EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCSEG00000001721 (Gene tree)
Gene ID: 103388180
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Cynoglossus_semilaevis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 810 bases
Position: chr13:4108539-4109348
Accession: 103388180
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSEP00000002588	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	8.8e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSET00000002628	-	810	XM_008323071	ENSCSEP00000002588	269 (aa)	XP_008321293	UPI000497004A

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
csem03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
csem03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	40.138	ENSG00000152464	RPP38	99	44.970	Homo_sapiens
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	58.519	ENSAPOG00000001240	rpp38	95	58.519	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	41.812	ENSAMEG00000018832	RPP38	94	41.577	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	63.235	ENSACIG00000011592	rpp38	97	65.809	Amphilophus_citrinellus
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	56.537	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	56.537	Amphiprion_ocellaris
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	60.526	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	60.526	Amphiprion_percula
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	67.159	ENSATEG00000000731	rpp38	97	67.300	Anabas_testudineus
ENSCSEG00000001721	rpp38	91	41.797	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	42.023	Anas_platyrhynchos
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	66.409	ENSACLG00000016962	rpp38	96	67.181	Astatotilapia_calliptera
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	66.409	ENSACLG00000016958	rpp38	96	67.181	Astatotilapia_calliptera
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	44.402	ENSAMXG00000025023	rpp38	93	44.402	Astyanax_mexicanus
ENSCSEG00000001721	rpp38	98	42.049	ENSBTAG00000007702	RPP38	94	41.516	Bos_taurus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	41.404	ENSCAFG00000024373	RPP38	94	42.199	Canis_familiaris
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	41.404	ENSCAFG00020008008	RPP38	94	42.199	Canis_lupus_dingo
ENSCSEG00000001721	rpp38	92	43.333	ENSCHIG00000012484	RPP38	88	43.243	Capra_hircus
ENSCSEG00000001721	rpp38	94	44.074	ENSCPOG00000003981	RPP38	88	42.322	Cavia_porcellus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.403	ENSCLAG00000010194	RPP38	94	41.912	Chinchilla_lanigera
ENSCSEG00000001721	rpp38	94	40.959	ENSCSAG00000019055	RPP38	94	41.606	Chlorocebus_sabaeus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.708	ENSCHOG00000004335	RPP38	94	42.599	Choloepus_hoffmanni
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	41.549	ENSCGRG00001001395	Rpp38	94	41.026	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	41.549	ENSCGRG00000017441	Rpp38	94	41.026	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	56.044	ENSCVAG00000001676	rpp38	95	57.875	Cyprinodon_variegatus
ENSCSEG00000001721	rpp38	97	51.481	ENSDARG00000040350	rpp38	95	51.311	Danio_rerio
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.509	ENSDNOG00000040314	RPP38	94	42.029	Dasypus_novemcinctus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	40.714	ENSDORG00000009783	Rpp38	93	40.149	Dipodomys_ordii
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.561	ENSETEG00000002839	RPP38	94	42.086	Echinops_telfairi
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	40.138	ENSEASG00005019783	RPP38	93	39.928	Equus_asinus_asinus
ENSCSEG00000001721	rpp38	94	38.889	ENSEEUG00000014677	RPP38	88	39.382	Erinaceus_europaeus
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	51.903	ENSELUG00000010160	rpp38	96	51.903	Esox_lucius
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	40.138	ENSFCAG00000022449	RPP38	94	39.928	Felis_catus
ENSCSEG00000001721	rpp38	93	42.803	ENSFALG00000014804	RPP38	89	43.396	Ficedula_albicollis
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	40.625	ENSFDAG00000018669	RPP38	94	40.072	Fukomys_damarensis
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	58.571	ENSFHEG00000013741	rpp38	96	58.123	Fundulus_heteroclitus
ENSCSEG00000001721	rpp38	91	44.015	ENSGALG00000008794	RPP38	86	43.346	Gallus_gallus
ENSCSEG00000001721	rpp38	59	69.136	ENSGACG00000009258	rpp38	99	69.136	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	66.795	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	67.568	Haplochromis_burtoni
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	43.007	ENSHGLG00000012144	RPP38	94	42.545	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	46.743	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.126	Ictalurus_punctatus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.069	ENSSTOG00000025699	RPP38	92	42.391	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	44.599	ENSJJAG00000007523	Rpp38	94	44.043	Jaculus_jaculus
ENSCSEG00000001721	rpp38	92	61.450	ENSKMAG00000003986	rpp38	90	61.686	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	60.949	ENSLBEG00000006853	rpp38	96	60.755	Labrus_bergylta
ENSCSEG00000001721	rpp38	90	41.111	ENSLACG00000006502	RPP38	88	41.418	Latimeria_chalumnae
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	43.571	ENSLOCG00000018347	rpp38	93	43.911	Lepisosteus_oculatus
ENSCSEG00000001721	rpp38	94	43.494	ENSLAFG00000000509	RPP38	89	43.023	Loxodonta_africana
ENSCSEG00000001721	rpp38	94	40.590	ENSMMUG00000007679	RPP38	94	41.241	Macaca_mulatta
ENSCSEG00000001721	rpp38	98	66.288	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	66.023	Mastacembelus_armatus
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	66.409	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	67.181	Maylandia_zebra
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	67.181	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	67.954	Maylandia_zebra
ENSCSEG00000001721	rpp38	91	43.191	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	43.191	Meleagris_gallopavo
