EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCSEG00000008807 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cynoglossus_semilaevis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10471 bases
Position: chr8:3327672-3338142
Accession: 103381594
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSCSEP00000013719	eRF1_1	PF03463.15	4.4e-51	1	1
ENSCSEP00000013738	eRF1_1	PF03463.15	6.1e-50	1	1

Transcripts

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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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ENSCSEG00000008807	pelo	64	92.713	ENSAPOG00000023700	-	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.948	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000008807	pelo	100	79.740	ENSAMEG00000007734	PELO	100	79.740	Ailuropoda_melanoleuca
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ENSCSEG00000008807	pelo	100	90.649	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.649	Astatotilapia_calliptera
ENSCSEG00000008807	pelo	97	92.493	ENSAMXG00000020299	pelo	100	91.710	Astyanax_mexicanus
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ENSCSEG00000008807	pelo	100	79.481	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	Capra_hircus
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ENSCSEG00000008807	pelo	97	80.697	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.260	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSEG00000008807	pelo	97	81.501	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.039	Cricetulus_griseus_crigri
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ENSCSEG00000008807	pelo	96	67.297	FBgn0011207	pelo	98	65.375	Drosophila_melanogaster
ENSCSEG00000008807	pelo	71	79.532	ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	Eptatretus_burgeri
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