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Description

Ensembl ID: ENSCSEG00000012674 (Gene tree)
Gene ID: 103389990
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cynoglossus_semilaevis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 25863 bases
Position: chr14:18596368-18622230
Accession: 103389990
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSEP00000019878	IBN_N	PF03810.19	1.8e-15	1	1
ENSCSEP00000019904	IBN_N	PF03810.19	1.8e-15	1	1
ENSCSEP00000019864	IBN_N	PF03810.19	1.9e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSET00000020121	-	6681	-	ENSCSEP00000019878	890 (aa)	-	UPI0004962ECC
ENSCSET00000020105	-	6393	XM_008325661	ENSCSEP00000019864	929 (aa)	-	-
ENSCSET00000020149	-	5885	XM_025062749	ENSCSEP00000019904	890 (aa)	XP_024918517	UPI0004962ECC

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCSEG00000012674	tnpo1	87	84.476	ENSCSEG00000011477	-	99	84.476
ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	83.127	ENSCSEG00000012923	tnpo2	99	83.127

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSG00000083312	TNPO1	100	92.247	Homo_sapiens
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.854	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	96.854	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.314	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.425	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSEG00000012674	tnpo1	87	95.995	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	95.995	Amphilophus_citrinellus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.966	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	96.966	Amphiprion_ocellaris
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.966	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	96.966	Amphiprion_percula
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.629	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	96.629	Anabas_testudineus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	89.290	ENSAPLG00000009619	-	99	89.064	Anas_platyrhynchos
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.697	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.697	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.798	ENSANAG00000022453	-	99	91.798	Aotus_nancymaae
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	82.472	ENSANAG00000025351	-	99	82.472	Aotus_nancymaae
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	94.494	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	94.494	Astatotilapia_calliptera
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.610	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.161	Astyanax_mexicanus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.360	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	92.360	Bos_taurus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.910	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	91.910	Callithrix_jacchus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	92.415	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.415	Canis_familiaris
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	89.775	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	89.775	Canis_lupus_dingo
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.247	Capra_hircus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	88.927	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.228	Carlito_syrichta
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.798	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	91.798	Cebus_capucinus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	92.247	Cercocebus_atys
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.022	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.022	Chinchilla_lanigera
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.247	Chlorocebus_sabaeus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	94	80.691	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.691	Choloepus_hoffmanni
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.034	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.042	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	75.982	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.758	Ciona_savignyi
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.247	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.247	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	92.632	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.632	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.180	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.180	Cyprinodon_variegatus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.490	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.929	Danio_rerio
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	86.562	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	86.562	Dasypus_novemcinctus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	93	92.530	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.521	Dipodomys_ordii
ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	58.625	FBgn0035693	CG8219	99	58.399	Drosophila_melanogaster
ENSCSEG00000012674	tnpo1	86	93.633	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	93.633	Echinops_telfairi
ENSCSEG00000012674	tnpo1	94	84.762	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.762	Eptatretus_burgeri
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	92.247	Equus_asinus_asinus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.247	Equus_caballus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	87.037	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.710	Esox_lucius
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	92.247	Felis_catus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.146	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.146	Ficedula_albicollis
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.910	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	91.910	Fukomys_damarensis
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.184	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.184	Fundulus_heteroclitus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.273	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.282	Gadus_morhua
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.360	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.360	Gallus_gallus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.516	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	95.516	Gambusia_affinis
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.393	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.393	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.146	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.146	Gopherus_agassizii
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	77.018	ENSGGOG00000022535	-	99	76.957	Gorilla_gorilla
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	92.247	Gorilla_gorilla
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.292	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.292	Haplochromis_burtoni
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.022	ENSHGLG00000000970	-	99	92.022	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	92.290	ENSHGLG00100017090	-	99	92.290	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSEG00000012674	tnpo1	97	72.326	ENSHGLG00100000963	-	99	71.977	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.360	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.360	Jaculus_jaculus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.618	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	95.618	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	91	93.711	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.711	Labrus_bergylta
ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	86.860	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.860	Latimeria_chalumnae
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.933	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	93.933	Lepisosteus_oculatus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	97	91.801	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	91.801	Loxodonta_africana
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.247	Macaca_fascicularis
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.135	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.212	Macaca_mulatta
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.247	Macaca_nemestrina
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.247	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.517	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	96.517	Mastacembelus_armatus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.843	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	95.843	Maylandia_zebra
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	91.573	Mesocricetus_auratus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	88.427	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.427	Microcebus_murinus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.247	Microtus_ochrogaster
ENSCSEG00000012674	tnpo1	87	95.490	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.490	Mola_mola
ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	93.191	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.191	Monodelphis_domestica
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.506	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	95.506	Monopterus_albus
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ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	92.565	Mus_musculus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.360	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.689	Mus_pahari
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.022	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	92.317	Mus_spretus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.247	Mustela_putorius_furo
ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	92.317	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.317	Myotis_lucifugus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.247	Nannospalax_galili
ENSCSEG00000012674	tnpo1	87	95.866	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	95.866	Neolamprologus_brichardi
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	92.247	Nomascus_leucogenys
ENSCSEG00000012674	tnpo1	90	87.117	ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	87.090	Ochotona_princeps
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.798	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.798	Octodon_degus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.536	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	95.546	Oreochromis_niloticus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	92	93.659	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.659	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	86.449	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.449	Oryctolagus_cuniculus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	87	95.071	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	95.071	Oryzias_latipes
ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	95.039	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	95.039	Oryzias_latipes_hni
ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	95.378	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	95.378	Oryzias_latipes_hsok
ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	95.490	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	95.490	Oryzias_melastigma
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.247	Otolemur_garnettii
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.360	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.360	Ovis_aries
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.247	Pan_paniscus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	92.247	Panthera_pardus
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	92.247	Panthera_tigris_altaica
ENSCSEG00000012674	tnpo1	94	81.354	ENSPTRG00000047731	-	100	81.354	Pan_troglodytes
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.247	Pan_troglodytes
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.247	Papio_anubis
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	90.112	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.112	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.034	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.042	Pelodiscus_sinensis
ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.929	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	92.593	Periophthalmus_magnuspinnatus
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