EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000003139 (Gene tree)
Gene ID: 107098456
Gene Symbol: rpp30
Alias: fk66h08|rpp1|wu:fk66h08|zgc:110189
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p30
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8323 bases
Position: chrKL653279.1:82281-90603
Accession: 107098456
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000002090	RNase_P_p30	PF01876.16	2.7e-63	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000012324	-	1017	XM_015396167	ENSCVAP00000002090	269 (aa)	XP_015251653	-

Gene Model

Click here to download ENSCVAG00000003139's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCVAG00000003139's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.456	ENSG00000148688	RPP30	99	58.889	Homo_sapiens
ENSCVAG00000003139	rpp30	96	73.432	ENSAPOG00000023156	rpp30	93	74.590	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	60.370	ENSAMEG00000016776	RPP30	99	60.370	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	71.053	ENSACIG00000022810	rpp30	99	66.667	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	78.652	ENSAOCG00000016438	rpp30	89	78.652	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	78.277	ENSAPEG00000008697	rpp30	89	78.277	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	78.889	ENSATEG00000015263	rpp30	99	78.519	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000003139	rpp30	86	57.692	ENSAPLG00000009959	RPP30	92	59.276	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	53.676	ENSACAG00000007996	RPP30	93	56.452	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	48.529	ENSANAG00000009439	RPP30	84	48.529	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	76.580	ENSACLG00000015389	-	100	76.580	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	62.172	ENSAMXG00000040653	rpp30	97	62.172	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	60.000	ENSBTAG00000002973	RPP30	99	60.000	Bos_taurus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.148	ENSCJAG00000011045	RPP30	92	60.887	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	60.000	ENSCAFG00000031801	RPP30	99	60.000	Canis_familiaris
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	60.000	ENSCAFG00020000258	RPP30	99	60.000	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	56.296	ENSCHIG00000012901	RPP30	99	56.296	Capra_hircus
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.456	ENSTSYG00000013903	RPP30	99	58.519	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000003139	rpp30	89	43.388	ENSCAPG00000001326	RPP30	98	43.388	Cavia_aperea
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	57.407	ENSCPOG00000033174	RPP30	99	57.407	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	59.259	ENSCCAG00000029514	RPP30	92	62.097	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.456	ENSCATG00000042072	RPP30	99	58.889	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	57.778	ENSCLAG00000008595	RPP30	99	57.778	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.519	ENSCSAG00000006694	RPP30	99	58.519	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000003139	rpp30	86	31.518	ENSCHOG00000007023	-	100	31.518	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000003139	rpp30	93	60.630	ENSCPBG00000026518	RPP30	91	61.382	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000003139	rpp30	54	50.694	ENSCING00000019714	-	93	38.672	Ciona_intestinalis
ENSCVAG00000003139	rpp30	92	38.521	ENSCSAVG00000011282	-	83	38.956	Ciona_savignyi
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.519	ENSCANG00000041084	RPP30	99	58.519	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	50.741	ENSCGRG00001000834	-	99	50.741	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000003139	rpp30	86	58.798	ENSCGRG00001017068	-	97	58.798	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	51.111	ENSCGRG00000006196	-	99	51.111	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	57.407	ENSCGRG00000002508	-	92	60.081	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	69.004	ENSCSEG00000001779	rpp30	93	69.373	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	65.799	ENSDARG00000027428	rpp30	98	65.169	Danio_rerio
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.519	ENSDNOG00000010186	RPP30	91	58.519	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000003139	rpp30	95	60.465	ENSDORG00000015333	Rpp30	92	62.097	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000003139	rpp30	88	30.204	FBgn0283652	Rpp30	80	30.204	Drosophila_melanogaster
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.889	ENSETEG00000018823	RPP30	92	62.097	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	59.259	ENSEASG00005011050	RPP30	99	59.259	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	59.259	ENSECAG00000021917	RPP30	99	59.259	Equus_caballus
ENSCVAG00000003139	rpp30	97	40.152	ENSEEUG00000009986	-	99	40.152	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	65.169	ENSELUG00000003731	rpp30	94	65.169	Esox_lucius
