EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCSEG00000000117 (Gene tree)
Gene ID: 103382054
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cynoglossus_semilaevis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5144 bases
Position: chr1:2254244-2259387
Accession: 103382054
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSEP00000000126	SYF2	PF08231.12	1.3e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSET00000000150	-	720	XM_008314742	ENSCSEP00000000126	239 (aa)	XP_008312964	-

Gene Model

Click here to download ENSCSEG00000000117's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
csem03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCSEG00000000117's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	ENSG00000117614	SYF2	90	77.982	Homo_sapiens
ENSCSEG00000000117	syf2	93	88.739	ENSAPOG00000001174	syf2	92	89.450	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000000117	syf2	94	75.000	ENSAMEG00000010115	-	90	77.064	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSEG00000000117	syf2	82	78.462	ENSAMEG00000010134	-	100	78.462	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSEG00000000117	syf2	98	85.532	ENSACIG00000023688	syf2	87	89.450	Amphilophus_citrinellus
ENSCSEG00000000117	syf2	99	86.076	ENSAOCG00000022046	syf2	93	88.991	Amphiprion_ocellaris
ENSCSEG00000000117	syf2	92	84.615	ENSAOCG00000010912	syf2	63	88.060	Amphiprion_ocellaris
ENSCSEG00000000117	syf2	99	86.076	ENSAPEG00000018858	syf2	84	88.991	Amphiprion_percula
ENSCSEG00000000117	syf2	91	89.401	ENSATEG00000007745	syf2	92	89.498	Anabas_testudineus
ENSCSEG00000000117	syf2	84	78.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	78.500	Anas_platyrhynchos
ENSCSEG00000000117	syf2	69	66.467	ENSACAG00000026777	-	100	66.467	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000000117	syf2	85	76.961	ENSACAG00000013653	-	100	76.961	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000000117	syf2	90	79.070	ENSANAG00000032473	SYF2	90	78.440	Aotus_nancymaae
ENSCSEG00000000117	syf2	93	88.739	ENSACLG00000019916	syf2	92	88.991	Astatotilapia_calliptera
ENSCSEG00000000117	syf2	94	83.482	ENSAMXG00000004051	syf2	92	84.404	Astyanax_mexicanus
ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.477	ENSBTAG00000001651	SYF2	92	78.440	Bos_taurus
ENSCSEG00000000117	syf2	87	51.887	WBGene00019402	syf-2	90	51.643	Caenorhabditis_elegans
ENSCSEG00000000117	syf2	90	79.070	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	78.440	Callithrix_jacchus
ENSCSEG00000000117	syf2	93	70.852	ENSCAFG00000030331	-	96	71.689	Canis_familiaris
ENSCSEG00000000117	syf2	90	77.674	ENSCAFG00000012895	-	89	77.064	Canis_familiaris
ENSCSEG00000000117	syf2	90	77.674	ENSCAFG00020021091	-	89	77.064	Canis_lupus_dingo
ENSCSEG00000000117	syf2	67	77.987	ENSCAFG00020021094	-	84	77.987	Canis_lupus_dingo
ENSCSEG00000000117	syf2	100	72.016	ENSCHIG00000020874	SYF2	90	77.982	Capra_hircus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	72.803	ENSTSYG00000005114	SYF2	90	77.064	Carlito_syrichta
ENSCSEG00000000117	syf2	83	77.778	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	77.778	Cavia_aperea
ENSCSEG00000000117	syf2	99	73.840	ENSCPOG00000005326	SYF2	89	78.440	Cavia_porcellus
ENSCSEG00000000117	syf2	90	79.070	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	78.440	Cebus_capucinus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.605	ENSCATG00000026917	SYF2	90	77.982	Cercocebus_atys
ENSCSEG00000000117	syf2	99	74.684	ENSCLAG00000008474	SYF2	89	78.899	Chinchilla_lanigera
ENSCSEG00000000117	syf2	91	77.982	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	77.982	Chlorocebus_sabaeus
ENSCSEG00000000117	syf2	72	58.382	ENSCHOG00000005273	-	85	61.538	Choloepus_hoffmanni
ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.378	ENSCPBG00000025073	SYF2	88	79.358	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSEG00000000117	syf2	88	54.460	ENSCING00000003017	-	89	54.460	Ciona_intestinalis
