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Description

Ensembl ID: ENSDARG00000040350 (Gene tree)
Gene ID: 436798
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1687 bases
Position: chr16:28592495-28594181
Accession: ZDB-GENE-040718-258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000059052	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1.8e-11	1	1
ENSDARP00000157126	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1.8e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000059053	-	1570	-	ENSDARP00000059052	265 (aa)	-	F1QS85
ENSDART00000183322	-	799	-	ENSDARP00000157126	265 (aa)	-	F1QS85

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
dre03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
dre03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.756	ENSG00000152464	RPP38	88	50.336	Homo_sapiens
ENSDARG00000040350	rpp38	94	48.201	ENSAPOG00000001240	rpp38	96	47.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	44.727	ENSAMEG00000018832	RPP38	94	44.649	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDARG00000040350	rpp38	94	49.630	ENSACIG00000011592	rpp38	98	50.000	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	46.048	ENSAOCG00000017293	rpp38	97	46.259	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000040350	rpp38	95	49.635	ENSAPEG00000002315	rpp38	96	49.819	Amphiprion_percula
ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.923	ENSATEG00000000731	rpp38	92	51.351	Anabas_testudineus
ENSDARG00000040350	rpp38	94	39.850	ENSAPLG00000002054	RPP38	96	41.697	Anas_platyrhynchos
ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.382	ENSACLG00000016958	rpp38	96	51.136	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.382	ENSACLG00000016962	rpp38	96	51.136	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000040350	rpp38	95	57.031	ENSAMXG00000025023	rpp38	94	57.529	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	43.885	ENSBTAG00000007702	RPP38	94	45.161	Bos_taurus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	44.776	ENSCAFG00000024373	RPP38	90	45.490	Canis_familiaris
ENSDARG00000040350	rpp38	95	44.776	ENSCAFG00020008008	RPP38	90	45.490	Canis_lupus_dingo
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.455	ENSCHIG00000012484	RPP38	94	44.803	Capra_hircus
ENSDARG00000040350	rpp38	97	45.620	ENSCPOG00000003981	RPP38	95	45.956	Cavia_porcellus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	44.118	ENSCLAG00000010194	RPP38	94	44.030	Chinchilla_lanigera
ENSDARG00000040350	rpp38	92	44.444	ENSCSAG00000019055	RPP38	90	46.094	Chlorocebus_sabaeus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	45.588	ENSCHOG00000004335	RPP38	94	45.353	Choloepus_hoffmanni
ENSDARG00000040350	rpp38	95	44.074	ENSCGRG00001001395	Rpp38	90	44.747	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000040350	rpp38	95	44.074	ENSCGRG00000017441	Rpp38	90	44.747	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000040350	rpp38	95	51.311	ENSCSEG00000001721	rpp38	97	51.481	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000040350	rpp38	95	47.872	ENSCVAG00000001676	rpp38	90	49.624	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	45.926	ENSDNOG00000040314	RPP38	94	45.693	Dasypus_novemcinctus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.018	ENSDORG00000009783	Rpp38	90	45.703	Dipodomys_ordii
ENSDARG00000040350	rpp38	96	43.066	ENSETEG00000002839	RPP38	94	42.804	Echinops_telfairi
ENSDARG00000040350	rpp38	96	44.565	ENSEASG00005019783	RPP38	93	44.161	Equus_asinus_asinus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	42.963	ENSEEUG00000014677	RPP38	90	43.529	Erinaceus_europaeus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	50.345	ENSELUG00000010160	rpp38	93	50.542	Esox_lucius
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.455	ENSFCAG00000022449	RPP38	94	45.387	Felis_catus
ENSDARG00000040350	rpp38	94	41.045	ENSFALG00000014804	RPP38	94	41.392	Ficedula_albicollis
