EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSDARG00000086107 (Gene tree)
Gene ID: 100536997
Gene Symbol: MTERF1
Alias: -
Full Name: mitochondrial transcription termination factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5865 bases
Position: chr19:432473-438337
Accession: 100536997
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000112440	mTERF	PF02536.14	1.2e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000127985	MTERF1-201	2637	XM_003200502	ENSDARP00000112440	366 (aa)	XP_003200550	E7FGP4

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.356	ENSG00000127989	MTERF1	91	46.356	Homo_sapiens
ENSDARG00000086107	MTERF1	96	56.583	ENSAPOG00000022230	MTERF1	92	56.583	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000086107	MTERF1	75	47.273	ENSAMEG00000007917	-	81	46.875	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	56.891	ENSACIG00000017700	MTERF1	87	56.891	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000086107	MTERF1	94	55.043	ENSAOCG00000004345	MTERF1	90	55.043	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000086107	MTERF1	94	55.043	ENSAPEG00000005877	MTERF1	90	55.043	Amphiprion_percula
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	54.942	ENSATEG00000011055	MTERF1	89	54.942	Anabas_testudineus
ENSDARG00000086107	MTERF1	87	30.530	ENSAPLG00000001889	MTERF2	82	30.530	Anas_platyrhynchos
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	45.152	ENSACAG00000015777	MTERF1	83	45.152	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	31.611	ENSACAG00000015290	MTERF2	82	31.611	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000086107	MTERF1	86	48.889	ENSANAG00000022640	MTERF1	89	47.813	Aotus_nancymaae
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	58.182	ENSACLG00000011571	MTERF1	85	58.182	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	55.523	ENSAMXG00000017008	MTERF1	97	55.523	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000086107	MTERF1	86	48.254	ENSBTAG00000045617	MTERF1	86	47.230	Bos_taurus
ENSDARG00000086107	MTERF1	86	48.889	ENSCJAG00000014169	MTERF1	87	47.813	Callithrix_jacchus
ENSDARG00000086107	MTERF1	87	46.541	ENSCAFG00000001908	MTERF1	88	45.665	Canis_familiaris
ENSDARG00000086107	MTERF1	87	46.541	ENSCAFG00020015983	MTERF1	88	45.665	Canis_lupus_dingo
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	47.230	ENSCHIG00000013172	MTERF1	86	47.230	Capra_hircus
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	46.224	ENSTSYG00000012629	MTERF1	86	46.199	Carlito_syrichta
ENSDARG00000086107	MTERF1	95	46.110	ENSCPOG00000003510	MTERF1	85	46.110	Cavia_porcellus
ENSDARG00000086107	MTERF1	86	48.571	ENSCCAG00000026587	MTERF1	87	47.522	Cebus_capucinus
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.356	ENSCATG00000039620	MTERF1	86	46.356	Cercocebus_atys
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.064	ENSCSAG00000012508	MTERF1	86	46.064	Chlorocebus_sabaeus
ENSDARG00000086107	MTERF1	98	47.354	ENSCPBG00000021801	MTERF1	89	47.354	Chrysemys_picta_bellii
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	46.462	ENSCANG00000030925	MTERF1	81	46.462	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	48.615	ENSCGRG00001009716	-	86	48.615	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	48.171	ENSCGRG00000018838	-	86	48.615	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000086107	MTERF1	92	57.313	ENSCVAG00000007837	MTERF1	88	57.313	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	33.867	ENSDNOG00000032229	MTERF1	82	33.867	Dasypus_novemcinctus
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	46.154	ENSDORG00000028877	-	86	46.154	Dipodomys_ordii
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	48.000	ENSEASG00005019646	MTERF1	83	48.000	Equus_asinus_asinus
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	47.692	ENSECAG00000018128	MTERF1	83	47.692	Equus_caballus
ENSDARG00000086107	MTERF1	86	47.937	ENSEEUG00000013448	MTERF1	80	47.937	Erinaceus_europaeus
ENSDARG00000086107	MTERF1	98	53.994	ENSELUG00000014952	MTERF1	91	53.994	Esox_lucius
