EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSCPOG00000010428 (Gene tree)
Gene ID: 100723471
Gene Symbol: AGO2
Alias: CASC7|EIF2C2|LINC00980|Q10|hAGO2
Full Name: argonaute 2%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Cavia_porcellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 91426 bases
Position: chrDS562872.1:36841449-36932874
Accession: 100723471
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPOP00000009364	PAZ	PF02170.22	8.3e-27	1	1
ENSCPOP00000032420	PAZ	PF02170.22	8.4e-27	1	1
ENSCPOP00000009364	Piwi	PF02171.17	2.1e-115	1	1
ENSCPOP00000032420	Piwi	PF02171.17	2.1e-115	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPOT00000010522	AGO2-202	2571	-	ENSCPOP00000009364	856 (aa)	-	H0VGV5
ENSCPOT00000031751	AGO2-201	2613	XM_003473208	ENSCPOP00000032420	857 (aa)	-	A0A286Y3L3

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	77.120	ENSCPOG00000011557	AGO4	98	77.856
ENSCPOG00000010428	AGO2	97	77.580	ENSCPOG00000030524	AGO3	99	77.580
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	83.550	ENSCPOG00000011568	AGO1	98	83.890

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.883	ENSG00000123908	AGO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.445	ENSAPOG00000017586	ago2	96	93.445	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.649	ENSAMEG00000005019	AGO2	99	99.649	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPOG00000010428	AGO2	81	93.669	ENSACIG00000001179	ago2	96	93.669	Amphilophus_citrinellus
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.921	ENSAOCG00000015307	ago2	96	93.921	Amphiprion_ocellaris
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.921	ENSAPEG00000018425	ago2	96	93.921	Amphiprion_percula
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	93.388	ENSATEG00000000529	ago2	96	93.921	Anabas_testudineus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.062	ENSAPLG00000010465	AGO2	99	99.062	Anas_platyrhynchos
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	98.712	ENSACAG00000000167	AGO2	98	98.712	Anolis_carolinensis
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSANAG00000027399	AGO2	99	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCPOG00000010428	AGO2	80	94.606	ENSACLG00000024684	ago2	98	94.606	Astatotilapia_calliptera
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	93.160	ENSAMXG00000014587	ago2	98	93.564	Astyanax_mexicanus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSBTAG00000001579	AGO2	99	100.000	Bos_taurus
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	66.783	WBGene00000106	alg-2	96	66.901	Caenorhabditis_elegans
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	67.431	WBGene00000105	alg-1	87	67.431	Caenorhabditis_elegans
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSCJAG00000004132	AGO2	99	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCPOG00000010428	AGO2	95	99.877	ENSCAFG00000001196	AGO2	100	99.877	Canis_familiaris
ENSCPOG00000010428	AGO2	100	99.533	ENSCAFG00020014198	AGO2	99	99.766	Canis_lupus_dingo
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSCHIG00000010156	AGO2	99	100.000	Capra_hircus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.883	ENSTSYG00000007281	AGO2	99	99.883	Carlito_syrichta
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	84.460	ENSCAPG00000013707	AGO2	98	84.460	Cavia_aperea
ENSCPOG00000010428	AGO2	100	99.417	ENSCCAG00000035031	AGO2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	96.516	ENSCATG00000038820	AGO2	100	96.516	Cercocebus_atys
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.766	ENSCLAG00000001381	AGO2	99	99.766	Chinchilla_lanigera
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSCSAG00000009574	AGO2	94	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPOG00000010428	AGO2	83	84.633	ENSCHOG00000008938	-	84	84.633	Choloepus_hoffmanni
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.297	ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.297	Chrysemys_picta_bellii
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	72.353	ENSCING00000007310	-	98	72.353	Ciona_intestinalis
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	73.113	ENSCSAVG00000005282	-	99	79.104	Ciona_savignyi
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	96.127	ENSCANG00000030899	AGO2	99	96.127	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.179	ENSCGRG00001013557	Ago2	99	99.179	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.178	ENSCGRG00000002120	Ago2	100	99.178	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.445	ENSCSEG00000012273	ago2	96	93.445	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	92.968	ENSCVAG00000008763	ago2	100	92.539	Cyprinodon_variegatus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	92.523	ENSDARG00000061268	ago2	96	93.222	Danio_rerio
ENSCPOG00000010428	AGO2	92	97.595	ENSDNOG00000033433	AGO2	100	97.595	Dasypus_novemcinctus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.297	ENSDORG00000011242	Ago2	100	99.297	Dipodomys_ordii
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	74.443	FBgn0262739	AGO1	90	74.443	Drosophila_melanogaster
ENSCPOG00000010428	AGO2	80	86.172	ENSEBUG00000008202	-	99	86.172	Eptatretus_burgeri
ENSCPOG00000010428	AGO2	80	86.192	ENSEBUG00000006807	-	100	86.192	Eptatretus_burgeri
ENSCPOG00000010428	AGO2	81	88.905	ENSEBUG00000014654	ago2	100	88.905	Eptatretus_burgeri
ENSCPOG00000010428	AGO2	93	57.263	ENSEBUG00000014681	ago2	99	57.263	Eptatretus_burgeri
ENSCPOG00000010428	AGO2	94	86.757	ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	Eptatretus_burgeri
ENSCPOG00000010428	AGO2	95	100.000	ENSEASG00005021922	AGO2	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.883	ENSECAG00000006078	AGO2	99	99.883	Equus_caballus
ENSCPOG00000010428	AGO2	74	99.301	ENSEEUG00000008564	-	74	99.301	Erinaceus_europaeus
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	92.857	ENSELUG00000019378	ago2	96	92.857	Esox_lucius
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.883	ENSFCAG00000002782	AGO2	100	99.766	Felis_catus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	98.946	ENSFALG00000002838	AGO2	99	98.946	Ficedula_albicollis
