EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCSEG00000019857 (Gene tree)
Gene ID: 103390281
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cynoglossus_semilaevis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46537 bases
Position: chr14:25408012-25454548
Accession: 103390281
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCSEP00000031027	MIF4G	PF02854.19	2.2e-25	1	1
ENSCSEP00000031026	MIF4G	PF02854.19	2.4e-25	1	1
ENSCSEP00000031032	MIF4G	PF02854.19	2.4e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCSET00000031434	-	5126	-	ENSCSEP00000031027	677 (aa)	-	-
ENSCSET00000031439	-	3032	XM_008326083	ENSCSEP00000031032	704 (aa)	XP_008324305	UPI000498699E
ENSCSET00000031433	-	5207	-	ENSCSEP00000031026	704 (aa)	XP_024917965	UPI000498699E

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.980	ENSG00000134030	CTIF	100	47.586	Homo_sapiens
ENSCSEG00000019857	ctif	92	81.471	ENSAPOG00000020192	ctif	96	81.471	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCSEG00000019857	ctif	81	54.181	ENSAMEG00000006759	CTIF	54	60.623	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCSEG00000019857	ctif	100	80.481	ENSACIG00000017099	ctif	100	79.066	Amphilophus_citrinellus
ENSCSEG00000019857	ctif	100	77.273	ENSAOCG00000014275	ctif	100	75.426	Amphiprion_ocellaris
ENSCSEG00000019857	ctif	100	81.716	ENSAPEG00000016975	ctif	100	80.556	Amphiprion_percula
ENSCSEG00000019857	ctif	100	82.794	ENSATEG00000016752	ctif	100	81.047	Anabas_testudineus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	58.832	ENSACAG00000018006	CTIF	99	55.322	Anolis_carolinensis
ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.058	ENSANAG00000024925	CTIF	60	62.060	Aotus_nancymaae
ENSCSEG00000019857	ctif	100	80.309	ENSACLG00000005956	ctif	100	78.481	Astatotilapia_calliptera
ENSCSEG00000019857	ctif	53	62.881	ENSAMXG00000015964	ctif	100	60.942	Astyanax_mexicanus
ENSCSEG00000019857	ctif	89	87.500	ENSBTAG00000018901	CTIF	89	86.000	Bos_taurus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.602	ENSCJAG00000004729	CTIF	60	61.662	Callithrix_jacchus
ENSCSEG00000019857	ctif	97	52.263	ENSCAFG00000019076	CTIF	91	60.367	Canis_familiaris
ENSCSEG00000019857	ctif	97	52.263	ENSCAFG00020026482	CTIF	91	60.367	Canis_lupus_dingo
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.247	ENSCHIG00000014455	CTIF	91	60.963	Capra_hircus
ENSCSEG00000019857	ctif	81	54.707	ENSTSYG00000030461	CTIF	66	60.054	Carlito_syrichta
ENSCSEG00000019857	ctif	99	50.573	ENSCAPG00000011865	CTIF	91	61.930	Cavia_aperea
ENSCSEG00000019857	ctif	99	52.699	ENSCPOG00000001049	CTIF	91	59.896	Cavia_porcellus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.757	ENSCCAG00000022758	CTIF	91	61.456	Cebus_capucinus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.980	ENSCATG00000038134	CTIF	75	67.500	Cercocebus_atys
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.813	ENSCLAG00000008174	CTIF	91	62.432	Chinchilla_lanigera
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.041	ENSCSAG00000018021	CTIF	58	61.995	Chlorocebus_sabaeus
ENSCSEG00000019857	ctif	89	89.583	ENSCPBG00000025654	CTIF	70	88.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.968	ENSCANG00000030916	CTIF	71	61.995	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	55.187	ENSCGRG00001020158	Ctif	60	63.369	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCSEG00000019857	ctif	99	51.117	ENSCGRG00000000052	Ctif	60	55.808	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCSEG00000019857	ctif	100	76.642	ENSCVAG00000017158	ctif	100	74.017	Cyprinodon_variegatus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	67.373	ENSDARG00000090617	ctif	50	70.670	Danio_rerio
ENSCSEG00000019857	ctif	68	56.067	ENSDNOG00000037310	CTIF	83	62.432	Dasypus_novemcinctus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.546	ENSDORG00000003221	Ctif	91	61.725	Dipodomys_ordii
ENSCSEG00000019857	ctif	80	86.000	ENSEASG00005016094	CTIF	91	60.263	Equus_asinus_asinus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.219	ENSECAG00000020473	CTIF	60	60.789	Equus_caballus
