EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000019543 (Gene tree)
Gene ID: 107096423
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14556 bases
Position: chrKL653123.1:98276-112831
Accession: 107096423
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000030757	SYF2	PF08231.12	5.2e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000024972	-	4834	XM_015393069	ENSCVAP00000030757	239 (aa)	XP_015248555	UPI000742799F

Gene Model

Click here to download ENSCVAG00000019543's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCVAG00000019543's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	ENSG00000117614	SYF2	90	81.735	Homo_sapiens
ENSCVAG00000019543	syf2	100	91.213	ENSAPOG00000001174	syf2	100	91.213	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000019543	syf2	82	81.538	ENSAMEG00000010134	-	100	81.538	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000019543	syf2	92	80.822	ENSAMEG00000010115	-	90	80.822	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000019543	syf2	96	91.739	ENSACIG00000023688	syf2	89	91.928	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.377	ENSAOCG00000022046	syf2	95	92.377	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000019543	syf2	93	89.640	ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.189	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.377	ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.377	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.121	ENSATEG00000007745	syf2	100	90.377	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000019543	syf2	83	83.417	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000019543	syf2	69	68.862	ENSACAG00000026777	-	100	68.862	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000019543	syf2	85	82.353	ENSACAG00000013653	-	100	82.353	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000019543	syf2	90	82.407	ENSANAG00000032473	SYF2	91	81.818	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.795	ENSACLG00000019916	syf2	100	90.795	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000019543	syf2	100	82.008	ENSAMXG00000004051	syf2	94	85.650	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	77.406	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	81.900	Bos_taurus
ENSCVAG00000019543	syf2	87	52.381	WBGene00019402	syf-2	90	51.905	Caenorhabditis_elegans
ENSCVAG00000019543	syf2	90	82.407	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	82.192	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000019543	syf2	90	76.389	ENSCAFG00000030331	-	92	76.389	Canis_familiaris
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.019	ENSCAFG00000012895	-	89	80.822	Canis_familiaris
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.019	ENSCAFG00020021091	-	89	80.822	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000019543	syf2	76	72.527	ENSCAFG00020021094	-	95	72.527	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.178	ENSCHIG00000020874	SYF2	92	81.448	Capra_hircus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	76.132	ENSTSYG00000005114	SYF2	91	80.543	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000019543	syf2	83	81.313	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.313	Cavia_aperea
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.311	ENSCPOG00000005326	SYF2	90	82.192	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000019543	syf2	90	82.407	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	82.192	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.215	ENSCATG00000026917	SYF2	90	80.822	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000019543	syf2	99	78.151	ENSCLAG00000008474	SYF2	91	82.353	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.215	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.822	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000019543	syf2	72	61.494	ENSCHOG00000005273	-	91	62.651	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000019543	syf2	92	83.258	ENSCPBG00000025073	SYF2	89	83.258	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000019543	syf2	89	54.673	ENSCING00000003017	-	89	55.140	Ciona_intestinalis
ENSCVAG00000019543	syf2	89	51.402	ENSCSAVG00000006627	-	98	51.402	Ciona_savignyi
ENSCVAG00000019543	syf2	99	67.932	ENSCANG00000037322	SYF2	89	70.776	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.099	ENSCGRG00001020733	Syf2	91	81.900	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000019543	syf2	82	82.143	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.910	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000019543	syf2	91	88.073	ENSCSEG00000000117	syf2	93	86.937	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000019543	syf2	100	83.264	ENSDARG00000004706	syf2	100	83.264	Danio_rerio
ENSCVAG00000019543	syf2	99	76.446	ENSDNOG00000047605	SYF2	90	80.995	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	77.049	ENSDORG00000001274	Syf2	91	81.532	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000019543	syf2	91	55.909	FBgn0033556	CG12343	97	55.909	Drosophila_melanogaster
ENSCVAG00000019543	syf2	87	67.308	ENSETEG00000015729	SYF2	91	67.308	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000019543	syf2	82	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.686	ENSEASG00005004224	-	89	82.648	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	68.595	ENSEASG00005004232	-	91	71.946	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000019543	syf2	97	79.060	ENSECAG00000010440	-	92	82.648	Equus_caballus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	77.824	ENSECAG00000012023	-	90	81.900	Equus_caballus
