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Description

Ensembl ID: ENSCSAG00000016692 (Gene tree)
Gene ID: 103221271
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Chlorocebus_sabaeus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6311 bases
Position: chr4:49094528-49100838
Accession: 103221271
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSAP00000012749	eRF1_2	PF03464.15	1.5e-37	1	1
ENSCSAP00000012749	eRF1_3	PF03465.15	5.5e-27	1	1
ENSCSAP00000012749	eRF1_1	PF03463.15	1.6e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSAT00000014788	PELO-201	6005	-	ENSCSAP00000012749	385 (aa)	XP_007970328	A0A0D9RVW0

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
csab03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.481	ENSG00000152684	PELO	100	99.481	Homo_sapiens
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	ENSAPOG00000023072	pelo	100	80.260	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSAG00000016692	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSAG00000016692	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	ENSAMEG00000007734	PELO	100	98.701	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSAG00000016692	PELO	97	76.944	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	Amphilophus_citrinellus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.519	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.519	Amphiprion_ocellaris
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.519	ENSAPEG00000011235	pelo	100	80.519	Amphiprion_percula
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.558	ENSATEG00000019550	pelo	100	81.558	Anabas_testudineus
ENSCSAG00000016692	PELO	77	84.899	ENSAPLG00000013265	PELO	100	84.899	Anas_platyrhynchos
ENSCSAG00000016692	PELO	98	90.160	ENSACAG00000004352	PELO	100	89.870	Anolis_carolinensis
ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.481	ENSANAG00000014096	PELO	100	99.481	Aotus_nancymaae
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.260	Astatotilapia_calliptera
ENSCSAG00000016692	PELO	97	80.965	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	Astyanax_mexicanus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	ENSBTAG00000003268	PELO	99	98.701	Bos_taurus
ENSCSAG00000016692	PELO	99	58.005	WBGene00011280	pelo-1	100	58.005	Caenorhabditis_elegans
ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.740	ENSCJAG00000035190	PELO	100	99.740	Callithrix_jacchus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.961	ENSCAFG00020023234	PELO	100	98.961	Canis_lupus_dingo
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.442	ENSCHIG00000016410	PELO	99	98.442	Capra_hircus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.221	ENSTSYG00000005203	PELO	100	99.221	Carlito_syrichta
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	ENSCPOG00000027406	PELO	100	98.701	Cavia_porcellus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.740	ENSCCAG00000035600	PELO	100	99.740	Cebus_capucinus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSCATG00000011829	PELO	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.182	ENSCLAG00000005043	PELO	100	98.182	Chinchilla_lanigera
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.442	ENSCHOG00000000523	PELO	100	98.442	Choloepus_hoffmanni
ENSCSAG00000016692	PELO	98	93.617	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSAG00000016692	PELO	97	68.901	ENSCING00000001979	-	100	69.351	Ciona_intestinalis
ENSCSAG00000016692	PELO	100	69.351	ENSCSAVG00000006158	-	100	69.351	Ciona_savignyi
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSCANG00000023382	PELO	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	95.844	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	95.844	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.143	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	97.143	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSAG00000016692	PELO	100	79.740	ENSCSEG00000008807	pelo	100	79.740	Cynoglossus_semilaevis
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.558	ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.558	Cyprinodon_variegatus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.818	ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	Danio_rerio
ENSCSAG00000016692	PELO	100	96.373	ENSDNOG00000036721	PELO	100	96.373	Dasypus_novemcinctus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.922	ENSDORG00000016689	Pelo	100	97.922	Dipodomys_ordii
ENSCSAG00000016692	PELO	96	67.385	FBgn0011207	pelo	96	67.282	Drosophila_melanogaster
ENSCSAG00000016692	PELO	71	81.287	ENSEBUG00000004955	pelo	99	81.287	Eptatretus_burgeri
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	ENSEASG00005013348	PELO	100	98.701	Equus_asinus_asinus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.519	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.519	Esox_lucius
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.442	ENSFCAG00000032341	PELO	100	98.442	Felis_catus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	94.545	ENSFALG00000004559	PELO	100	94.545	Ficedula_albicollis
ENSCSAG00000016692	PELO	74	97.535	ENSFDAG00000002076	PELO	88	97.535	Fukomys_damarensis
ENSCSAG00000016692	PELO	100	79.740	ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	Fundulus_heteroclitus
ENSCSAG00000016692	PELO	98	79.576	ENSGMOG00000005849	pelo	100	79.481	Gadus_morhua
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.779	ENSGAFG00000019350	pelo	100	80.779	Gambusia_affinis
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSAG00000016692	PELO	98	93.883	ENSGAGG00000004018	PELO	100	93.506	Gopherus_agassizii
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSGGOG00000012635	PELO	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	ENSHBUG00000005866	pelo	100	80.260	Haplochromis_burtoni
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.182	ENSHGLG00000005932	PELO	100	98.182	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSAG00000016692	PELO	100	95.844	ENSHGLG00100017627	PELO	100	95.844	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSAG00000016692	PELO	100	77.662	ENSHCOG00000016782	pelo	100	77.662	Hippocampus_comes
