EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSCVAG00000023105 (Gene tree)
Gene ID: 107094374
Gene Symbol: nrde2
Alias: c14orf102
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Cyprinodon_variegatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9628 bases
Position: chrKL652521.1:1111891-1121518
Accession: 107094374
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSCVAP00000019717	NRDE-2	PF08424.10	2.7e-100	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSCVAT00000033264	-	3689	XM_015389935	ENSCVAP00000019717	1176 (aa)	XP_015245421	UPI0007425970

Gene Model

Click here to download ENSCVAG00000023105's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSCVAG00000023105's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.115	ENSG00000119720	NRDE2	100	66.176	Homo_sapiens
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	74.482	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	74.482	Acanthochromis_polyacanthus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	43.230	ENSAMEG00000001807	NRDE2	100	44.674	Ailuropoda_melanoleuca
ENSCVAG00000023105	nrde2	97	73.124	ENSACIG00000014783	nrde2	100	72.878	Amphilophus_citrinellus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	74.688	ENSAOCG00000015576	nrde2	99	74.604	Amphiprion_ocellaris
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	74.791	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	74.707	Amphiprion_percula
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	72.227	ENSATEG00000010247	nrde2	99	72.560	Anabas_testudineus
ENSCVAG00000023105	nrde2	98	46.711	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	47.448	Anas_platyrhynchos
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	43.817	ENSACAG00000014571	NRDE2	100	44.609	Anolis_carolinensis
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.444	ENSANAG00000025313	NRDE2	100	44.665	Aotus_nancymaae
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	71.953	ENSACLG00000025154	nrde2	100	72.120	Astatotilapia_calliptera
ENSCVAG00000023105	nrde2	86	69.767	ENSAMXG00000034642	nrde2	83	49.134	Astyanax_mexicanus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.000	ENSBTAG00000005427	NRDE2	100	45.957	Bos_taurus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.700	ENSCJAG00000017711	NRDE2	100	46.898	Callithrix_jacchus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	43.364	ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	43.617	Canis_familiaris
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.432	ENSCAFG00020016346	NRDE2	100	45.672	Canis_lupus_dingo
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.621	ENSCHIG00000005876	NRDE2	100	45.575	Capra_hircus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.726	ENSTSYG00000000161	NRDE2	100	45.792	Carlito_syrichta
ENSCVAG00000023105	nrde2	97	44.831	ENSCAPG00000012039	NRDE2	89	47.512	Cavia_aperea
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.992	ENSCPOG00000002428	NRDE2	100	45.492	Cavia_porcellus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.449	ENSCCAG00000024917	NRDE2	100	46.650	Cebus_capucinus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.038	ENSCLAG00000015185	NRDE2	100	45.252	Chinchilla_lanigera
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.948	ENSCSAG00000011451	NRDE2	100	46.319	Chlorocebus_sabaeus
ENSCVAG00000023105	nrde2	74	47.183	ENSCHOG00000006165	NRDE2	75	47.149	Choloepus_hoffmanni
ENSCVAG00000023105	nrde2	89	48.204	ENSCPBG00000008537	NRDE2	98	45.559	Chrysemys_picta_bellii
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.115	ENSCANG00000029067	NRDE2	100	46.485	Colobus_angolensis_palliatus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.387	ENSCGRG00001015658	Nrde2	100	45.350	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.371	ENSCGRG00000005062	Nrde2	100	45.334	Cricetulus_griseus_crigri
ENSCVAG00000023105	nrde2	97	66.374	ENSCSEG00000000089	nrde2	100	66.696	Cynoglossus_semilaevis
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	55.705	ENSDARG00000074726	nrde2	100	55.546	Danio_rerio
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.805	ENSDNOG00000024057	NRDE2	100	45.297	Dasypus_novemcinctus
ENSCVAG00000023105	nrde2	80	46.575	ENSDORG00000003197	Nrde2	99	46.764	Dipodomys_ordii
ENSCVAG00000023105	nrde2	60	45.275	ENSETEG00000000198	NRDE2	60	45.770	Echinops_telfairi
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	38.355	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	38.418	Eptatretus_burgeri
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.007	ENSEASG00005020675	NRDE2	100	46.167	Equus_asinus_asinus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.230	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	46.091	Equus_caballus
ENSCVAG00000023105	nrde2	65	57.037	ENSEEUG00000004026	-	69	57.037	Erinaceus_europaeus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	57.759	ENSELUG00000005973	nrde2	100	57.759	Esox_lucius