ENSCSEG00000019857	ctif	78	56.320	ENSEEUG00000012451	CTIF	66	62.602	Erinaceus_europaeus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	65.818	ENSELUG00000008733	ctif	100	66.812	Esox_lucius
ENSCSEG00000019857	ctif	90	87.500	ENSFCAG00000000664	CTIF	71	86.000	Felis_catus
ENSCSEG00000019857	ctif	97	54.887	ENSFALG00000008943	CTIF	88	64.917	Ficedula_albicollis
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.419	ENSFDAG00000017379	CTIF	60	60.733	Fukomys_damarensis
ENSCSEG00000019857	ctif	100	76.578	ENSFHEG00000004334	ctif	100	83.051	Fundulus_heteroclitus
ENSCSEG00000019857	ctif	89	89.583	ENSGALG00000035912	-	71	88.000	Gallus_gallus
ENSCSEG00000019857	ctif	100	76.578	ENSGAFG00000011896	ctif	95	89.831	Gambusia_affinis
ENSCSEG00000019857	ctif	55	60.106	ENSGAGG00000020663	CTIF	86	60.773	Gopherus_agassizii
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.824	ENSGGOG00000015204	CTIF	62	61.497	Gorilla_gorilla
ENSCSEG00000019857	ctif	100	80.450	ENSHBUG00000018092	ctif	100	78.622	Haplochromis_burtoni
ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.638	ENSHGLG00000005663	CTIF	60	63.514	Heterocephalus_glaber_female
ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.783	ENSHGLG00100006976	CTIF	60	63.514	Heterocephalus_glaber_male
ENSCSEG00000019857	ctif	89	67.965	ENSHCOG00000011784	ctif	97	68.122	Hippocampus_comes
ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.269	ENSSTOG00000001967	CTIF	88	63.073	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	52.967	ENSJJAG00000013706	Ctif	91	62.432	Jaculus_jaculus
ENSCSEG00000019857	ctif	100	75.988	ENSKMAG00000014651	ctif	100	72.552	Kryptolebias_marmoratus
ENSCSEG00000019857	ctif	80	93.220	ENSLBEG00000018277	ctif	95	93.220	Labrus_bergylta
ENSCSEG00000019857	ctif	99	64.586	ENSLOCG00000011697	ctif	53	66.205	Lepisosteus_oculatus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	47.586	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	75.472	Loxodonta_africana
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.980	ENSMFAG00000037903	CTIF	75	67.500	Macaca_fascicularis
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.980	ENSMMUG00000020898	CTIF	75	67.500	Macaca_mulatta
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.980	ENSMNEG00000039395	CTIF	75	67.500	Macaca_nemestrina
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.824	ENSMLEG00000041132	CTIF	75	67.500	Mandrillus_leucophaeus
ENSCSEG00000019857	ctif	100	81.433	ENSMAMG00000014741	ctif	100	79.240	Mastacembelus_armatus
ENSCSEG00000019857	ctif	90	78.091	ENSMZEG00005019767	ctif	90	76.056	Maylandia_zebra
ENSCSEG00000019857	ctif	89	38.762	ENSMGAG00000001378	CTIF	74	88.000	Meleagris_gallopavo
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.890	ENSMAUG00000000656	Ctif	60	61.497	Mesocricetus_auratus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.623	ENSMICG00000010167	CTIF	60	62.299	Microcebus_murinus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.703	ENSMOCG00000020507	Ctif	60	63.342	Microtus_ochrogaster
ENSCSEG00000019857	ctif	100	76.403	ENSMMOG00000000831	ctif	100	74.929	Mola_mola
ENSCSEG00000019857	ctif	99	50.647	ENSMODG00000003464	CTIF	91	57.000	Monodelphis_domestica
ENSCSEG00000019857	ctif	69	83.333	ENSMALG00000020553	ctif	100	83.333	Monopterus_albus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.371	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	61	59.949	Mus_caroli
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.352	ENSMUSG00000052928	Ctif	61	59.596	Mus_musculus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.928	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	60	63.243	Mus_pahari
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.352	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	89	86.000	Mus_spretus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	52.782	ENSMPUG00000000844	CTIF	60	60.963	Mustela_putorius_furo
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.076	ENSMLUG00000003025	CTIF	91	60.526	Myotis_lucifugus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.414	ENSNGAG00000011452	Ctif	60	62.264	Nannospalax_galili
ENSCSEG00000019857	ctif	100	80.263	ENSNBRG00000008679	ctif	100	72.867	Neolamprologus_brichardi
