EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000006081 (Gene tree)
Gene ID: 107091043
Gene Symbol: aco2
Alias: cb1017|wu:fa10e03|wu:fb69g04|wu:fc20c11
Full Name: aconitate hydratase%2C mitochondrial-like
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13601 bases
Position: chrKL652822.1:57058-70658
Accession: 107091043
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000004730	Aconitase	PF00330.20	1e-123	1	2
ENSCVAP00000004730	Aconitase	PF00330.20	1e-123	2	2
ENSCVAP00000004730	Aconitase_C	PF00694.19	2.4e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000007860	-	2235	XM_015384755	ENSCVAP00000004730	744 (aa)	XP_015240241	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCVAG00000006081	aco2	63	32.906	ENSCVAG00000010739	ireb2	53	32.906
ENSCVAG00000006081	aco2	99	83.095	ENSCVAG00000010923	ACO2	100	83.646
ENSCVAG00000006081	aco2	55	32.692	ENSCVAG00000020264	aco1	54	32.692

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.294	ENSG00000100412	ACO2	98	75.294	Homo_sapiens
ENSCVAG00000006081	aco2	99	82.315	ENSAPOG00000011484	ACO2	98	82.315	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	87.532	ENSAPOG00000017786	aco2	98	87.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	72.785	ENSAMEG00000015641	ACO2	98	72.911	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000006081	aco2	82	86.427	ENSACIG00000021636	aco2	99	86.427	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	87.922	ENSAOCG00000020887	aco2	98	87.922	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000006081	aco2	99	82.575	ENSAOCG00000019100	ACO2	98	82.575	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000006081	aco2	99	82.575	ENSAPEG00000012427	ACO2	98	82.575	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000006081	aco2	99	87.792	ENSAPEG00000020171	aco2	98	87.792	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000006081	aco2	99	83.225	ENSATEG00000008001	ACO2	98	83.225	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	87.922	ENSATEG00000007473	aco2	98	87.922	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	88.052	ENSATEG00000006397	aco2	98	88.052	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.423	ENSAPLG00000005198	ACO2	98	75.423	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.651	ENSACAG00000004677	-	98	75.651	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.262	ENSANAG00000029281	ACO2	98	75.262	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000006081	aco2	99	87.273	ENSACLG00000019179	aco2	98	87.273	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000006081	aco2	99	77.279	ENSAMXG00000015485	ACO2	98	77.279	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	84.245	ENSAMXG00000008808	aco2	98	84.245	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	76.047	ENSBTAG00000006429	ACO2	98	76.047	Bos_taurus
ENSCVAG00000006081	aco2	98	70.565	WBGene00000041	aco-2	99	71.512	Caenorhabditis_elegans
ENSCVAG00000006081	aco2	99	73.004	ENSCJAG00000005004	ACO2	99	74.961	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.425	ENSCAFG00000001075	ACO2	98	75.425	Canis_familiaris
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.425	ENSCAFG00020001976	ACO2	98	75.425	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.916	ENSCHIG00000007877	ACO2	98	75.916	Capra_hircus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.425	ENSTSYG00000001084	ACO2	98	75.475	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000006081	aco2	100	75.032	ENSCAPG00000017225	ACO2	99	75.032	Cavia_aperea
ENSCVAG00000006081	aco2	100	75.032	ENSCPOG00000012642	ACO2	99	75.032	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.524	ENSCCAG00000028378	ACO2	98	75.524	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000006081	aco2	77	64.286	ENSCATG00000026864	-	100	64.286	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.556	ENSCATG00000030437	ACO2	98	75.556	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000006081	aco2	99	49.603	ENSCATG00000000038	-	98	49.603	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.686	ENSCLAG00000016998	ACO2	98	75.817	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.425	ENSCSAG00000005807	ACO2	98	75.425	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000006081	aco2	68	67.742	ENSCHOG00000003549	ACO2	79	67.742	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.130	ENSCPBG00000020545	ACO2	98	75.391	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000006081	aco2	52	71.256	ENSCING00000008967	-	99	71.256	Ciona_intestinalis
ENSCVAG00000006081	aco2	99	68.215	ENSCSAVG00000007584	-	99	75.330	Ciona_savignyi
ENSCVAG00000006081	aco2	93	74.699	ENSCANG00000018904	ACO2	94	74.699	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	67.935	ENSCGRG00001009672	-	92	67.935	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.556	ENSCGRG00001023335	Aco2	98	75.556	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.556	ENSCGRG00000005122	Aco2	98	75.556	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000006081	aco2	99	67.935	ENSCGRG00000002318	-	92	67.935	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000006081	aco2	99	81.534	ENSCSEG00000006701	ACO2	98	81.534	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000006081	aco2	82	80.455	ENSCSEG00000020501	aco2	99	80.455	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000006081	aco2	99	83.355	ENSDARG00000007294	aco2	97	83.355	Danio_rerio