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	46.071	ENSFCAG00000011312	NRDE2	100	45.988	Felis_catus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.446	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	47.190	Ficedula_albicollis
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.667	ENSFDAG00000021350	NRDE2	100	44.802	Fukomys_damarensis
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	83.305	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	83.305	Fundulus_heteroclitus
ENSCVAG00000023105	nrde2	64	70.868	ENSGMOG00000015815	nrde2	91	70.431	Gadus_morhua
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	48.010	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	48.010	Gallus_gallus
ENSCVAG00000023105	nrde2	92	79.136	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	83.135	Gambusia_affinis
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	69.115	ENSGACG00000012619	nrde2	100	69.199	Gasterosteus_aculeatus
ENSCVAG00000023105	nrde2	89	48.493	ENSGAGG00000003252	NRDE2	100	45.768	Gopherus_agassizii
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.865	ENSGGOG00000008835	NRDE2	100	45.988	Gorilla_gorilla
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	72.120	ENSHBUG00000016736	nrde2	100	72.287	Haplochromis_burtoni
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.318	ENSHGLG00000006731	NRDE2	100	45.281	Heterocephalus_glaber_female
ENSCVAG00000023105	nrde2	97	45.191	ENSHGLG00100017736	NRDE2	88	47.887	Heterocephalus_glaber_male
ENSCVAG00000023105	nrde2	92	64.625	ENSHCOG00000009559	nrde2	98	64.260	Hippocampus_comes
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	49.789	ENSIPUG00000016129	nrde2	100	49.621	Ictalurus_punctatus
ENSCVAG00000023105	nrde2	89	48.148	ENSSTOG00000001678	NRDE2	100	45.861	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.937	ENSJJAG00000000907	Nrde2	100	45.717	Jaculus_jaculus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	73.841	ENSKMAG00000008647	nrde2	100	73.841	Kryptolebias_marmoratus
ENSCVAG00000023105	nrde2	92	70.921	ENSLBEG00000021428	nrde2	98	70.142	Labrus_bergylta
ENSCVAG00000023105	nrde2	71	51.429	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.429	Latimeria_chalumnae
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	53.697	ENSLOCG00000009037	nrde2	99	53.827	Lepisosteus_oculatus
ENSCVAG00000023105	nrde2	97	45.161	ENSLAFG00000004966	NRDE2	99	45.240	Loxodonta_africana
ENSCVAG00000023105	nrde2	80	48.788	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	66.667	Macaca_mulatta
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	71.357	ENSMAMG00000013452	nrde2	99	71.274	Mastacembelus_armatus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	71.953	ENSMZEG00005008319	nrde2	100	72.120	Maylandia_zebra
ENSCVAG00000023105	nrde2	86	49.273	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	49.273	Meleagris_gallopavo
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.871	ENSMAUG00000018578	Nrde2	100	45.169	Mesocricetus_auratus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.617	ENSMICG00000016741	NRDE2	100	47.146	Microcebus_murinus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	43.890	ENSMOCG00000014472	Nrde2	100	44.198	Microtus_ochrogaster
ENSCVAG00000023105	nrde2	75	68.492	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	68.715	Mola_mola
ENSCVAG00000023105	nrde2	94	44.492	ENSMODG00000002711	NRDE2	100	44.825	Monodelphis_domestica
ENSCVAG00000023105	nrde2	92	69.890	ENSMALG00000021869	nrde2	94	69.936	Monopterus_albus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.212	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.589	Mus_caroli
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.432	ENSMUSG00000021179	Nrde2	100	45.312	Mus_musculus
ENSCVAG00000023105	nrde2	89	48.000	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	45.672	Mus_pahari
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.363	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	90	63.253	Mus_spretus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.463	ENSMPUG00000008135	NRDE2	100	44.536	Mustela_putorius_furo
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.303	ENSMLUG00000007484	NRDE2	100	45.597	Myotis_lucifugus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.787	ENSNGAG00000002993	Nrde2	100	45.169	Nannospalax_galili
ENSCVAG00000023105	nrde2	93	71.041	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	72.710	Neolamprologus_brichardi
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.665	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	44.949	Nomascus_leucogenys
ENSCVAG00000023105	nrde2	78	41.158	ENSMEUG00000011097	NRDE2	78	41.158	Notamacropus_eugenii
ENSCVAG00000023105	nrde2	60	56.842	ENSOPRG00000001375	-	61	59.434	Ochotona_princeps
ENSCVAG00000023105	nrde2	89	46.629	ENSODEG00000012422	NRDE2	89	46.854	Octodon_degus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	71.896	ENSONIG00000019512	nrde2	100	71.896	Oreochromis_niloticus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.645	ENSOCUG00000010083	NRDE2	99	45.674	Oryctolagus_cuniculus
