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Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSDARG00000055477 (Gene tree)
Gene ID: 394111
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17239 bases
Position: chr12:13188616-13205854
Accession: ZDB-GENE-040426-1074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000072295	eRF1_2	PF03464.15	2.7e-33	1	1
ENSDARP00000127006	eRF1_2	PF03464.15	1.5e-25	1	1
ENSDARP00000072295	eRF1_3	PF03465.15	8.5e-25	1	1
ENSDARP00000072295	eRF1_1	PF03463.15	3.1e-51	1	1
ENSDARP00000127006	eRF1_1	PF03463.15	5.7e-30	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000152670	-	717	-	ENSDARP00000127006	199 (aa)	-	R4GEU3
ENSDART00000077829	-	2260	-	ENSDARP00000072295	385 (aa)	-	Q7ZWC4

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
dre03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	ENSG00000152684	PELO	100	82.078	Homo_sapiens
ENSDARG00000055477	pelo	99	80.786	ENSAPOG00000000616	pelo	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000055477	pelo	100	89.351	ENSAPOG00000023072	pelo	100	89.351	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000055477	pelo	99	80.786	ENSAPOG00000023700	-	90	92.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDARG00000055477	pelo	97	84.718	ENSACIG00000014386	pelo	97	89.053	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000055477	pelo	100	89.610	ENSAOCG00000023717	pelo	100	89.610	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000055477	pelo	100	89.610	ENSAPEG00000011235	pelo	100	89.610	Amphiprion_percula
ENSDARG00000055477	pelo	100	89.870	ENSATEG00000019550	pelo	100	89.870	Anabas_testudineus
ENSDARG00000055477	pelo	77	71.812	ENSAPLG00000013265	PELO	100	71.812	Anas_platyrhynchos
ENSDARG00000055477	pelo	97	81.600	ENSACAG00000004352	PELO	100	81.299	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.818	Aotus_nancymaae
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.831	ENSACLG00000010305	pelo	100	88.831	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000055477	pelo	97	93.029	ENSAMXG00000020299	pelo	100	92.228	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.299	ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.299	Bos_taurus
ENSDARG00000055477	pelo	98	59.843	WBGene00011280	pelo-1	100	59.843	Caenorhabditis_elegans
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.558	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.558	Callithrix_jacchus
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.078	Canis_lupus_dingo
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.039	ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	Capra_hircus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSTSYG00000005203	PELO	100	81.818	Carlito_syrichta
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.818	Cavia_porcellus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.558	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.558	Cebus_capucinus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSCATG00000011829	PELO	100	81.818	Cercocebus_atys
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.299	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.299	Chinchilla_lanigera
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.818	Chlorocebus_sabaeus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.039	ENSCHOG00000000523	PELO	100	81.039	Choloepus_hoffmanni
ENSDARG00000055477	pelo	97	81.867	ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.558	Chrysemys_picta_bellii
ENSDARG00000055477	pelo	96	65.676	ENSCING00000001979	-	100	64.935	Ciona_intestinalis
ENSDARG00000055477	pelo	100	66.753	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.753	Ciona_savignyi
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSCANG00000023382	PELO	100	81.818	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000055477	pelo	97	82.574	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.078	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000055477	pelo	97	83.110	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.597	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.571	ENSCSEG00000008807	pelo	100	88.571	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.052	ENSCVAG00000016082	pelo	100	88.052	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000055477	pelo	100	79.016	ENSDNOG00000036721	PELO	100	79.016	Dasypus_novemcinctus
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.338	ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.338	Dipodomys_ordii
ENSDARG00000055477	pelo	96	66.757	FBgn0011207	pelo	96	65.455	Drosophila_melanogaster
ENSDARG00000055477	pelo	80	74.074	ENSEBUG00000004955	pelo	99	75.269	Eptatretus_burgeri
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.558	ENSEASG00005013348	PELO	100	81.558	Equus_asinus_asinus
ENSDARG00000055477	pelo	100	91.429	ENSELUG00000023229	pelo	100	91.429	Esox_lucius
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	ENSFCAG00000032341	PELO	100	82.078	Felis_catus
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.338	ENSFALG00000004559	PELO	100	82.338	Ficedula_albicollis
ENSDARG00000055477	pelo	99	71.179	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.746	Fukomys_damarensis
ENSDARG00000055477	pelo	100	87.792	ENSFHEG00000009769	pelo	100	87.792	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000055477	pelo	98	88.594	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.052	Gadus_morhua
ENSDARG00000055477	pelo	100	87.792	ENSGAFG00000019350	pelo	100	87.792	Gambusia_affinis
ENSDARG00000055477	pelo	100	89.091	ENSGACG00000007245	pelo	97	92.308	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000055477	pelo	97	82.133	ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.818	Gopherus_agassizii
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSGGOG00000012635	PELO	100	81.818	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.831	ENSHBUG00000005866	pelo	100	88.831	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.039	ENSHGLG00000005932	PELO	100	81.039	Heterocephalus_glaber_female
