EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCSAG00000000948 (Gene tree)
Gene ID: 103225362
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Chlorocebus_sabaeus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10097 bases
Position: chr20:107468940-107479036
Accession: 103225362
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSAP00000017060	SYF2	PF08231.12	3.6e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSAT00000017585	SYF2-201	1540	-	ENSCSAP00000017060	243 (aa)	XP_007978185	A0A0D9S871

Gene Model

Click here to download ENSCSAG00000000948's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
csab03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCSAG00000000948's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.119	ENSG00000117614	SYF2	100	97.119	Homo_sapiens
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	83.562	ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.085	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSAG00000000948	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSAG00000000948	SYF2	98	91.701	ENSAMEG00000010115	-	99	91.701	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.822	ENSACIG00000023688	syf2	94	76.170	Amphilophus_citrinellus
ENSCSAG00000000948	SYF2	95	80.508	ENSAOCG00000022046	syf2	98	81.385	Amphiprion_ocellaris
ENSCSAG00000000948	SYF2	88	78.995	ENSAOCG00000010912	syf2	68	78.995	Amphiprion_ocellaris
ENSCSAG00000000948	SYF2	95	80.508	ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.508	Amphiprion_percula
ENSCSAG00000000948	SYF2	89	82.488	ENSATEG00000007745	syf2	99	78.814	Anabas_testudineus
ENSCSAG00000000948	SYF2	82	88.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.000	Anas_platyrhynchos
ENSCSAG00000000948	SYF2	68	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSCSAG00000000948	SYF2	84	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	96.708	ENSANAG00000032473	SYF2	100	96.708	Aotus_nancymaae
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.365	ENSACLG00000019916	syf2	100	75.630	Astatotilapia_calliptera
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	76.860	ENSAMXG00000004051	syf2	99	76.860	Astyanax_mexicanus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.429	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	Bos_taurus
ENSCSAG00000000948	SYF2	86	51.905	WBGene00019402	syf-2	99	46.781	Caenorhabditis_elegans
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.119	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	97.119	Callithrix_jacchus
ENSCSAG00000000948	SYF2	91	88.288	ENSCAFG00000030331	-	95	88.288	Canis_familiaris
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	92.213	ENSCAFG00000012895	-	99	92.213	Canis_familiaris
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	92.213	ENSCAFG00020021091	-	99	92.213	Canis_lupus_dingo
ENSCSAG00000000948	SYF2	74	87.912	ENSCAFG00020021094	-	83	96.154	Canis_lupus_dingo
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.535	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	92.469	Capra_hircus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	92.593	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.593	Carlito_syrichta
ENSCSAG00000000948	SYF2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	92.593	ENSCPOG00000005326	SYF2	99	92.593	Cavia_porcellus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.119	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	97.119	Cebus_capucinus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	99.177	ENSCATG00000026917	SYF2	100	99.177	Cercocebus_atys
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	93.852	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.852	Chinchilla_lanigera
ENSCSAG00000000948	SYF2	70	78.698	ENSCHOG00000005273	-	93	78.698	Choloepus_hoffmanni
ENSCSAG00000000948	SYF2	92	89.286	ENSCPBG00000025073	SYF2	92	88.158	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSAG00000000948	SYF2	87	53.991	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSCSAG00000000948	SYF2	87	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	86.008	ENSCANG00000037322	SYF2	100	86.008	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	90.456	ENSCGRG00001020733	Syf2	99	90.456	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSAG00000000948	SYF2	81	95.408	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.455	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	91	77.982	Cynoglossus_semilaevis
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.822	ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.215	Cyprinodon_variegatus
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	77.917	ENSDARG00000004706	syf2	100	77.917	Danio_rerio
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	93.004	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	93.004	Dasypus_novemcinctus
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	91.322	ENSDORG00000001274	Syf2	99	91.322	Dipodomys_ordii
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	55.909	FBgn0033556	CG12343	97	54.091	Drosophila_melanogaster
ENSCSAG00000000948	SYF2	94	75.983	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	Echinops_telfairi
ENSCSAG00000000948	SYF2	81	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	80.658	ENSEASG00005004232	-	100	80.658	Equus_asinus_asinus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.612	ENSEASG00005004224	-	100	90.612	Equus_asinus_asinus
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	91.736	ENSECAG00000010440	-	99	91.736	Equus_caballus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.020	ENSECAG00000012023	-	100	91.020	Equus_caballus
ENSCSAG00000000948	SYF2	75	79.781	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.781	Erinaceus_europaeus
ENSCSAG00000000948	SYF2	96	79.412	ENSELUG00000003465	syf2	100	79.412	Esox_lucius
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	93.061	ENSFCAG00000010324	-	85	93.061	Felis_catus
