EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000013039 (Gene tree)
Gene ID: 107099977
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 47505 bases
Position: chrKL653426.1:106682-154186
Accession: 107099977
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000026997	Xpo1	PF08389.12	3.6e-23	1	1
ENSCVAP00000026997	IBN_N	PF03810.19	3.9e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000029696	-	4918	XM_015398316	ENSCVAP00000026997	961 (aa)	XP_015253802	UPI000742520F

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCVAG00000013039	ipo13	97	66.064	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	100	66.064

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.068	ENSG00000117408	IPO13	99	81.374	Homo_sapiens
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	97.711	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	97.711	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	70.000	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	70.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.173	ENSAMEG00000001123	IPO13	99	81.478	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000013039	ipo13	96	93.043	ENSACIG00000008146	ipo13	100	92.826	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000013039	ipo13	97	69.905	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	69.905	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	69.072	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	99	68.969	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	97.399	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	97.399	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	97.294	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	97.294	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	69.175	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	99	69.072	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	67.839	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	68.677	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	97.190	ENSATEG00000018367	ipo13	100	97.190	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.173	ENSAPLG00000001349	IPO13	98	82.173	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.700	ENSACAG00000014300	IPO13	99	82.700	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.068	ENSANAG00000034183	IPO13	98	82.000	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	69.278	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	69.215	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000013039	ipo13	96	97.831	ENSACLG00000011458	ipo13	100	97.831	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	91.060	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	91.060	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	64.308	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	64.308	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.540	ENSBTAG00000018887	IPO13	99	80.853	Bos_taurus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.173	ENSCJAG00000007453	IPO13	98	82.105	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.962	ENSCAFG00000004875	IPO13	99	81.270	Canis_familiaris
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.962	ENSCAFG00020017359	IPO13	99	81.270	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.646	ENSCHIG00000008341	IPO13	99	80.957	Capra_hircus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.068	ENSTSYG00000035980	IPO13	99	81.374	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000013039	ipo13	87	81.377	ENSCAPG00000001972	IPO13	97	81.377	Cavia_aperea
ENSCVAG00000013039	ipo13	98	81.663	ENSCPOG00000012445	IPO13	97	81.683	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.173	ENSCCAG00000022035	IPO13	98	82.105	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.068	ENSCATG00000041276	IPO13	99	81.374	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.751	ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.061	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.068	ENSCSAG00000001190	IPO13	99	81.374	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000013039	ipo13	95	82.661	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	82.770	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	38.125	ENSCING00000001863	-	100	38.046	Ciona_intestinalis
ENSCVAG00000013039	ipo13	98	36.677	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.573	Ciona_savignyi
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.068	ENSCANG00000009091	IPO13	99	81.374	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	80.907	ENSCGRG00001021177	Ipo13	98	80.927	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	80.907	ENSCGRG00000012411	Ipo13	98	80.927	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	63.229	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	98	63.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	93.652	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	93.652	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	65.964	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	65.964	Danio_rerio
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	90.651	ENSDARG00000060618	ipo13	99	90.651	Danio_rerio
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.751	ENSDNOG00000016583	IPO13	98	81.770	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.962	ENSDORG00000005471	Ipo13	99	81.270	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	68.607	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	67.927	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.962	ENSEASG00005001738	IPO13	99	81.270	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.962	ENSECAG00000015508	IPO13	99	81.270	Equus_caballus
ENSCVAG00000013039	ipo13	68	85.979	ENSEEUG00000011681	IPO13	82	85.979	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	93.340	ENSELUG00000001498	ipo13	100	93.340	Esox_lucius
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	67.108	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	67.006	Esox_lucius
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.068	ENSFCAG00000006488	IPO13	99	81.374	Felis_catus
ENSCVAG00000013039	ipo13	95	82.443	ENSFALG00000005368	IPO13	100	82.443	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.646	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	80.997	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	67.665	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	67.732	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	98.231	ENSFHEG00000023271	ipo13	100	98.231	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	95.114	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	95.114	Gadus_morhua
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	59.629	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	99	60.207	Gadus_morhua
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	81.998	ENSGALG00000010087	IPO13	100	81.998	Gallus_gallus
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	98.543	ENSGAFG00000006361	ipo13	100	98.543	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	67.461	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	67.461	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	94.699	ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.699	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	69.048	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	99	69.151	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000013039	ipo13	98	82.979	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	82.979	Gopherus_agassizii
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.068	ENSGGOG00000016375	IPO13	99	81.374	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	68.351	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	99	68.285	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	97.399	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	97.399	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.540	ENSHGLG00000001822	IPO13	98	81.560	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.540	ENSHGLG00100015830	IPO13	98	81.560	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000013039	ipo13	97	64.111	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	64.111	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	91.988	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	94.361	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	60.000	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	99	60.000	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	89.802	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	89.802	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.962	ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.270	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.751	ENSJJAG00000018591	Ipo13	98	81.770	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	69.318	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	99	69.215	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	97.482	ENSKMAG00000007869	ipo13	99	97.482	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000013039	ipo13	100	95.525	ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.525	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	68.191	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	100	67.946	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000013039	ipo13	85	32.418	ENSLACG00000002351	TNPO3	96	32.812	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000013039	ipo13	98	77.542	ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.542	Latimeria_chalumnae
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ENSCVAG00000013039	ipo13	99	80.231	ENSLAFG00000017144	IPO13	99	79.564	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000013039	ipo13	99	82.068	ENSMFAG00000032846	IPO13	99	81.374	Macaca_fascicularis
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ENSCVAG00000013039	ipo13	82	83.036	ENSMAUG00000013018	Ipo13	98	83.057	Mesocricetus_auratus
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ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.329	ENSMOCG00000008881	Ipo13	98	81.349	Microtus_ochrogaster
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ENSCVAG00000013039	ipo13	95	81.352	ENSMODG00000003017	IPO13	100	81.352	Monodelphis_domestica
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