EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCPOG00000010566 (Gene tree)
Gene ID: 100720683
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Cavia_porcellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33634 bases
Position: chrDS562922.1:9047822-9081455
Accession: 100720683
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPOP00000025893	GTP_EFTU	PF00009.27	2.5e-45	1	1
ENSCPOP00000009486	GTP_EFTU	PF00009.27	4.6e-40	1	1
ENSCPOP00000009486	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1e-12	1	1
ENSCPOP00000025893	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1e-12	1	1
ENSCPOP00000009486	EFG_IV	PF03764.18	2.1e-23	1	1
ENSCPOP00000025893	EFG_IV	PF03764.18	2.1e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPOT00000010661	EFTUD2-202	2916	-	ENSCPOP00000009486	971 (aa)	-	H0VH65
ENSCPOT00000044864	EFTUD2-201	3335	XM_003465735	ENSCPOP00000025893	972 (aa)	XP_003465783	A0A286XKS1

Gene Model

Click here to download ENSCPOG00000010566's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCPOG00000010566's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	51	31.944	ENSCPOG00000001194	GFM1	58	31.944
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	87	36.187	ENSCPOG00000015697	EEF2	99	36.187
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	74	34.507	ENSCPOG00000001924	EFL1	73	34.507

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.181	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.177	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	88.683	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.580	Amphilophus_citrinellus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	87	88.235	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.235	Amphiprion_ocellaris
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.284	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.593	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	99	93.821	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	93.821	Anas_platyrhynchos
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	96.914	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	96.914	Anolis_carolinensis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.971	Aotus_nancymaae
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.181	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.607	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	Astyanax_mexicanus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.074	Bos_taurus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	99	70.041	WBGene00001166	eftu-2	99	69.731	Caenorhabditis_elegans
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	98.971	Callithrix_jacchus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.177	Canis_familiaris
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.177	Canis_lupus_dingo
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.074	Capra_hircus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.765	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.765	Carlito_syrichta
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	100.000	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	100.000	Cavia_aperea
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	98.971	Cebus_capucinus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	98.971	Cercocebus_atys
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	99.177	Chinchilla_lanigera
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.971	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	91	86.261	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.261	Choloepus_hoffmanni
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.045	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.045	Chrysemys_picta_bellii
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	77.949	ENSCING00000009372	-	100	77.641	Ciona_intestinalis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	99	77.902	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.599	Ciona_savignyi
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	98.971	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	98.868	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	98.868	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.564	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.181	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.956	ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	Danio_rerio
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.457	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.457	Dasypus_novemcinctus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	Dipodomys_ordii
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	Eptatretus_burgeri
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.177	Equus_asinus_asinus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.074	Equus_caballus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.741	Esox_lucius
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.074	Felis_catus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	97.531	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	Ficedula_albicollis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	Fukomys_damarensis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.284	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.947	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.358	Gadus_morhua
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	97.428	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.060	Gallus_gallus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.284	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.181	Gambusia_affinis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.667	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	98.971	Gorilla_gorilla
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.078	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.868	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.868	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.947	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.947	Hippocampus_comes
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.255	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.078	Ictalurus_punctatus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	93.107	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.107	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	96	98.825	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	98.825	Jaculus_jaculus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.770	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.461	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	95	91.694	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.824	Labrus_bergylta
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	93.930	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	Latimeria_chalumnae
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.975	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	91.975	Lepisosteus_oculatus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.457	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.457	Loxodonta_africana
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	98.971	Macaca_fascicularis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	98.971	Macaca_nemestrina
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	98.971	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.387	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.284	Mastacembelus_armatus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.181	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	97.331	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.331	Meleagris_gallopavo
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.074	Mesocricetus_auratus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	98.971	Microcebus_murinus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	92	81.236	ENSMOCG00000017653	-	90	81.236	Microtus_ochrogaster
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSMOCG00000009039	-	100	98.971	Microtus_ochrogaster
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	87	94.000	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	94.000	Mola_mola
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.868	Monodelphis_domestica
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	87	92.235	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.235	Monopterus_albus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	98.868	Mus_caroli
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	98.868	Mus_musculus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	98.868	Mus_pahari
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	98.868	Mus_spretus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	97	98.941	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	98.941	Mustela_putorius_furo
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.177	Myotis_lucifugus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.074	Nannospalax_galili
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.078	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	97	97.131	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.131	Nomascus_leucogenys
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	95.165	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.165	Notamacropus_eugenii
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.741	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.741	Ochotona_princeps
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSODEG00000018041	-	100	98.971	Octodon_degus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	93	79.885	ENSODEG00000003385	-	100	79.885	Octodon_degus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.181	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	98.971	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.461	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.461	Oryzias_latipes
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes_hni
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.355	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	96.811	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	96.811	Otolemur_garnettii
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.074	Ovis_aries
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.074	Pan_paniscus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.177	Panthera_pardus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.177	Panthera_tigris_altaica
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.074	Pan_troglodytes
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	98.971	Papio_anubis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	93	96.692	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.692	Pelodiscus_sinensis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	84.671	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.671	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.074	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	98.868	Phascolarctos_cinereus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.284	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.181	Poecilia_formosa
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.284	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.181	Poecilia_latipinna
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.284	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.181	Poecilia_mexicana
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	97.531	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.531	Pongo_abelii
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	94.650	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.650	Procavia_capensis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.868	Propithecus_coquereli
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	94.444	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.444	Pteropus_vampyrus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.078	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.872	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.593	Pygocentrus_nattereri
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	98.868	Rattus_norvegicus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.074	Rhinopithecus_bieti
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.074	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.074	Rhinopithecus_roxellana
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	97	34.190	YKL173W	SNU114	91	34.672	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	98.971	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	97	98.827	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	98.827	Sarcophilus_harrisii
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.564	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.255	Scleropages_formosus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.770	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.667	Scophthalmus_maximus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.284	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.387	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.329	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.329	Sorex_araneus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	96.914	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	96.914	Sphenodon_punctatus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.387	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.971	Sus_scrofa
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	84	96.837	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.837	Taeniopygia_guttata
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.358	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	86.885	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.680	Tetraodon_nigroviridis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	93.313	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.313	Tupaia_belangeri
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.535	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.535	Tursiops_truncatus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.455	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.455	Ursus_americanus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.177	Ursus_maritimus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	99.177	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.177	Vulpes_vulpes
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	97	94.456	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.756	Xenopus_tropicalis
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	81	93.622	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.622	Xiphophorus_couchianus
ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.284	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	Xiphophorus_maculatus