EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCSAG00000002265 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chlorocebus_sabaeus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17763 bases
Position: chr11:115701408-115719170
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSAP00000015771	RRM_1	PF00076.22	1.5e-34	1	2
ENSCSAP00000015771	RRM_1	PF00076.22	1.5e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSAT00000000284	MSI1-201	972	-	ENSCSAP00000015771	290 (aa)	-	A0A0D9S4I2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCSAG00000002265	MSI1	64	40.887	ENSCSAG00000006389	-	56	41.315
ENSCSAG00000002265	MSI1	59	46.784	ENSCSAG00000004463	HNRNPD	66	41.079
ENSCSAG00000002265	MSI1	60	49.133	ENSCSAG00000004461	HNRNPDL	58	39.271
ENSCSAG00000002265	MSI1	61	43.750	ENSCSAG00000005140	-	64	43.750
ENSCSAG00000002265	MSI1	62	42.308	ENSCSAG00000005436	-	65	39.004
ENSCSAG00000002265	MSI1	63	38.919	ENSCSAG00000018870	-	76	36.626
ENSCSAG00000002265	MSI1	63	39.344	ENSCSAG00000010220	-	78	37.083
ENSCSAG00000002265	MSI1	81	36.842	ENSCSAG00000015503	RBM38	57	36.842
ENSCSAG00000002265	MSI1	54	40.260	ENSCSAG00000012245	CIRBP	87	40.260
ENSCSAG00000002265	MSI1	64	38.421	ENSCSAG00000004770	-	71	38.421
ENSCSAG00000002265	MSI1	61	33.146	ENSCSAG00000011517	-	56	31.696
ENSCSAG00000002265	MSI1	53	34.211	ENSCSAG00000011736	SLIRP	72	34.211
ENSCSAG00000002265	MSI1	85	77.733	ENSCSAG00000005633	MSI2	74	77.733
ENSCSAG00000002265	MSI1	58	43.860	ENSCSAG00000000499	HNRNPA0	60	42.541
ENSCSAG00000002265	MSI1	61	38.202	ENSCSAG00000019724	-	60	38.220
ENSCSAG00000002265	MSI1	62	41.989	ENSCSAG00000014797	-	78	39.419
ENSCSAG00000002265	MSI1	58	33.735	ENSCSAG00000019136	-	54	33.735
ENSCSAG00000002265	MSI1	61	43.750	ENSCSAG00000014175	HNRNPA2B1	64	43.750
ENSCSAG00000002265	MSI1	63	39.674	ENSCSAG00000000148	-	65	36.100
ENSCSAG00000002265	MSI1	60	48.555	ENSCSAG00000002626	-	62	48.555
ENSCSAG00000002265	MSI1	63	38.587	ENSCSAG00000000627	-	75	36.515
ENSCSAG00000002265	MSI1	64	40.887	ENSCSAG00000014399	-	70	38.258
ENSCSAG00000002265	MSI1	62	41.209	ENSCSAG00000018616	-	72	37.607
ENSCSAG00000002265	MSI1	66	41.346	ENSCSAG00000012126	DAZAP1	51	41.346
ENSCSAG00000002265	MSI1	58	33.735	ENSCSAG00000000785	-	54	33.735

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSG00000135097	MSI1	75	100.000	Homo_sapiens
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	82.437	ENSAPOG00000003191	MSI1	78	82.437	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	83.755	ENSAPOG00000023458	-	78	83.755	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSAG00000002265	MSI1	77	100.000	ENSAMEG00000013302	MSI1	58	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSAG00000002265	MSI1	88	81.496	ENSACIG00000017754	-	64	90.000	Amphilophus_citrinellus
ENSCSAG00000002265	MSI1	55	77.778	ENSACIG00000018210	zgc:110796	98	77.778	Amphilophus_citrinellus
ENSCSAG00000002265	MSI1	82	88.186	ENSAOCG00000009031	-	72	88.186	Amphiprion_ocellaris
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	82.437	ENSAOCG00000003804	MSI1	78	82.437	Amphiprion_ocellaris
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	82.437	ENSAPEG00000003245	MSI1	78	82.437	Amphiprion_percula
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	83.755	ENSAPEG00000006857	-	65	83.755	Amphiprion_percula
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	79.152	ENSATEG00000017059	MSI1	74	83.200	Anabas_testudineus
ENSCSAG00000002265	MSI1	84	83.401	ENSATEG00000023779	-	70	83.401	Anabas_testudineus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	94.245	ENSACAG00000002762	MSI1	75	94.245	Anolis_carolinensis
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	92.419	ENSANAG00000027901	-	83	92.419	Aotus_nancymaae
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSANAG00000027151	MSI1	75	96.390	Aotus_nancymaae
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	ENSACLG00000000117	-	78	84.116	Astatotilapia_calliptera