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	92.623	ENSFCAG00000043095	-	99	92.623	Felis_catus
ENSCSAG00000000948	SYF2	84	84.314	ENSFALG00000000460	SYF2	92	81.223	Ficedula_albicollis
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	92.593	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	Fukomys_damarensis
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	66.364	ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.364	Fundulus_heteroclitus
ENSCSAG00000000948	SYF2	88	83.721	ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	Gadus_morhua
ENSCSAG00000000948	SYF2	92	87.054	ENSGALG00000013639	SYF2	99	81.200	Gallus_gallus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	73.663	ENSGAFG00000019435	syf2	100	73.663	Gambusia_affinis
ENSCSAG00000000948	SYF2	88	82.791	ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSAG00000000948	SYF2	92	88.839	ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	Gopherus_agassizii
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.531	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	97.531	Gorilla_gorilla
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.365	ENSHBUG00000020477	syf2	94	80.365	Haplochromis_burtoni
ENSCSAG00000000948	SYF2	93	83.260	ENSHGLG00000004304	-	99	79.167	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	93.033	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.033	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	93.033	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.033	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSAG00000000948	SYF2	98	76.763	ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.763	Hippocampus_comes
ENSCSAG00000000948	SYF2	98	77.637	ENSIPUG00000019859	syf2	99	78.298	Ictalurus_punctatus
ENSCSAG00000000948	SYF2	60	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSAG00000000948	SYF2	82	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSCSAG00000000948	SYF2	95	77.447	ENSKMAG00000013856	syf2	99	77.447	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	82.192	ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	Labrus_bergylta
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	80.417	ENSLACG00000012064	SYF2	99	80.417	Latimeria_chalumnae
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	78.750	ENSLOCG00000002728	syf2	94	78.750	Lepisosteus_oculatus
ENSCSAG00000000948	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.837	ENSLAFG00000023150	-	100	91.837	Loxodonta_africana
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	99.588	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	99.588	Macaca_fascicularis
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	99.177	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	99.177	Macaca_mulatta
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	99.588	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	99.588	Macaca_nemestrina
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	99.177	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	99.177	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSAG00000000948	SYF2	89	80.645	ENSMAMG00000010403	syf2	98	75.000	Mastacembelus_armatus
ENSCSAG00000000948	SYF2	95	77.119	ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.119	Maylandia_zebra
ENSCSAG00000000948	SYF2	82	88.442	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.442	Meleagris_gallopavo
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.123	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.123	Mesocricetus_auratus
ENSCSAG00000000948	SYF2	82	97.487	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.947	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	90.947	Microtus_ochrogaster
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	78.995	ENSMMOG00000002396	syf2	92	78.995	Mola_mola
ENSCSAG00000000948	SYF2	93	88.106	ENSMODG00000013951	-	99	88.106	Monodelphis_domestica
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	81.364	ENSMALG00000010706	syf2	91	80.909	Monopterus_albus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.574	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	90.574	Mus_caroli
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.574	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	90.574	Mus_musculus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.574	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	90.574	Mus_pahari
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.574	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	90.574	Mus_spretus
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	92.623	ENSMPUG00000015802	-	99	92.623	Mustela_putorius_furo
ENSCSAG00000000948	SYF2	98	92.917	ENSMPUG00000015801	-	98	92.917	Mustela_putorius_furo
ENSCSAG00000000948	SYF2	98	92.437	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.437	Myotis_lucifugus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.057	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	91.057	Nannospalax_galili
ENSCSAG00000000948	SYF2	97	70.293	ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.293	Neolamprologus_brichardi
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.942	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	97.942	Nomascus_leucogenys
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.535	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	90.535	Ochotona_princeps
ENSCSAG00000000948	SYF2	96	94.421	ENSODEG00000017664	-	98	94.421	Octodon_degus
ENSCSAG00000000948	SYF2	96	84.549	ENSODEG00000014338	-	98	84.549	Octodon_degus
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.365	ENSONIG00000008213	syf2	100	75.630	Oreochromis_niloticus
ENSCSAG00000000948	SYF2	83	89.604	ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.604	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	94.262	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	Oryctolagus_cuniculus
ENSCSAG00000000948	SYF2	95	78.696	ENSORLG00000028820	syf2	99	78.696	Oryzias_latipes
