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PPI

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Gene Ontology

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Ensembl ID: ENSDARG00000041493 (Gene tree)
Gene ID: 553305
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 78487 bases
Position: chr24:12754013-12832499
Accession: ZDB-GENE-041014-307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000039155	IBN_N	PF03810.19	3.3e-12	1	1
ENSDARP00000156982	IBN_N	PF03810.19	1.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000060826	-	1394	-	ENSDARP00000060825	345 (aa)	-	F1R750
ENSDART00000182027	-	3819	-	ENSDARP00000156982	1110 (aa)	-	A0A2R8RZX0
ENSDART00000039312	-	3744	XM_679071	ENSDARP00000039155	1085 (aa)	XP_684163	F1QIP3

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.960	ENSG00000196497	IPO4	99	47.043	Homo_sapiens
ENSDARG00000041493	ipo4	100	74.333	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	74.425	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.617	ENSAMEG00000016271	IPO4	84	46.525	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDARG00000041493	ipo4	100	72.744	ENSACIG00000004246	ipo4	100	73.370	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000041493	ipo4	100	75.733	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	75.824	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000041493	ipo4	100	75.916	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	76.007	Amphiprion_percula
ENSDARG00000041493	ipo4	92	79.042	ENSATEG00000017082	ipo4	99	79.042	Anabas_testudineus
ENSDARG00000041493	ipo4	84	47.835	ENSACAG00000003973	-	96	47.546	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.305	ENSANAG00000037973	IPO4	99	46.525	Aotus_nancymaae
ENSDARG00000041493	ipo4	100	72.268	ENSACLG00000019742	ipo4	100	72.268	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000041493	ipo4	100	78.637	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	78.637	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.617	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	46.617	Bos_taurus
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.053	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	47.173	Callithrix_jacchus
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.802	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	47.637	Canis_familiaris
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.481	ENSCAFG00020002873	IPO4	98	46.642	Canis_lupus_dingo
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.399	ENSCHIG00000009413	IPO4	95	46.432	Capra_hircus
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.692	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	46.537	Carlito_syrichta
ENSDARG00000041493	ipo4	94	48.434	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	46.988	Cavia_porcellus
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.147	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	47.359	Cebus_capucinus
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.147	ENSCATG00000040395	IPO4	99	47.173	Cercocebus_atys
ENSDARG00000041493	ipo4	94	48.630	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	47.544	Chinchilla_lanigera
ENSDARG00000041493	ipo4	90	46.694	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	43.779	Chrysemys_picta_bellii
ENSDARG00000041493	ipo4	92	36.914	ENSCING00000008639	-	99	37.120	Ciona_intestinalis
ENSDARG00000041493	ipo4	93	37.741	ENSCSAVG00000011482	-	99	37.814	Ciona_savignyi
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.773	ENSCANG00000029513	IPO4	99	46.895	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	45.093	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	45.463	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000041493	ipo4	99	45.093	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	45.463	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000041493	ipo4	100	72.360	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	72.217	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000041493	ipo4	99	68.905	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	68.881	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	47.359	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	47.359	Dasypus_novemcinctus
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.960	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	46.895	Dipodomys_ordii
ENSDARG00000041493	ipo4	97	30.447	FBgn0042178	CG32165	97	30.712	Drosophila_melanogaster
ENSDARG00000041493	ipo4	97	30.663	FBgn0042177	CG32164	97	30.663	Drosophila_melanogaster
ENSDARG00000041493	ipo4	99	45.328	ENSETEG00000018381	IPO4	99	45.271	Echinops_telfairi
ENSDARG00000041493	ipo4	90	48.783	ENSEASG00005011954	IPO4	96	48.884	Equus_asinus_asinus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	47.729	ENSECAG00000009909	IPO4	99	47.822	Equus_caballus
ENSDARG00000041493	ipo4	100	79.652	ENSELUG00000020628	ipo4	100	78.918	Esox_lucius
ENSDARG00000041493	ipo4	99	47.637	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	47.637	Felis_catus
ENSDARG00000041493	ipo4	94	44.976	ENSFDAG00000000725	IPO4	98	43.697	Fukomys_damarensis
ENSDARG00000041493	ipo4	92	73.785	ENSFHEG00000009351	ipo4	99	73.038	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000041493	ipo4	100	79.155	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	78.721	Gadus_morhua
ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.492	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	73.376	Gambusia_affinis
ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.438	ENSGACG00000002276	ipo4	99	73.438	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.960	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	46.988	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.186	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	73.186	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.910	ENSHGLG00000002923	IPO4	98	47.097	Heterocephalus_glaber_female
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.629	ENSHGLG00100003725	IPO4	98	46.816	Heterocephalus_glaber_male
ENSDARG00000041493	ipo4	99	70.588	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	70.690	Hippocampus_comes
ENSDARG00000041493	ipo4	100	80.773	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	80.773	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	47.173	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	47.266	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDARG00000041493	ipo4	93	47.727	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	46.759	Jaculus_jaculus
ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.602	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	73.602	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000041493	ipo4	100	74.013	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	73.829	Labrus_bergylta
ENSDARG00000041493	ipo4	100	52.862	ENSLACG00000001428	IPO4	100	52.783	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000041493	ipo4	79	73.214	ENSLOCG00000001149	ipo4	100	51.981	Lepisosteus_oculatus
