EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000002281 (Gene tree)
Gene ID: 107098549
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16906 bases
Position: chrKL653288.1:80665-97570
Accession: 107098549
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000020727	IBN_N	PF03810.19	2.9e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000013621	-	4655	XM_015396288	ENSCVAP00000020727	1097 (aa)	XP_015251774	UPI000742BCA2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.055	ENSG00000196497	IPO4	99	44.332	Homo_sapiens
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	72.835	ENSAPOG00000019018	ipo4	99	72.786	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.092	ENSAMEG00000016271	IPO4	83	43.321	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	72.379	ENSACIG00000004246	ipo4	99	72.258	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	75.387	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	75.808	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	75.570	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	75.808	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000002281	ipo4	92	76.459	ENSATEG00000017082	ipo4	99	76.657	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000002281	ipo4	84	45.203	ENSACAG00000003973	-	97	45.833	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.687	ENSANAG00000037973	IPO4	99	44.055	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	71.103	ENSACLG00000019742	ipo4	99	70.718	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	66.089	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	66.205	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.658	ENSBTAG00000002707	IPO4	98	43.599	Bos_taurus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.147	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	44.424	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000002281	ipo4	98	45.083	ENSCAFG00000012049	IPO4	98	44.968	Canis_familiaris
ENSCVAG00000002281	ipo4	98	44.681	ENSCAFG00020002873	IPO4	98	44.126	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000002281	ipo4	98	44.156	ENSCHIG00000009413	IPO4	95	44.156	Capra_hircus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.675	ENSTSYG00000002643	IPO4	98	43.767	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.282	ENSCPOG00000014783	IPO4	98	44.414	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.963	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	44.332	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.147	ENSCATG00000040395	IPO4	99	44.424	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.190	ENSCLAG00000012817	IPO4	98	44.414	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000002281	ipo4	90	44.578	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	42.541	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000002281	ipo4	92	36.154	ENSCING00000008639	-	98	36.390	Ciona_intestinalis
ENSCVAG00000002281	ipo4	93	34.506	ENSCSAVG00000011482	-	99	35.339	Ciona_savignyi
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.240	ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.516	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.149	ENSCGRG00001001217	Ipo4	98	41.751	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.149	ENSCGRG00000014404	Ipo4	98	41.751	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	69.854	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	70.046	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	68.881	ENSDARG00000041493	ipo4	99	68.905	Danio_rerio
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.577	ENSDNOG00000000366	IPO4	98	44.249	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.044	ENSDORG00000009274	Ipo4	98	44.055	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.391	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.422	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000002281	ipo4	91	45.628	ENSEASG00005011954	IPO4	95	45.685	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.099	ENSECAG00000009909	IPO4	98	44.137	Equus_caballus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	70.583	ENSELUG00000020628	ipo4	99	70.193	Esox_lucius
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.831	ENSFCAG00000005587	IPO4	98	44.414	Felis_catus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	40.636	ENSFDAG00000000725	IPO4	98	40.734	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000002281	ipo4	88	81.769	ENSFHEG00000009351	ipo4	95	82.167	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	70.219	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	70.018	Gadus_morhua
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	81.677	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	81.625	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	73.838	ENSGACG00000002276	ipo4	99	73.500	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.871	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	44.147	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	72.197	ENSHBUG00000023269	ipo4	99	71.547	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.018	ENSHGLG00000002923	IPO4	98	44.229	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.744	ENSHGLG00100003725	IPO4	98	43.952	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	71.145	ENSHCOG00000016854	ipo4	98	71.168	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	66.819	ENSIPUG00000001185	ipo4	99	67.036	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.739	ENSSTOG00000002288	IPO4	98	44.783	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000002281	ipo4	98	44.115	ENSJJAG00000019002	Ipo4	98	44.208	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	77.028	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	77.008	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	75.296	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	75.346	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	47.745	ENSLACG00000001428	IPO4	99	48.075	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000002281	ipo4	79	64.010	ENSLOCG00000001149	ipo4	83	64.000	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.201	ENSLAFG00000015852	IPO4	98	44.147	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.240	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	44.516	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.240	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	44.516	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.147	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	44.424	Macaca_nemestrina
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.240	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	44.516	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	73.838	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	73.869	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	72.015	ENSMZEG00005017273	ipo4	99	71.639	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.700	ENSMAUG00000017565	Ipo4	98	42.096	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000002281	ipo4	98	44.022	ENSMICG00000001719	IPO4	98	43.860	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000002281	ipo4	98	43.466	ENSMOCG00000020462	Ipo4	98	43.422	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	73.133	ENSMMOG00000005264	ipo4	99	73.432	Mola_mola
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.477	ENSMODG00000003337	IPO4	95	42.500	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	73.612	ENSMALG00000001587	ipo4	99	73.825	Monopterus_albus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.424	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	97	44.717	Mus_caroli
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.149	ENSMUSG00000002319	Ipo4	97	44.349	Mus_musculus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.096	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	97	43.857	Mus_pahari
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.424	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	97	43.995	Mus_spretus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	45.105	ENSMPUG00000005916	IPO4	98	45.337	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.934	ENSMLUG00000025277	IPO4	84	44.341	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.700	ENSNGAG00000019340	Ipo4	98	44.600	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	75.296	ENSNBRG00000005870	ipo4	99	75.346	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.771	ENSOPRG00000016615	IPO4	98	44.824	Ochotona_princeps
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.099	ENSODEG00000002609	IPO4	98	43.761	Octodon_degus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	75.296	ENSONIG00000014574	ipo4	99	75.531	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.796	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	44.026	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	73.828	ENSORLG00000006457	ipo4	99	75.648	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	75.934	ENSORLG00020004286	ipo4	99	75.900	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	76.299	ENSORLG00015021856	ipo4	99	76.270	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	75.207	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	75.207	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000002281	ipo4	98	42.241	ENSOGAG00000010642	IPO4	98	42.725	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000002281	ipo4	98	43.482	ENSOARG00000019188	IPO4	98	43.482	Ovis_aries
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.594	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	43.779	Pan_paniscus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	45.014	ENSPPRG00000023607	IPO4	98	44.598	Panthera_pardus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.922	ENSPTIG00000008720	IPO4	98	44.506	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.779	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	44.055	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.332	ENSPANG00000026278	IPO4	99	44.608	Papio_anubis
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	61.580	ENSPKIG00000007683	-	98	62.015	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	61.762	ENSPKIG00000007830	ipo4	99	61.616	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	69.069	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	68.600	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.424	ENSPEMG00000016160	Ipo4	98	42.115	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000002281	ipo4	94	44.801	ENSPCIG00000010718	IPO4	96	44.834	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	82.133	ENSPFOG00000009255	ipo4	99	81.994	Poecilia_formosa
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	82.133	ENSPLAG00000020556	ipo4	99	81.994	Poecilia_latipinna
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	82.133	ENSPMEG00000013102	ipo4	99	81.994	Poecilia_mexicana
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	82.042	ENSPREG00000017605	ipo4	99	81.902	Poecilia_reticulata
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ENSCVAG00000002281	ipo4	99	44.147	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	44.424	Procavia_capensis
ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.266	ENSPCOG00000015319	IPO4	98	43.213	Propithecus_coquereli
ENSCVAG00000002281	ipo4	98	44.249	ENSPVAG00000010755	IPO4	98	44.898	Pteropus_vampyrus
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	73.564	ENSPNYG00000021414	ipo4	99	73.616	Pundamilia_nyererei
ENSCVAG00000002281	ipo4	100	67.183	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	67.405	Pygocentrus_nattereri
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