ENSDARG00000086107	MTERF1	87	46.688	ENSFCAG00000044797	MTERF1	87	45.954	Felis_catus
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	53.067	ENSFHEG00000000224	MTERF1	97	53.067	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	56.061	ENSGMOG00000007262	-	97	56.061	Gadus_morhua
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	55.394	ENSGAFG00000008852	MTERF1	90	55.394	Gambusia_affinis
ENSDARG00000086107	MTERF1	94	49.568	ENSGAGG00000025333	MTERF1	85	49.568	Gopherus_agassizii
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.647	ENSGGOG00000025995	MTERF1	88	46.647	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	58.182	ENSHBUG00000022218	MTERF1	85	58.182	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	58.589	ENSHCOG00000016064	MTERF1	85	58.589	Hippocampus_comes
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	61.280	ENSIPUG00000004017	mterf1	85	61.280	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	46.032	ENSSTOG00000001846	MTERF1	97	46.032	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	44.324	ENSJJAG00000011811	-	99	44.324	Jaculus_jaculus
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	49.563	ENSKMAG00000009695	MTERF1	89	49.563	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000086107	MTERF1	92	51.940	ENSLACG00000009880	MTERF1	84	51.940	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000086107	MTERF1	95	58.046	ENSLOCG00000018348	MTERF1	90	58.046	Lepisosteus_oculatus
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	44.149	ENSLAFG00000000054	MTERF1	99	44.149	Loxodonta_africana
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.356	ENSMFAG00000038723	MTERF1	86	46.356	Macaca_fascicularis
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.356	ENSMMUG00000015516	MTERF1	91	46.356	Macaca_mulatta
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.356	ENSMNEG00000041445	MTERF1	86	46.356	Macaca_nemestrina
ENSDARG00000086107	MTERF1	86	46.984	ENSMLEG00000008543	MTERF1	86	46.064	Mandrillus_leucophaeus
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	55.891	ENSMAMG00000015682	MTERF1	86	55.891	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	58.182	ENSMZEG00005026659	MTERF1	85	58.182	Maylandia_zebra
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	48.615	ENSMAUG00000006025	-	86	48.615	Mesocricetus_auratus
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	45.989	ENSMICG00000046314	MTERF1	95	45.989	Microcebus_murinus
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	47.692	ENSMUSG00000053178	Mterf1b	85	47.692	Mus_musculus
ENSDARG00000086107	MTERF1	94	45.773	ENSMUSG00000040429	Mterf1a	90	45.773	Mus_musculus
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	48.000	MGP_PahariEiJ_G0021712	-	85	48.000	Mus_pahari
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	48.000	MGP_PahariEiJ_G0021713	-	85	48.000	Mus_pahari
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	47.692	MGP_SPRETEiJ_G0027937	-	86	47.692	Mus_spretus
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	47.692	MGP_SPRETEiJ_G0027936	-	86	47.692	Mus_spretus
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	46.667	ENSMPUG00000008568	MTERF1	83	46.667	Mustela_putorius_furo
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.491	ENSMLUG00000011330	MTERF1	86	46.491	Myotis_lucifugus
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	43.200	ENSNGAG00000014383	-	97	43.200	Nannospalax_galili
ENSDARG00000086107	MTERF1	50	59.341	ENSNBRG00000022238	-	59	59.341	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.647	ENSNLEG00000015192	MTERF1	86	46.647	Nomascus_leucogenys
ENSDARG00000086107	MTERF1	92	47.619	ENSODEG00000000904	-	84	47.619	Octodon_degus
ENSDARG00000086107	MTERF1	92	47.619	ENSODEG00000014952	-	84	47.619	Octodon_degus
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	57.879	ENSONIG00000019792	MTERF1	86	57.879	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000086107	MTERF1	83	44.918	ENSOANG00000004680	-	98	44.918	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	30.460	ENSOANG00000005531	MTERF2	89	30.460	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	46.011	ENSOCUG00000010902	MTERF1	94	46.011	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	58.772	ENSORLG00000027811	MTERF1	89	58.772	Oryzias_latipes
