EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000016082 (Gene tree)
Gene ID: 107094279
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12078 bases
Position: chrKL652975.1:369890-381967
Accession: 107094279
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000013537	eRF1_2	PF03464.15	5.1e-34	1	1
ENSCVAP00000013537	eRF1_3	PF03465.15	7.7e-26	1	1
ENSCVAP00000013537	eRF1_1	PF03463.15	4.3e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000030764	-	2614	XM_015389808	ENSCVAP00000013537	385 (aa)	XP_015245294	UPI000742A811

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.299	ENSG00000152684	PELO	100	81.299	Homo_sapiens
ENSCVAG00000016082	pelo	64	91.903	ENSAPOG00000023700	-	90	91.903	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	92.468	ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.468	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000016082	pelo	64	91.903	ENSAPOG00000000616	pelo	90	91.903	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.558	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.558	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000016082	pelo	97	89.008	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	92.727	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.727	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000016082	pelo	100	92.727	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.727	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000016082	pelo	100	94.026	ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000016082	pelo	77	73.154	ENSAPLG00000013265	PELO	100	73.154	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000016082	pelo	97	80.533	ENSACAG00000004352	PELO	100	80.000	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.558	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.558	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.169	ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000016082	pelo	97	92.761	ENSAMXG00000020299	pelo	99	91.429	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.299	ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	Bos_taurus
ENSCVAG00000016082	pelo	99	61.155	WBGene00011280	pelo-1	100	61.155	Caenorhabditis_elegans
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.299	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.818	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.039	ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	Capra_hircus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	82.078	ENSTSYG00000005203	PELO	100	82.078	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000016082	pelo	100	82.078	ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.078	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.299	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.299	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.558	ENSCATG00000011829	PELO	100	81.558	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.558	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.558	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.558	ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.558	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	82.078	ENSCHOG00000000523	PELO	100	82.078	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000016082	pelo	97	81.867	ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.299	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000016082	pelo	97	65.147	ENSCING00000001979	-	100	65.455	Ciona_intestinalis
ENSCVAG00000016082	pelo	100	66.753	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.753	Ciona_savignyi
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.558	ENSCANG00000023382	PELO	100	81.558	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000016082	pelo	97	81.769	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.818	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000016082	pelo	97	82.574	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.597	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000016082	pelo	100	92.468	ENSCSEG00000008807	pelo	100	92.468	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000016082	pelo	100	88.052	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.052	Danio_rerio
ENSCVAG00000016082	pelo	100	78.497	ENSDNOG00000036721	PELO	100	78.497	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	83.377	ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.377	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000016082	pelo	96	68.108	FBgn0011207	pelo	96	67.546	Drosophila_melanogaster
ENSCVAG00000016082	pelo	71	79.532	ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	ENSEASG00005013348	PELO	100	81.818	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	90.909	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.909	Esox_lucius
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	ENSFCAG00000032341	PELO	100	81.818	Felis_catus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	82.078	ENSFALG00000004559	PELO	100	82.078	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000016082	pelo	74	82.746	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.746	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000016082	pelo	100	97.403	ENSFHEG00000009769	pelo	100	97.403	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000016082	pelo	98	88.859	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.571	Gadus_morhua
ENSCVAG00000016082	pelo	100	98.182	ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.182	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.948	ENSGACG00000007245	pelo	100	91.948	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000016082	pelo	97	81.867	ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.299	Gopherus_agassizii
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ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.169	ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.169	Haplochromis_burtoni
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ENSCVAG00000016082	pelo	100	80.260	ENSHGLG00100017627	PELO	100	80.260	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000016082	pelo	100	89.091	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.091	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000016082	pelo	100	89.091	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	Ictalurus_punctatus
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ENSCVAG00000016082	pelo	100	82.338	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	82.338	Mus_spretus
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ENSCVAG00000016082	pelo	100	80.000	ENSMEUG00000005468	PELO	100	80.000	Notamacropus_eugenii
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ENSCVAG00000016082	pelo	96	91.914	ENSONIG00000011511	pelo	100	91.948	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.818	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.688	ENSORLG00000005827	pelo	100	91.688	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.948	ENSORLG00020016456	pelo	100	91.948	Oryzias_latipes_hni
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ENSCVAG00000016082	pelo	100	93.766	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.766	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.558	ENSOGAG00000027940	PELO	100	81.558	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.299	ENSOARG00000008324	PELO	99	81.299	Ovis_aries
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.558	ENSPPAG00000038951	PELO	100	81.558	Pan_paniscus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	ENSPPRG00000018800	PELO	100	81.818	Panthera_pardus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.818	ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.818	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.299	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.299	Pan_troglodytes
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ENSCVAG00000016082	pelo	100	88.831	ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.831	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000016082	pelo	97	81.600	ENSPSIG00000004971	PELO	100	81.039	Pelodiscus_sinensis
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ENSCVAG00000016082	pelo	100	82.078	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	82.078	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000016082	pelo	100	81.299	ENSPCIG00000004880	PELO	100	81.299	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000016082	pelo	100	98.961	ENSPFOG00000007277	pelo	100	98.961	Poecilia_formosa
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ENSCVAG00000016082	pelo	98	32.987	YNL001W	-	98	32.987	Saccharomyces_cerevisiae
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