EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000001676 (Gene tree)
Gene ID: 107096296
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 855 bases
Position: chrKL653113.1:427035-427889
Accession: 107096296
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000000740	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1.9e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000014569	-	855	XM_015392888	ENSCVAP00000000740	284 (aa)	XP_015248374	UPI000742B337

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.808	ENSG00000152464	RPP38	100	46.154	Homo_sapiens
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.255	ENSAPOG00000001240	rpp38	95	61.255	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.215	ENSAMEG00000018832	RPP38	95	41.935	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	64.130	ENSACIG00000011592	rpp38	97	64.493	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	59.233	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	60.071	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	60.870	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	61.029	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000001676	rpp38	98	63.121	ENSATEG00000000731	rpp38	97	61.905	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000001676	rpp38	90	39.847	ENSAPLG00000002054	RPP38	88	42.636	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	62.500	ENSACLG00000016962	rpp38	96	61.765	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	60.662	ENSACLG00000016958	rpp38	96	61.397	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000001676	rpp38	89	44.314	ENSAMXG00000025023	rpp38	93	43.223	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.657	ENSBTAG00000007702	RPP38	95	41.993	Bos_taurus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.414	ENSCAFG00000024373	RPP38	95	40.000	Canis_familiaris
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.414	ENSCAFG00020008008	RPP38	95	40.000	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000001676	rpp38	90	42.642	ENSCHIG00000012484	RPP38	87	41.923	Capra_hircus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.750	ENSCPOG00000003981	RPP38	95	43.463	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.007	ENSCLAG00000010194	RPP38	95	42.857	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000001676	rpp38	94	42.456	ENSCSAG00000019055	RPP38	95	41.958	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.857	ENSCHOG00000004335	RPP38	95	42.857	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	40.925	ENSCGRG00001001395	Rpp38	95	40.217	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	40.925	ENSCGRG00000017441	Rpp38	95	40.217	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	57.875	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	56.044	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000001676	rpp38	90	49.624	ENSDARG00000040350	rpp38	95	47.872	Danio_rerio
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	41.404	ENSDNOG00000040314	RPP38	95	41.219	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000001676	rpp38	92	42.308	ENSDORG00000009783	Rpp38	87	40.079	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	41.993	ENSETEG00000002839	RPP38	95	41.667	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.448	ENSEASG00005019783	RPP38	94	42.403	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000001676	rpp38	90	39.773	ENSEEUG00000014677	RPP38	87	39.924	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	53.793	ENSELUG00000010160	rpp38	96	51.712	Esox_lucius
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.907	ENSFCAG00000022449	RPP38	95	42.143	Felis_catus
ENSCVAG00000001676	rpp38	90	41.154	ENSFALG00000014804	RPP38	88	40.996	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.308	ENSFDAG00000018669	RPP38	95	41.463	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	79.348	ENSFHEG00000013741	rpp38	96	79.348	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000001676	rpp38	90	44.280	ENSGALG00000008794	RPP38	86	44.280	Gallus_gallus
ENSCVAG00000001676	rpp38	55	70.064	ENSGACG00000009258	rpp38	98	70.064	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.029	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	61.765	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.056	ENSHGLG00000012144	RPP38	95	42.756	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000001676	rpp38	89	43.874	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	42.804	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000001676	rpp38	96	40.210	ENSSTOG00000025699	RPP38	92	39.568	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	44.330	ENSJJAG00000007523	Rpp38	95	42.606	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000001676	rpp38	91	59.176	ENSKMAG00000003986	rpp38	90	59.551	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000001676	rpp38	98	64.336	ENSLBEG00000006853	rpp38	96	63.538	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	44.291	ENSLACG00000006502	RPP38	95	44.056	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000001676	rpp38	98	45.172	ENSLOCG00000018347	rpp38	93	45.745	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	44.291	ENSLAFG00000000509	RPP38	95	42.553	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000001676	rpp38	94	41.343	ENSMMUG00000007679	RPP38	95	41.958	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	61.011	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	60.662	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	60.662	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	61.397	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.397	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	62.132	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000001676	rpp38	90	45.833	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	45.076	Meleagris_gallopavo
