EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCSAG00000014606 (Gene tree)
Gene ID: 103220190
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Chlorocebus_sabaeus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 56105 bases
Position: chr14:45432619-45488723
Accession: 103220190
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSAP00000010727	CRM1_C	PF08767.11	6.3e-134	1	1
ENSCSAP00000010727	Xpo1	PF08389.12	4.4e-42	1	1
ENSCSAP00000010727	IBN_N	PF03810.19	1.8e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSAT00000012697	XPO1-201	4873	-	ENSCSAP00000010727	1071 (aa)	XP_007968690	A0A0D9RQ38

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
csab03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
csab03013	RNA transport	KEGG
csab05164	Influenza A	KEGG
csab05166	Human T-cell leukemia virus 1 infection	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	100.000	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	89.681	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	89.681	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.612	ENSAPOG00000004984	-	100	95.612	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.787	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	98.787	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	95.851	ENSACIG00000010818	-	100	95.851	Amphilophus_citrinellus
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	92.128	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.128	Amphilophus_citrinellus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	91.410	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.410	Amphiprion_ocellaris
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.612	ENSAOCG00000010121	-	100	95.612	Amphiprion_ocellaris
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.612	ENSAPEG00000007038	-	100	95.612	Amphiprion_percula
ENSCSAG00000014606	XPO1	91	91.864	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	91.864	Amphiprion_percula
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	91.036	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.036	Anabas_testudineus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.612	ENSATEG00000008816	-	100	95.612	Anabas_testudineus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.599	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	98.599	Anas_platyrhynchos
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.413	ENSACAG00000002501	XPO1	100	98.413	Anolis_carolinensis
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	100.000	ENSANAG00000020802	XPO1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	92.234	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.234	Astatotilapia_calliptera
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.425	ENSACLG00000015192	-	100	95.425	Astatotilapia_calliptera
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	93.326	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.326	Astyanax_mexicanus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.892	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.892	Astyanax_mexicanus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	98.880	Bos_taurus
ENSCSAG00000014606	XPO1	99	51.479	WBGene00002078	xpo-1	99	51.479	Caenorhabditis_elegans
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	100.000	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	98.880	Canis_familiaris
ENSCSAG00000014606	XPO1	93	98.695	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	98.695	Canis_lupus_dingo
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	98.880	Capra_hircus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	98.880	Carlito_syrichta
ENSCSAG00000014606	XPO1	53	93.972	ENSCAPG00000006454	-	100	93.972	Cavia_aperea
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.386	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	97.386	Cavia_porcellus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	80.519	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	80.705	Cebus_capucinus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.138	ENSCATG00000032674	XPO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.599	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.599	Chinchilla_lanigera
ENSCSAG00000014606	XPO1	83	99.481	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.481	Choloepus_hoffmanni
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.506	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.506	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	80.819	ENSCING00000024562	-	100	80.819	Ciona_intestinalis
ENSCSAG00000014606	XPO1	99	79.832	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.832	Ciona_savignyi
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.705	ENSCANG00000028883	XPO1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.666	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	97.666	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.666	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	97.666	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	94.681	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	Cynoglossus_semilaevis
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	90.663	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	90.663	Cyprinodon_variegatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.518	ENSCVAG00000016788	-	100	95.518	Cyprinodon_variegatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	92.717	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	94.892	Danio_rerio
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	96.265	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.265	Danio_rerio
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.786	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	98.786	Dasypus_novemcinctus
ENSCSAG00000014606	XPO1	92	95.857	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.857	Dipodomys_ordii
ENSCSAG00000014606	XPO1	99	70.853	FBgn0020497	emb	99	70.853	Drosophila_melanogaster
ENSCSAG00000014606	XPO1	94	97.970	ENSETEG00000018045	XPO1	94	97.970	Echinops_telfairi
ENSCSAG00000014606	XPO1	90	79.046	ENSEBUG00000012580	-	100	87.500	Eptatretus_burgeri
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	ENSEASG00005007223	XPO1	100	98.880	Equus_asinus_asinus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.880	Equus_caballus
ENSCSAG00000014606	XPO1	92	91.667	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	91.667	Erinaceus_europaeus
ENSCSAG00000014606	XPO1	87	92.184	ENSELUG00000014306	-	99	92.184	Esox_lucius
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	94.362	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	94.362	Esox_lucius
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	98.880	Felis_catus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.319	ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.319	Ficedula_albicollis
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.012	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.012	Fukomys_damarensis
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	90.943	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	90.943	Fundulus_heteroclitus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	92.157	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.157	Gadus_morhua
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	89.636	ENSGMOG00000019063	-	100	89.636	Gadus_morhua
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.599	ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.599	Gallus_gallus
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	91.915	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.915	Gambusia_affinis
ENSCSAG00000014606	XPO1	91	95.572	ENSGAFG00000003355	-	98	95.572	Gambusia_affinis
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	90.850	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.331	ENSGACG00000002743	-	100	95.331	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.413	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.413	Gopherus_agassizii
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	100.000	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	91.503	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	91.503	Haplochromis_burtoni
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.518	ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	Haplochromis_burtoni
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.506	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	98.506	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.506	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	98.506	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	94.681	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	94.681	Hippocampus_comes
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.892	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	95.892	Ictalurus_punctatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	93.371	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.371	Ictalurus_punctatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.599	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	98.599	Jaculus_jaculus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.145	ENSKMAG00000016218	-	100	95.145	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	90.850	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	90.850	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.612	ENSLBEG00000005740	-	100	95.612	Labrus_bergylta
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	89.301	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	89.301	Labrus_bergylta
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	76.916	ENSLACG00000018213	XPO1	100	76.916	Latimeria_chalumnae
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	96.359	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.359	Lepisosteus_oculatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.506	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	98.506	Loxodonta_africana
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	100.000	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	100.000	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	100.000	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.140	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	98.140	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.425	ENSMAMG00000010568	-	100	95.425	Mastacembelus_armatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	91.317	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.317	Mastacembelus_armatus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.425	ENSMZEG00005018158	-	98	95.572	Maylandia_zebra
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	91.503	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	91.503	Maylandia_zebra
ENSCSAG00000014606	XPO1	68	98.072	ENSMGAG00000001496	-	100	98.072	Meleagris_gallopavo
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.666	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	97.666	Mesocricetus_auratus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	ENSMICG00000027770	XPO1	100	98.880	Microcebus_murinus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.946	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	97.946	Microtus_ochrogaster
ENSCSAG00000014606	XPO1	87	95.518	ENSMMOG00000008001	-	99	95.518	Mola_mola
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	92.021	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.021	Mola_mola
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.572	ENSMODG00000002831	XPO1	100	97.572	Monodelphis_domestica
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	95.145	ENSMALG00000007085	-	100	95.145	Monopterus_albus
ENSCSAG00000014606	XPO1	88	90.967	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	90.967	Monopterus_albus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.039	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.039	Mus_caroli
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.039	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	98.039	Mus_musculus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.946	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.946	Mus_pahari
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.039	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	98.039	Mus_spretus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	98.880	Mustela_putorius_furo
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.786	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	98.786	Myotis_lucifugus
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.786	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	98.786	Nannospalax_galili
ENSCSAG00000014606	XPO1	100	91.503	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	91.503	Neolamprologus_brichardi
ENSCSAG00000014606	XPO1	96	95.063	ENSNBRG00000012229	-	100	95.957	Neolamprologus_brichardi
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