ENSDARG00000040350	rpp38	96	44.485	ENSFDAG00000018669	RPP38	94	44.403	Fukomys_damarensis
ENSDARG00000040350	rpp38	94	48.227	ENSFHEG00000013741	rpp38	91	48.889	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000040350	rpp38	92	41.603	ENSGALG00000008794	RPP38	86	43.478	Gallus_gallus
ENSDARG00000040350	rpp38	59	54.777	ENSGACG00000009258	rpp38	90	54.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.000	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	50.758	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000040350	rpp38	96	43.750	ENSHGLG00000012144	RPP38	94	43.657	Heterocephalus_glaber_female
ENSDARG00000040350	rpp38	89	52.941	ENSIPUG00000022879	rpp38	96	55.253	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	45.756	ENSSTOG00000025699	RPP38	88	46.693	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	46.953	ENSJJAG00000007523	Rpp38	90	47.547	Jaculus_jaculus
ENSDARG00000040350	rpp38	89	48.077	ENSKMAG00000003986	rpp38	90	47.510	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000040350	rpp38	98	51.264	ENSLBEG00000006853	rpp38	92	51.172	Labrus_bergylta
ENSDARG00000040350	rpp38	90	44.074	ENSLACG00000006502	RPP38	91	44.649	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000040350	rpp38	99	47.183	ENSLOCG00000018347	rpp38	95	48.929	Lepisosteus_oculatus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	44.689	ENSLAFG00000000509	RPP38	95	44.280	Loxodonta_africana
ENSDARG00000040350	rpp38	92	44.444	ENSMMUG00000007679	RPP38	94	45.318	Macaca_mulatta
ENSDARG00000040350	rpp38	96	55.019	ENSMAMG00000012774	rpp38	91	55.556	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.763	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	51.515	Maylandia_zebra
ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.382	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	51.136	Maylandia_zebra
ENSDARG00000040350	rpp38	92	41.603	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	42.688	Meleagris_gallopavo
ENSDARG00000040350	rpp38	95	45.221	ENSMAUG00000003644	Rpp38	90	45.349	Mesocricetus_auratus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	43.750	ENSMOCG00000007020	Rpp38	90	44.358	Microtus_ochrogaster
ENSDARG00000040350	rpp38	93	50.936	ENSMMOG00000003446	rpp38	91	51.351	Mola_mola
ENSDARG00000040350	rpp38	93	45.076	ENSMODG00000024091	RPP38	95	45.149	Monodelphis_domestica
ENSDARG00000040350	rpp38	93	50.752	ENSMALG00000002356	rpp38	91	51.172	Monopterus_albus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	45.290	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	90	46.565	Mus_caroli
ENSDARG00000040350	rpp38	95	46.886	ENSMUSG00000049950	Rpp38	90	47.710	Mus_musculus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	44.118	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	90	44.906	Mus_pahari
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.255	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	90	46.183	Mus_spretus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	43.796	ENSMPUG00000018523	RPP38	94	45.318	Mustela_putorius_furo
ENSDARG00000040350	rpp38	92	44.402	ENSMLUG00000002153	RPP38	94	45.693	Myotis_lucifugus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	45.390	ENSNGAG00000011066	Rpp38	90	45.896	Nannospalax_galili
ENSDARG00000040350	rpp38	94	51.331	ENSNBRG00000006994	rpp38	97	51.698	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000040350	rpp38	95	50.758	ENSONIG00000020467	rpp38	95	51.321	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000040350	rpp38	92	44.015	ENSOCUG00000022768	-	94	44.737	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000040350	rpp38	92	44.015	ENSOCUG00000024367	-	94	44.737	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	49.446	ENSORLG00000009219	rpp38	96	49.635	Oryzias_latipes
