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Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000020264 (Gene tree)
Gene ID: 107099778
Gene Symbol: aco1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26347 bases
Position: chrKL653407.1:239245-265591
Accession: 107099778
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000017154	Aconitase	PF00330.20	6.9e-162	1	1
ENSCVAP00000017154	Aconitase_C	PF00694.19	2.8e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000025790	-	2574	XM_015398039	ENSCVAP00000017154	857 (aa)	XP_015253525	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSCVAG00000020264	aco1	99	56.835	ENSCVAG00000010739	ireb2	89	56.835
ENSCVAG00000020264	aco1	54	32.692	ENSCVAG00000006081	aco2	55	32.692

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.351	ENSG00000122729	ACO1	99	76.351	Homo_sapiens
ENSCVAG00000020264	aco1	100	81.879	ENSAPOG00000008670	aco1	100	82.103	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.153	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	76.153	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.998	ENSACIG00000014377	aco1	100	82.998	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.438	ENSAOCG00000007699	aco1	100	82.662	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.438	ENSAPEG00000014370	aco1	100	82.662	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000020264	aco1	100	83.893	ENSATEG00000000560	aco1	100	83.893	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.874	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	75.874	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000020264	aco1	95	75.235	ENSACAG00000001541	ACO1	99	75.235	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000020264	aco1	99	74.972	ENSANAG00000003359	ACO1	99	74.972	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.215	ENSACLG00000007755	aco1	100	82.215	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000020264	aco1	99	78.965	ENSAMXG00000002499	aco1	99	78.965	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.788	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	75.788	Bos_taurus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.788	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	75.788	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.506	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	75.506	Canis_familiaris
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.788	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	75.788	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.901	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	75.901	Capra_hircus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.577	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	76.577	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000020264	aco1	99	63.140	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	63.023	Cavia_aperea
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.099	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	76.099	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.113	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	75.113	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.239	ENSCATG00000045333	ACO1	99	76.239	Cercocebus_atys
ENSCVAG00000020264	aco1	99	74.859	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	74.859	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.897	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	76.126	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000020264	aco1	89	58.595	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	58.408	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.325	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	76.325	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.014	ENSCANG00000014847	ACO1	99	76.014	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.437	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	76.437	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.648	ENSCGRG00000004877	-	99	75.648	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000020264	aco1	100	78.747	ENSCSEG00000018262	aco1	100	78.523	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000020264	aco1	99	78.853	ENSDARG00000026376	aco1	99	78.853	Danio_rerio
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.126	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	76.126	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.663	ENSDORG00000014246	Aco1	99	76.663	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000020264	aco1	83	62.963	ENSETEG00000012415	-	79	62.963	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000020264	aco1	99	53.692	ENSEBUG00000015441	aco1	97	53.692	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.901	ENSEASG00005004602	ACO1	99	75.901	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.788	ENSECAG00000014846	ACO1	99	75.788	Equus_caballus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	65.428	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	65.428	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	78.403	ENSELUG00000016812	aco1	97	78.403	Esox_lucius
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.014	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	76.014	Felis_catus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.986	ENSFALG00000001167	ACO1	99	75.986	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.536	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	75.536	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000020264	aco1	100	85.347	ENSFHEG00000005619	aco1	100	85.347	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	77.878	ENSGMOG00000005514	aco1	99	77.878	Gadus_morhua
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.986	ENSGALG00000002162	ACO1	99	75.986	Gallus_gallus
ENSCVAG00000020264	aco1	100	81.096	ENSGACG00000001637	aco1	100	81.096	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.648	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	75.648	Gopherus_agassizii
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.239	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	76.239	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.438	ENSHBUG00000008952	aco1	100	82.438	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.423	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	75.423	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.423	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	75.423	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000020264	aco1	100	79.530	ENSHCOG00000015881	aco1	100	79.530	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000020264	aco1	99	78.266	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	78.266	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.550	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	76.550	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	77.001	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	77.001	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000020264	aco1	100	83.445	ENSKMAG00000015759	aco1	100	83.445	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000020264	aco1	100	77.877	ENSLBEG00000013866	aco1	100	77.877	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000020264	aco1	74	62.370	ENSLACG00000000936	ACO1	99	62.146	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000020264	aco1	99	78.330	ENSLOCG00000011082	aco1	99	78.330	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	74.099	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	74.099	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.464	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	76.464	Macaca_fascicularis
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.577	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	76.577	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.351	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	76.351	Macaca_nemestrina
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.126	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	76.126	Mandrillus_leucophaeus
ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.774	ENSMAMG00000002915	aco1	100	82.774	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	79.464	ENSMZEG00005012733	aco1	100	79.129	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000020264	aco1	99	66.023	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	66.023	Meleagris_gallopavo
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.776	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	76.776	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.239	ENSMICG00000006540	ACO1	99	76.239	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.550	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	76.550	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000020264	aco1	99	81.757	ENSMMOG00000020282	aco1	99	81.757	Mola_mola
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.225	ENSMODG00000004463	ACO1	99	75.225	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.438	ENSMALG00000019764	aco1	100	82.438	Monopterus_albus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.663	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	76.663	Mus_caroli
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.663	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	76.663	Mus_musculus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.663	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	76.663	Mus_pahari
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.776	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	87	92.754	Mus_spretus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.689	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	76.689	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000020264	aco1	99	74.437	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	74.437	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.761	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	75.761	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000020264	aco1	100	69.061	ENSNBRG00000008973	aco1	100	68.946	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.014	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	76.014	Nomascus_leucogenys
ENSCVAG00000020264	aco1	82	82.895	ENSMEUG00000014756	ACO1	79	82.895	Notamacropus_eugenii
ENSCVAG00000020264	aco1	99	72.297	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	72.297	Ochotona_princeps
ENSCVAG00000020264	aco1	99	70.688	ENSODEG00000015432	-	99	70.462	Octodon_degus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	73.281	ENSODEG00000001240	-	99	73.281	Octodon_degus
ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.662	ENSONIG00000019869	aco1	100	82.662	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000020264	aco1	80	75.104	ENSOANG00000012132	ACO1	100	75.104	Ornithorhynchus_anatinus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.501	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	75.278	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	83.559	ENSORLG00000020656	aco1	99	83.559	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000020264	aco1	99	83.221	ENSORLG00020010991	aco1	99	83.221	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000020264	aco1	100	82.886	ENSORLG00015011785	aco1	100	82.886	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000020264	aco1	99	81.930	ENSOMEG00000000660	aco1	99	81.930	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.577	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	76.577	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.673	ENSOARG00000014707	ACO1	99	75.673	Ovis_aries
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.351	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	76.351	Pan_paniscus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.126	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	76.126	Panthera_pardus
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.785	ENSPTIG00000016606	ACO1	99	75.785	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.351	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	76.351	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.126	ENSPANG00000025270	ACO1	99	76.126	Papio_anubis
ENSCVAG00000020264	aco1	99	77.156	ENSPKIG00000023168	aco1	99	77.156	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000020264	aco1	99	76.099	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	76.099	Pelodiscus_sinensis
ENSCVAG00000020264	aco1	100	81.320	ENSPMGG00000020708	aco1	100	81.320	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSCVAG00000020264	aco1	100	85.123	ENSPREG00000021791	aco1	100	85.123	Poecilia_reticulata
ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.901	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	75.901	Pongo_abelii
ENSCVAG00000020264	aco1	71	83.962	ENSPCAG00000013222	ACO1	80	83.962	Procavia_capensis
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