EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCSEG00000001693 (Gene tree)
Gene ID: 103386966
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cynoglossus_semilaevis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6509 bases
Position: chr12:1956679-1963187
Accession: 103386966
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSEP00000002549	CRM1_C	PF08767.11	3e-124	1	1
ENSCSEP00000002549	Xpo1	PF08389.12	5.4e-38	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSET00000002589	XPO1-201	2811	XM_017037461	ENSCSEP00000002549	936 (aa)	XP_016892950	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
csem03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
csem03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	ENSG00000082898	XPO1	88	94.681	Homo_sapiens
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	90.532	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	98.191	ENSAPOG00000004984	-	93	98.191	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSAMEG00000003460	XPO1	88	95.532	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	98.191	ENSACIG00000010818	-	100	98.191	Amphilophus_citrinellus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.553	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.553	Amphilophus_citrinellus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.766	ENSAOCG00000018914	xpo1a	88	92.766	Amphiprion_ocellaris
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	98.085	ENSAOCG00000010121	-	99	96.578	Amphiprion_ocellaris
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	98.085	ENSAPEG00000007038	-	99	96.578	Amphiprion_percula
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.766	ENSAPEG00000006583	xpo1a	96	92.766	Amphiprion_percula
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.979	ENSATEG00000020750	xpo1a	98	93.187	Anabas_testudineus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	98.085	ENSATEG00000008816	-	93	98.085	Anabas_testudineus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.745	ENSAPLG00000004008	XPO1	88	95.745	Anas_platyrhynchos
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.638	ENSACAG00000002501	XPO1	88	95.638	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	ENSANAG00000020802	XPO1	88	94.681	Aotus_nancymaae
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.979	ENSACLG00000015192	-	93	97.979	Astatotilapia_calliptera
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.553	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.553	Astatotilapia_calliptera
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	93.750	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.750	Astyanax_mexicanus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.128	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.112	Astyanax_mexicanus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSBTAG00000013254	XPO1	88	95.532	Bos_taurus
ENSCSEG00000001693	XPO1	99	52.532	WBGene00002078	xpo-1	91	52.632	Caenorhabditis_elegans
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	ENSCJAG00000008877	XPO1	88	94.681	Callithrix_jacchus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSCAFG00000003050	XPO1	88	95.532	Canis_familiaris
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSCAFG00020026910	XPO1	94	95.532	Canis_lupus_dingo
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSCHIG00000018132	XPO1	88	95.532	Capra_hircus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSTSYG00000004330	XPO1	88	95.532	Carlito_syrichta
ENSCSEG00000001693	XPO1	60	90.071	ENSCAPG00000006454	-	100	90.071	Cavia_aperea
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	93.936	ENSCPOG00000034053	XPO1	88	93.936	Cavia_porcellus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	73.812	ENSCCAG00000037445	XPO1	86	74.023	Cebus_capucinus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	ENSCATG00000032674	XPO1	100	94.681	Cercocebus_atys
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.213	ENSCLAG00000012953	XPO1	88	95.213	Chinchilla_lanigera
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	ENSCSAG00000014606	XPO1	88	94.681	Chlorocebus_sabaeus
ENSCSEG00000001693	XPO1	81	97.656	ENSCHOG00000012088	XPO1	71	97.656	Choloepus_hoffmanni
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.745	ENSCPBG00000026239	XPO1	94	95.745	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	81.934	ENSCING00000024562	-	88	81.934	Ciona_intestinalis
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	79.937	ENSCSAVG00000005965	-	88	79.937	Ciona_savignyi
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	90.000	ENSCANG00000028883	XPO1	100	93.972	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.468	ENSCGRG00001000263	Xpo1	88	94.468	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.468	ENSCGRG00000001520	Xpo1	88	94.468	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.128	ENSCVAG00000016558	xpo1a	88	92.128	Cyprinodon_variegatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	98.191	ENSCVAG00000016788	-	88	98.191	Cyprinodon_variegatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.468	ENSDARG00000078041	xpo1a	88	94.468	Danio_rerio
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.128	ENSDARG00000063229	xpo1b	88	97.128	Danio_rerio
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.638	ENSDNOG00000005805	XPO1	88	95.638	Dasypus_novemcinctus
ENSCSEG00000001693	XPO1	90	92.126	ENSDORG00000013050	Xpo1	86	92.126	Dipodomys_ordii
ENSCSEG00000001693	XPO1	99	70.726	FBgn0020497	emb	87	70.726	Drosophila_melanogaster
ENSCSEG00000001693	XPO1	93	95.864	ENSETEG00000018045	XPO1	82	95.864	Echinops_telfairi
ENSCSEG00000001693	XPO1	99	80.576	ENSEBUG00000012580	-	100	87.887	Eptatretus_burgeri
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSEASG00005007223	XPO1	88	95.532	Equus_asinus_asinus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSECAG00000024920	XPO1	94	95.532	Equus_caballus
ENSCSEG00000001693	XPO1	91	91.667	ENSEEUG00000009479	XPO1	80	91.667	Erinaceus_europaeus
ENSCSEG00000001693	XPO1	99	95.508	ENSELUG00000012707	xpo1a	99	95.508	Esox_lucius
ENSCSEG00000001693	XPO1	99	93.683	ENSELUG00000014306	-	99	93.683	Esox_lucius
