EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCPOG00000027406 (Gene tree)
Gene ID: 100728426
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cavia_porcellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2205 bases
Position: chrDS562884.1:9115366-9117570
Accession: 100728426
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCPOP00000015678	eRF1_2	PF03464.15	2.1e-37	1	1
ENSCPOP00000015678	eRF1_3	PF03465.15	7.4e-27	1	1
ENSCPOP00000015678	eRF1_1	PF03463.15	1.4e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCPOT00000026072	PELO-201	1938	XM_003470189	ENSCPOP00000015678	385 (aa)	XP_003470237	H0VY96

Gene Model

Click here to download ENSCPOG00000027406's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCPOG00000027406's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.182	ENSG00000152684	PELO	100	98.182	Homo_sapiens
ENSCPOG00000027406	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.000	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPOG00000027406	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	ENSAMEG00000007734	PELO	100	98.961	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCPOG00000027406	PELO	97	77.480	ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	Amphilophus_citrinellus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.260	Amphiprion_ocellaris
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.260	Amphiprion_percula
ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.818	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.818	Anabas_testudineus
ENSCPOG00000027406	PELO	77	85.235	ENSAPLG00000013265	PELO	100	85.235	Anas_platyrhynchos
ENSCPOG00000027406	PELO	98	90.691	ENSACAG00000004352	PELO	100	90.390	Anolis_carolinensis
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	ENSANAG00000014096	PELO	100	98.961	Aotus_nancymaae
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	Astatotilapia_calliptera
ENSCPOG00000027406	PELO	97	81.501	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.829	Astyanax_mexicanus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.961	Bos_taurus
ENSCPOG00000027406	PELO	99	58.530	WBGene00011280	pelo-1	100	58.530	Caenorhabditis_elegans
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	ENSCJAG00000035190	PELO	100	98.961	Callithrix_jacchus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.221	ENSCAFG00020023234	PELO	100	99.221	Canis_lupus_dingo
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.701	Capra_hircus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	ENSTSYG00000005203	PELO	100	98.961	Carlito_syrichta
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	ENSCCAG00000035600	PELO	100	98.961	Cebus_capucinus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSCATG00000011829	PELO	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.481	ENSCLAG00000005043	PELO	100	99.481	Chinchilla_lanigera
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	Chlorocebus_sabaeus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.182	ENSCHOG00000000523	PELO	100	98.182	Choloepus_hoffmanni
ENSCPOG00000027406	PELO	98	94.149	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.766	Chrysemys_picta_bellii
ENSCPOG00000027406	PELO	97	69.169	ENSCING00000001979	-	100	69.610	Ciona_intestinalis
ENSCPOG00000027406	PELO	100	70.390	ENSCSAVG00000006158	-	100	70.390	Ciona_savignyi
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSCANG00000023382	PELO	100	98.701	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	96.104	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.104	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCPOG00000027406	PELO	100	97.403	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.403	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	ENSCSEG00000008807	pelo	100	80.260	Cynoglossus_semilaevis
ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.078	ENSCVAG00000016082	pelo	100	82.078	Cyprinodon_variegatus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.818	ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	Danio_rerio
ENSCPOG00000027406	PELO	100	95.337	ENSDNOG00000036721	PELO	100	95.337	Dasypus_novemcinctus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSDORG00000016689	Pelo	100	98.701	Dipodomys_ordii
ENSCPOG00000027406	PELO	96	67.655	FBgn0011207	pelo	96	67.546	Drosophila_melanogaster
ENSCPOG00000027406	PELO	71	81.287	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	Eptatretus_burgeri
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.701	Equus_asinus_asinus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.779	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.779	Esox_lucius
ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.221	ENSFCAG00000032341	PELO	100	99.221	Felis_catus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	95.065	ENSFALG00000004559	PELO	100	95.065	Ficedula_albicollis
ENSCPOG00000027406	PELO	74	98.592	ENSFDAG00000002076	PELO	88	98.592	Fukomys_damarensis
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.260	Fundulus_heteroclitus
ENSCPOG00000027406	PELO	98	80.371	ENSGMOG00000005849	pelo	100	80.260	Gadus_morhua
ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.299	ENSGAFG00000019350	pelo	100	81.299	Gambusia_affinis
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.779	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.779	Gasterosteus_aculeatus
ENSCPOG00000027406	PELO	98	94.415	ENSGAGG00000004018	PELO	100	94.026	Gopherus_agassizii
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSGGOG00000012635	PELO	100	98.701	Gorilla_gorilla
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	Haplochromis_burtoni
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	ENSHGLG00000005932	PELO	100	98.961	Heterocephalus_glaber_female
ENSCPOG00000027406	PELO	100	96.623	ENSHGLG00100017627	PELO	100	96.623	Heterocephalus_glaber_male
ENSCPOG00000027406	PELO	100	77.922	ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.922	Hippocampus_comes
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.000	ENSIPUG00000020627	pelo	100	80.000	Ictalurus_punctatus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.481	ENSSTOG00000027378	PELO	100	99.481	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	95.065	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	95.065	Jaculus_jaculus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.078	ENSKMAG00000021305	pelo	100	82.078	Kryptolebias_marmoratus
ENSCPOG00000027406	PELO	99	80.729	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.729	Labrus_bergylta
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.701	Loxodonta_africana
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSMFAG00000000651	PELO	100	98.701	Macaca_fascicularis
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSMMUG00000039101	PELO	100	98.701	Macaca_mulatta
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSMNEG00000035538	PELO	100	98.701	Macaca_nemestrina
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSMLEG00000039113	PELO	100	98.701	Mandrillus_leucophaeus
ENSCPOG00000027406	PELO	97	83.110	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.857	Mastacembelus_armatus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	ENSMZEG00005014258	pelo	100	80.260	Maylandia_zebra
