EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCSEG00000017157 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nanos2
Alias: -
Full Name: nanos homolog 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Cynoglossus_semilaevis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 564 bases
Position: chr3:10443065-10443628
Accession: 107988356
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSEP00000026865	zf-nanos	PF05741.13	4.2e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSET00000027225	-	486	XM_017031416	ENSCSEP00000026865	161 (aa)	XP_016886905	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSEG00000017157	nanos2	78	41.481	ENSG00000187556	NANOS3	67	39.844	Homo_sapiens
ENSCSEG00000017157	nanos2	77	38.710	ENSG00000188425	NANOS2	80	38.281	Homo_sapiens
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	48.507	ENSAPOG00000020274	nanos2	78	53.435	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000017157	nanos2	87	40.714	ENSAMEG00000012972	NANOS3	68	37.143	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSEG00000017157	nanos2	84	39.706	ENSACIG00000007105	nanos2	75	38.971	Amphilophus_citrinellus
ENSCSEG00000017157	nanos2	84	44.853	ENSAOCG00000009429	nanos2	80	48.120	Amphiprion_ocellaris
ENSCSEG00000017157	nanos2	84	44.853	ENSAPEG00000019139	nanos2	81	49.624	Amphiprion_percula
ENSCSEG00000017157	nanos2	89	47.973	ENSATEG00000009393	nanos2	88	46.853	Anabas_testudineus
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	41.732	ENSACAG00000024639	-	86	40.580	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	40.945	ENSACAG00000027728	-	86	39.855	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	40.945	ENSACAG00000026334	-	85	37.956	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	41.732	ENSACAG00000023855	-	86	40.580	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	41.732	ENSACAG00000010268	-	86	40.580	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	41.732	ENSACAG00000026757	-	82	42.188	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	40.625	ENSACAG00000022790	-	84	40.625	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	41.732	ENSACAG00000005197	-	82	42.188	Anolis_carolinensis
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ENSCSEG00000017157	nanos2	79	41.732	ENSACAG00000024274	-	86	40.580	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	41.732	ENSACAG00000023823	-	82	42.188	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000017157	nanos2	79	41.732	ENSACAG00000025505	-	82	40.625	Anolis_carolinensis
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ENSCSEG00000017157	nanos2	79	39.370	ENSACAG00000027983	-	85	38.686	Anolis_carolinensis
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ENSCSEG00000017157	nanos2	77	39.516	ENSCAFG00020001772	NANOS2	83	36.496	Canis_lupus_dingo
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ENSCSEG00000017157	nanos2	87	37.857	ENSTSYG00000026709	NANOS3	68	36.429	Carlito_syrichta
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ENSCSEG00000017157	nanos2	77	37.097	ENSCPOG00000014969	NANOS2	78	36.800	Cavia_porcellus
ENSCSEG00000017157	nanos2	78	41.270	ENSCCAG00000036253	NANOS3	63	36.923	Cebus_capucinus
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ENSCSEG00000017157	nanos2	87	39.041	ENSCLAG00000015139	NANOS3	67	37.143	Chinchilla_lanigera
ENSCSEG00000017157	nanos2	77	39.516	ENSCLAG00000001832	NANOS2	79	38.710	Chinchilla_lanigera
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ENSCSEG00000017157	nanos2	77	39.695	ENSCSAG00000019629	NANOS2	80	37.795	Chlorocebus_sabaeus
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