ENSCVAG00000019543	syf2	74	66.480	ENSEEUG00000015084	SYF2	88	70.186	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	83.682	ENSELUG00000003465	syf2	93	88.235	Esox_lucius
ENSCVAG00000019543	syf2	100	77.551	ENSFCAG00000010324	-	76	82.648	Felis_catus
ENSCVAG00000019543	syf2	98	78.298	ENSFCAG00000043095	-	89	81.735	Felis_catus
ENSCVAG00000019543	syf2	85	79.902	ENSFALG00000000460	SYF2	89	79.091	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000019543	syf2	100	76.543	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	81.735	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000019543	syf2	94	81.858	ENSFHEG00000007238	syf2	100	81.858	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000019543	syf2	90	87.442	ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.442	Gadus_morhua
ENSCVAG00000019543	syf2	95	81.057	ENSGALG00000013639	SYF2	88	82.805	Gallus_gallus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	94.561	ENSGAFG00000019435	syf2	100	94.561	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000019543	syf2	100	85.774	ENSGACG00000007305	syf2	100	85.774	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000019543	syf2	92	83.710	ENSGAGG00000010670	SYF2	89	83.710	Gopherus_agassizii
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	81.735	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.795	ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.377	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000019543	syf2	92	72.398	ENSHGLG00000004304	-	92	72.851	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000019543	syf2	100	77.049	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	81.900	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000019543	syf2	100	77.049	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	81.900	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000019543	syf2	100	87.448	ENSHCOG00000012904	syf2	78	87.029	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000019543	syf2	100	82.845	ENSIPUG00000019859	syf2	100	82.845	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000019543	syf2	61	75.342	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	75.342	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000019543	syf2	83	81.910	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.910	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	92.050	ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.632	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.377	ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.795	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000019543	syf2	92	82.353	ENSLACG00000012064	SYF2	93	82.353	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000019543	syf2	100	84.519	ENSLOCG00000002728	syf2	88	87.387	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	76.327	ENSLAFG00000023150	-	91	81.081	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000019543	syf2	77	53.804	ENSLAFG00000030814	-	100	53.804	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.215	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	80.822	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.019	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	80.822	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.215	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	80.822	Macaca_nemestrina
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.215	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	80.822	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.958	ENSMAMG00000010403	syf2	98	89.958	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.795	ENSMZEG00005006429	syf2	100	90.795	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000019543	syf2	83	82.915	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	Meleagris_gallopavo
ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.926	ENSMAUG00000018974	Syf2	91	83.258	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000019543	syf2	83	81.910	ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.910	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.512	ENSMOCG00000022938	Syf2	91	82.805	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000019543	syf2	96	88.261	ENSMMOG00000002396	syf2	92	90.045	Mola_mola
ENSCVAG00000019543	syf2	92	78.027	ENSMODG00000013951	-	97	78.027	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000019543	syf2	100	88.797	ENSMALG00000010706	syf2	100	89.212	Monopterus_albus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.926	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	91	83.258	Mus_caroli
ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.926	ENSMUSG00000028821	Syf2	91	83.258	Mus_musculus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.926	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	91	83.258	Mus_pahari
ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.926	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	91	83.258	Mus_spretus
ENSCVAG00000019543	syf2	92	81.735	ENSMPUG00000015801	-	89	81.735	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.019	ENSMPUG00000015802	-	89	80.822	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000019543	syf2	99	76.667	ENSMLUG00000001885	SYF2	91	80.543	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	75.610	ENSNGAG00000007912	Syf2	90	81.448	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000019543	syf2	100	81.070	ENSNBRG00000010720	syf2	99	81.070	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	81.735	Nomascus_leucogenys
ENSCVAG00000019543	syf2	100	75.309	ENSOPRG00000012870	SYF2	91	80.180	Ochotona_princeps
ENSCVAG00000019543	syf2	98	77.447	ENSODEG00000017664	-	93	80.543	Octodon_degus