ENSDARG00000041493	ipo4	94	48.094	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	46.274	Loxodonta_africana
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.147	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	47.173	Macaca_fascicularis
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.147	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	47.173	Macaca_mulatta
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.053	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	47.081	Macaca_nemestrina
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.147	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	47.173	Mandrillus_leucophaeus
ENSDARG00000041493	ipo4	100	74.333	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	74.425	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.186	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	73.186	Maylandia_zebra
ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.468	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	46.468	Mesocricetus_auratus
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.521	ENSMICG00000001719	IPO4	99	47.637	Microcebus_murinus
ENSDARG00000041493	ipo4	98	45.650	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	45.926	Microtus_ochrogaster
ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.694	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	73.694	Mola_mola
ENSDARG00000041493	ipo4	99	45.278	ENSMODG00000003337	IPO4	96	45.185	Monodelphis_domestica
ENSDARG00000041493	ipo4	100	72.844	ENSMALG00000001587	ipo4	100	72.936	Monopterus_albus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.019	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	48.327	Mus_caroli
ENSDARG00000041493	ipo4	99	45.833	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	47.847	Mus_musculus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	45.690	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	47.891	Mus_pahari
ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.204	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	98	48.079	Mus_spretus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	48.107	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	48.199	Mustela_putorius_furo
ENSDARG00000041493	ipo4	99	47.037	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	47.130	Myotis_lucifugus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.884	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	46.791	Nannospalax_galili
ENSDARG00000041493	ipo4	100	76.081	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	76.081	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000041493	ipo4	99	47.456	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	47.456	Ochotona_princeps
ENSDARG00000041493	ipo4	99	45.652	ENSODEG00000002609	IPO4	99	46.438	Octodon_degus
ENSDARG00000041493	ipo4	100	75.276	ENSONIG00000014574	ipo4	100	75.276	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	47.130	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	47.315	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	72.525	ENSORLG00000006457	ipo4	99	73.659	Oryzias_latipes
ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.186	ENSORLG00020004286	ipo4	100	72.544	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.095	ENSORLG00015021856	ipo4	100	72.452	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000041493	ipo4	99	72.398	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	71.875	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.211	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	46.061	Otolemur_garnettii
ENSDARG00000041493	ipo4	98	45.915	ENSOARG00000019188	IPO4	98	45.915	Ovis_aries
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.773	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	46.901	Pan_paniscus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	47.822	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	47.822	Panthera_pardus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	47.729	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	47.729	Panthera_tigris_altaica
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.866	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	47.081	Pan_troglodytes
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.240	ENSPANG00000026278	IPO4	99	47.266	Papio_anubis
ENSDARG00000041493	ipo4	100	71.311	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	71.494	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000041493	ipo4	99	72.970	ENSPKIG00000007683	-	99	72.878	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000041493	ipo4	99	68.624	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	68.670	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	45.278	ENSPEMG00000016160	Ipo4	98	45.573	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDARG00000041493	ipo4	93	48.086	ENSPCIG00000010718	IPO4	96	48.086	Phascolarctos_cinereus
ENSDARG00000041493	ipo4	100	74.199	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	74.220	Poecilia_formosa
ENSDARG00000041493	ipo4	100	74.291	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	74.312	Poecilia_latipinna
ENSDARG00000041493	ipo4	100	74.199	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	74.220	Poecilia_mexicana
ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.670	ENSPREG00000017605	ipo4	100	73.670	Poecilia_reticulata
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.866	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	47.081	Pongo_abelii
ENSDARG00000041493	ipo4	99	47.584	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	47.238	Procavia_capensis
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.053	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	47.081	Propithecus_coquereli
ENSDARG00000041493	ipo4	98	47.428	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	47.637	Pteropus_vampyrus
ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.829	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	73.829	Pundamilia_nyererei
ENSDARG00000041493	ipo4	100	82.505	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	82.413	Pygocentrus_nattereri
ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.339	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	46.432	Rattus_norvegicus
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.866	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	46.895	Rhinopithecus_bieti
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.866	ENSRROG00000011492	IPO4	99	46.895	Rhinopithecus_roxellana
ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.492	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	46.710	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.869	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	46.961	Sarcophilus_harrisii
ENSDARG00000041493	ipo4	99	73.309	ENSSFOG00015012267	ipo4	99	73.309	Scleropages_formosus
ENSDARG00000041493	ipo4	99	70.377	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	70.561	Scleropages_formosus
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