EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCSAG00000002271 (Gene tree)
Gene ID: 103248787
Gene Symbol: SRPRA
Alias: SR-alpha|SRP-alpha|SRPR|Sralpha
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Chlorocebus_sabaeus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7372 bases
Position: chr1:117387044-117394415
Accession: 103248787
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSAP00000015765	SRP54	PF00448.22	1e-47	1	1
ENSCSAP00000015765	SRP54_N	PF02881.19	6.2e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSAT00000000290	SRPRA-201	4417	-	ENSCSAP00000015765	638 (aa)	XP_008019626	A0A0D9S4H6

Gene Model

Click here to download ENSCSAG00000002271's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
csab03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCSAG00000002271's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.373	ENSG00000182934	SRPRA	100	99.373	Homo_sapiens
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.481	ENSAPOG00000017588	srpra	100	68.349	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.335	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	97.335	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.362	ENSACIG00000021588	srpra	100	66.514	Amphilophus_citrinellus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	68.445	ENSAOCG00000018884	srpra	100	68.855	Amphiprion_ocellaris
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.939	ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.927	Amphiprion_percula
ENSCSAG00000002271	SRPRA	83	86.667	ENSATEG00000023578	srpra	93	86.420	Anabas_testudineus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	94	77.997	ENSAPLG00000016079	SRPRA	100	78.161	Anas_platyrhynchos
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	77.042	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	77.385	Anolis_carolinensis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.903	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	98.903	Aotus_nancymaae
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.228	ENSACLG00000000518	srpra	100	67.634	Astatotilapia_calliptera
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	65.683	ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.217	Astyanax_mexicanus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.496	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	97.496	Bos_taurus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	99	48.024	WBGene00009521	F38A1.8	99	47.720	Caenorhabditis_elegans
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.903	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	98.903	Callithrix_jacchus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	94.984	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	94.984	Canis_familiaris
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.022	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	97.022	Canis_lupus_dingo
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	96.714	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	96.714	Capra_hircus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	81	99.162	ENSTSYG00000005187	SRPRA	97	99.162	Carlito_syrichta
ENSCSAG00000002271	SRPRA	95	89.456	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	97.744	Cavia_aperea
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.492	ENSCPOG00000014976	SRPRA	100	97.492	Cavia_porcellus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.746	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	98.746	Cebus_capucinus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.687	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	99.687	Cercocebus_atys
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.433	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	98.433	Chinchilla_lanigera
ENSCSAG00000002271	SRPRA	55	98.469	ENSCHOG00000010015	-	73	98.469	Choloepus_hoffmanni
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	78.034	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	78.495	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSAG00000002271	SRPRA	99	58.321	ENSCING00000008954	-	100	58.626	Ciona_intestinalis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	99	58.679	ENSCSAVG00000005602	-	100	59.181	Ciona_savignyi
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.433	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	98.433	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.022	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	97.022	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.022	ENSCGRG00000009892	Srpr	100	97.022	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.879	ENSCSEG00000002374	srpra	100	67.879	Cynoglossus_semilaevis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.873	ENSCVAG00000019881	srpra	100	68.293	Cyprinodon_variegatus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.375	ENSDARG00000061124	srpra	100	66.920	Danio_rerio
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	95.659	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	95.659	Dasypus_novemcinctus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.492	ENSDORG00000016719	Srpr	100	97.492	Dipodomys_ordii
ENSCSAG00000002271	SRPRA	99	51.235	FBgn0010391	Gtp-bp	100	52.080	Drosophila_melanogaster
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	92.991	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	92.991	Echinops_telfairi
ENSCSAG00000002271	SRPRA	51	80.923	ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.916	Eptatretus_burgeri
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	96.401	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	96.401	Equus_asinus_asinus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	96.557	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	96.557	Equus_caballus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	87.227	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	86.449	Erinaceus_europaeus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	68.702	ENSELUG00000017643	srpra	100	68.855	Esox_lucius
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.340	ENSFCAG00000011274	-	100	97.340	Felis_catus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	80	96.477	ENSFCAG00000030894	-	99	96.477	Felis_catus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	99	74.883	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	74.883	Ficedula_albicollis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.589	ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	98.589	Fukomys_damarensis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.417	ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.275	Fundulus_heteroclitus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.702	ENSGMOG00000013244	srpra	100	68.527	Gadus_morhua
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	78.274	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	78.428	Gallus_gallus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.732	ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.218	Gambusia_affinis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.231	ENSGACG00000006550	srpra	100	67.492	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	79.263	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	79.263	Gopherus_agassizii
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.216	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	99.216	Gorilla_gorilla
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.075	ENSHBUG00000000119	srpra	100	67.481	Haplochromis_burtoni
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.492	ENSHGLG00000001597	SRPR	100	97.492	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.492	ENSHGLG00100006449	SRPR	100	97.492	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	68.437	ENSHCOG00000010749	srpra	100	68.845	Hippocampus_comes
ENSCSAG00000002271	SRPRA	94	64.344	ENSIPUG00000000867	srpra	99	64.668	Ictalurus_punctatus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.119	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	98.119	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	96.708	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	96.708	Jaculus_jaculus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	68.421	ENSKMAG00000002280	srpra	100	69.277	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.123	ENSLBEG00000009608	srpra	100	68.389	Labrus_bergylta
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	70.325	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	70.325	Latimeria_chalumnae
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.166	ENSLOCG00000002733	srpra	100	66.817	Lepisosteus_oculatus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	95.462	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	95.462	Loxodonta_africana
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.843	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	99.843	Macaca_fascicularis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.843	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	99.843	Macaca_mulatta
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.687	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	99.687	Macaca_nemestrina
