EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSDARG00000015638 (Gene tree)
Gene ID: 550271
Gene Symbol: gemin2
Alias: sip1|wu:fc52a05|zgc:110274
Full Name: gem (nuclear organelle) associated protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9726 bases
Position: chr17:13088594-13098319
Accession: ZDB-GENE-030131-3756
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000124464	SIP1	PF04938.12	3.6e-76	1	1
ENSDARP00000149265	SIP1	PF04938.12	4e-76	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000149779	-	1044	XM_021467156	ENSDARP00000124464	253 (aa)	XP_021322831	F8W384
ENSDART00000193207	-	2257	-	ENSDARP00000149265	261 (aa)	-	A0A2R8Q828

Gene Model

Click here to download ENSDARG00000015638's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
dre03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSDARG00000015638's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSG00000092208	GEMIN2	93	68.582	Homo_sapiens
ENSDARG00000015638	gemin2	53	68.657	ENSAPOG00000012870	gemin2	82	68.657	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.020	ENSAMEG00000003856	GEMIN2	94	68.702	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDARG00000015638	gemin2	97	68.217	ENSACIG00000014430	gemin2	95	68.217	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000015638	gemin2	100	70.833	ENSAOCG00000012349	gemin2	99	70.833	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000015638	gemin2	100	71.103	ENSAPEG00000002529	gemin2	100	70.635	Amphiprion_percula
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.821	ENSATEG00000009574	gemin2	99	68.821	Anabas_testudineus
ENSDARG00000015638	gemin2	90	67.249	ENSAPLG00000012052	GEMIN2	99	67.249	Anas_platyrhynchos
ENSDARG00000015638	gemin2	99	65.354	ENSACAG00000015872	GEMIN2	98	65.267	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000015638	gemin2	99	50.379	ENSANAG00000026213	GEMIN2	96	50.379	Aotus_nancymaae
ENSDARG00000015638	gemin2	95	66.798	ENSACLG00000024473	gemin2	99	66.798	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000015638	gemin2	100	85.214	ENSAMXG00000033969	gemin2	99	85.385	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSBTAG00000020930	GEMIN2	93	68.582	Bos_taurus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.110	ENSCJAG00000016248	GEMIN2	94	67.816	Callithrix_jacchus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.291	ENSCAFG00000013859	GEMIN2	97	68.966	Canis_familiaris
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.291	ENSCAFG00020022243	GEMIN2	97	68.966	Canis_lupus_dingo
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.291	ENSCHIG00000009881	GEMIN2	97	68.966	Capra_hircus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.685	ENSTSYG00000003528	-	93	69.349	Carlito_syrichta
ENSDARG00000015638	gemin2	99	66.929	ENSTSYG00000032612	-	99	66.923	Carlito_syrichta
ENSDARG00000015638	gemin2	99	63.386	ENSCPOG00000011338	GEMIN2	97	63.218	Cavia_porcellus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	51.724	ENSCCAG00000030361	-	89	51.724	Cebus_capucinus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSCCAG00000035944	GEMIN2	94	68.651	Cebus_capucinus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	47.893	ENSCATG00000031373	-	91	47.893	Cercocebus_atys
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSCATG00000042473	GEMIN2	97	68.582	Cercocebus_atys
ENSDARG00000015638	gemin2	95	69.136	ENSCLAG00000008967	GEMIN2	98	68.800	Chinchilla_lanigera
ENSDARG00000015638	gemin2	99	48.276	ENSCSAG00000016872	-	92	48.276	Chlorocebus_sabaeus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	53.571	ENSCHOG00000011644	GEMIN2	94	53.462	Choloepus_hoffmanni
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.110	ENSCPBG00000026207	GEMIN2	99	67.939	Chrysemys_picta_bellii
ENSDARG00000015638	gemin2	91	32.971	ENSCING00000012240	-	85	34.058	Ciona_intestinalis
ENSDARG00000015638	gemin2	92	35.036	ENSCSAVG00000009875	-	85	35.036	Ciona_savignyi
