EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSDARG00000012261 (Gene tree)
Gene ID: 393480
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24616 bases
Position: chr3:16389020-16413635
Accession: ZDB-GENE-040426-1569
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000112204	GTP_EFTU	PF00009.27	9.8e-45	1	1
ENSDARP00000114493	GTP_EFTU	PF00009.27	1.1e-44	1	1
ENSDARP00000028033	GTP_EFTU	PF00009.27	1.9e-44	1	1
ENSDARP00000115252	GTP_EFTU	PF00009.27	1.9e-44	1	1
ENSDARP00000112204	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	5.1e-12	1	1
ENSDARP00000028033	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.1e-12	1	1
ENSDARP00000115252	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.2e-12	1	1
ENSDARP00000115252	EFG_IV	PF03764.18	1.7e-24	1	1
ENSDARP00000028033	EFG_IV	PF03764.18	1.7e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000017172	-	3355	-	ENSDARP00000028033	973 (aa)	-	F1Q6N0
ENSDART00000140067	-	2913	-	ENSDARP00000115252	970 (aa)	-	E9QH15
ENSDART00000136465	-	1685	-	ENSDARP00000114493	398 (aa)	-	E9QFC1
ENSDART00000127309	-	2171	-	ENSDARP00000112204	683 (aa)	-	E7FGW2

Gene Model

Click here to download ENSDARG00000012261's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
dre03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSDARG00000012261's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDARG00000012261	eftud2	86	38.266	ENSDARG00000100371	eef2b	98	38.266
ENSDARG00000012261	eftud2	86	36.501	ENSDARG00000042094	eef2a.1	99	36.501
ENSDARG00000012261	eftud2	60	30.921	ENSDARG00000005561	gfm2	70	32.026
ENSDARG00000012261	eftud2	87	36.165	ENSDARG00000042065	eef2a.2	99	36.165
ENSDARG00000012261	eftud2	84	33.796	ENSDARG00000079672	efl1	58	33.796
ENSDARG00000012261	eftud2	87	38.014	ENSDARG00000035256	eef2l2	99	38.014

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSG00000108883	EFTUD2	100	98.507	Homo_sapiens
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.656	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	94.656	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.049	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.059	ENSACIG00000009096	eftud2	100	91.059	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000012261	eftud2	88	90.588	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	90.588	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.553	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	94.553	Amphiprion_percula
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.553	ENSATEG00000000457	eftud2	100	94.553	Anabas_testudineus
ENSDARG00000012261	eftud2	99	87.449	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	87.449	Anas_platyrhynchos
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.750	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	90.844	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.059	Aotus_nancymaae
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.347	ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.347	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000012261	eftud2	100	96.315	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	96.315	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	90.956	Bos_taurus
ENSDARG00000012261	eftud2	99	69.938	WBGene00001166	eftu-2	99	69.835	Caenorhabditis_elegans
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.059	Callithrix_jacchus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.049	Canis_familiaris
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.049	Canis_lupus_dingo
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	90.956	Capra_hircus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	90.947	Carlito_syrichta
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	90.956	Cavia_aperea
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.956	Cavia_porcellus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.059	Cebus_capucinus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.059	Cercocebus_atys
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.059	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.059	Chinchilla_lanigera
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.059	Chlorocebus_sabaeus
ENSDARG00000012261	eftud2	92	81.876	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.722	Choloepus_hoffmanni
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.581	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	90.741	Chrysemys_picta_bellii
ENSDARG00000012261	eftud2	100	78.109	ENSCING00000009372	-	100	78.109	Ciona_intestinalis
ENSDARG00000012261	eftud2	99	77.835	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.363	Ciona_savignyi
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.059	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	90.956	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	90.956	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.233	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.233	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.142	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.142	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	90.956	Dasypus_novemcinctus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.947	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	90.853	Dipodomys_ordii
ENSDARG00000012261	eftud2	100	74.667	FBgn0039566	CG4849	100	74.359	Drosophila_melanogaster
ENSDARG00000012261	eftud2	92	97.283	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.283	Echinops_telfairi
ENSDARG00000012261	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	88.039	Eptatretus_burgeri
ENSDARG00000012261	eftud2	60	74.380	ENSEBUG00000006421	-	98	74.380	Eptatretus_burgeri
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.049	Equus_asinus_asinus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	90.947	Equus_caballus
ENSDARG00000012261	eftud2	83	98.305	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	98.305	Erinaceus_europaeus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.536	ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.536	Esox_lucius