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	40.484	ENSMAUG00000003644	Rpp38	94	40.293	Mesocricetus_auratus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	40.000	ENSMOCG00000007020	Rpp38	94	39.427	Microtus_ochrogaster
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	57.509	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	57.736	Mola_mola
ENSCSEG00000001721	rpp38	91	43.077	ENSMODG00000024091	RPP38	90	43.077	Monodelphis_domestica
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	62.681	ENSMALG00000002356	rpp38	96	62.593	Monopterus_albus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	43.056	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	42.806	Mus_caroli
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.361	ENSMUSG00000049950	Rpp38	94	42.806	Mus_musculus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.199	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.165	Mus_pahari
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.361	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	42.806	Mus_spretus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	40.493	ENSMPUG00000018523	RPP38	94	40.217	Mustela_putorius_furo
ENSCSEG00000001721	rpp38	94	38.376	ENSMLUG00000002153	RPP38	94	39.781	Myotis_lucifugus
ENSCSEG00000001721	rpp38	98	42.606	ENSNGAG00000011066	Rpp38	94	42.238	Nannospalax_galili
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	64.231	ENSNBRG00000006994	rpp38	97	67.308	Neolamprologus_brichardi
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	66.154	ENSONIG00000020467	rpp38	95	66.923	Oreochromis_niloticus
ENSCSEG00000001721	rpp38	94	41.791	ENSOCUG00000024367	-	94	42.066	Oryctolagus_cuniculus
ENSCSEG00000001721	rpp38	94	41.791	ENSOCUG00000022768	-	94	42.066	Oryctolagus_cuniculus
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	60.985	ENSORLG00000009219	rpp38	95	60.985	Oryzias_latipes
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	60.300	ENSORLG00020011503	rpp38	92	60.150	Oryzias_latipes_hni
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	59.551	ENSORLG00015017702	rpp38	92	59.480	Oryzias_latipes_hsok
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	59.551	ENSOMEG00000005414	rpp38	95	60.674	Oryzias_melastigma
ENSCSEG00000001721	rpp38	100	42.808	ENSOGAG00000008059	RPP38	95	42.199	Otolemur_garnettii
ENSCSEG00000001721	rpp38	92	44.403	ENSOARG00000004534	RPP38	88	43.893	Ovis_aries
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	40.767	ENSPPAG00000041577	RPP38	86	40.502	Pan_paniscus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	39.796	ENSPPRG00000015329	RPP38	94	39.568	Panthera_pardus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	39.024	ENSPTIG00000007188	RPP38	94	39.209	Panthera_tigris_altaica
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	40.767	ENSPTRG00000002318	RPP38	86	40.502	Pan_troglodytes
ENSCSEG00000001721	rpp38	93	47.692	ENSPKIG00000025652	rpp38	93	48.315	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCSEG00000001721	rpp38	95	41.328	ENSPSIG00000001527	RPP38	90	40.769	Pelodiscus_sinensis
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.199	ENSPEMG00000008375	Rpp38	94	42.435	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCSEG00000001721	rpp38	95	44.485	ENSPCIG00000009096	RPP38	85	43.893	Phascolarctos_cinereus
ENSCSEG00000001721	rpp38	75	58.654	ENSPFOG00000016823	rpp38	95	58.586	Poecilia_formosa
ENSCSEG00000001721	rpp38	100	51.930	ENSPLAG00000007626	rpp38	96	53.455	Poecilia_latipinna
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	48.699	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	50.558	Poecilia_mexicana
ENSCSEG00000001721	rpp38	95	54.982	ENSPREG00000017744	rpp38	93	55.939	Poecilia_reticulata
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.308	ENSPPYG00000002113	RPP38	94	41.935	Pongo_abelii
ENSCSEG00000001721	rpp38	94	40.794	ENSPVAG00000007155	RPP38	94	41.429	Pteropus_vampyrus
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	66.795	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	67.568	Pundamilia_nyererei
ENSCSEG00000001721	rpp38	91	45.749	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	46.565	Pygocentrus_nattereri
ENSCSEG00000001721	rpp38	98	43.956	ENSRNOG00000038025	Rpp38	94	43.284	Rattus_norvegicus
ENSCSEG00000001721	rpp38	95	43.382	ENSSHAG00000015529	RPP38	90	42.912	Sarcophilus_harrisii
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	64.093	ENSSMAG00000018276	rpp38	91	63.745	Scophthalmus_maximus
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	67.954	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	68.582	Seriola_dumerili
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	67.433	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	67.816	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	36.918	ENSSARG00000012099	RPP38	93	36.194	Sorex_araneus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	43.214	ENSSPUG00000005237	-	92	43.071	Sphenodon_punctatus
ENSCSEG00000001721	rpp38	100	42.403	ENSSPUG00000018363	-	95	41.912	Sphenodon_punctatus
ENSCSEG00000001721	rpp38	95	41.418	ENSSPUG00000008560	-	90	40.856	Sphenodon_punctatus
ENSCSEG00000001721	rpp38	96	57.471	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	57.471	Stegastes_partitus
ENSCSEG00000001721	rpp38	94	43.841	ENSSSCG00000027110	RPP38	88	43.396	Sus_scrofa
ENSCSEG00000001721	rpp38	93	43.561	ENSTGUG00000001366	RPP38	92	44.151	Taeniopygia_guttata
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	60.148	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	60.837	Tetraodon_nigroviridis
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	41.869	ENSTTRG00000004420	RPP38	94	41.367	Tursiops_truncatus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	41.638	ENSUAMG00000002618	RPP38	94	41.935	Ursus_americanus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.160	ENSUMAG00000012382	RPP38	94	41.667	Ursus_maritimus
ENSCSEG00000001721	rpp38	99	41.522	ENSVVUG00000005272	RPP38	94	41.993	Vulpes_vulpes
ENSCSEG00000001721	rpp38	91	42.529	ENSXETG00000003419	rpp38	91	42.529	Xenopus_tropicalis