EuRBPDB

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PPI

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Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSDARG00000027428 (Gene tree)
Gene ID: 541352
Gene Symbol: rpp30
Alias: fk66h08|rpp1|wu:fk66h08|zgc:110189
Full Name: ribonuclease P/MRP 30 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5973 bases
Position: chr12:16446228-16452200
Accession: ZDB-GENE-050320-45
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000037308	RNase_P_p30	PF01876.16	5.7e-70	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000149679	-	732	-	-	- (aa)	-	-
ENSDART00000148712	-	982	-	-	- (aa)	-	-
ENSDART00000148823	-	950	-	-	- (aa)	-	-
ENSDART00000037601	-	1197	XM_021480064	ENSDARP00000037308	265 (aa)	XP_021335739	Q5BJK2
ENSDART00000148690	-	760	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
dre03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
dre03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.049	ENSG00000148688	RPP30	99	61.049	Homo_sapiens
ENSDARG00000027428	rpp30	98	62.687	ENSAPOG00000023156	rpp30	94	61.943	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.798	ENSAMEG00000016776	RPP30	99	61.798	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDARG00000027428	rpp30	99	62.774	ENSACIG00000022810	rpp30	99	62.774	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	66.917	ENSAOCG00000016438	rpp30	90	66.917	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000027428	rpp30	99	66.541	ENSAPEG00000008697	rpp30	90	66.541	Amphiprion_percula
ENSDARG00000027428	rpp30	98	65.799	ENSATEG00000015263	rpp30	98	65.799	Anabas_testudineus
ENSDARG00000027428	rpp30	89	62.083	ENSAPLG00000009959	RPP30	99	62.083	Anas_platyrhynchos
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.701	ENSACAG00000007996	RPP30	100	59.701	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000027428	rpp30	98	52.060	ENSANAG00000009439	RPP30	83	52.060	Aotus_nancymaae
ENSDARG00000027428	rpp30	98	63.019	ENSACLG00000015389	-	99	63.019	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000027428	rpp30	99	72.348	ENSAMXG00000040653	rpp30	98	72.348	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSBTAG00000002973	RPP30	99	61.423	Bos_taurus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSCJAG00000011045	RPP30	99	61.423	Callithrix_jacchus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSCAFG00000031801	RPP30	99	61.423	Canis_familiaris
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSCAFG00020000258	RPP30	99	61.423	Canis_lupus_dingo
ENSDARG00000027428	rpp30	99	58.052	ENSCHIG00000012901	RPP30	99	58.052	Capra_hircus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.551	ENSTSYG00000013903	RPP30	99	59.551	Carlito_syrichta
ENSDARG00000027428	rpp30	89	46.025	ENSCAPG00000001326	RPP30	99	46.025	Cavia_aperea
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.925	ENSCPOG00000033174	RPP30	99	59.925	Cavia_porcellus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.798	ENSCCAG00000029514	RPP30	99	61.798	Cebus_capucinus
ENSDARG00000027428	rpp30	98	61.132	ENSCATG00000042072	RPP30	99	61.132	Cercocebus_atys
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.674	ENSCLAG00000008595	RPP30	99	60.674	Chinchilla_lanigera
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSCSAG00000006694	RPP30	99	61.423	Chlorocebus_sabaeus
ENSDARG00000027428	rpp30	62	80.769	ENSCHOG00000007023	-	75	80.769	Choloepus_hoffmanni
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.674	ENSCPBG00000026518	RPP30	99	60.674	Chrysemys_picta_bellii
ENSDARG00000027428	rpp30	82	39.301	ENSCING00000019714	-	85	40.175	Ciona_intestinalis
ENSDARG00000027428	rpp30	95	38.951	ENSCSAVG00000011282	-	87	38.951	Ciona_savignyi