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	81.720	ENSACLG00000011230	MSI1	97	66.387	Astatotilapia_calliptera
ENSCSAG00000002265	MSI1	85	86.441	ENSAMXG00000038960	msi1	59	86.441	Astyanax_mexicanus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSBTAG00000009800	MSI1	75	96.390	Bos_taurus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSCJAG00000008578	MSI1	75	96.390	Callithrix_jacchus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.029	ENSCAFG00000010283	MSI1	75	96.029	Canis_familiaris
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.575	ENSCAFG00020020585	MSI1	71	95.575	Canis_lupus_dingo
ENSCSAG00000002265	MSI1	84	100.000	ENSCHIG00000024304	MSI1	67	100.000	Capra_hircus
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.868	ENSTSYG00000033949	MSI1	68	95.868	Carlito_syrichta
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	94.681	ENSCAPG00000003919	MSI1	52	94.681	Cavia_aperea
ENSCSAG00000002265	MSI1	94	93.040	ENSCPOG00000012361	MSI1	73	96.109	Cavia_porcellus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSCCAG00000035567	MSI1	75	96.390	Cebus_capucinus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSCATG00000030019	MSI1	75	96.390	Cercocebus_atys
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	91.727	ENSCLAG00000011329	MSI1	73	96.109	Chinchilla_lanigera
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	94.946	ENSCPBG00000011349	MSI1	77	94.946	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.885	ENSCANG00000040651	MSI1	72	95.885	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSCGRG00001018883	Msi1	75	96.390	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.902	ENSCGRG00000002191	Msi1	52	95.902	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSAG00000002265	MSI1	77	86.547	ENSCSEG00000011032	MSI1	72	86.547	Cynoglossus_semilaevis
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	81.720	ENSCSEG00000005834	-	78	81.720	Cynoglossus_semilaevis
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	83.394	ENSCSEG00000008352	-	74	88.115	Cynoglossus_semilaevis
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	ENSCVAG00000009100	MSI1	74	88.934	Cyprinodon_variegatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	50	57.534	ENSCVAG00000017463	-	53	57.534	Cyprinodon_variegatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	61	61.194	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	61.194	Cyprinodon_variegatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	87	86.413	ENSDARG00000010710	msi1	86	86.413	Danio_rerio
ENSCSAG00000002265	MSI1	71	81.250	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	58	81.250	Danio_rerio
ENSCSAG00000002265	MSI1	50	86.667	ENSDARG00000041299	zgc:110796	98	78.261	Danio_rerio
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.902	ENSDNOG00000005713	MSI1	69	95.902	Dasypus_novemcinctus
ENSCSAG00000002265	MSI1	93	90.335	ENSDORG00000005610	Msi1	74	90.335	Dipodomys_ordii
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.473	ENSETEG00000004756	MSI1	72	95.473	Echinops_telfairi
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSEASG00005004736	MSI1	75	96.390	Equus_asinus_asinus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSECAG00000017526	MSI1	75	96.390	Equus_caballus
ENSCSAG00000002265	MSI1	84	86.364	ENSELUG00000023280	-	75	86.364	Esox_lucius
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	81.481	ENSELUG00000023219	MSI1	70	82.510	Esox_lucius
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSFCAG00000011007	MSI1	75	96.390	Felis_catus
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	94.690	ENSFALG00000007574	MSI1	73	94.690	Ficedula_albicollis
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.473	ENSFDAG00000019586	MSI1	72	95.473	Fukomys_damarensis
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	ENSFHEG00000022446	MSI1	78	84.116	Fundulus_heteroclitus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	82.796	ENSFHEG00000003560	-	78	82.796	Fundulus_heteroclitus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	ENSGMOG00000001006	MSI1	82	81.034	Gadus_morhua