ENSCVAG00000023105	nrde2	96	67.489	ENSORLG00000017730	nrde2	99	67.606	Oryzias_latipes
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	68.683	ENSORLG00020015965	nrde2	100	69.345	Oryzias_latipes_hni
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	69.925	ENSORLG00015012437	nrde2	100	69.843	Oryzias_latipes_hsok
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	70.622	ENSOMEG00000010890	nrde2	100	70.788	Oryzias_melastigma
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.768	ENSOGAG00000006624	NRDE2	100	46.903	Otolemur_garnettii
ENSCVAG00000023105	nrde2	97	42.796	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	43.345	Ovis_aries
ENSCVAG00000023105	nrde2	97	46.193	ENSPPAG00000034133	NRDE2	99	48.710	Pan_paniscus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	45.357	ENSPPRG00000006422	NRDE2	100	45.950	Panthera_pardus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	45.440	ENSPTIG00000009989	NRDE2	100	46.033	Panthera_tigris_altaica
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.032	ENSPTRG00000023399	NRDE2	100	46.154	Pan_troglodytes
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	50.251	ENSPKIG00000009331	nrde2	100	50.749	Paramormyrops_kingsleyae
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.319	ENSPSIG00000005588	NRDE2	100	45.230	Pelodiscus_sinensis
ENSCVAG00000023105	nrde2	97	62.813	ENSPMGG00000024089	nrde2	100	62.640	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.325	ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	44.947	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSCVAG00000023105	nrde2	53	45.171	ENSPMAG00000003270	-	99	45.104	Petromyzon_marinus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.200	ENSPCIG00000018567	NRDE2	100	45.447	Phascolarctos_cinereus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	80.100	ENSPFOG00000013217	nrde2	99	80.936	Poecilia_formosa
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	81.932	ENSPLAG00000022350	nrde2	99	82.764	Poecilia_latipinna
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	82.098	ENSPMEG00000000778	nrde2	99	82.931	Poecilia_mexicana
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	81.349	ENSPREG00000009066	nrde2	99	82.182	Poecilia_reticulata
ENSCVAG00000023105	nrde2	85	46.785	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	47.019	Pongo_abelii
ENSCVAG00000023105	nrde2	70	66.154	ENSPCAG00000016399	NRDE2	69	66.154	Procavia_capensis
ENSCVAG00000023105	nrde2	94	45.939	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	45.455	Propithecus_coquereli
ENSCVAG00000023105	nrde2	97	41.660	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	41.645	Pteropus_vampyrus
ENSCVAG00000023105	nrde2	98	70.929	ENSPNYG00000022833	nrde2	98	75.322	Pundamilia_nyererei
ENSCVAG00000023105	nrde2	92	54.338	ENSPNAG00000015807	nrde2	96	54.388	Pygocentrus_nattereri
ENSCVAG00000023105	nrde2	90	44.273	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	44.182	Rattus_norvegicus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.700	ENSSBOG00000024346	NRDE2	100	46.898	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.856	ENSSHAG00000016736	NRDE2	97	45.881	Sarcophilus_harrisii
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	52.314	ENSSFOG00015011794	nrde2	100	52.794	Scleropages_formosus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	71.216	ENSSMAG00000011671	nrde2	99	71.665	Scophthalmus_maximus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	74.752	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	74.046	Seriola_dumerili
ENSCVAG00000023105	nrde2	92	74.125	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	76.022	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSCVAG00000023105	nrde2	89	48.679	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	48.315	Sphenodon_punctatus
ENSCVAG00000023105	nrde2	92	72.803	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	74.162	Stegastes_partitus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	46.090	ENSSSCG00000002434	NRDE2	100	46.458	Sus_scrofa
ENSCVAG00000023105	nrde2	98	47.373	ENSTGUG00000012462	-	99	47.377	Taeniopygia_guttata
ENSCVAG00000023105	nrde2	79	68.382	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	68.274	Takifugu_rubripes
ENSCVAG00000023105	nrde2	88	48.847	ENSTBEG00000011834	NRDE2	85	50.769	Tupaia_belangeri
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.212	ENSTTRG00000013583	NRDE2	100	45.455	Tursiops_truncatus
ENSCVAG00000023105	nrde2	89	45.951	ENSUAMG00000004159	NRDE2	92	46.773	Ursus_americanus
ENSCVAG00000023105	nrde2	89	45.558	ENSUMAG00000006393	NRDE2	96	44.191	Ursus_maritimus
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.390	ENSVVUG00000018202	NRDE2	100	45.172	Vulpes_vulpes
ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.351	ENSXETG00000015708	nrde2	100	44.649	Xenopus_tropicalis
ENSCVAG00000023105	nrde2	92	79.063	ENSXCOG00000013298	nrde2	97	79.247	Xiphophorus_couchianus
ENSCVAG00000023105	nrde2	100	82.377	ENSXMAG00000009320	nrde2	100	82.627	Xiphophorus_maculatus