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.968	ENSNLEG00000011503	CTIF	61	61.290	Nomascus_leucogenys
ENSCSEG00000019857	ctif	99	48.046	ENSMEUG00000000218	CTIF	82	86.000	Notamacropus_eugenii
ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.348	ENSOPRG00000003558	CTIF	91	63.243	Ochotona_princeps
ENSCSEG00000019857	ctif	99	52.022	ENSODEG00000018390	CTIF	91	59.033	Octodon_degus
ENSCSEG00000019857	ctif	53	81.044	ENSONIG00000007750	ctif	60	81.044	Oreochromis_niloticus
ENSCSEG00000019857	ctif	80	45.937	ENSOANG00000001337	CTIF	90	64.211	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.276	ENSOCUG00000024842	CTIF	91	60.471	Oryctolagus_cuniculus
ENSCSEG00000019857	ctif	100	76.264	ENSORLG00000005786	ctif	100	74.719	Oryzias_latipes
ENSCSEG00000019857	ctif	100	75.140	ENSORLG00020005385	ctif	100	73.455	Oryzias_latipes_hni
ENSCSEG00000019857	ctif	100	75.843	ENSORLG00015011872	ctif	100	74.157	Oryzias_latipes_hsok
ENSCSEG00000019857	ctif	100	77.107	ENSOMEG00000007917	ctif	100	75.281	Oryzias_melastigma
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.913	ENSOGAG00000013927	CTIF	60	60.916	Otolemur_garnettii
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.468	ENSOARG00000003754	CTIF	91	61.126	Ovis_aries
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.824	ENSPPAG00000023554	CTIF	75	67.500	Pan_paniscus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.067	ENSPPRG00000002265	CTIF	60	60.630	Panthera_pardus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.210	ENSPTIG00000013761	CTIF	60	60.630	Panthera_tigris_altaica
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.824	ENSPTRG00000010009	CTIF	75	67.500	Pan_troglodytes
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.824	ENSPANG00000017087	CTIF	75	67.500	Papio_anubis
ENSCSEG00000019857	ctif	80	57.248	ENSPKIG00000011234	ctif	91	68.539	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCSEG00000019857	ctif	89	87.500	ENSPSIG00000006508	CTIF	70	86.000	Pelodiscus_sinensis
ENSCSEG00000019857	ctif	100	71.955	ENSPMGG00000022958	ctif	100	68.785	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.414	ENSPEMG00000022746	Ctif	60	62.264	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCSEG00000019857	ctif	72	54.043	ENSPCIG00000026247	CTIF	88	65.529	Phascolarctos_cinereus
ENSCSEG00000019857	ctif	100	77.669	ENSPFOG00000009243	ctif	100	77.107	Poecilia_formosa
ENSCSEG00000019857	ctif	100	78.102	ENSPLAG00000019171	ctif	100	77.518	Poecilia_latipinna
ENSCSEG00000019857	ctif	100	78.102	ENSPMEG00000020089	ctif	100	77.518	Poecilia_mexicana
ENSCSEG00000019857	ctif	100	75.140	ENSPREG00000017326	ctif	100	73.034	Poecilia_reticulata
ENSCSEG00000019857	ctif	80	56.553	ENSPPYG00000009147	CTIF	71	61.995	Pongo_abelii
ENSCSEG00000019857	ctif	99	51.655	ENSPCOG00000013391	CTIF	90	50.000	Propithecus_coquereli
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.680	ENSPVAG00000001965	CTIF	60	61.995	Pteropus_vampyrus
ENSCSEG00000019857	ctif	100	80.450	ENSPNYG00000007879	ctif	100	78.622	Pundamilia_nyererei
ENSCSEG00000019857	ctif	99	67.710	ENSPNAG00000029174	ctif	100	68.137	Pygocentrus_nattereri
ENSCSEG00000019857	ctif	99	54.993	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	62.464	Rattus_norvegicus
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.890	ENSRBIG00000043937	CTIF	61	61.497	Rhinopithecus_bieti
ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.746	ENSRROG00000006039	CTIF	61	61.497	Rhinopithecus_roxellana
ENSCSEG00000019857	ctif	89	87.500	ENSSBOG00000028468	CTIF	71	87.500	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCSEG00000019857	ctif	99	50.794	ENSSHAG00000016321	CTIF	90	61.394	Sarcophilus_harrisii
ENSCSEG00000019857	ctif	99	67.107	ENSSFOG00015022594	ctif	100	65.395	Scleropages_formosus
ENSCSEG00000019857	ctif	100	82.749	ENSSMAG00000005707	ctif	100	82.456	Scophthalmus_maximus
ENSCSEG00000019857	ctif	100	80.082	ENSSDUG00000016033	ctif	100	78.243	Seriola_dumerili
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ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.010	ENSSPUG00000014734	CTIF	91	63.712	Sphenodon_punctatus
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