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.687	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	99.687	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.868	ENSMAMG00000000473	srpra	100	66.868	Mastacembelus_armatus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.228	ENSMZEG00005013432	srpra	100	67.634	Maylandia_zebra
ENSCSAG00000002271	SRPRA	94	78.053	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	78.218	Meleagris_gallopavo
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.335	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	97.335	Mesocricetus_auratus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.649	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	97.649	Microcebus_murinus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.335	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	97.335	Microtus_ochrogaster
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.752	ENSMMOG00000005019	srpra	100	67.752	Mola_mola
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	90.141	ENSMODG00000004576	-	100	89.655	Monodelphis_domestica
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	68.237	ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	Monopterus_albus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.022	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	100	97.022	Mus_caroli
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.022	ENSMUSG00000032042	Srpr	100	97.022	Mus_musculus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.179	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	100	97.179	Mus_pahari
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	92.537	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	92.537	Mus_spretus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.179	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	97.179	Mustela_putorius_furo
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	95.141	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	95.141	Myotis_lucifugus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	96.865	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	96.865	Nannospalax_galili
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.378	ENSNBRG00000017311	srpra	100	67.841	Neolamprologus_brichardi
ENSCSAG00000002271	SRPRA	95	99.343	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	99.343	Nomascus_leucogenys
ENSCSAG00000002271	SRPRA	94	90.667	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	90.333	Notamacropus_eugenii
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	90.767	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	90.767	Ochotona_princeps
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	96.708	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	96.708	Octodon_degus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.226	ENSONIG00000005324	srpra	100	67.634	Oreochromis_niloticus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.903	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	98.903	Oryctolagus_cuniculus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	86	86.032	ENSORLG00000014676	srpra	100	68.098	Oryzias_latipes
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.331	ENSORLG00020009240	srpra	100	68.098	Oryzias_latipes_hni
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.331	ENSORLG00015015405	srpra	100	68.252	Oryzias_latipes_hsok
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	68.364	ENSOMEG00000005872	srpra	100	68.453	Oryzias_melastigma
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.649	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	97.649	Otolemur_garnettii
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	92.824	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	93.448	Ovis_aries
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.373	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	99.373	Pan_paniscus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.340	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	97.340	Panthera_pardus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.183	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	97.183	Panthera_tigris_altaica
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.373	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	99.373	Pan_troglodytes
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.843	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	99.843	Papio_anubis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.563	ENSPKIG00000016106	srpra	100	67.079	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCSAG00000002271	SRPRA	94	77.176	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	77.340	Pelodiscus_sinensis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	68.098	ENSPMGG00000001393	srpra	100	68.098	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.492	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	97.492	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCSAG00000002271	SRPRA	99	61.290	ENSPMAG00000009559	srpra	99	60.518	Petromyzon_marinus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	90.141	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	90.297	Phascolarctos_cinereus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.424	ENSPFOG00000003114	srpra	100	69.127	Poecilia_formosa
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.119	ENSPLAG00000007323	srpra	100	68.825	Poecilia_latipinna
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.424	ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.127	Poecilia_mexicana
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.825	ENSPREG00000004937	srpra	100	68.627	Poecilia_reticulata
ENSCSAG00000002271	SRPRA	89	99.182	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	99.182	Pongo_abelii
ENSCSAG00000002271	SRPRA	64	98.450	ENSPCAG00000003801	-	64	98.450	Procavia_capensis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.806	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	97.806	Propithecus_coquereli
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	96.708	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	96.708	Pteropus_vampyrus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.228	ENSPNYG00000012371	srpra	100	67.634	Pundamilia_nyererei
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	64.688	ENSPNAG00000013476	srpra	100	66.616	Pygocentrus_nattereri
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.492	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	97.492	Rattus_norvegicus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.530	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	99.530	Rhinopithecus_bieti
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	99.374	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	99.374	Rhinopithecus_roxellana
ENSCSAG00000002271	SRPRA	67	38.285	YDR292C	-	76	38.285	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	98.903	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	98.903	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	94	90.698	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	90.365	Sarcophilus_harrisii
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	65.109	ENSSFOG00015008837	srpra	100	66.303	Scleropages_formosus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.563	ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.096	Scophthalmus_maximus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.031	ENSSDUG00000013920	srpra	100	67.031	Seriola_dumerili
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.869	ENSSLDG00000008601	srpra	93	67.580	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	81	100.000	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	Sorex_araneus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	77.469	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	77.623	Sphenodon_punctatus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.920	ENSSPAG00000005103	srpra	100	67.732	Stegastes_partitus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.492	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.492	Sus_scrofa
ENSCSAG00000002271	SRPRA	94	75.124	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	75.124	Taeniopygia_guttata
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.252	ENSTRUG00000006856	srpra	100	67.431	Takifugu_rubripes
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	64.340	ENSTNIG00000010316	srpra	100	65.554	Tetraodon_nigroviridis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	96.557	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	96.557	Tursiops_truncatus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.183	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	97.183	Ursus_americanus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	96	88.207	ENSUMAG00000002269	SRPRA	99	88.207	Ursus_maritimus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	69	98.450	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	98.450	Vicugna_pacos
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.179	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	97.179	Vulpes_vulpes
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	62.443	ENSXETG00000003920	srpra	100	62.748	Xenopus_tropicalis
ENSCSAG00000002271	SRPRA	84	87.619	ENSXCOG00000001286	srpra	100	61.646	Xiphophorus_couchianus
ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.830	ENSXMAG00000028401	srpra	100	67.669	Xiphophorus_maculatus