EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSDARG00000068863 (Gene tree)
Gene ID: 569123
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-98f17.5
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35435 bases
Position: chr5:12590403-12625837
Accession: ZDB-GENE-060526-354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000118566	MMR_HSR1	PF01926.23	5.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000133167	-	1373	-	ENSDARP00000118566	440 (aa)	-	A5WVV4

Gene Model

Click here to download ENSDARG00000068863's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSDARG00000068863's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	61.451	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.980

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.317	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	98	60.317	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	98	83.864	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.910	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	98	59.910	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.091	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	98	84.091	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.091	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	98	84.091	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.544	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	98	60.544	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.544	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	98	60.544	Amphiprion_percula
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	98	83.864	Amphiprion_percula
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.771	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	98	60.771	Anabas_testudineus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.091	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	98	84.091	Anabas_testudineus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.685	ENSACAG00000028632	-	98	59.685	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.636	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	98	83.636	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.449	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	98	60.449	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.636	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	98	83.636	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.910	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	98	59.910	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	80	59.615	ENSCING00000020807	-	96	59.615	Ciona_intestinalis
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	98	55.452	ENSCSAVG00000009987	-	96	55.684	Ciona_savignyi
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	83.066	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	96	80.723	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.184	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	97	59.368	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.181	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	98	60.181	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.500	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	98	82.500	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	83	54.821	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	97	54.821	Eptatretus_burgeri
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	81.818	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	98	81.818	Esox_lucius
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.500	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	98	82.500	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.722	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	98	60.722	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	92	54.208	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	100	54.208	Gadus_morhua
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.637	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	98	59.637	Gambusia_affinis
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.045	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	88	82.045	Gambusia_affinis
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	59	92.664	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	92.664	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	84	65.147	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	100	61.330	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.674	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	98	60.674	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	98	83.864	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	80.460	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	95	80.460	Hippocampus_comes
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.410	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	98	59.410	Hippocampus_comes
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	85	57.447	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	57.447	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.409	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	98	83.409	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	98	59.584	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.584	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.955	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	98	82.955	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.091	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	98	60.091	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.500	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	98	82.500	Labrus_bergylta
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	68.950	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	96	68.950	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	63.182	ENSLACG00000004899	-	98	63.182	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	62.014	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	96	62.243	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	73.973	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	97	73.973	Lepisosteus_oculatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	98	83.864	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	98	60.046	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.046	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	98	83.864	Maylandia_zebra
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.674	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	98	60.674	Maylandia_zebra
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.502	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	97	59.502	Mola_mola
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	81.591	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	81.591	Monopterus_albus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.544	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	98	60.544	Monopterus_albus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	98	83.864	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	98	60.460	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.460	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.045	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	98	60.045	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.091	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	98	84.091	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	78.636	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	98	78.636	Oryzias_latipes
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.771	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	98	60.771	Oryzias_latipes
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.544	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	98	60.544	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	81.818	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	98	81.818	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	61.625	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	98	61.625	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.727	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	98	82.727	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	61.086	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	98	61.086	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.636	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	83.796	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.360	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	98	61.312	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	57.955	ENSPKIG00000023918	-	96	58.087	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	76.591	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	98	76.591	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	61.573	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	98	61.573	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	80.455	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	98	80.455	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	61.224	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	98	61.224	Poecilia_formosa
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.167	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	98	82.167	Poecilia_formosa
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.500	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	98	82.500	Poecilia_latipinna
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.998	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	98	60.998	Poecilia_latipinna
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	61.224	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	60.970	Poecilia_mexicana
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.727	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	92	82.727	Poecilia_mexicana
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	92	60.396	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	92	60.396	Poecilia_reticulata
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	81.136	ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	81.136	Poecilia_reticulata
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	ENSPNYG00000017266	si:dkey-98f17.5	98	83.864	Pundamilia_nyererei
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.674	ENSPNYG00000017099	si:ch211-11k18.4	98	60.674	Pundamilia_nyererei
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.545	ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	98	84.545	Pygocentrus_nattereri
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.860	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	98	60.633	Pygocentrus_nattereri
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	74.773	ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	98	74.773	Scleropages_formosus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.850	ENSSFOG00015000985	si:ch211-11k18.4	92	60.850	Scleropages_formosus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	82.380	ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	98	82.639	Scophthalmus_maximus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.184	ENSSMAG00000009651	si:ch211-11k18.4	98	59.184	Scophthalmus_maximus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.864	ENSSDUG00000016411	si:ch211-11k18.4	98	60.091	Seriola_dumerili
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	82.609	ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	98	82.609	Seriola_dumerili
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.637	ENSSLDG00000019145	si:ch211-11k18.4	98	59.864	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	82.609	ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	98	82.609	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	88	60.465	ENSSPUG00000010096	-	97	60.825	Sphenodon_punctatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.091	ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	98	84.091	Stegastes_partitus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.317	ENSSPAG00000010697	si:ch211-11k18.4	98	60.317	Stegastes_partitus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	81.591	ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	98	81.591	Takifugu_rubripes
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.998	ENSTRUG00000020291	si:ch211-11k18.4	98	60.998	Takifugu_rubripes
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	57.432	ENSXETG00000031783	-	98	57.432	Xenopus_tropicalis
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	59.910	ENSXCOG00000018094	si:ch211-11k18.4	98	59.910	Xiphophorus_couchianus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.727	ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	98	82.727	Xiphophorus_couchianus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.727	ENSXMAG00000007688	si:dkey-98f17.5	93	82.727	Xiphophorus_maculatus
ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	60.317	ENSXMAG00000021235	si:ch211-11k18.4	98	60.544	Xiphophorus_maculatus

Gene Ontology

Go ID	Go_term	PubmedID	Evidence	Category
GO:0016020	membrane	-	IEA	Component
GO:0016021	integral component of membrane	-	IEA	Component