EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000012537 (Gene tree)
Gene ID: 107084828
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17059 bases
Position: chrKL652609.1:685225-702283
Accession: 107084828
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000010335	GTP_EFTU	PF00009.27	6.8e-45	1	1
ENSCVAP00000010358	GTP_EFTU	PF00009.27	3.9e-40	1	1
ENSCVAP00000010335	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	3.8e-12	1	1
ENSCVAP00000010358	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	4.1e-12	1	1
ENSCVAP00000010335	EFG_IV	PF03764.18	9.9e-25	1	1
ENSCVAP00000010358	EFG_IV	PF03764.18	1.1e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000029517	-	3430	XM_015374861	ENSCVAP00000010335	971 (aa)	XP_015230347	UPI00074259DA
ENSCVAT00000017026	-	3526	-	ENSCVAP00000010358	1003 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSCVAG00000012537's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCVAG00000012537's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCVAG00000012537	eftud2	86	38.035	ENSCVAG00000005478	-	98	38.035
ENSCVAG00000012537	eftud2	86	37.572	ENSCVAG00000018746	eef2b	98	37.572
ENSCVAG00000012537	eftud2	63	33.621	ENSCVAG00000004126	gfm1	77	33.621

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	98.043	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	98.043	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	92.387	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.027	ENSACIG00000009096	eftud2	100	94.027	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000012537	eftud2	88	91.882	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	91.882	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.940	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	97.940	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.837	ENSATEG00000000457	eftud2	100	97.837	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000012537	eftud2	99	88.671	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.980	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.564	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.975	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.284	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.631	ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.631	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.063	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.063	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	92.593	Bos_taurus
ENSCVAG00000012537	eftud2	99	71.074	WBGene00001166	eftu-2	99	70.971	Caenorhabditis_elegans
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.284	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	92.387	Canis_familiaris
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.387	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.593	Capra_hircus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.284	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	92.181	Cavia_aperea
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.181	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	92.284	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.284	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.872	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.975	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.284	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000012537	eftud2	91	81.419	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.419	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	78.850	ENSCING00000009372	-	100	78.645	Ciona_intestinalis
ENSCVAG00000012537	eftud2	99	78.550	ENSCSAVG00000004985	-	99	80.189	Ciona_savignyi
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	92.284	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	92.078	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	92.078	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.116	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.116	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.142	ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.142	Danio_rerio
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.667	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.872	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.387	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	75.333	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSCVAG00000012537	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000012537	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	92.387	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	92.284	Equus_caballus
ENSCVAG00000012537	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.233	ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.821	Esox_lucius
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.284	Felis_catus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.284	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.387	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	99.279	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	99.279	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.748	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	94.748	Gadus_morhua
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.239	Gallus_gallus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	99.073	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	99.073	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.116	ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.116	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	92.284	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.528	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.528	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	92.284	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.284	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	96.811	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.811	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.233	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.233	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000012537	eftud2	91	93.468	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.257	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000012537	eftud2	95	94.130	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.130	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.528	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	97.528	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000012537	eftud2	95	97.624	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.997	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.997	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.130	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	93.718	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.975	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	92.284	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	92.284	Macaca_nemestrina
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	92.284	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.631	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	97.631	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.631	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	97.631	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.786	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	92.094	Meleagris_gallopavo
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	92.181	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	92.284	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000012537	eftud2	92	75.730	ENSMOCG00000017653	-	90	75.730	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	ENSMOCG00000009039	-	100	92.181	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000012537	eftud2	88	98.118	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	98.118	Mola_mola
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.872	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.078	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000012537	eftud2	88	96.471	ENSMALG00000014501	eftud2	100	96.471	Monopterus_albus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	92.078	Mus_caroli
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	92.078	Mus_musculus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.078	Mus_pahari
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	92.078	Mus_spretus
ENSCVAG00000012537	eftud2	97	91.631	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.949	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	92.387	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.284	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.528	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.528	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000012537	eftud2	97	90.011	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.223	Nomascus_leucogenys
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	88.169	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.374	Notamacropus_eugenii
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	84.156	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.465	Ochotona_princeps
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	ENSODEG00000018041	-	100	91.461	Octodon_degus
ENSCVAG00000012537	eftud2	93	76.040	ENSODEG00000003385	-	100	76.149	Octodon_degus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.631	ENSONIG00000000912	eftud2	100	97.631	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.181	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.387	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.219	ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.219	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.322	ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.322	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.219	ENSORLG00015002611	eftud2	100	98.257	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	90.535	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.741	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	92.593	Ovis_aries
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	92.284	Pan_paniscus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	92.387	Panthera_pardus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	92.387	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.284	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	92.284	Papio_anubis
ENSCVAG00000012537	eftud2	93	90.077	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	Pelodiscus_sinensis
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	89.186	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	95.376	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	92.284	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.872	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	92.078	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	99.279	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	99.279	Poecilia_formosa
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	99.279	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	99.279	Poecilia_latipinna
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	99.279	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	99.279	Poecilia_mexicana
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	90.844	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	91.049	Pongo_abelii
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	88.066	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.272	Procavia_capensis
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.284	Propithecus_coquereli
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	87.860	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.169	Pteropus_vampyrus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.528	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	97.528	Pundamilia_nyererei
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.645	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.645	Pygocentrus_nattereri
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.864	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.864	Rattus_norvegicus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	92.181	Rhinopithecus_bieti
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	92.181	Rhinopithecus_roxellana
ENSCVAG00000012537	eftud2	97	33.927	YKL173W	SNU114	91	34.567	Saccharomyces_cerevisiae
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.284	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCVAG00000012537	eftud2	95	93.913	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.913	Sarcophilus_harrisii
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.130	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.718	Scleropages_formosus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.322	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	97.322	Scophthalmus_maximus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	98.146	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.146	Seriola_dumerili
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	98.249	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	98.249	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	84.362	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.362	Sorex_araneus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.872	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	92.078	Sphenodon_punctatus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.940	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	97.940	Stegastes_partitus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.284	Sus_scrofa
ENSCVAG00000012537	eftud2	83	93.284	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.284	Taeniopygia_guttata
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	95.984	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	95.984	Takifugu_rubripes
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.282	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.282	Tetraodon_nigroviridis
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	86.728	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.934	Tupaia_belangeri
ENSCVAG00000012537	eftud2	91	90.238	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.238	Tursiops_truncatus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	90.947	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.255	Ursus_americanus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	92.387	Ursus_maritimus
ENSCVAG00000012537	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	92.387	Vulpes_vulpes
ENSCVAG00000012537	eftud2	96	92.193	ENSXETG00000003394	eftud2	98	93.145	Xenopus_tropicalis
ENSCVAG00000012537	eftud2	81	99.362	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	99.362	Xiphophorus_couchianus
ENSCVAG00000012537	eftud2	100	99.073	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	99.073	Xiphophorus_maculatus