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSFDAG00000004759	AGO2	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSCPOG00000010428	AGO2	94	93.432	ENSFHEG00000016080	ago2	96	93.432	Fundulus_heteroclitus
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	92.729	ENSGMOG00000013651	ago2	98	92.518	Gadus_morhua
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	98.829	ENSGALG00000040957	AGO2	99	98.829	Gallus_gallus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	93.262	ENSGAFG00000018026	ago2	97	93.683	Gambusia_affinis
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	93.034	ENSGACG00000006796	ago2	98	93.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.297	ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	Gopherus_agassizii
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSGGOG00000011412	AGO2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	93.388	ENSHBUG00000018515	ago2	98	94.606	Haplochromis_burtoni
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ENSCPOG00000010428	AGO2	98	89.074	ENSHGLG00100000694	-	98	89.074	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.766	ENSHGLG00100015994	-	99	99.766	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.921	ENSHCOG00000006200	ago2	98	93.921	Hippocampus_comes
ENSCPOG00000010428	AGO2	100	92.182	ENSIPUG00000001018	ago2	98	93.103	Ictalurus_punctatus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.648	ENSSTOG00000008113	AGO2	100	99.648	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.648	ENSJJAG00000018712	Ago2	99	99.648	Jaculus_jaculus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	92.916	ENSKMAG00000019999	ago2	98	93.445	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.445	ENSLBEG00000005112	ago2	96	93.445	Labrus_bergylta
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	88.249	ENSLACG00000001277	-	98	88.507	Latimeria_chalumnae
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.325	ENSLOCG00000007766	ago2	97	93.325	Lepisosteus_oculatus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.648	ENSLAFG00000012905	AGO2	100	99.648	Loxodonta_africana
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSMFAG00000015384	AGO2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSMMUG00000008045	AGO2	99	99.766	Macaca_mulatta
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSMNEG00000019904	AGO2	99	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSMLEG00000038874	AGO2	99	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	93.270	ENSMAMG00000008662	ago2	99	91.548	Mastacembelus_armatus
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.921	ENSMZEG00005008998	ago2	98	94.606	Maylandia_zebra
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	98.946	ENSMGAG00000012942	AGO2	99	98.946	Meleagris_gallopavo
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	91.090	ENSMAUG00000007785	Ago2	99	91.090	Mesocricetus_auratus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSMICG00000004427	AGO2	99	100.000	Microcebus_murinus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.531	ENSMOCG00000000300	Ago2	100	99.531	Microtus_ochrogaster
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	90.822	ENSMMOG00000020165	ago2	100	90.822	Mola_mola
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	98.363	ENSMODG00000000748	AGO2	99	98.363	Monodelphis_domestica
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.683	ENSMALG00000020610	ago2	98	93.683	Monopterus_albus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.297	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	99	99.297	Mus_caroli
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.297	ENSMUSG00000036698	Ago2	99	99.297	Mus_musculus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.062	MGP_PahariEiJ_G0019867	Ago2	99	99.062	Mus_pahari
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.289	MGP_SPRETEiJ_G0020759	Ago2	99	99.289	Mus_spretus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.648	ENSMPUG00000001930	AGO2	100	99.648	Mustela_putorius_furo
ENSCPOG00000010428	AGO2	66	87.456	ENSMLUG00000004552	-	100	87.346	Myotis_lucifugus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.412	ENSNGAG00000014556	Ago2	99	99.412	Nannospalax_galili
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.921	ENSNBRG00000006100	ago2	96	93.921	Neolamprologus_brichardi
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	94.836	ENSNLEG00000001461	AGO2	97	94.836	Nomascus_leucogenys
ENSCPOG00000010428	AGO2	88	86.154	ENSMEUG00000001395	AGO2	86	98.039	Notamacropus_eugenii
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	87.089	ENSOPRG00000008795	-	100	87.089	Ochotona_princeps
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	100.000	ENSODEG00000014145	AGO2	100	100.000	Octodon_degus
ENSCPOG00000010428	AGO2	98	93.921	ENSONIG00000010747	ago2	96	93.921	Oreochromis_niloticus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.297	ENSOANG00000007125	AGO2	99	99.297	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	97.773	ENSOCUG00000006066	AGO2	99	97.773	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	92.798	ENSORLG00000004615	ago2	98	93.325	Oryzias_latipes
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	92.798	ENSORLG00020003449	ago2	98	93.325	Oryzias_latipes_hni
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	92.798	ENSORLG00015015319	ago2	98	93.325	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	92.916	ENSOMEG00000017751	ago2	98	93.445	Oryzias_melastigma
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.883	ENSOGAG00000007933	AGO2	99	99.883	Otolemur_garnettii
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ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.883	ENSPPAG00000037787	AGO2	100	99.883	Pan_paniscus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.883	ENSPPRG00000002594	AGO2	99	99.883	Panthera_pardus
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	98.592	ENSPTIG00000007438	AGO2	99	98.592	Panthera_tigris_altaica
ENSCPOG00000010428	AGO2	99	99.883	ENSPTRG00000020622	AGO2	99	99.883	Pan_troglodytes
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