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	59.259	ENSFCAG00000029073	RPP30	92	59.259	Felis_catus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	57.407	ENSFALG00000007711	RPP30	92	59.274	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	59.259	ENSFDAG00000019241	RPP30	99	59.259	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000003139	rpp30	92	84.274	ENSFHEG00000014739	rpp30	98	82.041	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000003139	rpp30	90	62.249	ENSGMOG00000005379	rpp30	100	62.249	Gadus_morhua
ENSCVAG00000003139	rpp30	96	57.854	ENSGALG00000006486	RPP30	83	67.961	Gallus_gallus
ENSCVAG00000003139	rpp30	96	82.490	ENSGAFG00000001445	rpp30	91	84.836	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	76.000	ENSGACG00000010285	rpp30	99	76.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000003139	rpp30	93	59.843	ENSGAGG00000000980	RPP30	64	60.569	Gopherus_agassizii
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.824	ENSGGOG00000026917	RPP30	99	59.259	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	76.952	ENSHBUG00000019332	rpp30	100	76.952	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.889	ENSHGLG00000013072	RPP30	99	58.889	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.889	ENSHGLG00100017798	RPP30	99	58.889	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	66.308	ENSHCOG00000004763	-	98	64.875	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	61.798	ENSIPUG00000003863	rpp30	99	61.798	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.148	ENSSTOG00000027002	RPP30	99	58.148	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	61.111	ENSJJAG00000020041	Rpp30	99	61.111	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	82.900	ENSKMAG00000015355	rpp30	100	82.900	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	68.889	ENSLBEG00000019989	rpp30	99	68.889	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000003139	rpp30	71	47.727	ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.727	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	63.670	ENSLOCG00000000031	rpp30	98	63.670	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.519	ENSLAFG00000015931	RPP30	92	61.694	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.088	ENSMFAG00000031109	RPP30	99	58.519	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.519	ENSMMUG00000006628	RPP30	99	58.519	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	57.721	ENSMNEG00000033838	RPP30	97	65.600	Macaca_nemestrina
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.088	ENSMLEG00000037578	RPP30	99	58.519	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	77.037	ENSMAMG00000010934	rpp30	100	77.037	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	76.952	ENSMZEG00005018508	-	100	76.952	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000003139	rpp30	96	52.874	ENSMGAG00000008452	RPP30	92	54.435	Meleagris_gallopavo
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	57.037	ENSMAUG00000008797	Rpp30	92	59.677	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	59.926	ENSMICG00000012019	RPP30	99	60.000	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	57.037	ENSMOCG00000016872	Rpp30	99	57.037	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000003139	rpp30	97	72.797	ENSMMOG00000009266	rpp30	97	72.797	Mola_mola
ENSCVAG00000003139	rpp30	96	50.575	ENSMODG00000009342	-	92	52.016	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000003139	rpp30	96	59.387	ENSMODG00000006863	-	93	61.290	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	77.037	ENSMALG00000011718	rpp30	100	77.037	Monopterus_albus
ENSCVAG00000003139	rpp30	95	58.140	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	92	60.081	Mus_caroli
ENSCVAG00000003139	rpp30	95	58.140	ENSMUSG00000024800	Rpp30	92	60.081	Mus_musculus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	57.037	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	92	60.081	Mus_pahari
ENSCVAG00000003139	rpp30	95	58.140	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	92	60.081	Mus_spretus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	60.370	ENSMPUG00000017258	RPP30	93	60.370	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	60.000	ENSMLUG00000017169	RPP30	99	60.000	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000003139	rpp30	75	56.311	ENSNGAG00000014392	-	83	57.653	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	57.407	ENSNGAG00000012018	-	92	60.081	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000003139	rpp30	92	67.339	ENSNBRG00000024170	-	91	67.623	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.456	ENSNLEG00000012383	RPP30	99	58.889	Nomascus_leucogenys
ENSCVAG00000003139	rpp30	96	53.558	ENSMEUG00000015587	-	94	55.118	Notamacropus_eugenii
ENSCVAG00000003139	rpp30	53	67.606	ENSOPRG00000007367	-	100	67.606	Ochotona_princeps
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	42.963	ENSODEG00000004560	-	99	42.963	Octodon_degus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	57.463	ENSODEG00000004530	-	94	60.081	Octodon_degus