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	76.667	ENSORLG00020018333	syf2	100	76.667	Oryzias_latipes_hni
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	76.250	ENSORLG00015014665	syf2	100	76.250	Oryzias_latipes_hsok
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	82.648	ENSOMEG00000013911	syf2	92	82.648	Oryzias_melastigma
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	93.388	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.388	Otolemur_garnettii
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.498	ENSOARG00000006348	-	100	91.498	Ovis_aries
ENSCSAG00000000948	SYF2	80	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	66.154	Ovis_aries
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.531	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	97.531	Pan_paniscus
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	92.623	ENSPPRG00000001651	-	99	92.623	Panthera_pardus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	92.683	ENSPPRG00000001638	-	100	92.683	Panthera_pardus
ENSCSAG00000000948	SYF2	94	95.197	ENSPTIG00000005711	-	83	95.197	Panthera_tigris_altaica
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	92.213	ENSPTIG00000007036	-	99	92.213	Panthera_tigris_altaica
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.531	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.531	Pan_troglodytes
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	99.588	ENSPANG00000008139	SYF2	100	99.588	Papio_anubis
ENSCSAG00000000948	SYF2	95	79.828	ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCSAG00000000948	SYF2	94	86.404	ENSPSIG00000011816	SYF2	89	86.404	Pelodiscus_sinensis
ENSCSAG00000000948	SYF2	97	77.119	ENSPMGG00000008755	syf2	92	77.119	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.535	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.535	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCSAG00000000948	SYF2	93	93.333	ENSPCIG00000014235	SYF2	91	92.544	Phascolarctos_cinereus
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	79.358	ENSPFOG00000004116	syf2	90	79.358	Poecilia_formosa
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	79.358	ENSPLAG00000006691	syf2	94	79.358	Poecilia_latipinna
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	71.605	ENSPMEG00000011684	syf2	100	71.605	Poecilia_mexicana
ENSCSAG00000000948	SYF2	89	80.093	ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	Poecilia_reticulata
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	97.942	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	97.942	Pongo_abelii
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	62.963	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.551	Propithecus_coquereli
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	80.658	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	80.658	Pteropus_vampyrus
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.365	ENSPNYG00000004979	syf2	92	80.365	Pundamilia_nyererei
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	78.601	ENSPNAG00000015570	syf2	100	78.601	Pygocentrus_nattereri
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.574	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	90.574	Rattus_norvegicus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	96.708	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	96.708	Rhinopithecus_bieti
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	99.588	ENSRROG00000001347	SYF2	100	99.588	Rhinopithecus_roxellana
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	96.296	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	96.296	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCSAG00000000948	SYF2	93	91.556	ENSSHAG00000015630	-	92	90.789	Sarcophilus_harrisii
ENSCSAG00000000948	SYF2	82	94.472	ENSSHAG00000007152	-	97	94.472	Sarcophilus_harrisii
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	76.955	ENSSFOG00015023647	syf2	96	80.617	Scleropages_formosus
ENSCSAG00000000948	SYF2	95	77.119	ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.119	Scophthalmus_maximus
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	82.569	ENSSDUG00000013072	syf2	92	82.569	Seriola_dumerili
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	82.569	ENSSLDG00000012677	syf2	92	82.569	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	73.361	ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.361	Sorex_araneus
ENSCSAG00000000948	SYF2	95	85.714	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	85.714	Sphenodon_punctatus
ENSCSAG00000000948	SYF2	95	79.237	ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	Stegastes_partitus
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	89.388	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	89.388	Sus_scrofa
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.275	ENSTRUG00000001499	syf2	88	80.275	Takifugu_rubripes
ENSCSAG00000000948	SYF2	90	79.358	ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	Tetraodon_nigroviridis
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	70.782	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.547	Tupaia_belangeri
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.393	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	Tursiops_truncatus
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	91.393	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	91.393	Ursus_americanus
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	91.803	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	91.803	Ursus_maritimus
ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.393	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	Vicugna_pacos
ENSCSAG00000000948	SYF2	99	92.213	ENSVVUG00000027175	-	99	92.213	Vulpes_vulpes
ENSCSAG00000000948	SYF2	84	96.098	ENSVVUG00000027181	-	100	89.113	Vulpes_vulpes
ENSCSAG00000000948	SYF2	96	81.545	ENSXETG00000022797	syf2	94	81.545	Xenopus_tropicalis
ENSCSAG00000000948	SYF2	88	80.465	ENSXMAG00000022698	syf2	92	79.358	Xiphophorus_maculatus