EuRBPDB

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PPI

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Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSDARG00000035390 (Gene tree)
Gene ID: 562607
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 50699 bases
Position: chr5:35202063-35252761
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000051277	IBN_N	PF03810.19	2e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000051278	-	5804	XM_685987	ENSDARP00000051277	891 (aa)	XP_691079	F1RDR1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDARG00000035390	tnpo1	99	84.459	ENSDARG00000038239	tnpo2	99	84.459

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSG00000083312	TNPO1	100	92.593	Homo_sapiens
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.725	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	95.174	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.324	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.769	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDARG00000035390	tnpo1	87	93.806	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.935	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.837	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	95.286	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.837	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	95.286	Amphiprion_percula
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.276	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.949	Anabas_testudineus
ENSDARG00000035390	tnpo1	99	88.388	ENSAPLG00000009619	-	97	89.220	Anas_platyrhynchos
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.154	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.807	ENSANAG00000022453	-	99	92.144	Aotus_nancymaae
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	82.941	ENSANAG00000025351	-	99	82.941	Aotus_nancymaae
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.480	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.593	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.507	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.507	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.144	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	92.480	Bos_taurus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.919	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.256	Callithrix_jacchus
ENSDARG00000035390	tnpo1	96	92.308	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.657	Canis_familiaris
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	89.675	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.011	Canis_lupus_dingo
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.031	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.368	Capra_hircus
ENSDARG00000035390	tnpo1	99	89.165	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.472	Carlito_syrichta
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.807	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.144	Cebus_capucinus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	92.593	Cercocebus_atys
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.807	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.144	Chinchilla_lanigera
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.593	Chlorocebus_sabaeus
ENSDARG00000035390	tnpo1	94	80.714	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.833	Choloepus_hoffmanni
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.378	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.378	Chrysemys_picta_bellii
ENSDARG00000035390	tnpo1	99	76.009	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.009	Ciona_savignyi
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.593	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.368	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.705	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000035390	tnpo1	96	92.640	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.991	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.929	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.490	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.715	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	94.276	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	87.025	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.136	Dasypus_novemcinctus
ENSDARG00000035390	tnpo1	93	92.298	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.651	Dipodomys_ordii
ENSDARG00000035390	tnpo1	99	58.286	FBgn0035693	CG8219	99	57.835	Drosophila_melanogaster
ENSDARG00000035390	tnpo1	86	92.509	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	92.509	Echinops_telfairi
ENSDARG00000035390	tnpo1	94	85.256	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.291	Eptatretus_burgeri
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	92.593	Equus_asinus_asinus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.480	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.817	Equus_caballus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	87.800	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.419	Esox_lucius
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	92.593	Felis_catus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.593	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.266	Ficedula_albicollis
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.919	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.256	Fukomys_damarensis
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.939	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.939	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.609	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.609	Gadus_morhua
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.470	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.144	Gallus_gallus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.170	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	94.170	Gambusia_affinis
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.154	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.603	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.593	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.266	Gopherus_agassizii
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	92.593	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	77.354	ENSGGOG00000022535	-	98	77.466	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.939	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	94.388	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.582	ENSHGLG00000000970	-	99	91.919	Heterocephalus_glaber_female
ENSDARG00000035390	tnpo1	97	72.474	ENSHGLG00100000963	-	99	71.893	Heterocephalus_glaber_male
ENSDARG00000035390	tnpo1	96	91.715	ENSHGLG00100017090	-	99	92.065	Heterocephalus_glaber_male
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.368	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.705	Jaculus_jaculus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.827	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.388	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000035390	tnpo1	91	91.245	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.245	Labrus_bergylta
ENSDARG00000035390	tnpo1	96	87.456	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.456	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.725	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.725	Lepisosteus_oculatus
ENSDARG00000035390	tnpo1	97	91.696	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.042	Loxodonta_africana
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.593	Macaca_fascicularis
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.144	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.672	Macaca_mulatta
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.593	Macaca_nemestrina
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.593	Mandrillus_leucophaeus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.613	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	95.286	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.827	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.939	Maylandia_zebra
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.368	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	92.705	Mesocricetus_auratus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	88.440	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.777	Microcebus_murinus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.368	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.705	Microtus_ochrogaster
ENSDARG00000035390	tnpo1	87	93.814	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	94.330	Mola_mola
ENSDARG00000035390	tnpo1	99	93.404	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.404	Monodelphis_domestica
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.715	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	94.164	Monopterus_albus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.144	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	92.822	Mus_caroli
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.368	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	92.822	Mus_musculus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.698	Mus_pahari
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.368	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	92.822	Mus_spretus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.144	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.480	Mustela_putorius_furo
ENSDARG00000035390	tnpo1	96	92.093	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.442	Myotis_lucifugus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.480	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.817	Nannospalax_galili
ENSDARG00000035390	tnpo1	87	93.935	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	94.065	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	92.593	Nomascus_leucogenys
ENSDARG00000035390	tnpo1	90	87.220	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.220	Ochotona_princeps
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.582	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.919	Octodon_degus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.200	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	93.645	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000035390	tnpo1	92	92.570	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.301	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDARG00000035390	tnpo1	96	86.814	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.814	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000035390	tnpo1	87	93.782	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	93.912	Oryzias_latipes
ENSDARG00000035390	tnpo1	99	94.257	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	94.369	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000035390	tnpo1	99	94.257	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	94.707	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000035390	tnpo1	99	93.919	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	94.369	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.593	Otolemur_garnettii
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.480	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.480	Ovis_aries
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.593	Pan_paniscus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	92.593	Panthera_pardus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	92.593	Panthera_tigris_altaica
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.593	Pan_troglodytes
ENSDARG00000035390	tnpo1	94	81.077	ENSPTRG00000047731	-	100	81.077	Pan_troglodytes
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.593	Papio_anubis
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	90.909	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.246	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.817	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.490	Pelodiscus_sinensis
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.031	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	91.256	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDARG00000035390	tnpo1	96	92.640	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.991	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.705	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.154	Phascolarctos_cinereus
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.295	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	94.295	Poecilia_formosa
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ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.283	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	94.507	Poecilia_reticulata
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.144	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.480	Pongo_abelii
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.593	Propithecus_coquereli
ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.817	Pteropus_vampyrus
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