNBRG00000010720	syf2	99	72.034	Neolamprologus_brichardi
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.443	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	93.443	Nomascus_leucogenys
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.574	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.574	Ochotona_princeps
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	84.016	ENSODEG00000014338	-	100	84.016	Octodon_degus
ENSCPOG00000005326	SYF2	98	94.118	ENSODEG00000017664	-	100	94.118	Octodon_degus
ENSCPOG00000005326	SYF2	90	81.735	ENSONIG00000008213	syf2	99	77.637	Oreochromis_niloticus
ENSCPOG00000005326	SYF2	83	90.099	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.852	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.852	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPOG00000005326	SYF2	94	80.000	ENSORLG00000028820	syf2	99	80.000	Oryzias_latipes
ENSCPOG00000005326	SYF2	99	77.686	ENSORLG00020018333	syf2	99	77.686	Oryzias_latipes_hni
ENSCPOG00000005326	SYF2	99	77.273	ENSORLG00015014665	syf2	99	77.273	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPOG00000005326	SYF2	94	80.769	ENSOMEG00000013911	syf2	98	80.769	Oryzias_melastigma
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.443	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.443	Otolemur_garnettii
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.903	ENSOARG00000006348	-	100	91.903	Ovis_aries
ENSCPOG00000005326	SYF2	80	66.667	ENSOARG00000006269	-	100	66.667	Ovis_aries
ENSCPOG00000005326	SYF2	99	94.215	ENSPPAG00000036579	SYF2	98	94.215	Pan_paniscus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.057	ENSPPRG00000001638	-	100	91.057	Panthera_pardus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.870	ENSPPRG00000001651	-	100	91.870	Panthera_pardus
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	98.611	ENSPTIG00000005711	-	82	96.018	Panthera_tigris_altaica
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.870	ENSPTIG00000007036	-	100	91.870	Panthera_tigris_altaica
ENSCPOG00000005326	SYF2	99	94.215	ENSPTRG00000000352	SYF2	98	94.215	Pan_troglodytes
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.033	ENSPANG00000008139	SYF2	100	93.033	Papio_anubis
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	78.279	ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.279	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCPOG00000005326	SYF2	94	86.463	ENSPSIG00000011816	SYF2	89	86.463	Pelodiscus_sinensis
ENSCPOG00000005326	SYF2	98	76.763	ENSPMGG00000008755	syf2	94	76.763	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.984	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.984	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCPOG00000005326	SYF2	92	92.889	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	92.140	Phascolarctos_cinereus
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	80.734	ENSPFOG00000004116	syf2	90	80.734	Poecilia_formosa
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	80.734	ENSPLAG00000006691	syf2	94	80.734	Poecilia_latipinna
ENSCPOG00000005326	SYF2	99	72.428	ENSPMEG00000011684	syf2	99	72.428	Poecilia_mexicana
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	97	77.682	Poecilia_reticulata
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.443	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.443	Pongo_abelii
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	63.934	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.525	Propithecus_coquereli
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	81.224	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.224	Pteropus_vampyrus
ENSCPOG00000005326	SYF2	90	81.735	ENSPNYG00000004979	syf2	99	77.637	Pundamilia_nyererei
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	78.689	ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.689	Pygocentrus_nattereri
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.164	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	90.164	Rattus_norvegicus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.574	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.574	Rhinopithecus_bieti
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.033	ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.033	Rhinopithecus_roxellana
ENSCPOG00000005326	SYF2	99	93.004	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	92.213	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	84.739	ENSSHAG00000015630	-	100	84.739	Sarcophilus_harrisii
ENSCPOG00000005326	SYF2	84	93.204	ENSSHAG00000007152	-	100	93.204	Sarcophilus_harrisii
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	77.459	ENSSFOG00015023647	syf2	100	77.459	Scleropages_formosus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	76.230	ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.230	Scophthalmus_maximus
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	83.486	ENSSDUG00000013072	syf2	100	77.049	Seriola_dumerili
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	83.486	ENSSLDG00000012677	syf2	100	77.049	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	72.541	ENSSARG00000012889	SYF2	100	72.541	Sorex_araneus
ENSCPOG00000005326	SYF2	94	86.463	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.463	Sphenodon_punctatus
ENSCPOG00000005326	SYF2	95	78.571	ENSSPAG00000009626	syf2	100	77.459	Stegastes_partitus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.429	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.429	Sus_scrofa
ENSCPOG00000005326	SYF2	61	60.265	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	60.227	Taeniopygia_guttata
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	75.820	ENSTRUG00000001499	syf2	95	75.934	Takifugu_rubripes
ENSCPOG00000005326	SYF2	89	80.734	ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.734	Tetraodon_nigroviridis
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	70.492	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	70.082	Tupaia_belangeri
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.393	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.393	Tursiops_truncatus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.463	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.463	Ursus_americanus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.057	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.057	Ursus_maritimus
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.164	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	90.164	Vicugna_pacos
ENSCPOG00000005326	SYF2	84	96.585	ENSVVUG00000027181	-	100	88.306	Vulpes_vulpes
ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.870	ENSVVUG00000027175	-	100	91.870	Vulpes_vulpes
ENSCPOG00000005326	SYF2	97	82.278	ENSXETG00000022797	syf2	95	82.278	Xenopus_tropicalis
ENSCPOG00000005326	SYF2	88	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	92	80.275	Xiphophorus_maculatus