EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCSEG00000016775 (Gene tree)
Gene ID: 103393137
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Cynoglossus_semilaevis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11581 bases
Position: chr17:9943534-9955114
Accession: 103393137
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSEP00000026325	GTP_EFTU	PF00009.27	5e-44	1	1
ENSCSEP00000026346	GTP_EFTU	PF00009.27	1.3e-38	1	1
ENSCSEP00000026346	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	9.8e-13	1	1
ENSCSEP00000026325	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1e-12	1	1
ENSCSEP00000026346	EFG_IV	PF03764.18	9.8e-25	1	1
ENSCSEP00000026325	EFG_IV	PF03764.18	1e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSET00000026699	-	2895	-	ENSCSEP00000026346	964 (aa)	-	-
ENSCSET00000026671	-	4844	XM_008329998	ENSCSEP00000026325	971 (aa)	XP_008328220	UPI0004960203

Gene Model

Click here to download ENSCSEG00000016775's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
csem03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCSEG00000016775's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCSEG00000016775	eftud2	87	37.041	ENSCSEG00000002828	-	98	37.384
ENSCSEG00000016775	eftud2	85	30.310	ENSCSEG00000005856	efl1	95	30.310
ENSCSEG00000016775	eftud2	86	37.500	ENSCSEG00000014097	eef2b	99	37.500