ENSCVAG00000019543	syf2	99	67.227	ENSODEG00000014338	-	92	71.041	Octodon_degus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.377	ENSONIG00000008213	syf2	100	90.377	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000019543	syf2	85	81.683	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCVAG00000019543	syf2	90	82.407	ENSOCUG00000013050	SYF2	91	81.900	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000019543	syf2	96	91.304	ENSORLG00000028820	syf2	95	93.213	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.121	ENSORLG00020018333	syf2	94	92.793	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.540	ENSORLG00015014665	syf2	94	92.377	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.958	ENSOMEG00000013911	syf2	93	94.144	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000019543	syf2	99	78.151	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	82.353	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000019543	syf2	99	75.820	ENSOARG00000006348	-	90	80.717	Ovis_aries
ENSCVAG00000019543	syf2	82	54.872	ENSOARG00000006269	-	100	54.872	Ovis_aries
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	81.735	Pan_paniscus
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.593	ENSPPRG00000001638	-	89	82.648	Panthera_pardus
ENSCVAG00000019543	syf2	98	78.298	ENSPPRG00000001651	-	89	81.735	Panthera_pardus
ENSCVAG00000019543	syf2	90	82.870	ENSPTIG00000005711	-	80	82.569	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000019543	syf2	92	81.735	ENSPTIG00000007036	-	89	81.735	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	81.735	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.215	ENSPANG00000008139	SYF2	90	80.822	Papio_anubis
ENSCVAG00000019543	syf2	100	81.172	ENSPKIG00000008130	syf2	94	85.520	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000019543	syf2	99	78.992	ENSPSIG00000011816	SYF2	86	81.900	Pelodiscus_sinensis
ENSCVAG00000019543	syf2	95	89.035	ENSPMGG00000008755	syf2	87	90.991	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.099	ENSPEMG00000008283	Syf2	91	82.353	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000019543	syf2	92	82.353	ENSPCIG00000014235	SYF2	88	82.353	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	92.469	ENSPFOG00000004116	syf2	99	92.469	Poecilia_formosa
ENSCVAG00000019543	syf2	99	92.017	ENSPLAG00000006691	syf2	96	95.516	Poecilia_latipinna
ENSCVAG00000019543	syf2	100	91.213	ENSPMEG00000011684	syf2	100	90.795	Poecilia_mexicana
ENSCVAG00000019543	syf2	100	93.724	ENSPREG00000003009	syf2	100	93.305	Poecilia_reticulata
ENSCVAG00000019543	syf2	99	78.059	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.735	Pongo_abelii
ENSCVAG00000019543	syf2	100	53.086	ENSPCOG00000027011	SYF2	87	55.656	Propithecus_coquereli
ENSCVAG00000019543	syf2	99	69.198	ENSPVAG00000005841	SYF2	90	71.946	Pteropus_vampyrus
ENSCVAG00000019543	syf2	93	91.928	ENSPNYG00000004979	syf2	100	90.377	Pundamilia_nyererei
ENSCVAG00000019543	syf2	100	82.427	ENSPNAG00000015570	syf2	94	86.099	Pygocentrus_nattereri
ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.926	ENSRNOG00000060597	Syf2	91	83.258	Rattus_norvegicus
ENSCVAG00000019543	syf2	99	75.105	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	78.539	Rhinopithecus_bieti
ENSCVAG00000019543	syf2	99	77.215	ENSRROG00000001347	SYF2	90	80.822	Rhinopithecus_roxellana
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	81.735	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCVAG00000019543	syf2	92	81.448	ENSSHAG00000015630	-	89	81.448	Sarcophilus_harrisii
ENSCVAG00000019543	syf2	86	81.553	ENSSHAG00000007152	-	100	81.553	Sarcophilus_harrisii
ENSCVAG00000019543	syf2	96	82.969	ENSSFOG00015023647	syf2	94	85.135	Scleropages_formosus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	87.448	ENSSMAG00000009867	syf2	100	87.029	Scophthalmus_maximus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	88.703	ENSSDUG00000013072	syf2	93	91.441	Seriola_dumerili
ENSCVAG00000019543	syf2	100	88.703	ENSSLDG00000012677	syf2	93	91.441	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCVAG00000019543	syf2	99	59.751	ENSSARG00000012889	SYF2	91	62.443	Sorex_araneus
ENSCVAG00000019543	syf2	99	79.339	ENSSPUG00000005251	SYF2	87	84.163	Sphenodon_punctatus
ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.540	ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.540	Stegastes_partitus
ENSCVAG00000019543	syf2	96	78.879	ENSSSCG00000037481	SYF2	90	81.448	Sus_scrofa
ENSCVAG00000019543	syf2	62	52.318	ENSTGUG00000001126	SYF2	84	53.529	Taeniopygia_guttata
ENSCVAG00000019543	syf2	100	85.000	ENSTRUG00000001499	syf2	90	87.892	Takifugu_rubripes
ENSCVAG00000019543	syf2	92	87.783	ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.783	Tetraodon_nigroviridis
ENSCVAG00000019543	syf2	100	58.025	ENSTBEG00000017370	SYF2	89	60.633	Tupaia_belangeri
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	ENSTTRG00000003550	SYF2	91	81.448	Tursiops_truncatus
ENSCVAG00000019543	syf2	98	77.872	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.279	Ursus_americanus
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.019	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	80.822	Ursus_maritimus
ENSCVAG00000019543	syf2	99	76.349	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	80.995	Vicugna_pacos
ENSCVAG00000019543	syf2	86	80.976	ENSVVUG00000027181	-	88	80.822	Vulpes_vulpes
ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.019	ENSVVUG00000027175	-	89	80.822	Vulpes_vulpes
ENSCVAG00000019543	syf2	97	76.395	ENSXETG00000022797	syf2	89	78.829	Xenopus_tropicalis
ENSCVAG00000019543	syf2	100	92.887	ENSXMAG00000022698	syf2	100	92.887	Xiphophorus_maculatus