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Description

Ensembl ID: ENSCPOG00000011568 (Gene tree)
Gene ID: 100726664
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Cavia_porcellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 37469 bases
Position: chrDS562880.1:1542769-1580237
Accession: 100726664
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPOP00000010405	PAZ	PF02170.22	8.4e-29	1	1
ENSCPOP00000027610	PAZ	PF02170.22	8.4e-29	1	1
ENSCPOP00000010405	Piwi	PF02171.17	1.1e-110	1	1
ENSCPOP00000027610	Piwi	PF02171.17	1.1e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPOT00000036700	AGO1-201	3053	XM_003471377	ENSCPOP00000027610	857 (aa)	XP_003471425	A0A286XQ36
ENSCPOT00000011679	AGO1-202	2574	-	ENSCPOP00000010405	857 (aa)	-	H0VJH3

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCPOG00000011568	AGO1	98	82.009	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	82.009
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	80.556	ENSCPOG00000030524	AGO3	99	81.390
ENSCPOG00000011568	AGO1	98	83.890	ENSCPOG00000010428	AGO2	99	83.550

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSG00000092847	AGO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSAPOG00000024299	ago1	98	96.916	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPOG00000011568	AGO1	82	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSAOCG00000017727	ago1	98	96.916	Amphiprion_ocellaris
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.576	Amphiprion_percula
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSATEG00000008523	ago1	98	96.916	Anabas_testudineus
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	93.794	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.794	Anas_platyrhynchos
ENSCPOG00000011568	AGO1	91	99.872	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	95.921	ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	Astatotilapia_calliptera
ENSCPOG00000011568	AGO1	80	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	Bos_taurus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	100.000	Canis_familiaris
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	98.133	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.072	ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	Capra_hircus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	78.763	ENSTSYG00000032426	-	99	79.499	Carlito_syrichta
ENSCPOG00000011568	AGO1	89	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	100	93.111	Cavia_aperea
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.301	ENSCATG00000031521	AGO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPOG00000011568	AGO1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.767	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	Chrysemys_picta_bellii
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	94.780	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.780	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	95.921	ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	Cyprinodon_variegatus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.503	ENSDARG00000092644	ago1	99	96.145	Danio_rerio
ENSCPOG00000011568	AGO1	91	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSCPOG00000011568	AGO1	93	98.820	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSCPOG00000011568	AGO1	84	93.204	ENSETEG00000007626	AGO1	100	93.204	Echinops_telfairi
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	100	100.000	Equus_caballus
ENSCPOG00000011568	AGO1	92	91.614	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	Erinaceus_europaeus
ENSCPOG00000011568	AGO1	91	97.059	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	100.000	Felis_catus
ENSCPOG00000011568	AGO1	91	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	Fukomys_damarensis
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	92.680	ENSFHEG00000017927	ago1	99	93.001	Fundulus_heteroclitus
ENSCPOG00000011568	AGO1	87	84.646	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.646	Gadus_morhua
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.883	Gallus_gallus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.270	ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	Gambusia_affinis
ENSCPOG00000011568	AGO1	87	97.204	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPOG00000011568	AGO1	91	99.872	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	95.921	ENSHBUG00000010459	ago1	98	96.679	Haplochromis_burtoni
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	96.576	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.576	Hippocampus_comes
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSIPUG00000023216	ago1	98	96.686	Ictalurus_punctatus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.883	Jaculus_jaculus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSKMAG00000019464	ago1	99	96.576	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.270	ENSLBEG00000007694	ago1	98	96.916	Labrus_bergylta
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	93.522	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	Latimeria_chalumnae
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	94.056	ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	Lepisosteus_oculatus
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	100.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	Loxodonta_africana
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	95.289	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.255	Macaca_mulatta
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.033	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSMAMG00000008381	ago1	98	96.916	Mastacembelus_armatus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	95.921	ENSMZEG00005007996	ago1	98	96.679	Maylandia_zebra
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	94.296	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	Meleagris_gallopavo
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSMICG00000016147	AGO1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.883	Microtus_ochrogaster
ENSCPOG00000011568	AGO1	78	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.650	ENSMODG00000023335	AGO1	100	99.650	Monodelphis_domestica
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	96.458	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.797	Monopterus_albus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	Mus_caroli
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	100.000	Mus_musculus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	100.000	Mus_pahari
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	100.000	Mus_spretus
ENSCPOG00000011568	AGO1	84	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSCPOG00000011568	AGO1	61	99.617	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.617	Myotis_lucifugus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.767	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.767	Nannospalax_galili
ENSCPOG00000011568	AGO1	91	97.059	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	Nomascus_leucogenys
ENSCPOG00000011568	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSCPOG00000011568	AGO1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSODEG00000005321	AGO1	100	100.000	Octodon_degus
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	96.340	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	Oreochromis_niloticus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	91.003	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.977	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.883	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSORLG00000014965	ago1	99	96.576	Oryzias_latipes
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSORLG00020018253	ago1	99	96.576	Oryzias_latipes_hni
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSORLG00015003287	ago1	99	96.576	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.154	ENSOMEG00000020528	ago1	99	96.576	Oryzias_melastigma
ENSCPOG00000011568	AGO1	99	100.000	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	100.000	Otolemur_garnettii
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.883	Ovis_aries
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	100.000	Pan_paniscus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	100.000	Panthera_pardus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.767	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.767	Panthera_tigris_altaica
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSPANG00000009060	AGO1	100	100.000	Papio_anubis
ENSCPOG00000011568	AGO1	98	99.050	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	Pelodiscus_sinensis
ENSCPOG00000011568	AGO1	80	97.384	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.650	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	Phascolarctos_cinereus
ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.270	ENSPFOG00000005867	ago1	99	96.694	Poecilia_formosa
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