EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000016602 (Gene tree)
Gene ID: 107081761
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16929 bases
Position: chrKL652540.1:1867376-1884304
Accession: 107081761
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000013973	PAP_RNA-bind	PF04926.15	7.4e-29	1	2
ENSCVAP00000013973	PAP_RNA-bind	PF04926.15	7.4e-29	2	2
ENSCVAP00000013988	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.3e-28	1	2
ENSCVAP00000013988	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.3e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000021684	-	4609	XM_015369992	ENSCVAP00000013988	849 (aa)	XP_015225478	UPI00074257F0
ENSCVAT00000030928	-	1683	-	ENSCVAP00000013973	560 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSCVAG00000016602's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCVAG00000016602's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSG00000115421	PAPOLG	100	86.752	Homo_sapiens
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.284	ENSAPOG00000004798	papolg	100	86.166	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	90	80.175	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000016602	papolg	89	96.600	ENSACIG00000010546	papolg	93	94.794	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.635	ENSAOCG00000010254	papolg	100	86.049	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.635	ENSAPEG00000006944	papolg	100	86.049	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000016602	papolg	100	87.573	ENSATEG00000009007	papolg	90	97.395	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000016602	papolg	88	81.727	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	78.545	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000016602	papolg	65	77.049	ENSACAG00000015048	-	62	76.344	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	68.200	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.518	ENSACLG00000015592	papolg	100	86.722	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000016602	papolg	89	89.600	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.514	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	90	81.982	Bos_taurus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	78	80.035	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.200	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	88	76.233	Canis_familiaris
ENSCVAG00000016602	papolg	90	84.661	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	82.162	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	90	81.802	Capra_hircus
ENSCVAG00000016602	papolg	90	84.387	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	67.493	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000016602	papolg	68	80.052	ENSCAPG00000014901	-	100	80.052	Cavia_aperea
ENSCVAG00000016602	papolg	90	84.722	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	75	82.258	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	92	79.685	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000016602	papolg	81	81.818	ENSCATG00000044395	PAPOLG	75	81.818	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	75	82.226	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	68.200	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000016602	papolg	76	86.385	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	65.936	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000016602	papolg	91	63.261	ENSCING00000024664	-	94	63.261	Ciona_intestinalis
ENSCVAG00000016602	papolg	86	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSCVAG00000016602	papolg	89	84.830	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	68.200	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000016602	papolg	90	83.897	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	67.725	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000016602	papolg	90	83.897	ENSCGRG00000005552	-	100	67.725	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000016602	papolg	89	96.000	ENSCSEG00000000771	papolg	95	94.434	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000016602	papolg	89	90.220	ENSDARG00000012141	papolg	100	74.189	Danio_rerio
ENSCVAG00000016602	papolg	90	80.952	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	65.752	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000016602	papolg	75	85.545	ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.315	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000016602	papolg	89	67.671	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	55.714	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000016602	papolg	71	74.561	ENSEBUG00000004020	papolg	90	70.157	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000016602	papolg	81	58.901	ENSEBUG00000005042	-	78	58.734	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	ENSEASG00005002038	PAPOLG	90	79.688	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000016602	papolg	90	84.752	ENSECAG00000009859	PAPOLG	88	79.649	Equus_caballus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	74.349	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	60.622	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	92.385	ENSELUG00000014497	papolg	60	92.385	Esox_lucius
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	67.568	Felis_catus
ENSCVAG00000016602	papolg	88	75.709	ENSFALG00000011079	PAPOLG	67	73.922	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.429	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	67.738	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000016602	papolg	64	88.807	ENSFHEG00000019080	papolg	97	86.314	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000016602	papolg	92	91.845	ENSGMOG00000018772	papolg	93	92.139	Gadus_morhua
ENSCVAG00000016602	papolg	93	75.235	ENSGALG00000007853	PAPOLG	86	74.679	Gallus_gallus
ENSCVAG00000016602	papolg	94	98.400	ENSGAFG00000003263	papolg	100	89.542	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000016602	papolg	89	96.400	ENSGACG00000002718	papolg	100	85.976	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	67.543	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.635	ENSHBUG00000004882	papolg	100	86.722	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.429	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	75	82.577	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.429	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	75	82.585	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000016602	papolg	90	95.644	ENSHCOG00000006782	papolg	100	83.784	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000016602	papolg	97	83.156	ENSIPUG00000021642	papolg	88	86.679	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	68.277	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000016602	papolg	75	85.782	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	85.548	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000016602	papolg	95	96.230	ENSKMAG00000016439	papolg	100	85.731	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	96.607	ENSLBEG00000023218	papolg	100	84.078	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000016602	papolg	89	78.226	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	61.568	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000016602	papolg	89	92.742	ENSLOCG00000016130	papolg	100	75.587	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.848	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	68.463	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	68.463	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000016602	papolg	89	74.653	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	61.097	Macaca_nemestrina
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.200	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	68.200	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	97.390	ENSMAMG00000010667	papolg	100	85.932	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.518	ENSMZEG00005018140	papolg	100	86.722	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000016602	papolg	88	78.831	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	71	76.099	Meleagris_gallopavo
ENSCVAG00000016602	papolg	90	84.692	ENSMAUG00000009088	Papolg	77	80.668	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.685	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	67.895	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000016602	papolg	90	84.524	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	68.799	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000016602	papolg	89	96.400	ENSMMOG00000008020	papolg	99	84.837	Mola_mola
ENSCVAG00000016602	papolg	88	85.051	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	68.504	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.486	ENSMALG00000007012	papolg	100	85.614	Monopterus_albus
ENSCVAG00000016602	papolg	92	83.109	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	86.150	Mus_caroli
ENSCVAG00000016602	papolg	92	83.109	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	Mus_musculus
ENSCVAG00000016602	papolg	95	79.783	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	68.407	Mus_pahari
ENSCVAG00000016602	papolg	92	82.917	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	Mus_spretus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.200	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	81	81.622	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	89	80.035	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000016602	papolg	90	84.921	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	68.468	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000016602	papolg	90	83.865	ENSNBRG00000011943	papolg	99	76.216	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000016602	papolg	75	85.308	ENSNLEG00000009507	-	100	85.082	Nomascus_leucogenys
ENSCVAG00000016602	papolg	73	69.203	ENSMEUG00000013605	-	68	66.207	Notamacropus_eugenii
ENSCVAG00000016602	papolg	89	84.830	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	78	79.340	Ochotona_princeps
ENSCVAG00000016602	papolg	75	82.701	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.701	Octodon_degus
ENSCVAG00000016602	papolg	99	78.609	ENSONIG00000002985	papolg	100	78.740	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000016602	papolg	91	83.629	ENSOANG00000012403	PAPOLG	86	81.651	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	78	79.861	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000016602	papolg	96	94.477	ENSORLG00000001577	papolg	100	84.714	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000016602	papolg	96	94.675	ENSORLG00020002482	papolg	100	84.481	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000016602	papolg	96	94.675	ENSORLG00015008836	papolg	100	84.714	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.033	ENSOMEG00000001406	papolg	100	85.446	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000016602	papolg	53	56.087	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	54.505	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	66.624	Ovis_aries
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	68.331	Pan_paniscus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	67.568	Panthera_pardus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	67.439	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	68.331	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000016602	papolg	89	80.279	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	64.613	Papio_anubis
ENSCVAG00000016602	papolg	89	89.579	ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000016602	papolg	97	84.375	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	84.775	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000016602	papolg	88	83.838	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	84	80.935	Pelodiscus_sinensis
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.341	ENSPEMG00000008960	-	100	67.674	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000016602	papolg	88	64.789	ENSPMAG00000004864	-	98	64.789	Petromyzon_marinus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	64.660	ENSPMAG00000002961	papolg	77	61.806	Petromyzon_marinus
ENSCVAG00000016602	papolg	88	85.455	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	68.346	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000016602	papolg	95	98.606	ENSPFOG00000012909	papolg	100	89.202	Poecilia_formosa
ENSCVAG00000016602	papolg	94	99.000	ENSPLAG00000018445	papolg	100	88.954	Poecilia_latipinna
ENSCVAG00000016602	papolg	94	99.000	ENSPMEG00000003961	papolg	100	88.732	Poecilia_mexicana
ENSCVAG00000016602	papolg	95	98.020	ENSPREG00000010358	papolg	100	88.850	Poecilia_reticulata
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	68.200	Pongo_abelii
ENSCVAG00000016602	papolg	85	82.563	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	87	82.390	Procavia_capensis
ENSCVAG00000016602	papolg	89	78.873	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	93	73.611	Propithecus_coquereli
ENSCVAG00000016602	papolg	89	83.034	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	79.747	Pteropus_vampyrus
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.518	ENSPNYG00000006729	papolg	100	86.722	Pundamilia_nyererei
ENSCVAG00000016602	papolg	90	88.889	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.636	Pygocentrus_nattereri
ENSCVAG00000016602	papolg	95	79.422	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	68.668	Rattus_norvegicus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	78.244	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	63.732	Rhinopithecus_bieti
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	68.200	Rhinopithecus_roxellana
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	80	80.385	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCVAG00000016602	papolg	83	86.207	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	68.536	Sarcophilus_harrisii
ENSCVAG00000016602	papolg	90	88.515	ENSSFOG00015002383	papolg	100	71.166	Scleropages_formosus
ENSCVAG00000016602	papolg	97	75.862	ENSSFOG00015011874	papolg	82	75.690	Scleropages_formosus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	96.016	ENSSMAG00000015598	papolg	100	84.120	Scophthalmus_maximus
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.722	ENSSDUG00000000912	papolg	100	86.251	Seriola_dumerili
ENSCVAG00000016602	papolg	100	86.722	ENSSLDG00000001217	papolg	100	86.251	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCVAG00000016602	papolg	93	79.406	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	75	79.633	Sphenodon_punctatus
ENSCVAG00000016602	papolg	100	87.251	ENSSPAG00000009004	papolg	100	87.383	Stegastes_partitus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	68.277	Sus_scrofa
ENSCVAG00000016602	papolg	88	75.813	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	94	74.016	Taeniopygia_guttata
ENSCVAG00000016602	papolg	90	95.418	ENSTRUG00000006410	papolg	77	93.478	Takifugu_rubripes
ENSCVAG00000016602	papolg	90	86.640	ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.314	Tetraodon_nigroviridis
ENSCVAG00000016602	papolg	89	77.844	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	61.579	Tupaia_belangeri
ENSCVAG00000016602	papolg	89	79.637	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	63.708	Tursiops_truncatus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	67.405	Ursus_americanus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.371	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	67.014	Ursus_maritimus
ENSCVAG00000016602	papolg	89	80.800	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	64.605	Vicugna_pacos
ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.400	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	90	81.802	Vulpes_vulpes
ENSCVAG00000016602	papolg	88	83.198	ENSXETG00000002208	papolg	100	64.545	Xenopus_tropicalis
ENSCVAG00000016602	papolg	90	97.228	ENSXCOG00000006611	papolg	74	97.228	Xiphophorus_couchianus
ENSCVAG00000016602	papolg	90	94.664	ENSXMAG00000007383	papolg	96	95.400	Xiphophorus_maculatus