ENSCSAG00000016692	PELO	100	79.481	ENSIPUG00000020627	pelo	100	79.481	Ictalurus_punctatus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	ENSSTOG00000027378	PELO	100	98.701	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	94.545	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	94.545	Jaculus_jaculus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.039	ENSKMAG00000021305	pelo	100	81.039	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSAG00000016692	PELO	99	80.208	ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	Labrus_bergylta
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.961	ENSLAFG00000020551	PELO	100	98.961	Loxodonta_africana
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSMFAG00000000651	PELO	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSMMUG00000039101	PELO	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSMNEG00000035538	PELO	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSMLEG00000039113	PELO	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSAG00000016692	PELO	97	82.842	ENSMAMG00000013260	pelo	100	82.597	Mastacembelus_armatus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	ENSMZEG00005014258	pelo	100	80.260	Maylandia_zebra
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.143	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	97.143	Mesocricetus_auratus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.221	ENSMICG00000044040	PELO	100	99.221	Microcebus_murinus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.403	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	97.403	Microtus_ochrogaster
ENSCSAG00000016692	PELO	100	79.221	ENSMMOG00000001324	pelo	100	79.221	Mola_mola
ENSCSAG00000016692	PELO	100	82.338	ENSMALG00000008194	pelo	100	82.338	Monopterus_albus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.403	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.403	Mus_caroli
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.403	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	97.403	Mus_musculus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.662	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	97.662	Mus_pahari
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.403	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	97.403	Mus_spretus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	95.325	ENSMLUG00000024132	PELO	100	95.325	Myotis_lucifugus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.922	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	97.922	Nannospalax_galili
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	ENSNBRG00000011799	pelo	100	80.260	Neolamprologus_brichardi
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSNLEG00000035970	PELO	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSCSAG00000016692	PELO	100	94.805	ENSMEUG00000005468	PELO	100	94.805	Notamacropus_eugenii
ENSCSAG00000016692	PELO	98	97.625	ENSOPRG00000018793	PELO	100	97.625	Ochotona_princeps
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.403	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.403	Octodon_degus
ENSCSAG00000016692	PELO	96	80.541	ENSONIG00000011511	pelo	100	80.260	Oreochromis_niloticus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	ENSOCUG00000023902	PELO	100	98.701	Oryctolagus_cuniculus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.558	ENSORLG00000005827	pelo	100	81.558	Oryzias_latipes
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.818	ENSORLG00020016456	pelo	100	81.818	Oryzias_latipes_hni
ENSCSAG00000016692	PELO	100	82.078	ENSORLG00015014447	pelo	100	82.078	Oryzias_latipes_hsok
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.818	ENSOMEG00000021567	pelo	100	81.818	Oryzias_melastigma
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.442	ENSOGAG00000027940	PELO	100	98.442	Otolemur_garnettii
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.701	ENSOARG00000008324	PELO	99	98.701	Ovis_aries
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSPPAG00000038951	PELO	100	100.000	Pan_paniscus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.442	ENSPPRG00000018800	PELO	100	98.442	Panthera_pardus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	98.442	ENSPTIG00000019988	PELO	100	98.442	Panthera_tigris_altaica
ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.740	ENSPTRG00000034409	PELO	100	99.740	Pan_troglodytes
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSPANG00000010902	PELO	100	100.000	Papio_anubis
ENSCSAG00000016692	PELO	100	82.078	ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCSAG00000016692	PELO	98	93.351	ENSPSIG00000004971	PELO	100	92.987	Pelodiscus_sinensis
ENSCSAG00000016692	PELO	67	78.295	ENSPMGG00000014561	pelo	95	78.295	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.143	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCSAG00000016692	PELO	100	96.623	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.623	Phascolarctos_cinereus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.558	ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.558	Poecilia_formosa
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.818	ENSPLAG00000020787	pelo	100	81.818	Poecilia_latipinna
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.558	ENSPMEG00000016964	pelo	100	81.558	Poecilia_mexicana
ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.818	ENSPREG00000023071	pelo	100	81.818	Poecilia_reticulata
ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.740	ENSPPYG00000015451	PELO	96	99.740	Pongo_abelii
ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.221	ENSPCOG00000021178	PELO	100	99.221	Propithecus_coquereli
ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	ENSPNYG00000017325	pelo	100	80.260	Pundamilia_nyererei
ENSCSAG00000016692	PELO	97	81.501	ENSPNAG00000012458	pelo	99	80.260	Pygocentrus_nattereri
ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.662	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	97.662	Rattus_norvegicus
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSRBIG00000007299	PELO	100	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSCSAG00000016692	PELO	100	100.000	ENSRROG00000035507	PELO	100	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSCSAG00000016692	PELO	99	34.872	YNL001W	-	99	34.872	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCSAG00000016692	PELO	100	99.481	ENSSBOG00000036140	PELO	100	99.481	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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