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	39.583	ENSMAUG00000003644	Rpp38	95	40.511	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	39.863	ENSMOCG00000007020	Rpp38	95	40.794	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	57.040	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	57.143	Mola_mola
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	42.599	ENSMODG00000024091	RPP38	95	42.599	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000001676	rpp38	99	57.627	ENSMALG00000002356	rpp38	96	57.394	Monopterus_albus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.448	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	95	44.765	Mus_caroli
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ENSCVAG00000001676	rpp38	97	44.128	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	95	44.765	Mus_pahari
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.772	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	95	43.682	Mus_spretus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.657	ENSMPUG00000018523	RPP38	95	41.219	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000001676	rpp38	94	41.516	ENSMLUG00000002153	RPP38	95	42.908	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	45.296	ENSNGAG00000011066	Rpp38	95	42.403	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.172	ENSNBRG00000006994	rpp38	97	63.004	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	62.637	ENSONIG00000020467	rpp38	95	63.370	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000001676	rpp38	94	42.599	ENSOCUG00000022768	-	95	41.429	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000001676	rpp38	94	41.577	ENSOCUG00000024367	-	95	41.429	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	63.004	ENSORLG00000009219	rpp38	95	61.029	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.905	ENSORLG00020011503	rpp38	92	60.440	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.905	ENSORLG00015017702	rpp38	92	60.806	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000001676	rpp38	90	61.628	ENSOMEG00000005414	rpp38	95	61.172	Oryzias_melastigma
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ENSCVAG00000001676	rpp38	90	43.019	ENSOARG00000004534	RPP38	87	42.308	Ovis_aries
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ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.907	ENSPPRG00000015329	RPP38	95	42.606	Panthera_pardus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.561	ENSPTIG00000007188	RPP38	95	42.143	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.808	ENSPTRG00000002318	RPP38	86	42.509	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000001676	rpp38	93	44.891	ENSPKIG00000025652	rpp38	93	44.484	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000001676	rpp38	92	40.449	ENSPSIG00000001527	RPP38	90	38.931	Pelodiscus_sinensis
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.500	ENSPEMG00000008375	Rpp38	95	42.182	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	44.326	ENSPCIG00000009096	RPP38	90	43.841	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000001676	rpp38	76	67.873	ENSPFOG00000016823	rpp38	95	67.619	Poecilia_formosa
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ENSCVAG00000001676	rpp38	95	65.809	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	65.809	Poecilia_mexicana
ENSCVAG00000001676	rpp38	99	72.028	ENSPREG00000017744	rpp38	96	72.000	Poecilia_reticulata
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.808	ENSPPYG00000002113	RPP38	95	42.361	Pongo_abelii
ENSCVAG00000001676	rpp38	94	42.349	ENSPVAG00000007155	RPP38	95	43.007	Pteropus_vampyrus
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.029	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	61.765	Pundamilia_nyererei
ENSCVAG00000001676	rpp38	89	45.490	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	44.322	Pygocentrus_nattereri
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.206	ENSRNOG00000038025	Rpp38	95	45.255	Rattus_norvegicus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.705	ENSSHAG00000015529	RPP38	95	43.636	Sarcophilus_harrisii
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	62.593	ENSSMAG00000018276	rpp38	91	61.069	Scophthalmus_maximus
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	62.132	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	62.500	Seriola_dumerili
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ENSCVAG00000001676	rpp38	97	37.589	ENSSARG00000012099	RPP38	94	37.091	Sorex_araneus
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ENSCVAG00000001676	rpp38	92	41.636	ENSSPUG00000005237	-	89	41.288	Sphenodon_punctatus
ENSCVAG00000001676	rpp38	92	42.007	ENSSPUG00000018363	-	89	41.887	Sphenodon_punctatus
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	61.538	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	60.806	Stegastes_partitus
ENSCVAG00000001676	rpp38	90	41.877	ENSSSCG00000027110	RPP38	87	40.152	Sus_scrofa
ENSCVAG00000001676	rpp38	90	41.923	ENSTGUG00000001366	RPP38	90	41.379	Taeniopygia_guttata
ENSCVAG00000001676	rpp38	96	56.475	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	56.159	Tetraodon_nigroviridis
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	43.299	ENSTTRG00000004420	RPP38	95	43.007	Tursiops_truncatus
ENSCVAG00000001676	rpp38	100	42.373	ENSUAMG00000002618	RPP38	95	41.935	Ursus_americanus
ENSCVAG00000001676	rpp38	100	42.193	ENSUMAG00000012382	RPP38	95	41.608	Ursus_maritimus
ENSCVAG00000001676	rpp38	97	42.759	ENSVVUG00000005272	RPP38	95	41.577	Vulpes_vulpes
ENSCVAG00000001676	rpp38	95	38.652	ENSXETG00000003419	rpp38	95	37.589	Xenopus_tropicalis