ENSDARG00000015638	gemin2	99	48.276	ENSCANG00000033060	-	87	48.276	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSCANG00000035266	GEMIN2	94	68.582	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.291	ENSCGRG00001017720	Gemin2	97	68.966	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.291	ENSCGRG00000007060	Gemin2	97	68.966	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000015638	gemin2	99	64.504	ENSCSEG00000016057	gemin2	99	64.504	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000015638	gemin2	96	67.984	ENSCVAG00000003125	gemin2	100	67.984	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000015638	gemin2	74	66.154	ENSDNOG00000018278	GEMIN2	89	66.154	Dasypus_novemcinctus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.685	ENSDORG00000003814	Gemin2	97	69.349	Dipodomys_ordii
ENSDARG00000015638	gemin2	99	66.535	ENSETEG00000006463	GEMIN2	94	66.412	Echinops_telfairi
ENSDARG00000015638	gemin2	82	41.892	ENSEBUG00000002198	gemin2	77	42.735	Eptatretus_burgeri
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.685	ENSEASG00005007617	GEMIN2	93	69.349	Equus_asinus_asinus
ENSDARG00000015638	gemin2	96	69.672	ENSECAG00000007554	GEMIN2	84	69.323	Equus_caballus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	62.992	ENSEEUG00000008438	GEMIN2	94	62.835	Erinaceus_europaeus
ENSDARG00000015638	gemin2	100	77.567	ENSELUG00000005266	gemin2	99	77.567	Esox_lucius
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSFCAG00000029921	GEMIN2	94	68.582	Felis_catus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.110	ENSFALG00000006169	GEMIN2	94	67.939	Ficedula_albicollis
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.110	ENSFDAG00000001562	GEMIN2	97	67.816	Fukomys_damarensis
ENSDARG00000015638	gemin2	99	70.566	ENSFHEG00000020705	gemin2	99	70.566	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000015638	gemin2	88	65.351	ENSGMOG00000009379	gemin2	99	65.254	Gadus_morhua
ENSDARG00000015638	gemin2	99	67.717	ENSGALG00000010154	GEMIN2	99	67.176	Gallus_gallus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	64.794	ENSGAFG00000019641	gemin2	99	64.794	Gambusia_affinis
ENSDARG00000015638	gemin2	99	66.412	ENSGACG00000012444	gemin2	98	66.412	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000015638	gemin2	91	67.100	ENSGAGG00000003982	GEMIN2	97	67.100	Gopherus_agassizii
ENSDARG00000015638	gemin2	99	46.743	ENSGGOG00000043428	-	78	46.743	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000015638	gemin2	99	58.661	ENSGGOG00000016691	GEMIN2	92	58.621	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000015638	gemin2	100	70.943	ENSHBUG00000016285	gemin2	99	70.943	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSHGLG00000004890	GEMIN2	97	68.582	Heterocephalus_glaber_female
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSHGLG00100009949	GEMIN2	97	68.582	Heterocephalus_glaber_male
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.202	ENSHCOG00000012786	gemin2	99	69.202	Hippocampus_comes
ENSDARG00000015638	gemin2	100	79.297	ENSIPUG00000012821	gemin2	100	79.297	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.685	ENSSTOG00000006357	GEMIN2	97	69.349	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	70.079	ENSJJAG00000022975	Gemin2	97	69.732	Jaculus_jaculus
ENSDARG00000015638	gemin2	100	67.547	ENSKMAG00000007880	gemin2	99	67.547	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000015638	gemin2	96	60.956	ENSLBEG00000022377	gemin2	100	60.956	Labrus_bergylta
ENSDARG00000015638	gemin2	100	68.482	ENSLACG00000004723	GEMIN2	100	67.925	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000015638	gemin2	100	69.057	ENSLOCG00000009221	gemin2	100	69.057	Lepisosteus_oculatus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.685	ENSLAFG00000010321	GEMIN2	97	69.349	Loxodonta_africana
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSMFAG00000014362	GEMIN2	94	68.582	Macaca_fascicularis
ENSDARG00000015638	gemin2	99	47.126	ENSMFAG00000003283	-	90	47.126	Macaca_fascicularis
ENSDARG00000015638	gemin2	99	48.276	ENSMMUG00000001073	-	87	48.276	Macaca_mulatta
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSMMUG00000021028	GEMIN2	97	68.582	Macaca_mulatta
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSMNEG00000033286	GEMIN2	97	68.582	Macaca_nemestrina
ENSDARG00000015638	gemin2	99	48.276	ENSMNEG00000033555	-	89	48.276	Macaca_nemestrina
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSMLEG00000035575	GEMIN2	94	68.582	Mandrillus_leucophaeus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	47.431	ENSMLEG00000008946	-	89	47.126	Mandrillus_leucophaeus
ENSDARG00000015638	gemin2	96	68.235	ENSMAMG00000012985	gemin2	99	68.235	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000015638	gemin2	100	70.189	ENSMZEG00005007915	gemin2	99	70.189	Maylandia_zebra
