EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000017158 (Gene tree)
Gene ID: 107085824
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 61656 bases
Position: chrKL652634.1:219677-281332
Accession: 107085824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000014499	MIF4G	PF02854.19	1.2e-25	1	1
ENSCVAP00000029411	MIF4G	PF02854.19	1.3e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000022367	-	7190	XM_015376399	ENSCVAP00000029411	698 (aa)	XP_015231885	UPI000742BB94
ENSCVAT00000022388	-	7109	XM_015376401	ENSCVAP00000014499	671 (aa)	XP_015231887	UPI000742C0A5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.539	ENSG00000134030	CTIF	99	53.619	Homo_sapiens
ENSCVAG00000017158	ctif	86	82.514	ENSAPOG00000020192	ctif	100	79.970	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000017158	ctif	88	52.874	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	50.739	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.409	ENSACIG00000017099	ctif	100	77.983	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000017158	ctif	100	76.353	ENSAOCG00000014275	ctif	100	75.533	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000017158	ctif	100	80.682	ENSAPEG00000016975	ctif	100	80.678	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000017158	ctif	100	81.093	ENSATEG00000016752	ctif	100	80.502	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	59.735	ENSACAG00000018006	CTIF	99	59.440	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.669	ENSANAG00000024925	CTIF	99	53.779	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000017158	ctif	100	80.742	ENSACLG00000005956	ctif	100	80.314	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000017158	ctif	99	62.676	ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.453	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.310	ENSBTAG00000018901	CTIF	94	61.316	Bos_taurus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.022	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	52.814	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000017158	ctif	97	54.341	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	53.130	Canis_familiaris
ENSCVAG00000017158	ctif	97	54.641	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	53.421	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.519	ENSCHIG00000014455	CTIF	94	59.897	Capra_hircus
ENSCVAG00000017158	ctif	81	56.962	ENSTSYG00000030461	CTIF	96	54.301	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000017158	ctif	99	51.316	ENSCAPG00000011865	CTIF	94	61.155	Cavia_aperea
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.335	ENSCPOG00000001049	CTIF	94	59.033	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.072	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	53.179	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.783	ENSCATG00000038134	CTIF	98	66.250	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.523	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	53.666	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.783	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	51.645	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000017158	ctif	89	87.500	ENSCPBG00000025654	CTIF	98	86.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.839	ENSCANG00000030916	CTIF	99	55.273	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.912	ENSCGRG00001020158	Ctif	94	60.881	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000017158	ctif	99	52.489	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	49.858	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000017158	ctif	100	74.017	ENSCSEG00000019857	ctif	100	76.642	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000017158	ctif	99	65.286	ENSDARG00000090617	ctif	100	65.254	Danio_rerio
ENSCVAG00000017158	ctif	68	57.717	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	54.968	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.473	ENSDORG00000003221	Ctif	94	61.376	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000017158	ctif	80	84.000	ENSEASG00005016094	CTIF	81	84.000	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.344	ENSECAG00000020473	CTIF	94	60.881	Equus_caballus
ENSCVAG00000017158	ctif	77	58.634	ENSEEUG00000012451	CTIF	91	55.955	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	63.151	ENSELUG00000008733	ctif	100	63.782	Esox_lucius
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.344	ENSFCAG00000000664	CTIF	98	84.000	Felis_catus
ENSCVAG00000017158	ctif	97	55.640	ENSFALG00000008943	CTIF	98	54.173	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.335	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	52.374	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000017158	ctif	100	87.960	ENSFHEG00000004334	ctif	100	91.525	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	58.918	ENSGALG00000035912	-	99	58.333	Gallus_gallus
ENSCVAG00000017158	ctif	100	86.506	ENSGAFG00000011896	ctif	100	94.915	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000017158	ctif	65	54.566	ENSGAGG00000020663	CTIF	95	57.107	Gopherus_agassizii
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.325	ENSGGOG00000015204	CTIF	94	61.257	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000017158	ctif	100	80.884	ENSHBUG00000018092	ctif	100	80.456	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.030	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	53.166	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.882	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	53.019	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000017158	ctif	99	59.016	ENSHCOG00000011784	ctif	99	60.741	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000017158	ctif	99	64.568	ENSIPUG00000014050	ctif	99	64.017	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.539	ENSSTOG00000001967	CTIF	94	60.825	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.373	ENSJJAG00000013706	Ctif	94	60.207	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000017158	ctif	100	80.267	ENSKMAG00000014651	ctif	100	80.889	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	65.634	ENSLOCG00000011697	ctif	100	65.739	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	48.527	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	75.000	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.198	ENSMFAG00000037903	CTIF	98	66.250	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.783	ENSMMUG00000020898	CTIF	98	66.250	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.783	ENSMNEG00000039395	CTIF	98	66.250	Macaca_nemestrina
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.036	ENSMLEG00000041132	CTIF	98	66.250	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000017158	ctif	100	80.267	ENSMAMG00000014741	ctif	100	79.080	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000017158	ctif	90	78.855	ENSMZEG00005019767	ctif	90	78.378	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000017158	ctif	89	39.803	ENSMGAG00000001378	CTIF	62	86.000	Meleagris_gallopavo
ENSCVAG00000017158	ctif	99	56.041	ENSMAUG00000000656	Ctif	94	62.467	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.391	ENSMICG00000010167	CTIF	96	59.091	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.523	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	53.431	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000017158	ctif	100	76.912	ENSMMOG00000000831	ctif	100	75.036	Mola_mola
ENSCVAG00000017158	ctif	99	53.010	ENSMODG00000003464	CTIF	100	50.073	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000017158	ctif	71	78.205	ENSMALG00000020553	ctif	100	78.205	Monopterus_albus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.455	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	94	58.333	Mus_caroli
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.443	ENSMUSG00000052928	Ctif	94	58.049	Mus_musculus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	56.287	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	94	61.818	Mus_pahari
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.584	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	91	73.203	Mus_spretus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.539	ENSMPUG00000000844	CTIF	94	61.598	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.638	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	53.461	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.685	ENSNGAG00000011452	Ctif	94	60.982	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000017158	ctif	100	80.861	ENSNBRG00000008679	ctif	100	80.415	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.891	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	52.847	Nomascus_leucogenys
ENSCVAG00000017158	ctif	99	49.485	ENSMEUG00000000218	CTIF	84	84.000	Notamacropus_eugenii
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.786	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	52.562	Ochotona_princeps
ENSCVAG00000017158	ctif	99	53.738	ENSODEG00000018390	CTIF	100	51.336	Octodon_degus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	72.321	ENSONIG00000007750	ctif	100	72.619	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000017158	ctif	80	51.429	ENSOANG00000001337	CTIF	99	49.331	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.810	ENSOCUG00000024842	CTIF	94	61.053	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000017158	ctif	100	77.684	ENSORLG00000005786	ctif	100	76.554	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.143	ENSORLG00020005385	ctif	100	78.143	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.267	ENSORLG00015011872	ctif	100	78.125	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.014	ENSOMEG00000007917	ctif	100	78.014	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.198	ENSOGAG00000013927	CTIF	94	60.622	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.891	ENSOARG00000003754	CTIF	94	60.309	Ovis_aries
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.376	ENSPPAG00000023554	CTIF	98	66.250	Pan_paniscus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.182	ENSPPRG00000002265	CTIF	94	60.982	Panthera_pardus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.182	ENSPTIG00000013761	CTIF	94	60.825	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.376	ENSPTRG00000010009	CTIF	98	66.250	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.783	ENSPANG00000017087	CTIF	98	66.250	Papio_anubis
ENSCVAG00000017158	ctif	80	58.071	ENSPKIG00000011234	ctif	99	62.105	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000017158	ctif	89	85.417	ENSPSIG00000006508	CTIF	98	84.000	Pelodiscus_sinensis
ENSCVAG00000017158	ctif	100	71.246	ENSPMGG00000022958	ctif	100	70.638	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.994	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	52.984	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000017158	ctif	71	57.438	ENSPCIG00000026247	CTIF	97	61.094	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000017158	ctif	100	87.712	ENSPFOG00000009243	ctif	100	86.723	Poecilia_formosa
ENSCVAG00000017158	ctif	100	87.853	ENSPLAG00000019171	ctif	100	86.864	Poecilia_latipinna
ENSCVAG00000017158	ctif	100	87.853	ENSPMEG00000020089	ctif	100	86.864	Poecilia_mexicana
ENSCVAG00000017158	ctif	100	85.248	ENSPREG00000017326	ctif	100	85.248	Poecilia_reticulata
ENSCVAG00000017158	ctif	80	58.652	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	56.341	Pongo_abelii
ENSCVAG00000017158	ctif	99	52.838	ENSPCOG00000013391	CTIF	94	56.923	Propithecus_coquereli
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.867	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	52.863	Pteropus_vampyrus
ENSCVAG00000017158	ctif	100	80.884	ENSPNYG00000007879	ctif	100	80.456	Pundamilia_nyererei
ENSCVAG00000017158	ctif	99	66.856	ENSPNAG00000029174	ctif	100	65.072	Pygocentrus_nattereri
ENSCVAG00000017158	ctif	99	56.785	ENSRNOG00000018342	Ctif	94	63.061	Rattus_norvegicus
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.735	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	52.915	Rhinopithecus_bieti
ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.294	ENSRROG00000006039	CTIF	99	52.478	Rhinopithecus_roxellana
ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.942	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	53.043	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCVAG00000017158	ctif	99	52.725	ENSSHAG00000016321	CTIF	100	50.365	Sarcophilus_harrisii
ENSCVAG00000017158	ctif	99	66.124	ENSSFOG00015022594	ctif	100	65.731	Scleropages_formosus
ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.963	ENSSMAG00000005707	ctif	100	80.296	Scophthalmus_maximus
ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.801	ENSSDUG00000016033	ctif	100	78.382	Seriola_dumerili
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ENSCVAG00000017158	ctif	99	55.952	ENSSPUG00000014734	CTIF	99	54.653	Sphenodon_punctatus
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