EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000011351 (Gene tree)
Gene ID: 107100052
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC107100052
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18830 bases
Position: chrKL653432.1:184740-203569
Accession: 107100052
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000009383	MMR_HSR1	PF01926.23	5.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000015788	-	3359	XM_015398406	ENSCVAP00000009383	448 (aa)	XP_015253892	UPI0007425E8D

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.667

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	58.537	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.537	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	88.393	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	88.393	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	99	58.929	ENSACAG00000028632	-	99	58.929	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	79.733	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.733	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	60.793	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.793	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	77	62.609	ENSCING00000020807	-	91	62.609	Ciona_intestinalis
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	98	55.000	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.455	Ciona_savignyi
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	85.142	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	61.333	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.490	Danio_rerio
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	98	82.500	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.500	Danio_rerio
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	80	55.866	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	55.866	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	99	79.372	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	79.372	Esox_lucius
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	93.527	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	93.527	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	89	54.863	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	54.863	Gadus_morhua
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	94.420	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	94.420	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	85	64.230	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.940	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	58	95.349	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	95.349	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	99	83.333	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.333	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	96	60.739	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.739	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	81	59.557	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	80	59.557	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	77.728	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.728	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	88.170	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.170	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	99	62.022	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.798	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	62.806	ENSLACG00000004899	-	99	62.806	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	99	70.270	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.270	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	99	73.154	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.154	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	96	60.508	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.369	Mastacembelus_armatus
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ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	59.071	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Mola_mola
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	98	87.927	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.927	Monopterus_albus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Monopterus_albus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	96	60.277	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.277	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	85.491	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.491	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	89.062	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	89.062	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	58.129	ENSPKIG00000023918	-	98	58.129	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	75.056	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.056	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	84.152	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	84.152	Periophthalmus_magnuspinnatus
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