EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000001010 (Gene tree)
Gene ID: 107093363
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 33521 bases
Position: chrKL652921.1:418202-451722
Accession: 107093363
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000019955	IBN_N	PF03810.19	1.6e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000015592	-	7800	XM_015388368	ENSCVAP00000019955	890 (aa)	XP_015243854	UPI0007429D7E

Gene Model

Click here to download ENSCVAG00000001010's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCVAG00000001010's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	87.050	ENSCVAG00000001908	TNPO2	99	87.050
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	86.502	ENSCVAG00000002750	tnpo2	99	86.502

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.865	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.865	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.316	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.428	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000001010	tnpo1	87	96.899	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.899	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.865	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	97.865	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.865	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.865	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.528	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.528	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	89.064	ENSAPLG00000009619	-	97	89.908	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.146	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.809	ENSANAG00000022453	-	99	92.809	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	58.241	ENSANAG00000027118	-	99	60.421	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	83.034	ENSANAG00000025351	-	99	83.034	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	95.281	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.281	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	94.731	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.619	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.146	Bos_taurus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.921	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.921	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	93.232	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.232	Canis_familiaris
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	90.787	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.787	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.034	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.034	Capra_hircus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	89.831	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.164	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.809	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.809	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.258	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.034	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.034	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.258	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	94	81.764	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.764	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.708	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.708	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	76.543	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.319	Ciona_savignyi
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.258	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.146	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	93.333	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.333	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.180	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.180	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	94.276	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.715	Danio_rerio
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	87.570	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.570	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	93	93.253	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.245	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	58.174	FBgn0035693	CG8219	99	57.948	Drosophila_melanogaster
ENSCVAG00000001010	tnpo1	86	94.757	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.757	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000001010	tnpo1	94	85.952	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	86.071	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.258	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.258	Equus_caballus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	88.562	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.744	Esox_lucius
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.258	Felis_catus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.596	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.596	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.921	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.921	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.429	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.429	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.945	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.945	Gadus_morhua
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.809	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.809	Gallus_gallus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.094	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.094	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.292	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.292	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.820	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.820	Gopherus_agassizii
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.258	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	78.251	ENSGGOG00000022535	-	98	78.251	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.966	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.966	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.809	ENSHGLG00000000970	-	99	92.809	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000001010	tnpo1	97	73.023	ENSHGLG00100000963	-	99	72.326	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	92.874	ENSHGLG00100017090	-	99	92.874	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.483	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.483	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.966	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.966	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	91	93.958	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.958	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	87.442	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	94.607	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.607	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	97	92.725	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.725	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.258	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.228	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.258	Macaca_nemestrina
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.258	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.753	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.753	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.629	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.629	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	89.663	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.663	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.146	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000001010	tnpo1	87	96.263	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.263	Mola_mola
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	93.830	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.830	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.404	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.404	Monopterus_albus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.921	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.309	Mus_caroli
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.556	Mus_musculus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.034	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.432	Mus_pahari
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.921	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.309	Mus_spretus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.258	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	92.782	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.782	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.258	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000001010	tnpo1	87	96.899	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.899	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.258	Nomascus_leucogenys
ENSCVAG00000001010	tnpo1	90	88.139	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.115	Ochotona_princeps
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.921	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.921	Octodon_degus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.205	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.205	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	92	94.634	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	87.033	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.033	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	87	96.757	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.757	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	96.843	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.843	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	97.069	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.069	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	97.294	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.294	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.258	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.146	Ovis_aries
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.258	Pan_paniscus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.258	Panthera_pardus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.258	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.258	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000001010	tnpo1	94	82.182	ENSPTRG00000047731	-	100	82.044	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.258	Papio_anubis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	90.562	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.596	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.596	Pelodiscus_sinensis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.939	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.715	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	93.333	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.333	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.820	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.820	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.096	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	98.096	Poecilia_formosa
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.096	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	98.096	Poecilia_latipinna
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.539	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.539	Poecilia_mexicana
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.318	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	98.318	Poecilia_reticulata
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.146	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.146	Pongo_abelii
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.371	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.371	Propithecus_coquereli
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.258	Pteropus_vampyrus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.745	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	96.745	Pundamilia_nyererei
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.049	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.498	Pygocentrus_nattereri
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.371	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	93.371	Rattus_norvegicus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.258	Rhinopithecus_bieti
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	93.258	Rhinopithecus_roxellana
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	92.921	ENSSBOG00000029256	TNPO1	100	92.921	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	93.801	ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.801	Sarcophilus_harrisii
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	95.960	ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.960	Scleropages_formosus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	96.963	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	96.963	Scophthalmus_maximus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.640	ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.640	Seriola_dumerili
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.528	ENSSLDG00000014578	tnpo1	100	97.528	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.483	ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.483	Sphenodon_punctatus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.978	ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	97.978	Stegastes_partitus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.258	Sus_scrofa
ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	91.518	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.518	Taeniopygia_guttata
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.067	ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.067	Takifugu_rubripes
ENSCVAG00000001010	tnpo1	69	91.396	ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.396	Tetraodon_nigroviridis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	87	93.333	ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	93.333	Tupaia_belangeri
ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	89.708	ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.708	Tursiops_truncatus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSUMAG00000007635	TNPO1	100	93.258	Ursus_maritimus
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	89.326	ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.326	Vicugna_pacos
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	93.258	Vulpes_vulpes
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	91.910	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.910	Xenopus_tropicalis
ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.204	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.204	Xiphophorus_maculatus