EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCSEG00000017194 (Gene tree)
Gene ID: 103378462
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Cynoglossus_semilaevis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4140 bases
Position: chr4:16988083-16992222
Accession: 103378462
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSEP00000026979	MMR_HSR1	PF01926.23	3.9e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSET00000027340	-	828	XM_008309684	ENSCSEP00000026979	275 (aa)	XP_008307906	-

Gene Model

Click here to download ENSCSEG00000017194's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
csem03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCSEG00000017194's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSEG00000017194	srprb	100	86.282	ENSAPOG00000021219	srprb	100	86.282	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000017194	srprb	97	86.466	ENSACIG00000014621	srprb	100	86.466	Amphilophus_citrinellus
ENSCSEG00000017194	srprb	100	84.838	ENSAOCG00000017265	srprb	100	84.838	Amphiprion_ocellaris
ENSCSEG00000017194	srprb	100	84.838	ENSAPEG00000024541	srprb	88	84.838	Amphiprion_percula
ENSCSEG00000017194	srprb	100	82.545	ENSATEG00000014016	srprb	100	82.545	Anabas_testudineus
ENSCSEG00000017194	srprb	100	86.232	ENSACLG00000016748	srprb	100	86.232	Astatotilapia_calliptera
ENSCSEG00000017194	srprb	97	68.797	ENSAMXG00000044118	srprb	100	68.797	Astyanax_mexicanus
ENSCSEG00000017194	srprb	97	84.586	ENSCVAG00000004221	srprb	100	84.586	Cyprinodon_variegatus
ENSCSEG00000017194	srprb	97	69.925	ENSDARG00000030949	srprb	100	69.925	Danio_rerio
ENSCSEG00000017194	srprb	97	76.404	ENSELUG00000009740	srprb	98	76.404	Esox_lucius
ENSCSEG00000017194	srprb	97	83.459	ENSFHEG00000006004	srprb	100	83.459	Fundulus_heteroclitus
ENSCSEG00000017194	srprb	99	77.860	ENSGMOG00000002081	srprb	100	77.860	Gadus_morhua
ENSCSEG00000017194	srprb	96	82.576	ENSGAFG00000012593	srprb	99	82.576	Gambusia_affinis
ENSCSEG00000017194	srprb	99	84.133	ENSGACG00000009891	srprb	100	84.133	Gasterosteus_aculeatus
ENSCSEG00000017194	srprb	100	86.232	ENSHBUG00000002145	srprb	100	86.232	Haplochromis_burtoni
ENSCSEG00000017194	srprb	98	77.695	ENSHCOG00000007732	srprb	99	77.695	Hippocampus_comes
ENSCSEG00000017194	srprb	97	65.543	ENSIPUG00000004177	srprb	100	65.543	Ictalurus_punctatus
ENSCSEG00000017194	srprb	97	80.827	ENSKMAG00000020736	srprb	100	80.827	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSEG00000017194	srprb	100	84.000	ENSLBEG00000021483	srprb	100	84.000	Labrus_bergylta
ENSCSEG00000017194	srprb	99	68.000	ENSLOCG00000009740	srprb	92	68.364	Lepisosteus_oculatus
ENSCSEG00000017194	srprb	100	84.000	ENSMAMG00000011876	srprb	100	84.000	Mastacembelus_armatus
ENSCSEG00000017194	srprb	94	87.259	ENSMZEG00005016621	srprb	100	87.259	Maylandia_zebra
ENSCSEG00000017194	srprb	97	83.146	ENSMMOG00000012550	srprb	99	83.146	Mola_mola
ENSCSEG00000017194	srprb	100	81.455	ENSMALG00000012595	srprb	100	81.455	Monopterus_albus
ENSCSEG00000017194	srprb	75	85.437	ENSNBRG00000004699	srprb	95	79.646	Neolamprologus_brichardi
ENSCSEG00000017194	srprb	100	85.455	ENSONIG00000003788	srprb	82	85.455	Oreochromis_niloticus
ENSCSEG00000017194	srprb	99	77.491	ENSORLG00000006430	srprb	99	77.491	Oryzias_latipes
ENSCSEG00000017194	srprb	99	77.860	ENSORLG00020003413	srprb	99	77.860	Oryzias_latipes_hni
ENSCSEG00000017194	srprb	99	77.860	ENSORLG00015000166	srprb	99	77.860	Oryzias_latipes_hsok
ENSCSEG00000017194	srprb	99	78.598	ENSOMEG00000012735	srprb	99	78.598	Oryzias_melastigma
ENSCSEG00000017194	srprb	97	68.165	ENSPKIG00000013147	srprb	99	68.165	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCSEG00000017194	srprb	100	78.909	ENSPMGG00000014061	srprb	100	78.909	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCSEG00000017194	srprb	96	82.955	ENSPFOG00000011347	srprb	96	82.955	Poecilia_formosa
ENSCSEG00000017194	srprb	94	83.721	ENSPLAG00000001156	srprb	100	83.721	Poecilia_latipinna
ENSCSEG00000017194	srprb	94	82.946	ENSPMEG00000012169	srprb	100	82.946	Poecilia_mexicana
ENSCSEG00000017194	srprb	94	82.171	ENSPREG00000001449	srprb	100	82.171	Poecilia_reticulata
ENSCSEG00000017194	srprb	100	86.232	ENSPNYG00000005911	srprb	100	86.232	Pundamilia_nyererei
ENSCSEG00000017194	srprb	97	70.301	ENSPNAG00000009983	srprb	100	70.301	Pygocentrus_nattereri
ENSCSEG00000017194	srprb	92	73.622	ENSSFOG00015019355	srprb	95	73.622	Scleropages_formosus
ENSCSEG00000017194	srprb	100	85.091	ENSSMAG00000013202	srprb	100	85.091	Scophthalmus_maximus
ENSCSEG00000017194	srprb	100	85.091	ENSSDUG00000018746	srprb	94	85.091	Seriola_dumerili
ENSCSEG00000017194	srprb	100	85.455	ENSSLDG00000020560	srprb	100	85.455	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCSEG00000017194	srprb	100	84.838	ENSSPAG00000008898	srprb	100	84.838	Stegastes_partitus
ENSCSEG00000017194	srprb	99	82.418	ENSTRUG00000022463	srprb	99	82.418	Takifugu_rubripes
ENSCSEG00000017194	srprb	95	80.153	ENSTNIG00000007725	srprb	100	80.153	Tetraodon_nigroviridis
ENSCSEG00000017194	srprb	94	84.496	ENSXCOG00000012585	srprb	100	84.496	Xiphophorus_couchianus
ENSCSEG00000017194	srprb	94	84.109	ENSXMAG00000028725	srprb	100	84.109	Xiphophorus_maculatus