EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCPOG00000010306 (Gene tree)
Gene ID: 100719679
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Cavia_porcellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30063 bases
Position: chrDS562903.1:4242576-4272638
Accession: 100719679
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPOP00000009255	PAP_RNA-bind	PF04926.15	7.5e-28	1	2
ENSCPOP00000009255	PAP_RNA-bind	PF04926.15	7.5e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPOT00000010400	PAPOLG-201	2223	XM_003467514	ENSCPOP00000009255	740 (aa)	XP_003467562	H0VGL0

Gene Model

Click here to download ENSCPOG00000010306's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCPOG00000010306's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	57.775	ENSCPOG00000002648	PAPOLA	98	57.909
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	58	64.352	ENSCPOG00000021527	PAPOLB	68	69.372

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.682	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	72.473	ENSAPOG00000004798	papolg	99	71.390	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	94.986	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	94.986	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.366	ENSACIG00000010546	papolg	99	69.542	Amphilophus_citrinellus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	72.606	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.739	Amphiprion_ocellaris
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	72.739	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.872	Amphiprion_percula
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	72.703	ENSATEG00000009007	papolg	79	86.774	Anabas_testudineus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	73.901	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.502	Anas_platyrhynchos
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	81	64.204	ENSACAG00000015048	-	100	64.204	Anolis_carolinensis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.682	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	95.682	Aotus_nancymaae
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.560	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.169	Astatotilapia_calliptera
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	73.642	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.642	Astyanax_mexicanus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.277	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	95.277	Bos_taurus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.816	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	95.816	Callithrix_jacchus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.007	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	87.042	Canis_familiaris
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.378	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.378	Canis_lupus_dingo
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.007	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.007	Capra_hircus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	96.221	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	96.221	Carlito_syrichta
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	51	91.864	ENSCAPG00000014901	-	100	91.864	Cavia_aperea
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.816	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.816	Cebus_capucinus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	91	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	97.301	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	97.301	Chinchilla_lanigera
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.951	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	95.951	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	89	93.171	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.171	Choloepus_hoffmanni
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	67	64.752	ENSCING00000024664	-	94	64.752	Ciona_intestinalis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	65	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	96.086	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	96.086	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	94.399	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	94.399	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	94.399	ENSCGRG00000005552	-	100	94.399	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.774	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.549	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	75	82.258	ENSCVAG00000016602	papolg	90	84.722	Cyprinodon_variegatus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	73.642	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.642	Danio_rerio
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.324	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	94.324	Dasypus_novemcinctus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	58	99.301	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.301	Dipodomys_ordii
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	73.984	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.919	Echinops_telfairi
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	60	71.540	ENSEBUG00000004020	papolg	90	71.540	Eptatretus_burgeri
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	63	57.725	ENSEBUG00000005042	-	79	57.725	Eptatretus_burgeri
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.951	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	95.951	Equus_asinus_asinus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.816	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	95.393	Equus_caballus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	84.189	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.189	Erinaceus_europaeus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	72.443	ENSELUG00000014497	papolg	99	65.348	Esox_lucius
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.872	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	94.872	Felis_catus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	65.339	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.339	Ficedula_albicollis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	96.896	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	96.896	Fukomys_damarensis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	66	62.695	ENSFHEG00000019080	papolg	90	62.963	Fundulus_heteroclitus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	87	82.852	ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.852	Gadus_morhua
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	70.080	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	69.814	Gallus_gallus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	68.889	ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.412	Gambusia_affinis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	71.523	ENSGACG00000002718	papolg	100	71.693	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.951	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	95.951	Gorilla_gorilla
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.560	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.833	Haplochromis_burtoni
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	96.748	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	96.748	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	97.166	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	97.166	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	71.011	ENSHCOG00000006782	papolg	89	71.032	Hippocampus_comes
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	71.736	ENSIPUG00000021642	papolg	100	73.056	Ictalurus_punctatus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	96.491	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.491	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	58	99.068	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	99.068	Jaculus_jaculus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	70.916	ENSKMAG00000016439	papolg	97	69.407	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	68.286	ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.502	Labrus_bergylta
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	70.187	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.400	Latimeria_chalumnae
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	73.263	ENSLOCG00000016130	papolg	100	73.263	Lepisosteus_oculatus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.205	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	Loxodonta_africana
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	96.221	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	96.221	Macaca_fascicularis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	96.221	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	96.221	Macaca_mulatta
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	86.327	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	87.265	Macaca_nemestrina
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.816	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	95.816	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	72.074	ENSMAMG00000010667	papolg	99	70.850	Mastacembelus_armatus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.560	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.532	Maylandia_zebra
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	70.817	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.549	Meleagris_gallopavo