ENSCSEG00000000117	syf2	88	50.704	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSCSEG00000000117	syf2	100	62.551	ENSCANG00000037322	SYF2	88	67.890	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.477	ENSCGRG00001020733	Syf2	90	78.440	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSEG00000000117	syf2	82	78.571	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	78.788	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSEG00000000117	syf2	93	86.937	ENSCVAG00000019543	syf2	91	88.073	Cyprinodon_variegatus
ENSCSEG00000000117	syf2	97	81.385	ENSDARG00000004706	syf2	92	83.105	Danio_rerio
ENSCSEG00000000117	syf2	99	72.840	ENSDNOG00000047605	SYF2	89	77.982	Dasypus_novemcinctus
ENSCSEG00000000117	syf2	95	76.957	ENSDORG00000001274	Syf2	89	78.440	Dipodomys_ordii
ENSCSEG00000000117	syf2	90	53.241	FBgn0033556	CG12343	94	53.241	Drosophila_melanogaster
ENSCSEG00000000117	syf2	91	62.162	ENSETEG00000015729	SYF2	89	64.706	Echinops_telfairi
ENSCSEG00000000117	syf2	82	57.868	ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.868	Eptatretus_burgeri
ENSCSEG00000000117	syf2	100	63.636	ENSEASG00005004232	-	90	68.807	Equus_asinus_asinus
ENSCSEG00000000117	syf2	91	78.899	ENSEASG00005004224	-	89	78.899	Equus_asinus_asinus
ENSCSEG00000000117	syf2	91	78.899	ENSECAG00000010440	-	91	78.899	Equus_caballus
ENSCSEG00000000117	syf2	96	75.214	ENSECAG00000012023	-	89	78.440	Equus_caballus
ENSCSEG00000000117	syf2	74	60.109	ENSEEUG00000015084	SYF2	86	66.242	Erinaceus_europaeus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	79.079	ENSELUG00000003465	syf2	92	85.321	Esox_lucius
ENSCSEG00000000117	syf2	91	78.899	ENSFCAG00000010324	-	75	78.899	Felis_catus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.138	ENSFCAG00000043095	-	89	77.982	Felis_catus
ENSCSEG00000000117	syf2	85	76.471	ENSFALG00000000460	SYF2	89	75.688	Ficedula_albicollis
ENSCSEG00000000117	syf2	99	73.840	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	78.440	Fukomys_damarensis
ENSCSEG00000000117	syf2	94	73.451	ENSFHEG00000007238	syf2	97	73.516	Fundulus_heteroclitus
ENSCSEG00000000117	syf2	90	86.512	ENSGMOG00000019138	syf2	96	86.512	Gadus_morhua
ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.477	ENSGALG00000013639	SYF2	87	78.440	Gallus_gallus
ENSCSEG00000000117	syf2	99	83.122	ENSGAFG00000019435	syf2	92	85.780	Gambusia_affinis
ENSCSEG00000000117	syf2	93	89.189	ENSGACG00000007305	syf2	91	89.908	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSEG00000000117	syf2	96	76.957	ENSGAGG00000010670	SYF2	88	79.358	Gopherus_agassizii
ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	77.982	Gorilla_gorilla
ENSCSEG00000000117	syf2	97	86.695	ENSHBUG00000020477	syf2	94	88.991	Haplochromis_burtoni
ENSCSEG00000000117	syf2	93	68.161	ENSHGLG00000004304	-	91	70.183	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.130	ENSHGLG00000014393	SYF2	89	78.440	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.130	ENSHGLG00100014722	SYF2	89	78.440	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSEG00000000117	syf2	100	84.937	ENSHCOG00000012904	syf2	71	88.532	Hippocampus_comes
ENSCSEG00000000117	syf2	99	78.661	ENSIPUG00000019859	syf2	92	82.569	Ictalurus_punctatus
ENSCSEG00000000117	syf2	61	71.233	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	71.233	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSEG00000000117	syf2	83	78.392	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	78.392	Jaculus_jaculus
ENSCSEG00000000117	syf2	99	85.654	ENSKMAG00000013856	syf2	92	88.532	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSEG00000000117	syf2	91	89.862	ENSLBEG00000014425	syf2	91	89.862	Labrus_bergylta
ENSCSEG00000000117	syf2	97	74.892	ENSLACG00000012064	SYF2	92	77.982	Latimeria_chalumnae
ENSCSEG00000000117	syf2	99	79.325	ENSLOCG00000002728	syf2	87	83.486	Lepisosteus_oculatus
ENSCSEG00000000117	syf2	77	51.087	ENSLAFG00000030814	-	100	51.087	Loxodonta_africana
ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.928	ENSLAFG00000023150	-	89	78.440	Loxodonta_africana
ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.605	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	77.982	Macaca_fascicularis
ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	77.982	Macaca_mulatta
ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.605	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	77.982	Macaca_nemestrina
ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.605	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	77.982	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSEG00000000117	syf2	91	88.479	ENSMAMG00000010403	syf2	90	88.532	Mastacembelus_armatus
ENSCSEG00000000117	syf2	99	84.810	ENSMZEG00005006429	syf2	92	88.991	Maylandia_zebra
ENSCSEG00000000117	syf2	83	78.392	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	78.392	Meleagris_gallopavo
ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.829	ENSMAUG00000018974	Syf2	90	79.817	Mesocricetus_auratus
ENSCSEG00000000117	syf2	83	78.392	ENSMICG00000016191	SYF2	100	78.392	Microcebus_murinus
ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.378	ENSMOCG00000022938	Syf2	90	79.358	Microtus_ochrogaster
ENSCSEG00000000117	syf2	99	85.714	ENSMMOG00000002396	syf2	91	88.532	Mola_mola
ENSCSEG00000000117	syf2	93	74.554	ENSMODG00000013951	-	96	75.455	Monodelphis_domestica
ENSCSEG00000000117	syf2	96	87.446	ENSMALG00000010706	syf2	91	89.954	Monopterus_albus
ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.829	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	90	79.817	Mus_caroli
ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.829	ENSMUSG00000028821	Syf2	90	79.817	Mus_musculus
ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.829	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	90	79.817	Mus_pahari
ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.829	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	90	79.817	Mus_spretus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	69.919	ENSMPUG00000015802	-	89	77.064	Mustela_putorius_furo
ENSCSEG00000000117	syf2	91	77.982	ENSMPUG00000015801	-	89	77.982	Mustela_putorius_furo
ENSCSEG00000000117	syf2	100	72.803	ENSMLUG00000001885	SYF2	89	77.064	Myotis_lucifugus
ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.027	ENSNGAG00000007912	Syf2	89	77.982	Nannospalax_galili
ENSCSEG00000000117	syf2	100	74.486	ENSNBRG00000010720	syf2	90	79.717	Neolamprologus_brichardi
ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	77.982	Nomascus_leucogenys
ENSCSEG00000000117	syf2	97	74.249	ENSOPRG00000012870	SYF2	90	77.064	Ochotona_princeps
ENSCSEG00000000117	syf2	99	65.823	ENSODEG00000014338	-	90	69.266	Octodon_degus
ENSCSEG00000000117	syf2	99	72.689	ENSODEG00000017664	-	92	77.523	Octodon_degus
ENSCSEG00000000117	syf2	93	88.739	ENSONIG00000008213	syf2	92	88.991	Oreochromis_niloticus
ENSCSEG00000000117	syf2	85	78.713	ENSOANG00000009552	SYF2	100	78.713	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCSEG00000000117	syf2	90	79.070	ENSOCUG00000013050	SYF2	89	78.440	Oryctolagus_cuniculus
ENSCSEG00000000117	syf2	95	86.726	ENSORLG00000028820	syf2	94	88.991	Oryzias_latipes
ENSCSEG00000000117	syf2	97	85.345	ENSORLG00020018333	syf2	92	88.991	Oryzias_latipes_hni
ENSCSEG00000000117	syf2	97	85.345	ENSORLG00015014665	syf2	92	88.991	Oryzias_latipes_hsok
ENSCSEG00000000117	syf2	99	84.810	ENSOMEG00000013911	syf2	92	89.450	Oryzias_melastigma
ENSCSEG00000000117	syf2	100	74.059	ENSOGAG00000009962	SYF2	89	78.899	Otolemur_garnettii
ENSCSEG00000000117	syf2	82	53.846	ENSOARG00000006269	-	100	53.846	Ovis_aries
ENSCSEG00000000117	syf2	93	76.339	ENSOARG00000006348	-	89	77.273	Ovis_aries
ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	77.982	Pan_paniscus
ENSCSEG00000000117	syf2	91	78.899	ENSPPRG00000001638	-	89	78.899	Panthera_pardus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.138	ENSPPRG00000001651	-	89	77.982	Panthera_pardus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	72.614	ENSPTIG00000007036	-	89	77.982	Panthera_tigris_altaica
ENSCSEG00000000117	syf2	90	79.535	ENSPTIG00000005711	-	80	78.995	Panthera_tigris_altaica
ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	77.982	Pan_troglodytes
ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.605	ENSPANG00000008139	SYF2	90	77.982	Papio_anubis
ENSCSEG00000000117	syf2	92	83.258	ENSPKIG00000008130	syf2	93	83.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCSEG00000000117	syf2	91	77.982	ENSPSIG00000011816	SYF2	85	77.982	Pelodiscus_sinensis
ENSCSEG00000000117	syf2	100	82.008	ENSPMGG00000008755	syf2	85	88.073	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.928	ENSPEMG00000008283	Syf2	90	78.899	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.378	ENSPCIG00000014235	SYF2	87	79.358	Phascolarctos_cinereus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	82.427	ENSPFOG00000004116	syf2	90	86.697	Poecilia_formosa
ENSCSEG00000000117	syf2	97	84.549	ENSPLAG00000006691	syf2	94	86.239	Poecilia_latipinna
ENSCSEG00000000117	syf2	100	79.916	ENSPMEG00000011684	syf2	93	83.486	Poecilia_mexicana
ENSCSEG00000000117	syf2	90	86.977	ENSPREG00000003009	syf2	92	86.239	Poecilia_reticulata
ENSCSEG00000000117	syf2	91	77.982	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	77.982	Pongo_abelii
ENSCSEG00000000117	syf2	100	50.617	ENSPCOG00000027011	SYF2	85	54.587	Propithecus_coquereli
ENSCSEG00000000117	syf2	100	64.082	ENSPVAG00000005841	SYF2	89	68.664	Pteropus_vampyrus
ENSCSEG00000000117	syf2	93	88.739	ENSPNYG00000004979	syf2	92	88.991	Pundamilia_nyererei
ENSCSEG00000000117	syf2	97	81.385	ENSPNAG00000015570	syf2	92	84.404	Pygocentrus_nattereri
ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.829	ENSRNOG00000060597	Syf2	90	79.817	Rattus_norvegicus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	69.547	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	75.688	Rhinopithecus_bieti
ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.605	ENSRROG00000001347	SYF2	90	77.982	Rhinopithecus_roxellana
ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	77.982	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCSEG00000000117	syf2	93	78.378	ENSSHAG00000015630	-	88	79.358	Sarcophilus_harrisii
ENSCSEG00000000117	syf2	86	79.126	ENSSHAG00000007152	-	100	79.126	Sarcophilus_harrisii
ENSCSEG00000000117	syf2	92	83.258	ENSSFOG00015023647	syf2	92	83.105	Scleropages_formosus
ENSCSEG00000000117	syf2	99	82.700	ENSSMAG00000009867	syf2	92	86.697	Scophthalmus_maximus
ENSCSEG00000000117	syf2	92	90.411	ENSSDUG00000013072	syf2	92	90.411	Seriola_dumerili
ENSCSEG00000000117	syf2	92	90.411	ENSSLDG00000012677	syf2	92	90.411	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCSEG00000000117	syf2	95	60.793	ENSSARG00000012889	SYF2	89	61.468	Sorex_araneus
ENSCSEG00000000117	syf2	99	74.793	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	74.793	Sphenodon_punctatus
ENSCSEG00000000117	syf2	99	86.076	ENSSPAG00000009626	syf2	92	89.450	Stegastes_partitus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.020	ENSSSCG00000037481	SYF2	89	77.982	Sus_scrofa
ENSCSEG00000000117	syf2	62	49.664	ENSTGUG00000001126	SYF2	77	52.258	Taeniopygia_guttata
ENSCSEG00000000117	syf2	100	80.488	ENSTRUG00000001499	syf2	88	86.697	Takifugu_rubripes
ENSCSEG00000000117	syf2	93	85.586	ENSTNIG00000016912	syf2	98	85.845	Tetraodon_nigroviridis
ENSCSEG00000000117	syf2	93	55.405	ENSTBEG00000017370	SYF2	87	55.963	Tupaia_belangeri
ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	ENSTTRG00000003550	SYF2	89	77.982	Tursiops_truncatus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	70.325	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	77.064	Ursus_americanus
ENSCSEG00000000117	syf2	90	77.209	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	76.606	Ursus_maritimus
ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.311	ENSVPAG00000005705	SYF2	89	77.523	Vicugna_pacos
ENSCSEG00000000117	syf2	90	77.674	ENSVVUG00000027175	-	89	77.064	Vulpes_vulpes
ENSCSEG00000000117	syf2	86	78.049	ENSVVUG00000027181	-	88	77.523	Vulpes_vulpes
ENSCSEG00000000117	syf2	93	76.126	ENSXETG00000022797	syf2	88	76.606	Xenopus_tropicalis
ENSCSEG00000000117	syf2	99	83.544	ENSXMAG00000022698	syf2	92	86.697	Xiphophorus_maculatus