ENSDARG00000055477	pelo	100	78.961	ENSHGLG00100017627	PELO	100	78.961	Heterocephalus_glaber_male
ENSDARG00000055477	pelo	100	87.532	ENSHCOG00000016782	pelo	100	87.532	Hippocampus_comes
ENSDARG00000055477	pelo	100	92.468	ENSIPUG00000020627	pelo	100	92.468	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.558	ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.558	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDARG00000055477	pelo	100	80.000	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	80.000	Jaculus_jaculus
ENSDARG00000055477	pelo	100	89.091	ENSKMAG00000021305	pelo	100	89.091	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000055477	pelo	100	89.610	ENSLBEG00000022399	pelo	100	89.610	Labrus_bergylta
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.299	ENSLAFG00000020551	PELO	100	81.299	Loxodonta_africana
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSMFAG00000000651	PELO	100	81.818	Macaca_fascicularis
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSMMUG00000039101	PELO	100	81.818	Macaca_mulatta
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSMNEG00000035538	PELO	100	81.818	Macaca_nemestrina
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSMLEG00000039113	PELO	100	81.818	Mandrillus_leucophaeus
ENSDARG00000055477	pelo	97	91.153	ENSMAMG00000013260	pelo	100	90.649	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.831	ENSMZEG00005014258	pelo	100	88.831	Maylandia_zebra
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	81.818	Mesocricetus_auratus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.558	ENSMICG00000044040	PELO	100	81.558	Microcebus_murinus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	81.818	Microtus_ochrogaster
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.312	ENSMMOG00000001324	pelo	100	88.312	Mola_mola
ENSDARG00000055477	pelo	100	89.610	ENSMALG00000008194	pelo	100	89.610	Monopterus_albus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	81.818	Mus_caroli
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	81.818	Mus_musculus
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	82.078	Mus_pahari
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	81.818	Mus_spretus
ENSDARG00000055477	pelo	100	80.519	ENSMLUG00000024132	PELO	100	80.519	Myotis_lucifugus
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.338	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	82.338	Nannospalax_galili
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.831	ENSNBRG00000011799	pelo	100	88.831	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSNLEG00000035970	PELO	100	81.818	Nomascus_leucogenys
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.039	ENSMEUG00000005468	PELO	100	81.039	Notamacropus_eugenii
ENSDARG00000055477	pelo	96	81.941	ENSOPRG00000018793	PELO	98	81.941	Ochotona_princeps
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSODEG00000017579	PELO	100	81.818	Octodon_degus
ENSDARG00000055477	pelo	96	88.949	ENSONIG00000011511	pelo	100	88.052	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	ENSOCUG00000023902	PELO	100	82.078	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.052	ENSORLG00000005827	pelo	100	88.052	Oryzias_latipes
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.312	ENSORLG00020016456	pelo	100	88.312	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.571	ENSORLG00015014447	pelo	100	88.889	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000055477	pelo	99	91.414	ENSOMEG00000021567	pelo	100	89.610	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	ENSOGAG00000027940	PELO	100	82.078	Otolemur_garnettii
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.299	ENSOARG00000008324	PELO	99	81.299	Ovis_aries
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSPPAG00000038951	PELO	100	81.818	Pan_paniscus
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	ENSPPRG00000018800	PELO	100	82.078	Panthera_pardus
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.078	ENSPTIG00000019988	PELO	100	82.078	Panthera_tigris_altaica
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.818	Pan_troglodytes
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSPANG00000010902	PELO	100	81.818	Papio_anubis
ENSDARG00000055477	pelo	100	92.208	ENSPKIG00000015190	pelo	100	92.208	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000055477	pelo	97	81.600	ENSPSIG00000004971	PELO	100	81.299	Pelodiscus_sinensis
ENSDARG00000055477	pelo	99	79.039	ENSPMGG00000014561	pelo	95	89.535	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	81.818	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.039	ENSPCIG00000004880	PELO	100	81.039	Phascolarctos_cinereus
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.312	ENSPFOG00000007277	pelo	100	88.312	Poecilia_formosa
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.571	ENSPLAG00000020787	pelo	100	88.571	Poecilia_latipinna
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.312	ENSPMEG00000016964	pelo	100	88.312	Poecilia_mexicana
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.571	ENSPREG00000023071	pelo	100	88.571	Poecilia_reticulata
ENSDARG00000055477	pelo	97	82.842	ENSPPYG00000015451	PELO	96	82.078	Pongo_abelii
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.558	ENSPCOG00000021178	PELO	100	81.558	Propithecus_coquereli
ENSDARG00000055477	pelo	100	88.831	ENSPNYG00000017325	pelo	100	88.831	Pundamilia_nyererei
ENSDARG00000055477	pelo	97	94.370	ENSPNAG00000012458	pelo	99	93.247	Pygocentrus_nattereri
ENSDARG00000055477	pelo	100	82.597	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	82.597	Rattus_norvegicus
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSRBIG00000007299	PELO	100	81.818	Rhinopithecus_bieti
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	ENSRROG00000035507	PELO	100	81.818	Rhinopithecus_roxellana
ENSDARG00000055477	pelo	94	32.065	YNL001W	-	94	32.065	Saccharomyces_cerevisiae
ENSDARG00000055477	pelo	100	81.299	ENSSBOG00000036140	PELO	100	81.299	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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