ENSCVAG00000006081	aco2	99	67.792	ENSDNOG00000018156	ACO2	98	67.792	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.294	ENSDORG00000002209	Aco2	99	75.294	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000006081	aco2	99	66.753	FBgn0037862	CG4706	97	66.753	Drosophila_melanogaster
ENSCVAG00000006081	aco2	98	69.291	FBgn0010100	Acon	97	69.110	Drosophila_melanogaster
ENSCVAG00000006081	aco2	83	83.283	ENSETEG00000010742	ACO2	79	83.283	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000006081	aco2	88	61.404	ENSEBUG00000009201	aco2	97	70.105	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000006081	aco2	99	76.078	ENSEASG00005001546	ACO2	96	76.078	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.948	ENSECAG00000023762	ACO2	96	75.948	Equus_caballus
ENSCVAG00000006081	aco2	93	74.274	ENSEEUG00000010201	ACO2	93	74.412	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	81.664	ENSELUG00000007787	ACO2	98	81.664	Esox_lucius
ENSCVAG00000006081	aco2	99	82.078	ENSELUG00000019769	aco2	98	82.078	Esox_lucius
ENSCVAG00000006081	aco2	99	72.832	ENSFCAG00000018526	ACO2	98	72.959	Felis_catus
ENSCVAG00000006081	aco2	97	76.305	ENSFALG00000011957	ACO2	99	76.305	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.393	ENSFDAG00000010448	ACO2	98	75.524	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000006081	aco2	99	82.965	ENSFHEG00000020556	ACO2	100	83.378	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	90.519	ENSFHEG00000012709	aco2	98	90.519	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	82.812	ENSGMOG00000013297	aco2	98	82.812	Gadus_morhua
ENSCVAG00000006081	aco2	93	84.282	ENSGMOG00000001946	-	89	84.282	Gadus_morhua
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.683	ENSGALG00000011950	ACO2	98	75.683	Gallus_gallus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	81.664	ENSGAFG00000010889	ACO2	98	81.664	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000006081	aco2	99	89.740	ENSGAFG00000008252	aco2	98	89.740	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000006081	aco2	99	84.655	ENSGACG00000004686	aco2	99	84.535	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.260	ENSGAGG00000017500	ACO2	98	75.521	Gopherus_agassizii
ENSCVAG00000006081	aco2	89	57.252	ENSGGOG00000037860	-	96	59.585	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.163	ENSGGOG00000001107	ACO2	98	75.163	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000006081	aco2	99	87.273	ENSHBUG00000004106	aco2	98	87.273	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.821	ENSHGLG00000015463	Aco2	99	75.821	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.163	ENSHGLG00100010294	ACO2	99	74.244	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000006081	aco2	99	82.705	ENSHCOG00000006890	ACO2	98	82.705	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000006081	aco2	99	85.714	ENSHCOG00000010190	aco2	98	85.714	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000006081	aco2	99	84.135	ENSIPUG00000001101	aco2	98	84.135	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.425	ENSSTOG00000016210	ACO2	98	75.425	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000006081	aco2	91	67.150	ENSJJAG00000014029	Aco2	98	67.150	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	83.745	ENSKMAG00000014823	ACO2	98	83.745	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000006081	aco2	53	94.402	ENSKMAG00000021995	aco2	82	94.402	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	85.455	ENSLBEG00000002060	aco2	98	85.455	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000006081	aco2	81	73.810	ENSLACG00000011854	ACO2	100	73.810	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000006081	aco2	88	70.160	ENSLOCG00000011607	aco2	96	70.160	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.262	ENSLAFG00000006030	ACO2	98	75.262	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000006081	aco2	81	63.711	ENSMFAG00000041445	-	96	63.711	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.556	ENSMFAG00000043571	ACO2	98	75.556	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.556	ENSMMUG00000001454	ACO2	98	75.556	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.425	ENSMNEG00000044522	ACO2	98	75.425	Macaca_nemestrina
ENSCVAG00000006081	aco2	97	60.027	ENSMLEG00000042289	-	97	62.623	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.556	ENSMLEG00000031603	ACO2	98	75.556	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	87.403	ENSMAMG00000003762	aco2	98	87.403	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	84.655	ENSMAMG00000007378	ACO2	100	84.584	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	87.273	ENSMZEG00005019194	aco2	98	87.273	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.683	ENSMGAG00000012110	ACO2	98	75.683	Meleagris_gallopavo
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.425	ENSMAUG00000007598	Aco2	98	75.556	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	68.448	ENSMICG00000013529	ACO2	98	68.448	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000006081	aco2	99	75.425	ENSMOCG00000008387	Aco2	98	75.425	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000006081	aco2	82	83.775	ENSMMOG00000003639	aco2	99	83.775	Mola_mola
ENSCVAG00000006081	aco2	99	84.094	ENSMMOG00000002702	ACO2	98	84.094	Mola_mola
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ENSCVAG00000006081	aco2	99	74.902	ENSMLUG00000002472	ACO2	98	74.902	Myotis_lucifugus
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ENSCVAG00000006081	aco2	99	87.143	ENSNBRG00000004766	aco2	98	87.143	Neolamprologus_brichardi
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