EuRBPDB

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PPI

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Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSDARG00000020749 (Gene tree)
Gene ID: 407729
Gene Symbol: caprin2
Alias: c1qdc1|wu:fj80b02
Full Name: caprin family member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13777 bases
Position: chr4:16615026-16628802
Accession: ZDB-GENE-040812-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000040707	Caprin-1_C	PF12287.8	3.7e-13	1	1

Transcripts

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000020749	caprin2	96	43.005	ENSG00000110888	CAPRIN2	88	70.476	Homo_sapiens
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ENSDARG00000020749	caprin2	97	47.812	ENSAPLG00000006703	CAPRIN2	83	47.812	Anas_platyrhynchos
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ENSDARG00000020749	caprin2	96	42.857	ENSANAG00000035460	CAPRIN2	92	42.746	Aotus_nancymaae
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ENSDARG00000020749	caprin2	94	48.288	ENSCHIG00000026352	CAPRIN2	86	48.089	Capra_hircus
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ENSDARG00000020749	caprin2	96	46.875	ENSCCAG00000027709	CAPRIN2	100	43.680	Cebus_capucinus
ENSDARG00000020749	caprin2	99	42.314	ENSCATG00000031463	CAPRIN2	100	43.785	Cercocebus_atys
ENSDARG00000020749	caprin2	96	42.448	ENSCLAG00000001513	CAPRIN2	92	54.626	Chinchilla_lanigera
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ENSDARG00000020749	caprin2	95	49.032	ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	78	49.032	Chrysemys_picta_bellii
ENSDARG00000020749	caprin2	99	42.254	ENSCANG00000035343	CAPRIN2	89	42.155	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000020749	caprin2	88	48.201	ENSCGRG00001002901	Caprin2	93	51.695	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000020749	caprin2	79	53.023	ENSCGRG00000001249	Caprin2	92	51.695	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000020749	caprin2	68	50.253	ENSDNOG00000009793	CAPRIN2	87	43.060	Dasypus_novemcinctus
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ENSDARG00000020749	caprin2	94	47.297	ENSEASG00005005997	CAPRIN2	86	47.170	Equus_asinus_asinus
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ENSDARG00000020749	caprin2	99	46.479	ENSFALG00000009038	CAPRIN2	85	45.503	Ficedula_albicollis
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Gene Ontology

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