ENSDARG00000015638	gemin2	90	67.686	ENSMGAG00000012566	GEMIN2	99	67.686	Meleagris_gallopavo
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.291	ENSMAUG00000017447	Gemin2	97	68.966	Mesocricetus_auratus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSMICG00000004811	-	92	68.582	Microcebus_murinus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	55.172	ENSMICG00000043979	-	96	55.172	Microcebus_murinus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.685	ENSMOCG00000023031	Gemin2	97	69.349	Microtus_ochrogaster
ENSDARG00000015638	gemin2	95	68.127	ENSMMOG00000004604	gemin2	99	63.137	Mola_mola
ENSDARG00000015638	gemin2	99	67.717	ENSMODG00000011946	GEMIN2	99	67.557	Monodelphis_domestica
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.441	ENSMALG00000021507	gemin2	99	68.441	Monopterus_albus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.504	MGP_CAROLIEiJ_G0017777	Gemin2	97	68.199	Mus_caroli
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.504	ENSMUSG00000060121	Gemin2	97	68.199	Mus_musculus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.504	MGP_PahariEiJ_G0029533	Gemin2	97	68.199	Mus_pahari
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.110	MGP_SPRETEiJ_G0018622	Gemin2	97	67.816	Mus_spretus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.291	ENSMPUG00000016240	GEMIN2	96	69.650	Mustela_putorius_furo
ENSDARG00000015638	gemin2	97	67.339	ENSMLUG00000002619	GEMIN2	97	67.059	Myotis_lucifugus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.291	ENSNGAG00000001053	Gemin2	97	68.966	Nannospalax_galili
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSNLEG00000004013	GEMIN2	96	68.582	Nomascus_leucogenys
ENSDARG00000015638	gemin2	95	64.198	ENSMEUG00000011734	-	92	64.000	Notamacropus_eugenii
ENSDARG00000015638	gemin2	99	62.598	ENSOPRG00000007714	GEMIN2	93	62.069	Ochotona_princeps
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSODEG00000000272	GEMIN2	97	68.582	Octodon_degus
ENSDARG00000015638	gemin2	100	70.943	ENSONIG00000019495	gemin2	99	70.943	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	66.929	ENSOANG00000014013	-	96	66.920	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	66.929	ENSOCUG00000000673	GEMIN2	93	66.667	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000015638	gemin2	100	64.259	ENSORLG00000017666	gemin2	100	64.259	Oryzias_latipes
ENSDARG00000015638	gemin2	100	66.667	ENSORLG00020016613	gemin2	100	66.667	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000015638	gemin2	100	67.045	ENSORLG00015013224	gemin2	100	67.045	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000015638	gemin2	100	67.681	ENSOMEG00000011576	gemin2	100	67.681	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSOGAG00000007906	GEMIN2	93	68.199	Otolemur_garnettii
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.020	ENSOARG00000008466	GEMIN2	93	68.702	Ovis_aries
ENSDARG00000015638	gemin2	99	62.593	ENSPPAG00000043467	GEMIN2	94	62.455	Pan_paniscus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	48.077	ENSPPAG00000033797	-	79	54.701	Pan_paniscus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSPPRG00000009485	GEMIN2	94	68.582	Panthera_pardus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSPTIG00000018115	GEMIN2	97	68.582	Panthera_tigris_altaica
ENSDARG00000015638	gemin2	99	48.077	ENSPTRG00000045455	-	78	48.077	Pan_troglodytes
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSPTRG00000006291	GEMIN2	93	68.582	Pan_troglodytes
ENSDARG00000015638	gemin2	99	47.893	ENSPANG00000034146	-	89	47.893	Papio_anubis
ENSDARG00000015638	gemin2	99	57.088	ENSPANG00000011343	-	95	57.088	Papio_anubis
ENSDARG00000015638	gemin2	100	75.197	ENSPKIG00000010339	gemin2	100	75.191	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000015638	gemin2	99	67.557	ENSPSIG00000013560	GEMIN2	87	67.557	Pelodiscus_sinensis
ENSDARG00000015638	gemin2	98	66.538	ENSPMGG00000008763	gemin2	100	66.538	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.685	ENSPEMG00000008079	Gemin2	97	69.349	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDARG00000015638	gemin2	90	48.606	ENSPMAG00000009804	gemin2	94	48.606	Petromyzon_marinus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.504	ENSPCIG00000025754	GEMIN2	79	68.321	Phascolarctos_cinereus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.421	ENSPFOG00000014660	gemin2	99	68.421	Poecilia_formosa