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	90.947	Felis_catus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.376	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	90.545	Ficedula_albicollis
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.889	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	90.853	Fukomys_damarensis
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.039	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	94.039	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.233	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	94.233	Gadus_morhua
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.545	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.137	Gallus_gallus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.731	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	93.731	Gambusia_affinis
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.936	ENSGACG00000009163	eftud2	100	93.936	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.059	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.245	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.245	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.684	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	90.750	Heterocephalus_glaber_female
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.684	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.750	Heterocephalus_glaber_male
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.650	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	93.936	Hippocampus_comes
ENSDARG00000012261	eftud2	100	96.197	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	96.197	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000012261	eftud2	92	92.793	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.601	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDARG00000012261	eftud2	95	93.471	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.464	Jaculus_jaculus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.245	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	94.245	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.801	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.412	Labrus_bergylta
ENSDARG00000012261	eftud2	100	92.276	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.189	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.433	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	94.433	Lepisosteus_oculatus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.844	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.741	Loxodonta_africana
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.059	Macaca_fascicularis
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	98.507	Macaca_mulatta
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.059	Macaca_nemestrina
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.059	Mandrillus_leucophaeus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.656	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	94.656	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.347	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	94.347	Maylandia_zebra
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.462	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.462	Meleagris_gallopavo
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.844	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	90.750	Mesocricetus_auratus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.059	Microcebus_murinus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.947	ENSMOCG00000009039	-	100	90.853	Microtus_ochrogaster
ENSDARG00000012261	eftud2	100	71.157	ENSMOCG00000017653	-	90	74.523	Microtus_ochrogaster
ENSDARG00000012261	eftud2	88	96.706	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	96.706	Mola_mola
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.059	Monodelphis_domestica
ENSDARG00000012261	eftud2	88	94.941	ENSMALG00000014501	eftud2	100	94.941	Monopterus_albus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.059	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.059	Mus_caroli
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.246	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	91.161	Mus_musculus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.059	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.059	Mus_pahari
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.059	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.059	Mus_spretus
ENSDARG00000012261	eftud2	97	90.890	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	90.784	Mustela_putorius_furo
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.049	Myotis_lucifugus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.947	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	90.844	Nannospalax_galili
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.245	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.245	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000012261	eftud2	97	89.160	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.066	Nomascus_leucogenys
ENSDARG00000012261	eftud2	100	88.141	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.359	Notamacropus_eugenii
ENSDARG00000012261	eftud2	100	83.333	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.230	Ochotona_princeps
ENSDARG00000012261	eftud2	93	75.323	ENSODEG00000003385	-	100	75.431	Octodon_degus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.947	ENSODEG00000018041	-	100	90.750	Octodon_degus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.347	ENSONIG00000000912	eftud2	100	94.347	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	90.956	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.718	ENSORLG00000003109	eftud2	100	93.718	Oryzias_latipes
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.628	ENSORLG00020009865	eftud2	100	93.628	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.628	ENSORLG00015002611	eftud2	100	96.078	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000012261	eftud2	61	93.852	ENSOMEG00000017329	-	79	93.852	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000012261	eftud2	100	89.528	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	89.436	Otolemur_garnettii