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	58.235	ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	58.235	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	44.800	ENSOGAG00000001378	MTERF1	94	44.800	Otolemur_garnettii
ENSDARG00000086107	MTERF1	94	47.399	ENSOARG00000016682	MTERF1	86	47.522	Ovis_aries
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.356	ENSPPAG00000027361	MTERF1	88	46.356	Pan_paniscus
ENSDARG00000086107	MTERF1	94	45.954	ENSPPRG00000002171	MTERF1	87	45.954	Panthera_pardus
ENSDARG00000086107	MTERF1	87	47.003	ENSPTIG00000016254	MTERF1	87	46.243	Panthera_tigris_altaica
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.064	ENSPTRG00000052592	-	88	46.064	Pan_troglodytes
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.064	ENSPTRG00000019388	MTERF1	88	46.064	Pan_troglodytes
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	46.647	ENSPANG00000007445	MTERF1	85	49.653	Papio_anubis
ENSDARG00000086107	MTERF1	96	54.648	ENSPKIG00000017849	MTERF1	96	54.648	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000086107	MTERF1	96	54.648	ENSPKIG00000017556	MTERF1	96	54.648	Paramormyrops_kingsleyae
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	48.930	ENSPSIG00000016905	MTERF1	82	48.930	Pelodiscus_sinensis
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	47.692	ENSPEMG00000013884	-	86	47.692	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	43.161	ENSPMAG00000007898	MTERF1	98	43.161	Petromyzon_marinus
ENSDARG00000086107	MTERF1	95	53.161	ENSPFOG00000006919	MTERF1	89	53.161	Poecilia_formosa
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	53.353	ENSPLAG00000011584	MTERF1	89	53.353	Poecilia_latipinna
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	53.353	ENSPREG00000012369	MTERF1	90	53.353	Poecilia_reticulata
ENSDARG00000086107	MTERF1	86	48.089	ENSPPYG00000017826	MTERF1	76	48.089	Pongo_abelii
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	46.154	ENSPCOG00000013179	MTERF1	94	46.154	Propithecus_coquereli
ENSDARG00000086107	MTERF1	72	45.627	ENSPVAG00000006613	MTERF1	67	45.627	Pteropus_vampyrus
ENSDARG00000086107	MTERF1	90	57.879	ENSPNYG00000009120	MTERF1	85	57.879	Pundamilia_nyererei
ENSDARG00000086107	MTERF1	92	61.128	ENSPNAG00000022366	MTERF1	87	61.128	Pygocentrus_nattereri
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	48.466	ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	48.466	Rattus_norvegicus
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	46.626	ENSRBIG00000027323	MTERF1	82	46.626	Rhinopithecus_bieti
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	46.626	ENSRROG00000031256	MTERF1	82	46.626	Rhinopithecus_roxellana
ENSDARG00000086107	MTERF1	86	48.889	ENSSBOG00000034146	MTERF1	88	48.640	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	54.986	ENSSFOG00015008650	mterf1	92	54.986	Scleropages_formosus
ENSDARG00000086107	MTERF1	98	54.469	ENSSMAG00000004934	MTERF1	76	54.469	Scophthalmus_maximus
ENSDARG00000086107	MTERF1	98	54.545	ENSSDUG00000013580	MTERF1	94	54.545	Seriola_dumerili
ENSDARG00000086107	MTERF1	95	42.816	ENSSPUG00000017132	MTERF1	92	42.816	Sphenodon_punctatus
ENSDARG00000086107	MTERF1	93	55.652	ENSSPAG00000018734	MTERF1	90	55.652	Stegastes_partitus
ENSDARG00000086107	MTERF1	86	46.965	ENSSSCG00000015309	MTERF1	86	46.769	Sus_scrofa
ENSDARG00000086107	MTERF1	87	30.218	ENSTGUG00000011016	-	90	30.218	Taeniopygia_guttata
ENSDARG00000086107	MTERF1	89	59.202	ENSTRUG00000013118	MTERF1	81	57.726	Takifugu_rubripes
ENSDARG00000086107	MTERF1	99	44.533	ENSTBEG00000005760	MTERF1	95	44.533	Tupaia_belangeri
ENSDARG00000086107	MTERF1	86	46.349	ENSTTRG00000010321	MTERF1	94	43.733	Tursiops_truncatus
ENSDARG00000086107	MTERF1	87	48.113	ENSUAMG00000022225	MTERF1	87	47.399	Ursus_americanus
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ENSDARG00000086107	MTERF1	89	46.462	ENSXETG00000027398	mterf1	86	46.462	Xenopus_tropicalis