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.057	ENSPLAG00000020265	gemin2	99	69.057	Poecilia_latipinna
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.182	ENSPMEG00000011134	gemin2	99	68.182	Poecilia_mexicana
ENSDARG00000015638	gemin2	99	64.906	ENSPREG00000007692	gemin2	99	64.906	Poecilia_reticulata
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSPPYG00000005764	GEMIN2	94	68.582	Pongo_abelii
ENSDARG00000015638	gemin2	99	60.385	ENSPCAG00000005387	GEMIN2	93	60.385	Procavia_capensis
ENSDARG00000015638	gemin2	99	64.961	ENSPCOG00000016964	GEMIN2	93	64.751	Propithecus_coquereli
ENSDARG00000015638	gemin2	95	67.901	ENSPVAG00000002586	GEMIN2	95	67.600	Pteropus_vampyrus
ENSDARG00000015638	gemin2	100	70.943	ENSPNYG00000022626	gemin2	99	70.943	Pundamilia_nyererei
ENSDARG00000015638	gemin2	100	83.721	ENSPNAG00000017346	gemin2	100	83.083	Pygocentrus_nattereri
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSRNOG00000004360	Gemin2	97	68.582	Rattus_norvegicus
ENSDARG00000015638	gemin2	95	45.200	ENSRBIG00000038026	-	73	59.322	Rhinopithecus_bieti
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSRBIG00000034601	GEMIN2	97	68.582	Rhinopithecus_bieti
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSRROG00000042627	GEMIN2	94	68.582	Rhinopithecus_roxellana
ENSDARG00000015638	gemin2	96	68.980	ENSSBOG00000022280	GEMIN2	97	68.651	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDARG00000015638	gemin2	62	65.409	ENSSHAG00000000156	-	97	65.409	Sarcophilus_harrisii
ENSDARG00000015638	gemin2	100	76.336	ENSSFOG00015012315	gemin2	99	76.336	Scleropages_formosus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.821	ENSSMAG00000011151	gemin2	99	68.821	Scophthalmus_maximus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	70.992	ENSSDUG00000017275	gemin2	99	70.992	Seriola_dumerili
ENSDARG00000015638	gemin2	97	69.685	ENSSLDG00000023429	gemin2	98	69.685	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDARG00000015638	gemin2	95	67.901	ENSSARG00000010294	GEMIN2	93	67.871	Sorex_araneus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	61.450	ENSSPUG00000017222	GEMIN2	99	61.450	Sphenodon_punctatus
ENSDARG00000015638	gemin2	100	71.970	ENSSPAG00000001354	gemin2	99	71.970	Stegastes_partitus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.020	ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	68.321	Sus_scrofa
ENSDARG00000015638	gemin2	99	67.717	ENSTGUG00000012039	GEMIN2	99	67.557	Taeniopygia_guttata
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.061	ENSTRUG00000021760	gemin2	97	68.061	Takifugu_rubripes
ENSDARG00000015638	gemin2	99	67.300	ENSTNIG00000016875	gemin2	99	67.300	Tetraodon_nigroviridis
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.291	ENSTBEG00000002654	GEMIN2	94	68.966	Tupaia_belangeri
ENSDARG00000015638	gemin2	99	57.480	ENSTTRG00000017126	GEMIN2	93	57.471	Tursiops_truncatus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.504	ENSUAMG00000021811	GEMIN2	97	68.199	Ursus_americanus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	68.898	ENSUMAG00000008366	GEMIN2	97	68.582	Ursus_maritimus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.685	ENSVPAG00000006856	GEMIN2	93	69.349	Vicugna_pacos
ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.291	ENSVVUG00000020954	GEMIN2	93	68.966	Vulpes_vulpes
ENSDARG00000015638	gemin2	99	67.717	ENSXETG00000000298	gemin2	96	67.557	Xenopus_tropicalis
ENSDARG00000015638	gemin2	99	66.165	ENSXCOG00000014021	gemin2	99	66.165	Xiphophorus_couchianus
ENSDARG00000015638	gemin2	99	64.906	ENSXMAG00000009532	gemin2	99	64.906	Xiphophorus_maculatus

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0000245	spliceosomal complex assembly	-	IEA	Process
GO:0000387	spliceosomal snRNP assembly	21873635.	IBA	Process
GO:0000387	spliceosomal snRNP assembly	-	IEA	Process
GO:0003674	molecular_function	-	ND	Function
GO:0005634	nucleus	21873635.	IBA	Component
GO:0005681	spliceosomal complex	-	IEA	Component
GO:0005737	cytoplasm	21873635.	IBA	Component
GO:0005737	cytoplasm	-	IEA	Component
GO:0006397	mRNA processing	-	IEA	Process
GO:0008380	RNA splicing	-	IEA	Process
GO:0032797	SMN complex	21873635.	IBA	Component
GO:0048675	axon extension	16204184.	IMP	Process