ENSCVAG00000003139	rpp30	76	79.412	ENSONIG00000019140	rpp30	100	77.295	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	58.519	ENSOANG00000003415	RPP30	99	58.519	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	56.296	ENSOCUG00000006896	RPP30	91	56.296	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	71.034	ENSORLG00000020420	rpp30	84	79.918	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	78.439	ENSORLG00020009037	-	100	78.439	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	78.439	ENSORLG00015008300	rpp30	93	78.439	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000003139	rpp30	67	81.768	ENSOMEG00000012640	-	98	81.768	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	59.630	ENSOGAG00000013963	RPP30	92	62.500	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000003139	rpp30	94	58.824	ENSOARG00000015789	RPP30	93	58.824	Ovis_aries
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.824	ENSPPAG00000043779	RPP30	99	59.259	Pan_paniscus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	59.259	ENSPPRG00000000115	RPP30	99	59.259	Panthera_pardus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	59.259	ENSPTIG00000014949	RPP30	99	59.259	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.824	ENSPTRG00000002742	RPP30	99	55.926	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	58.088	ENSPANG00000021710	RPP30	99	58.519	Papio_anubis
ENSCVAG00000003139	rpp30	53	47.887	ENSPKIG00000024858	rpp30	78	47.887	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000003139	rpp30	84	59.307	ENSPSIG00000013213	RPP30	92	59.821	Pelodiscus_sinensis
ENSCVAG00000003139	rpp30	86	51.739	ENSPMGG00000014872	rpp30	93	51.739	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	45.926	ENSPEMG00000001948	Rpp30	99	45.926	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000003139	rpp30	52	35.802	ENSPMAG00000001855	-	99	35.802	Petromyzon_marinus
ENSCVAG00000003139	rpp30	96	59.387	ENSPCIG00000015730	RPP30	93	61.290	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	85.130	ENSPFOG00000000610	rpp30	100	85.130	Poecilia_formosa
ENSCVAG00000003139	rpp30	91	85.656	ENSPLAG00000003728	rpp30	80	89.083	Poecilia_latipinna
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	83.643	ENSPMEG00000015692	rpp30	100	83.643	Poecilia_mexicana
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	85.502	ENSPREG00000001536	rpp30	100	85.502	Poecilia_reticulata
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	59.630	ENSPPYG00000002473	RPP30	93	62.097	Pongo_abelii
ENSCVAG00000003139	rpp30	57	64.286	ENSPCAG00000016930	RPP30	94	44.030	Procavia_capensis
ENSCVAG00000003139	rpp30	100	59.926	ENSPCOG00000017865	RPP30	99	60.000	Propithecus_coquereli
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	54.795	ENSPVAG00000010524	RPP30	94	54.795	Pteropus_vampyrus
ENSCVAG00000003139	rpp30	92	64.257	ENSPNYG00000016930	-	84	64.490	Pundamilia_nyererei
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	62.921	ENSPNAG00000014804	rpp30	98	62.921	Pygocentrus_nattereri
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	56.458	ENSRNOG00000018718	Rpp30	99	56.089	Rattus_norvegicus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	55.351	ENSRBIG00000036948	RPP30	86	55.351	Rhinopithecus_bieti
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	47.970	ENSSBOG00000025405	RPP30	82	49.799	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCVAG00000003139	rpp30	96	58.935	ENSSHAG00000007452	RPP30	93	60.800	Sarcophilus_harrisii
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	62.921	ENSSFOG00015012510	rpp30	98	62.921	Scleropages_formosus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	78.277	ENSSMAG00000013854	rpp30	98	78.277	Scophthalmus_maximus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	77.985	ENSSDUG00000015086	rpp30	97	77.985	Seriola_dumerili
ENSCVAG00000003139	rpp30	87	71.488	ENSSLDG00000021234	rpp30	94	71.488	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCVAG00000003139	rpp30	95	61.240	ENSSARG00000007110	RPP30	92	63.306	Sorex_araneus
ENSCVAG00000003139	rpp30	70	56.915	ENSSPUG00000000595	RPP30	83	61.765	Sphenodon_punctatus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	60.000	ENSSSCG00000010460	RPP30	92	63.306	Sus_scrofa
ENSCVAG00000003139	rpp30	93	55.952	ENSTGUG00000008399	RPP30	92	57.826	Taeniopygia_guttata
ENSCVAG00000003139	rpp30	53	54.930	ENSTRUG00000020711	-	57	54.930	Takifugu_rubripes
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	72.101	ENSTNIG00000018540	rpp30	98	72.101	Tetraodon_nigroviridis
ENSCVAG00000003139	rpp30	82	57.848	ENSTBEG00000010734	RPP30	91	61.692	Tupaia_belangeri
ENSCVAG00000003139	rpp30	90	55.328	ENSTTRG00000014708	RPP30	90	55.328	Tursiops_truncatus
ENSCVAG00000003139	rpp30	67	57.609	ENSUAMG00000001045	RPP30	90	57.609	Ursus_americanus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	60.370	ENSUMAG00000000971	RPP30	99	60.370	Ursus_maritimus
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	50.000	ENSVPAG00000002077	RPP30	100	50.000	Vicugna_pacos
ENSCVAG00000003139	rpp30	99	52.963	ENSVVUG00000021784	RPP30	99	52.963	Vulpes_vulpes
ENSCVAG00000003139	rpp30	90	54.286	ENSXETG00000021785	rpp30	82	57.466	Xenopus_tropicalis
ENSCVAG00000003139	rpp30	96	79.767	ENSXCOG00000017864	rpp30	90	81.818	Xiphophorus_couchianus