ENSDARG00000040350	rpp38	95	50.923	ENSORLG00020011503	rpp38	93	51.095	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000040350	rpp38	95	50.368	ENSORLG00015017702	rpp38	93	50.365	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000040350	rpp38	95	50.183	ENSOMEG00000005414	rpp38	96	50.362	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000040350	rpp38	95	43.636	ENSOGAG00000008059	RPP38	90	44.444	Otolemur_garnettii
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.455	ENSOARG00000004534	RPP38	94	45.161	Ovis_aries
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.756	ENSPPAG00000041577	RPP38	82	46.484	Pan_paniscus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	47.253	ENSPPRG00000015329	RPP38	94	47.212	Panthera_pardus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	46.886	ENSPTIG00000007188	RPP38	94	45.985	Panthera_tigris_altaica
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.387	ENSPTRG00000002318	RPP38	82	46.094	Pan_troglodytes
ENSDARG00000040350	rpp38	94	49.627	ENSPKIG00000025652	rpp38	92	51.698	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000040350	rpp38	97	42.182	ENSPSIG00000001527	RPP38	96	41.758	Pelodiscus_sinensis
ENSDARG00000040350	rpp38	95	46.125	ENSPEMG00000008375	Rpp38	90	46.718	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDARG00000040350	rpp38	95	47.426	ENSPCIG00000009096	RPP38	90	45.926	Phascolarctos_cinereus
ENSDARG00000040350	rpp38	71	51.485	ENSPFOG00000016823	rpp38	96	50.515	Poecilia_formosa
ENSDARG00000040350	rpp38	98	45.833	ENSPLAG00000007626	rpp38	92	46.241	Poecilia_latipinna
ENSDARG00000040350	rpp38	94	41.758	ENSPMEG00000020392	rpp38	91	42.966	Poecilia_mexicana
ENSDARG00000040350	rpp38	93	46.350	ENSPREG00000017744	rpp38	94	46.617	Poecilia_reticulata
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.756	ENSPPYG00000002113	RPP38	90	46.484	Pongo_abelii
ENSDARG00000040350	rpp38	92	43.985	ENSPVAG00000007155	RPP38	94	44.853	Pteropus_vampyrus
ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.382	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	51.136	Pundamilia_nyererei
ENSDARG00000040350	rpp38	89	55.085	ENSPNAG00000010633	rpp38	96	56.471	Pygocentrus_nattereri
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.387	ENSRNOG00000038025	Rpp38	90	46.094	Rattus_norvegicus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	48.148	ENSSHAG00000015529	RPP38	90	48.221	Sarcophilus_harrisii
ENSDARG00000040350	rpp38	94	52.632	ENSSMAG00000018276	rpp38	91	52.918	Scophthalmus_maximus
ENSDARG00000040350	rpp38	94	49.813	ENSSDUG00000001651	rpp38	92	50.980	Seriola_dumerili
ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.368	ENSSLDG00000014355	rpp38	92	51.362	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDARG00000040350	rpp38	96	39.927	ENSSARG00000012099	RPP38	89	40.310	Sorex_araneus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	45.161	ENSSPUG00000018363	-	90	45.283	Sphenodon_punctatus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	45.520	ENSSPUG00000005237	-	89	45.660	Sphenodon_punctatus
ENSDARG00000040350	rpp38	94	41.516	ENSSPUG00000008560	-	91	41.221	Sphenodon_punctatus
ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.958	ENSSPAG00000020387	rpp38	96	50.943	Stegastes_partitus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	41.993	ENSSSCG00000027110	RPP38	90	42.857	Sus_scrofa
ENSDARG00000040350	rpp38	92	42.751	ENSTGUG00000001366	RPP38	90	44.061	Taeniopygia_guttata
ENSDARG00000040350	rpp38	94	50.388	ENSTNIG00000001334	rpp38	90	50.826	Tetraodon_nigroviridis
ENSDARG00000040350	rpp38	96	43.902	ENSTTRG00000004420	RPP38	90	44.485	Tursiops_truncatus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.725	ENSUAMG00000002618	RPP38	94	46.038	Ursus_americanus
ENSDARG00000040350	rpp38	96	45.055	ENSUMAG00000012382	RPP38	94	44.118	Ursus_maritimus
ENSDARG00000040350	rpp38	95	44.610	ENSVVUG00000005272	RPP38	90	45.098	Vulpes_vulpes
ENSDARG00000040350	rpp38	93	42.222	ENSXETG00000003419	rpp38	95	42.857	Xenopus_tropicalis