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSCANG00000041084	RPP30	99	61.423	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000027428	rpp30	86	61.207	ENSCGRG00001017068	-	97	61.207	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000027428	rpp30	99	52.434	ENSCGRG00001000834	-	99	52.434	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000027428	rpp30	99	52.809	ENSCGRG00000006196	-	99	52.809	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.551	ENSCGRG00000002508	-	99	59.551	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.779	ENSCSEG00000001779	rpp30	93	59.779	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000027428	rpp30	98	65.169	ENSCVAG00000003139	rpp30	99	65.799	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.674	ENSDNOG00000010186	RPP30	92	60.674	Dasypus_novemcinctus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.300	ENSDORG00000015333	Rpp30	99	60.300	Dipodomys_ordii
ENSDARG00000027428	rpp30	89	32.787	FBgn0283652	Rpp30	80	32.787	Drosophila_melanogaster
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.300	ENSETEG00000018823	RPP30	99	60.300	Echinops_telfairi
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.674	ENSEASG00005011050	RPP30	99	60.674	Equus_asinus_asinus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.674	ENSECAG00000021917	RPP30	99	60.674	Equus_caballus
ENSDARG00000027428	rpp30	98	41.065	ENSEEUG00000009986	-	99	41.065	Erinaceus_europaeus
ENSDARG00000027428	rpp30	100	71.536	ENSELUG00000003731	rpp30	95	71.536	Esox_lucius
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.049	ENSFCAG00000029073	RPP30	92	61.049	Felis_catus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.448	ENSFALG00000007711	RPP30	100	60.448	Ficedula_albicollis
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.300	ENSFDAG00000019241	RPP30	99	60.300	Fukomys_damarensis
ENSDARG00000027428	rpp30	92	67.073	ENSFHEG00000014739	rpp30	98	63.485	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000027428	rpp30	91	59.600	ENSGMOG00000005379	rpp30	100	59.600	Gadus_morhua
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.176	ENSGALG00000006486	RPP30	98	67.480	Gallus_gallus
ENSDARG00000027428	rpp30	92	66.397	ENSGAFG00000001445	rpp30	92	66.397	Gambusia_affinis
ENSDARG00000027428	rpp30	99	63.309	ENSGACG00000010285	rpp30	99	63.309	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.551	ENSGAGG00000000980	RPP30	69	59.551	Gopherus_agassizii
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.049	ENSGGOG00000026917	RPP30	99	61.049	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000027428	rpp30	98	63.396	ENSHBUG00000019332	rpp30	99	63.396	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.674	ENSHGLG00000013072	RPP30	99	60.674	Heterocephalus_glaber_female
ENSDARG00000027428	rpp30	99	60.674	ENSHGLG00100017798	RPP30	99	60.674	Heterocephalus_glaber_male
ENSDARG00000027428	rpp30	99	55.830	ENSHCOG00000004763	-	99	55.830	Hippocampus_comes
ENSDARG00000027428	rpp30	99	73.783	ENSIPUG00000003863	rpp30	99	73.783	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	62.172	ENSSTOG00000027002	RPP30	99	62.172	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	62.547	ENSJJAG00000020041	Rpp30	99	62.547	Jaculus_jaculus
ENSDARG00000027428	rpp30	98	66.415	ENSKMAG00000015355	rpp30	99	66.415	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000027428	rpp30	98	62.313	ENSLBEG00000019989	rpp30	99	62.313	Labrus_bergylta
ENSDARG00000027428	rpp30	71	51.142	ENSLACG00000002534	RPP30	96	51.142	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000027428	rpp30	99	70.455	ENSLOCG00000000031	rpp30	99	70.455	Lepisosteus_oculatus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.551	ENSLAFG00000015931	RPP30	99	59.551	Loxodonta_africana
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSMFAG00000031109	RPP30	99	61.423	Macaca_fascicularis
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSMMUG00000006628	RPP30	99	61.423	Macaca_mulatta
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.049	ENSMNEG00000033838	RPP30	98	67.480	Macaca_nemestrina
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSMLEG00000037578	RPP30	99	61.423	Mandrillus_leucophaeus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	66.171	ENSMAMG00000010934	rpp30	99	66.171	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000027428	rpp30	98	63.396	ENSMZEG00005018508	-	99	63.396	Maylandia_zebra
ENSDARG00000027428	rpp30	99	55.056	ENSMGAG00000008452	RPP30	99	55.431	Meleagris_gallopavo
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.925	ENSMAUG00000008797	Rpp30	99	59.925	Mesocricetus_auratus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSMICG00000012019	RPP30	99	61.423	Microcebus_murinus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	58.801	ENSMOCG00000016872	Rpp30	99	58.801	Microtus_ochrogaster
ENSDARG00000027428	rpp30	98	62.357	ENSMMOG00000009266	rpp30	98	62.357	Mola_mola
ENSDARG00000027428	rpp30	99	54.682	ENSMODG00000009342	-	99	54.682	Monodelphis_domestica
ENSDARG00000027428	rpp30	99	63.670	ENSMODG00000006863	-	99	63.670	Monodelphis_domestica
ENSDARG00000027428	rpp30	98	66.418	ENSMALG00000011718	rpp30	99	66.418	Monopterus_albus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	58.801	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	58.801	Mus_caroli
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.176	ENSMUSG00000024800	Rpp30	99	59.176	Mus_musculus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.176	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	59.176	Mus_pahari
ENSDARG00000027428	rpp30	99	58.801	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	58.801	Mus_spretus
ENSDARG00000027428	rpp30	98	61.887	ENSMPUG00000017258	RPP30	93	61.887	Mustela_putorius_furo
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.049	ENSMLUG00000017169	RPP30	99	61.049	Myotis_lucifugus
ENSDARG00000027428	rpp30	81	55.856	ENSNGAG00000014392	-	94	55.856	Nannospalax_galili
ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.551	ENSNGAG00000012018	-	99	59.551	Nannospalax_galili
ENSDARG00000027428	rpp30	92	57.317	ENSNBRG00000024170	-	92	57.317	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.798	ENSNLEG00000012383	RPP30	99	61.798	Nomascus_leucogenys
ENSDARG00000027428	rpp30	98	55.720	ENSMEUG00000015587	-	100	55.720	Notamacropus_eugenii
ENSDARG00000027428	rpp30	52	69.065	ENSOPRG00000007367	-	98	69.065	Ochotona_princeps
ENSDARG00000027428	rpp30	98	60.456	ENSODEG00000004530	-	100	60.456	Octodon_degus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	45.318	ENSODEG00000004560	-	99	45.318	Octodon_degus
ENSDARG00000027428	rpp30	76	65.196	ENSONIG00000019140	rpp30	100	63.285	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.049	ENSOANG00000003415	RPP30	99	61.049	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	58.801	ENSOCUG00000006896	RPP30	92	58.801	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000027428	rpp30	92	65.854	ENSORLG00000020420	rpp30	85	65.854	Oryzias_latipes
ENSDARG00000027428	rpp30	99	64.662	ENSORLG00020009037	-	99	64.662	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000027428	rpp30	99	64.286	ENSORLG00015008300	rpp30	93	64.286	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000027428	rpp30	68	67.956	ENSOMEG00000012640	-	98	67.956	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.798	ENSOGAG00000013963	RPP30	99	61.798	Otolemur_garnettii
ENSDARG00000027428	rpp30	95	60.156	ENSOARG00000015789	RPP30	96	60.156	Ovis_aries
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.049	ENSPPAG00000043779	RPP30	99	61.049	Pan_paniscus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSPPRG00000000115	RPP30	99	61.423	Panthera_pardus
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSPTIG00000014949	RPP30	99	61.423	Panthera_tigris_altaica
ENSDARG00000027428	rpp30	98	61.132	ENSPTRG00000002742	RPP30	99	58.052	Pan_troglodytes
ENSDARG00000027428	rpp30	99	61.423	ENSPANG00000021710	RPP30	99	61.423	Papio_anubis
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