ENSCPOG00000027406	PELO	100	97.403	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	97.403	Mesocricetus_auratus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	ENSMICG00000044040	PELO	100	98.961	Microcebus_murinus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	97.922	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.922	Microtus_ochrogaster
ENSCPOG00000027406	PELO	100	79.221	ENSMMOG00000001324	pelo	100	79.221	Mola_mola
ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.078	ENSMALG00000008194	pelo	100	82.078	Monopterus_albus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.182	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	98.182	Mus_caroli
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.182	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	98.182	Mus_musculus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.442	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	98.442	Mus_pahari
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.182	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	98.182	Mus_spretus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	95.584	ENSMLUG00000024132	PELO	100	95.584	Myotis_lucifugus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.182	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	98.182	Nannospalax_galili
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	Neolamprologus_brichardi
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSNLEG00000035970	PELO	100	98.701	Nomascus_leucogenys
ENSCPOG00000027406	PELO	100	94.545	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.545	Notamacropus_eugenii
ENSCPOG00000027406	PELO	98	97.889	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.889	Ochotona_princeps
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.442	ENSODEG00000017579	PELO	100	98.442	Octodon_degus
ENSCPOG00000027406	PELO	96	80.541	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.260	Oreochromis_niloticus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.442	ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.442	Oryctolagus_cuniculus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.299	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes
ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.558	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes_hni
ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.818	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.818	Oryzias_latipes_hsok
ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.338	ENSOMEG00000021567	pelo	100	82.338	Oryzias_melastigma
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.182	ENSOGAG00000027940	PELO	100	98.182	Otolemur_garnettii
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	ENSOARG00000008324	PELO	99	98.961	Ovis_aries
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSPPAG00000038951	PELO	100	98.701	Pan_paniscus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.221	ENSPPRG00000018800	PELO	100	99.221	Panthera_pardus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.221	ENSPTIG00000019988	PELO	100	99.221	Panthera_tigris_altaica
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.442	ENSPTRG00000034409	PELO	100	98.442	Pan_troglodytes
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSPANG00000010902	PELO	100	98.701	Papio_anubis
ENSCPOG00000027406	PELO	100	83.117	ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.117	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCPOG00000027406	PELO	98	93.883	ENSPSIG00000004971	PELO	100	93.506	Pelodiscus_sinensis
ENSCPOG00000027406	PELO	67	78.682	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.682	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	97.922	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.922	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCPOG00000027406	PELO	100	96.883	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.883	Phascolarctos_cinereus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.078	ENSPFOG00000007277	pelo	100	82.078	Poecilia_formosa
ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.338	ENSPLAG00000020787	pelo	100	82.338	Poecilia_latipinna
ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.078	ENSPMEG00000016964	pelo	100	82.078	Poecilia_mexicana
ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.338	ENSPREG00000023071	pelo	100	82.338	Poecilia_reticulata
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.442	ENSPPYG00000015451	PELO	96	98.442	Pongo_abelii
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.961	ENSPCOG00000021178	PELO	100	98.961	Propithecus_coquereli
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.260	Pundamilia_nyererei
ENSCPOG00000027406	PELO	97	82.038	ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.779	Pygocentrus_nattereri
ENSCPOG00000027406	PELO	100	97.922	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.922	Rattus_norvegicus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSRBIG00000007299	PELO	100	98.701	Rhinopithecus_bieti
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSRROG00000035507	PELO	100	98.701	Rhinopithecus_roxellana
ENSCPOG00000027406	PELO	98	34.805	YNL001W	-	98	34.805	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSSBOG00000036140	PELO	100	98.701	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCPOG00000027406	PELO	63	95.492	ENSSHAG00000010770	PELO	100	95.492	Sarcophilus_harrisii
ENSCPOG00000027406	PELO	98	83.820	ENSSFOG00015013399	pelo	100	83.636	Scleropages_formosus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	ENSSMAG00000017171	pelo	100	80.260	Scophthalmus_maximus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.779	ENSSDUG00000022938	pelo	100	80.779	Seriola_dumerili
ENSCPOG00000027406	PELO	100	77.143	ENSSLDG00000017884	pelo	100	77.143	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCPOG00000027406	PELO	98	92.553	ENSSPUG00000005545	PELO	100	92.208	Sphenodon_punctatus
ENSCPOG00000027406	PELO	98	81.167	ENSSPAG00000008501	pelo	100	81.039	Stegastes_partitus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	97.403	ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.403	Sus_scrofa
ENSCPOG00000027406	PELO	100	95.065	ENSTGUG00000002416	PELO	100	95.065	Taeniopygia_guttata
ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.000	ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.000	Takifugu_rubripes
ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.299	ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.299	Tetraodon_nigroviridis
ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	ENSTTRG00000001857	PELO	100	98.701	Tursiops_truncatus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.481	ENSUAMG00000002535	PELO	100	99.481	Ursus_americanus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.481	ENSUMAG00000005809	PELO	100	99.481	Ursus_maritimus
ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.221	ENSVPAG00000001113	PELO	100	99.221	Vicugna_pacos
ENSCPOG00000027406	PELO	100	99.221	ENSVVUG00000025499	PELO	100	99.221	Vulpes_vulpes
ENSCPOG00000027406	PELO	81	81.613	ENSXETG00000018368	pelo	100	79.755	Xenopus_tropicalis
ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.338	ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.338	Xiphophorus_maculatus