EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCSAG00000003614 (Gene tree)
Gene ID: 103243308
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Chlorocebus_sabaeus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 46066 bases
Position: chr16:61505825-61551890
Accession: 103243308
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSAP00000014438	GTP_EFTU	PF00009.27	2e-45	1	1
ENSCSAP00000014438	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	7.7e-13	1	1
ENSCSAP00000014438	EFG_IV	PF03764.18	1.6e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSAT00000001644	EFTUD2-201	5663	-	ENSCSAP00000014438	972 (aa)	XP_008010572	A0A0D9S0P9

Gene Model

Click here to download ENSCSAG00000003614's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
csab03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCSAG00000003614's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	87	39.061	ENSCSAG00000010865	EEF2	99	39.061

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.897	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.284	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.794	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	88.786	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.580	Amphilophus_citrinellus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.387	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.695	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	99	94.336	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.336	Anas_platyrhynchos
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	97.737	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	Anolis_carolinensis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.284	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.486	Bos_taurus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.794	Canis_familiaris
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	Canis_lupus_dingo
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	Capra_hircus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.588	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	Carlito_syrichta
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.971	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.971	Cavia_aperea
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.971	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	Cavia_porcellus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.868	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	Chinchilla_lanigera
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.663	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	99	78.004	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.872	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.059	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	Danio_rerio
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.383	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.383	Dasypus_novemcinctus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.383	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	Dipodomys_ordii
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.794	Equus_asinus_asinus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.691	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.691	Equus_caballus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.691	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	Felis_catus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	97.942	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	Ficedula_albicollis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.177	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	Fukomys_damarensis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.255	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.045	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.770	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.181	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.765	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.765	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.358	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	96	99.466	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	Jaculus_jaculus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.770	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	94.342	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	Latimeria_chalumnae
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.280	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	Loxodonta_africana
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.695	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.490	Mastacembelus_armatus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.284	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.049	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	Meleagris_gallopavo
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.486	Mesocricetus_auratus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	92	81.798	ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	Microtus_ochrogaster
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.588	ENSMOCG00000009039	-	100	99.588	Microtus_ochrogaster
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.588	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	Monodelphis_domestica
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.280	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.280	Mus_caroli
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.280	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.280	Mus_musculus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.280	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	Mus_pahari
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.280	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.280	Mus_spretus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	97	99.576	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.576	Mustela_putorius_furo
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.794	Myotis_lucifugus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	Nannospalax_galili
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.181	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	97	98.193	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	Nomascus_leucogenys
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	95.988	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	Notamacropus_eugenii
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.461	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	Ochotona_princeps
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.560	ENSODEG00000018041	-	100	98.560	Octodon_degus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.284	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	Oryctolagus_cuniculus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.872	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	Oryzias_latipes
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes_hni
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	97.737	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.737	Otolemur_garnettii
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.486	Ovis_aries
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.897	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.897	Pan_paniscus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.794	Panthera_pardus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.794	Panthera_tigris_altaica
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.897	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	Pan_troglodytes
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	100.000	Papio_anubis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	84.568	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.486	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.486	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.691	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.691	Phascolarctos_cinereus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.560	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.560	Pongo_abelii
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	95.679	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	Procavia_capensis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.897	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	Propithecus_coquereli
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	94.856	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	Pteropus_vampyrus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.181	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.280	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	Rattus_norvegicus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.897	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_bieti
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.897	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_roxellana
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.893	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	97	99.680	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	Sarcophilus_harrisii
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.667	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	Scleropages_formosus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.078	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.872	Scophthalmus_maximus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.387	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.490	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.152	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	Sorex_araneus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	97.634	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	Sphenodon_punctatus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.490	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.588	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	Sus_scrofa
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.461	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	86.988	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	Tetraodon_nigroviridis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	94.342	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	Tupaia_belangeri
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	98.665	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	Ursus_americanus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.794	Ursus_maritimus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.794	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.794	Vulpes_vulpes
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	97	94.883	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus