EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000018173 (Gene tree)
Gene ID: 107082980
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25695 bases
Position: chrKL652566.1:1528699-1554393
Accession: 107082980
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000029956	PAZ	PF02170.22	7.2e-29	1	1
ENSCVAP00000029956	Piwi	PF02171.17	1.6e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000023417	-	5622	XM_015371881	ENSCVAP00000029956	858 (aa)	XP_015227367	UPI000742C4C0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCVAG00000018173	ago1	100	83.276	ENSCVAG00000018224	ago3a	100	83.276
ENSCVAG00000018173	ago1	98	82.002	ENSCVAG00000008763	ago2	100	81.611
ENSCVAG00000018173	ago1	50	72.383	ENSCVAG00000011229	-	96	72.383

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSG00000092847	AGO1	100	97.187	Homo_sapiens
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	ENSAPOG00000024299	ago1	100	99.650	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	95.921	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000018173	ago1	82	93.162	ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	ENSAOCG00000017727	ago1	100	99.650	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	ENSAPEG00000004458	ago1	100	99.882	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	ENSATEG00000008523	ago1	100	99.650	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000018173	ago1	99	89.884	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	89.884	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000018173	ago1	91	97.059	ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSANAG00000037711	AGO1	100	95.921	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.417	ENSACLG00000000890	ago1	100	99.417	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000018173	ago1	80	99.854	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.854	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	95.921	Bos_taurus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	95.921	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	95.921	Canis_familiaris
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.667	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.222	ENSCHIG00000011848	-	100	95.133	Capra_hircus
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSTSYG00000009767	-	100	95.921	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000018173	ago1	100	75.641	ENSTSYG00000032426	-	99	78.143	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000018173	ago1	89	92.531	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	Cavia_aperea
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	95.921	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	95.921	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.804	ENSCATG00000031521	AGO1	100	97.187	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.140	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	95.921	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	95.921	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000018173	ago1	85	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.804	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.804	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSCANG00000039798	AGO1	100	95.921	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.235	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	95.921	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.576	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000018173	ago1	99	97.798	ENSCSEG00000001051	ago1	100	97.798	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000018173	ago1	100	98.718	ENSDARG00000092644	ago1	100	98.718	Danio_rerio
ENSCVAG00000018173	ago1	91	97.187	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	97.187	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000018173	ago1	91	97.087	ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000018173	ago1	82	89.958	ENSETEG00000007626	AGO1	100	88.920	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSEASG00005012086	AGO1	100	95.921	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSECAG00000024353	AGO1	100	95.921	Equus_caballus
ENSCVAG00000018173	ago1	92	88.818	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000018173	ago1	91	99.744	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.744	Esox_lucius
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	95.921	Felis_catus
ENSCVAG00000018173	ago1	91	90.816	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.921	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.921	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000018173	ago1	99	95.873	ENSFHEG00000017927	ago1	100	95.873	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000018173	ago1	87	86.649	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.649	Gadus_morhua
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.797	ENSGALG00000002249	AGO1	100	95.804	Gallus_gallus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	ENSGAFG00000009775	ago1	100	99.650	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000018173	ago1	87	99.334	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000018173	ago1	91	97.059	ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	Gopherus_agassizii
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	95.921	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.417	ENSHBUG00000010459	ago1	100	99.417	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	95.921	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	95.921	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000018173	ago1	99	99.882	ENSHCOG00000005708	ago1	100	99.882	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.068	ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.068	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.235	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	95.921	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.921	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	95.921	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.767	ENSKMAG00000019464	ago1	100	99.767	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.534	ENSLBEG00000007694	ago1	100	99.534	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000018173	ago1	99	90.824	ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000018173	ago1	100	94.522	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.522	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.235	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	95.921	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000018173	ago1	99	91.972	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	92.171	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000018173	ago1	99	93.152	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	97.187	Macaca_nemestrina
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	95.921	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	ENSMAMG00000008381	ago1	100	99.650	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.417	ENSMZEG00005007996	ago1	100	99.417	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000018173	ago1	100	90.405	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.405	Meleagris_gallopavo
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	95.921	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSMICG00000016147	AGO1	100	95.921	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000018173	ago1	99	95.916	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	95.804	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000018173	ago1	78	99.701	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.701	Mola_mola
ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.688	ENSMODG00000023335	AGO1	100	95.688	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000018173	ago1	99	99.764	ENSMALG00000011057	ago1	100	99.764	Monopterus_albus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	Mus_caroli
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.011	Mus_musculus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.011	Mus_pahari
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.011	Mus_spretus
ENSCVAG00000018173	ago1	84	97.772	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.772	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000018173	ago1	61	94.646	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	94.646	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.804	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	95.804	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000018173	ago1	91	99.872	ENSNBRG00000010867	ago1	100	99.872	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.921	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	95.921	Nomascus_leucogenys
ENSCVAG00000018173	ago1	84	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSCVAG00000018173	ago1	93	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	Ochotona_princeps
ENSCVAG00000018173	ago1	100	94.919	ENSODEG00000005321	AGO1	100	95.921	Octodon_degus
ENSCVAG00000018173	ago1	99	99.647	ENSONIG00000016345	ago1	100	99.647	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	88.037	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.037	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.797	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	95.804	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.767	ENSORLG00000014965	ago1	100	99.767	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.767	ENSORLG00020018253	ago1	100	99.767	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.767	ENSORLG00015003287	ago1	100	99.767	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.767	ENSOMEG00000020528	ago1	100	99.767	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.353	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	96.353	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSOARG00000019591	AGO1	100	95.921	Ovis_aries
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	95.921	Pan_paniscus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	95.921	Panthera_pardus
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.679	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	95.688	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	95.921	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	ENSPANG00000009060	AGO1	100	95.921	Papio_anubis
ENSCVAG00000018173	ago1	98	95.962	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	Pelodiscus_sinensis
ENSCVAG00000018173	ago1	80	98.547	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	95.921	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.688	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.688	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	ENSPFOG00000005867	ago1	100	99.650	Poecilia_formosa
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	ENSPLAG00000002824	ago1	100	99.650	Poecilia_latipinna
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	ENSPMEG00000001787	ago1	100	99.650	Poecilia_mexicana
ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	ENSPREG00000006534	ago1	100	99.650	Poecilia_reticulata
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