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.455	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	98.455	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.770	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.130	ENSACIG00000009096	eftud2	100	94.130	Amphilophus_citrinellus
ENSCSEG00000016775	eftud2	88	92.353	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	92.353	Amphiprion_ocellaris
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.352	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	98.352	Amphiprion_percula
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.455	ENSATEG00000000457	eftud2	100	98.455	Anabas_testudineus
ENSCSEG00000016775	eftud2	99	88.260	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.465	Anas_platyrhynchos
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	90.947	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.358	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.872	Aotus_nancymaae
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.043	ENSACLG00000001296	eftud2	100	98.043	Astatotilapia_calliptera
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.371	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.371	Astyanax_mexicanus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.564	Bos_taurus
ENSCSEG00000016775	eftud2	99	70.351	WBGene00001166	eftu-2	99	70.041	Caenorhabditis_elegans
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.872	Callithrix_jacchus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.770	Canis_familiaris
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.770	Canis_lupus_dingo
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.564	Capra_hircus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.872	Carlito_syrichta
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	91.564	Cavia_aperea
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.564	Cavia_porcellus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.872	Cebus_capucinus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.872	Cercocebus_atys
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.255	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.358	Chinchilla_lanigera
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.872	Chlorocebus_sabaeus
ENSCSEG00000016775	eftud2	91	80.631	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.631	Choloepus_hoffmanni
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	77.823	ENSCING00000009372	-	100	77.515	Ciona_intestinalis
ENSCSEG00000016775	eftud2	99	77.835	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.481	Ciona_savignyi
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.872	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.461	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.461	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.116	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.116	Cyprinodon_variegatus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.233	ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.233	Danio_rerio
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.770	Dasypus_novemcinctus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.564	Dipodomys_ordii
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	74.590	FBgn0039566	CG4849	100	74.154	Drosophila_melanogaster
ENSCSEG00000016775	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSCSEG00000016775	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.344	Eptatretus_burgeri
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.770	Equus_asinus_asinus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.667	Equus_caballus
ENSCSEG00000016775	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.027	ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.615	Esox_lucius
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.667	Felis_catus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.461	Ficedula_albicollis
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.564	Fukomys_damarensis
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.116	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	97.116	Fundulus_heteroclitus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	96.296	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	96.296	Gadus_morhua
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.255	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.261	Gallus_gallus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.116	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	97.116	Gambusia_affinis
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.734	ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.734	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.872	Gorilla_gorilla
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.940	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.940	Haplochromis_burtoni
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.358	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.358	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	96.708	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.708	Hippocampus_comes
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.542	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.542	Ictalurus_punctatus
ENSCSEG00000016775	eftud2	91	92.680	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.492	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSEG00000016775	eftud2	95	93.370	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.370	Jaculus_jaculus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	96.807	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	96.807	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSEG00000016775	eftud2	95	97.624	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.176	Labrus_bergylta
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	93.100	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.100	Latimeria_chalumnae
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.748	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	94.439	Lepisosteus_oculatus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.564	Loxodonta_africana
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.872	Macaca_fascicularis
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.872	Macaca_nemestrina
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.872	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.734	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	97.734	Mastacembelus_armatus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.043	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	98.043	Maylandia_zebra
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.068	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.273	Meleagris_gallopavo
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.564	Mesocricetus_auratus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.872	Microcebus_murinus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSMOCG00000009039	-	100	91.564	Microtus_ochrogaster
ENSCSEG00000016775	eftud2	92	75.056	ENSMOCG00000017653	-	90	75.169	Microtus_ochrogaster
ENSCSEG00000016775	eftud2	88	98.471	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	98.471	Mola_mola
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.872	Monodelphis_domestica
ENSCSEG00000016775	eftud2	88	96.941	ENSMALG00000014501	eftud2	100	96.941	Monopterus_albus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.461	Mus_caroli
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.761	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	91.761	Mus_musculus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.461	Mus_pahari
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.461	Mus_spretus
ENSCSEG00000016775	eftud2	97	91.102	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.314	Mustela_putorius_furo
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.770	Myotis_lucifugus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.461	Nannospalax_galili
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.940	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.940	Neolamprologus_brichardi
ENSCSEG00000016775	eftud2	97	89.586	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.798	Nomascus_leucogenys
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	87.963	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.169	Notamacropus_eugenii
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	83.642	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.848	Ochotona_princeps
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSODEG00000018041	-	100	91.049	Octodon_degus
ENSCSEG00000016775	eftud2	93	75.610	ENSODEG00000003385	-	100	75.877	Octodon_degus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.043	ENSONIG00000000912	eftud2	100	98.043	Oreochromis_niloticus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.770	Oryctolagus_cuniculus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.734	ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.734	Oryzias_latipes
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.631	ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.631	Oryzias_latipes_hni
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.528	ENSORLG00015002611	eftud2	100	98.148	Oryzias_latipes_hsok
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	90.123	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.329	Otolemur_garnettii
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.564	Ovis_aries
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.872	Pan_paniscus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.770	Panthera_pardus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.770	Panthera_tigris_altaica
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.872	Pan_troglodytes
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.872	Papio_anubis
ENSCSEG00000016775	eftud2	93	89.526	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.746	Pelodiscus_sinensis
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	88.671	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	88.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.461	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.872	Phascolarctos_cinereus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.219	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	97.219	Poecilia_formosa
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.219	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	97.219	Poecilia_latipinna
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.219	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	97.219	Poecilia_mexicana
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	90.432	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.638	Pongo_abelii
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	87.860	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.066	Procavia_capensis
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.872	Propithecus_coquereli
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	87.140	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.346	Pteropus_vampyrus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.940	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	97.940	Pundamilia_nyererei
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.851	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.851	Pygocentrus_nattereri
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.864	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.864	Rattus_norvegicus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.770	Rhinopithecus_bieti
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.770	Rhinopithecus_roxellana
ENSCSEG00000016775	eftud2	97	33.664	YKL173W	SNU114	91	34.325	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.872	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCSEG00000016775	eftud2	95	93.370	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.370	Sarcophilus_harrisii
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.748	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.336	Scleropages_formosus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.425	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	97.425	Scophthalmus_maximus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.352	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.352	Seriola_dumerili
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.455	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	98.455	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	83.642	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.848	Sorex_araneus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.255	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.461	Sphenodon_punctatus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	98.352	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	98.352	Stegastes_partitus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.564	Sus_scrofa
ENSCSEG00000016775	eftud2	83	92.164	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.164	Taeniopygia_guttata
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	96.498	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.498	Takifugu_rubripes
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.897	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.897	Tetraodon_nigroviridis
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	86.317	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.523	Tupaia_belangeri
ENSCSEG00000016775	eftud2	91	89.444	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.444	Tursiops_truncatus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	90.432	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.638	Ursus_americanus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.770	Ursus_maritimus
ENSCSEG00000016775	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.564	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.770	Vulpes_vulpes
ENSCSEG00000016775	eftud2	96	92.193	ENSXETG00000003394	eftud2	98	93.036	Xenopus_tropicalis
ENSCSEG00000016775	eftud2	81	97.832	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.832	Xiphophorus_couchianus
ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.116	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.116	Xiphophorus_maculatus