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	90.956	Ovis_aries
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.059	Pan_paniscus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.049	Panthera_pardus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.049	Panthera_tigris_altaica
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.059	Pan_troglodytes
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.059	Papio_anubis
ENSDARG00000012261	eftud2	99	89.673	ENSPKIG00000020714	eftud2	94	88.262	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000012261	eftud2	100	88.450	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	88.864	Pelodiscus_sinensis
ENSDARG00000012261	eftud2	100	86.495	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	86.495	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.956	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	90.956	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.059	Phascolarctos_cinereus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.936	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	93.936	Poecilia_formosa
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.936	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	93.936	Poecilia_latipinna
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.936	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	93.936	Poecilia_mexicana
ENSDARG00000012261	eftud2	85	76.855	ENSPREG00000008409	eftud2	88	82.051	Poecilia_reticulata
ENSDARG00000012261	eftud2	100	89.815	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.723	Pongo_abelii
ENSDARG00000012261	eftud2	100	87.701	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.140	Procavia_capensis
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.059	Propithecus_coquereli
ENSDARG00000012261	eftud2	100	86.742	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	86.742	Pteropus_vampyrus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.245	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	94.245	Pundamilia_nyererei
ENSDARG00000012261	eftud2	100	95.786	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	95.786	Pygocentrus_nattereri
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.349	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.264	Rattus_norvegicus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	90.956	Rhinopithecus_bieti
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	90.956	Rhinopithecus_roxellana
ENSDARG00000012261	eftud2	99	35.036	YKL173W	SNU114	91	34.644	Saccharomyces_cerevisiae
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.059	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDARG00000012261	eftud2	95	93.471	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.464	Sarcophilus_harrisii
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.742	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.742	Scleropages_formosus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.834	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	93.834	Scophthalmus_maximus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.553	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	94.553	Seriola_dumerili
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.656	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	94.656	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDARG00000012261	eftud2	100	83.128	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.025	Sorex_araneus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.339	Sphenodon_punctatus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	94.347	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	94.347	Stegastes_partitus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	90.947	Sus_scrofa
ENSDARG00000012261	eftud2	92	90.650	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.145	Taeniopygia_guttata
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.628	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.628	Takifugu_rubripes
ENSDARG00000012261	eftud2	100	88.741	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	88.741	Tetraodon_nigroviridis
ENSDARG00000012261	eftud2	100	88.141	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	85.714	Tupaia_belangeri
ENSDARG00000012261	eftud2	91	89.557	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.557	Tursiops_truncatus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.319	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.442	Ursus_americanus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.049	Ursus_maritimus
ENSDARG00000012261	eftud2	88	98.507	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	98.507	Vicugna_pacos
ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.049	Vulpes_vulpes
ENSDARG00000012261	eftud2	96	91.880	ENSXETG00000003394	eftud2	98	92.702	Xenopus_tropicalis
ENSDARG00000012261	eftud2	81	96.173	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.173	Xiphophorus_couchianus
ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.731	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	93.731	Xiphophorus_maculatus

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0000398	mRNA splicing, via spliceosome	21873635.	IBA	Process
GO:0000398	mRNA splicing, via spliceosome	27899647.	IMP	Process
GO:0003924	GTPase activity	21873635.	IBA	Function
GO:0003924	GTPase activity	-	IEA	Function
GO:0005525	GTP binding	-	IEA	Function
GO:0005829	cytosol	21873635.	IBA	Component
GO:0030623	U5 snRNA binding	21873635.	IBA	Function
GO:0043010	camera-type eye development	26118977.	IMP	Process
GO:0045664	regulation of neuron differentiation	27899647.	IMP	Process
GO:0046540	U4/U6 x U5 tri-snRNP complex	21873635.	IBA	Component
GO:0048666	neuron development	27899647.	IMP	Process
GO:0060322	head development	26118977.	IMP	Process
GO:0071007	U2-type catalytic step 2 spliceosome	21873635.	IBA	Component
GO:1990904	ribonucleoprotein complex	21873635.	IBA	Component