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	94.809	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	94.809	Mesocricetus_auratus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.547	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	95.547	Microcebus_murinus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.595	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	94.595	Microtus_ochrogaster
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	71.751	ENSMMOG00000008020	papolg	99	72.149	Mola_mola
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	87.131	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.131	Monodelphis_domestica
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	71.505	ENSMALG00000007012	papolg	89	71.505	Monopterus_albus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.865	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.533	Mus_caroli
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.865	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.533	Mus_musculus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.730	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.730	Mus_pahari
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.730	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.533	Mus_spretus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.142	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	95.142	Mustela_putorius_furo
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	93.496	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	93.496	Myotis_lucifugus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.405	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.405	Nannospalax_galili
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	63.276	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.540	Neolamprologus_brichardi
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	58	98.834	ENSNLEG00000009507	-	100	98.834	Nomascus_leucogenys
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	81	77.397	ENSMEUG00000013605	-	87	77.397	Notamacropus_eugenii
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.816	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	95.816	Ochotona_princeps
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	58	94.601	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	Octodon_degus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	65.107	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.374	Oreochromis_niloticus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	86.193	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	86.193	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	96.626	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	96.626	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.960	ENSORLG00000001577	papolg	89	70.066	Oryzias_latipes
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	70.120	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.385	Oryzias_latipes_hni
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.960	ENSORLG00015008836	papolg	89	70.066	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	70.267	ENSOMEG00000001406	papolg	89	69.934	Oryzias_melastigma
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	58	89.070	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	89.070	Otolemur_garnettii
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.142	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	95.142	Ovis_aries
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.682	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	95.682	Pan_paniscus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.007	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	95.007	Panthera_pardus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.872	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.872	Panthera_tigris_altaica
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.682	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	95.682	Pan_troglodytes
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	91.790	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	91.790	Papio_anubis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	95	70.297	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.297	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	72.727	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.727	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	78.976	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.976	Pelodiscus_sinensis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	93.989	ENSPEMG00000008960	-	100	93.989	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	53.665	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.581	Petromyzon_marinus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	66	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	87.316	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.316	Phascolarctos_cinereus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	68.889	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.261	Poecilia_formosa
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	68.627	ENSPLAG00000018445	papolg	89	69.514	Poecilia_latipinna
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	68.449	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.332	Poecilia_mexicana
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	68.359	ENSPREG00000010358	papolg	89	69.069	Poecilia_reticulata
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.816	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.816	Pongo_abelii
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	81.769	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.769	Procavia_capensis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	84.480	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	84.480	Propithecus_coquereli
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	89	93.262	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.262	Pteropus_vampyrus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	70.850	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.850	Pundamilia_nyererei
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	73.396	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.396	Pygocentrus_nattereri
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.189	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	94.189	Rattus_norvegicus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	89.879	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	89.879	Rhinopithecus_bieti
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.816	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	95.816	Rhinopithecus_roxellana
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.547	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.547	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	94	87.943	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	87.943	Sarcophilus_harrisii
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	63.661	ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.661	Scleropages_formosus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	69.987	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.987	Scleropages_formosus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	78	81.142	ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.000	Scophthalmus_maximus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	72.386	ENSSDUG00000000912	papolg	99	71.120	Seriola_dumerili
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	71.809	ENSSLDG00000001217	papolg	97	72.340	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	78.961	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	78.961	Sphenodon_punctatus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	70.445	ENSSPAG00000009004	papolg	99	70.445	Stegastes_partitus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.412	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.412	Sus_scrofa
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	73	76.994	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	76.994	Taeniopygia_guttata
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	71.046	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.643	Takifugu_rubripes
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	66.008	ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.008	Tetraodon_nigroviridis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	88.299	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	88.299	Tupaia_belangeri
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	90.553	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	90.553	Tursiops_truncatus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	94.952	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.952	Ursus_americanus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	94.952	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	94.952	Ursus_maritimus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	91.020	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.020	Vicugna_pacos
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.412	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.412	Vulpes_vulpes
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	74.005	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.005	Xenopus_tropicalis
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	67	85.170	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.170	Xiphophorus_couchianus
ENSCPOG00000010306	PAPOLG	74	82.600	ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	Xiphophorus_maculatus