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSFCAG00000002702	XPO1	88	95.532	Felis_catus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSFALG00000010989	XPO1	88	95.532	Ficedula_albicollis
ENSCSEG00000001693	XPO1	99	95.508	ENSFDAG00000014716	XPO1	88	95.508	Fukomys_damarensis
ENSCSEG00000001693	XPO1	51	97.423	ENSFHEG00000018974	-	98	97.423	Fundulus_heteroclitus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.553	ENSFHEG00000002412	xpo1a	88	92.553	Fundulus_heteroclitus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	93.936	ENSGMOG00000004441	xpo1a	88	93.936	Gadus_morhua
ENSCSEG00000001693	XPO1	93	97.254	ENSGMOG00000019063	-	82	97.254	Gadus_morhua
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.745	ENSGALG00000029476	XPO1	88	95.745	Gallus_gallus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.872	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.872	Gambusia_affinis
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.979	ENSGAFG00000003355	-	95	97.979	Gambusia_affinis
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.553	ENSGACG00000002743	-	88	97.553	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.447	ENSGACG00000019736	xpo1a	88	92.447	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.638	ENSGAGG00000017558	XPO1	88	95.638	Gopherus_agassizii
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	ENSGGOG00000034878	XPO1	88	94.681	Gorilla_gorilla
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.553	ENSHBUG00000007128	xpo1a	88	92.553	Haplochromis_burtoni
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	98.085	ENSHBUG00000020037	-	93	98.085	Haplochromis_burtoni
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.106	ENSHGLG00000003115	XPO1	88	95.106	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.106	ENSHGLG00100012227	XPO1	88	95.106	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.021	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	97.021	Hippocampus_comes
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.340	ENSIPUG00000012891	Xpo1	88	97.340	Ictalurus_punctatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.106	ENSIPUG00000024394	XPO1	88	95.106	Ictalurus_punctatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.319	ENSSTOG00000016122	XPO1	88	95.319	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.426	ENSJJAG00000020468	Xpo1	88	95.426	Jaculus_jaculus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.872	ENSKMAG00000004830	xpo1a	88	92.872	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.553	ENSKMAG00000016218	-	95	97.553	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.979	ENSLBEG00000005740	-	89	98.396	Labrus_bergylta
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	90.466	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.466	Labrus_bergylta
ENSCSEG00000001693	XPO1	99	72.439	ENSLACG00000018213	XPO1	87	72.439	Latimeria_chalumnae
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.340	ENSLOCG00000016095	xpo1b	87	97.340	Lepisosteus_oculatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.213	ENSLAFG00000014553	XPO1	88	95.213	Loxodonta_africana
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	ENSMFAG00000038679	XPO1	88	94.681	Macaca_fascicularis
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	ENSMMUG00000006941	XPO1	88	94.681	Macaca_mulatta
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	ENSMNEG00000030909	XPO1	88	94.681	Macaca_nemestrina
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.691	ENSMLEG00000032004	XPO1	88	92.691	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.872	ENSMAMG00000010568	-	98	98.184	Mastacembelus_armatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.660	ENSMAMG00000023037	xpo1a	93	92.660	Mastacembelus_armatus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.553	ENSMZEG00005005105	xpo1a	88	92.553	Maylandia_zebra
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.979	ENSMZEG00005018158	-	95	97.979	Maylandia_zebra
ENSCSEG00000001693	XPO1	77	95.455	ENSMGAG00000001496	-	100	95.455	Meleagris_gallopavo
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.468	ENSMAUG00000006769	Xpo1	92	94.468	Mesocricetus_auratus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSMICG00000027770	XPO1	88	95.532	Microcebus_murinus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	ENSMOCG00000012169	Xpo1	88	94.681	Microtus_ochrogaster
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	93.298	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	93.298	Mola_mola
ENSCSEG00000001693	XPO1	99	97.861	ENSMMOG00000008001	-	99	97.861	Mola_mola
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.468	ENSMODG00000002831	XPO1	88	94.468	Monodelphis_domestica
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	91.923	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	91.923	Monopterus_albus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.766	ENSMALG00000007085	-	95	98.182	Monopterus_albus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	83.032	Mus_caroli
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.574	ENSMUSG00000020290	Xpo1	88	94.574	Mus_musculus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.468	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	83.032	Mus_pahari
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.574	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	83.032	Mus_spretus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSMPUG00000005560	XPO1	88	95.532	Mustela_putorius_furo
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.426	ENSMLUG00000010670	XPO1	88	95.426	Myotis_lucifugus
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	ENSNGAG00000022158	Xpo1	88	95.532	Nannospalax_galili
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	98.085	ENSNBRG00000012229	-	100	98.085	Neolamprologus_brichardi
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.553	ENSNBRG00000003776	xpo1a	88	92.553	Neolamprologus_brichardi
ENSCSEG00000001693	XPO1	100	90.496	ENSNLEG00000009680	XPO1	88	90.496	Nomascus_leucogenys
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