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	74.101	ENSGMOG00000017838	-	77	74.101	Gadus_morhua
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	94.585	ENSGALG00000007227	MSI1	68	94.585	Gallus_gallus
ENSCSAG00000002265	MSI1	84	65.587	ENSGAFG00000005860	-	74	65.060	Gambusia_affinis
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	85.214	ENSGAFG00000021522	MSI1	70	91.518	Gambusia_affinis
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	77.617	ENSGACG00000008674	-	75	77.617	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	ENSGACG00000012679	MSI1	76	88.934	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	94.585	ENSGAGG00000016037	MSI1	77	94.585	Gopherus_agassizii
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.633	ENSGGOG00000010328	MSI1	71	95.633	Gorilla_gorilla
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	ENSHBUG00000011841	-	78	84.116	Haplochromis_burtoni
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	81.720	ENSHBUG00000021921	MSI1	78	81.720	Haplochromis_burtoni
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.029	ENSHGLG00000012782	MSI1	75	96.029	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.473	ENSHGLG00100016848	MSI1	72	95.473	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	77.936	ENSHCOG00000012067	-	77	90.678	Hippocampus_comes
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	83.984	ENSHCOG00000012019	MSI1	73	90.135	Hippocampus_comes
ENSCSAG00000002265	MSI1	94	82.418	ENSIPUG00000001976	msi1	78	82.418	Ictalurus_punctatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.575	ENSSTOG00000009799	MSI1	71	95.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSJJAG00000010463	Msi1	75	96.390	Jaculus_jaculus
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.753	ENSJJAG00000010643	-	79	95.753	Jaculus_jaculus
ENSCSAG00000002265	MSI1	77	92.377	ENSKMAG00000019877	-	73	92.377	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	83.755	ENSKMAG00000011251	MSI1	78	83.755	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	81.362	ENSLBEG00000001375	-	78	81.362	Labrus_bergylta
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.477	ENSLBEG00000008789	MSI1	74	89.344	Labrus_bergylta
ENSCSAG00000002265	MSI1	81	91.026	ENSLACG00000018287	MSI1	69	91.026	Latimeria_chalumnae
ENSCSAG00000002265	MSI1	62	70.000	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	70.000	Lepisosteus_oculatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	84	81.707	ENSLAFG00000009412	MSI1	71	85.253	Loxodonta_africana
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	96.109	ENSMFAG00000001798	MSI1	73	96.109	Macaca_fascicularis
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	91.336	ENSMMUG00000031527	MSI1	74	91.336	Macaca_mulatta
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.390	ENSMNEG00000040034	MSI1	75	96.390	Macaca_nemestrina
ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.885	ENSMLEG00000003921	MSI1	72	95.885	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	ENSMAMG00000002279	MSI1	78	84.116	Mastacembelus_armatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	91	85.606	ENSMAMG00000018426	-	78	82.796	Mastacembelus_armatus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	81.720	ENSMZEG00005026892	MSI1	78	81.720	Maylandia_zebra
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	84.116	ENSMZEG00005000340	-	74	88.934	Maylandia_zebra
ENSCSAG00000002265	MSI1	80	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSCSAG00000002265	MSI1	88	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSCSAG00000002265	MSI1	95	98.551	ENSMICG00000033181	MSI1	79	98.551	Microcebus_murinus
ENSCSAG00000002265	MSI1	96	96.029	ENSMOCG00000002286	Msi1	75	96.029	Microtus_ochrogaster
ENSCSAG00000002265	MSI1	77	87.215	ENSMMOG00000012265	-	71	87.215	Mola_mola
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