EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: ENSDARG00000092644 (Gene tree)
Gene ID: 570775
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: argonaute RISC catalytic component 1
Gene Type: protein_coding
Species: Danio_rerio
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 67522 bases
Position: chr16:51084472-51151993
Accession: ZDB-GENE-110606-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSDARP00000129194	PAZ	PF02170.22	1.1e-28	1	1
ENSDARP00000129194	Piwi	PF02171.17	2.5e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSDART00000156255	-	3026	XM_005158472	ENSDARP00000129194	858 (aa)	XP_005158529	X1WG39

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSDARG00000092644	ago1	99	82.442	ENSDARG00000100854	ago4	99	82.442
ENSDARG00000092644	ago1	100	83.276	ENSDARG00000063079	ago3b	100	83.276
ENSDARG00000092644	ago1	99	81.564	ENSDARG00000061268	ago2	98	81.564
ENSDARG00000092644	ago1	100	82.838	ENSDARG00000059888	ago3a	100	82.838

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSG00000092847	AGO1	100	97.315	Homo_sapiens
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSAPOG00000024299	ago1	100	98.951	Acanthochromis_polyacanthus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	96.503	Ailuropoda_melanoleuca
ENSDARG00000092644	ago1	82	92.877	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.877	Amphilophus_citrinellus
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSAOCG00000017727	ago1	100	98.951	Amphiprion_ocellaris
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSAPEG00000004458	ago1	100	99.057	Amphiprion_percula
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSATEG00000008523	ago1	100	98.951	Anabas_testudineus
ENSDARG00000092644	ago1	99	90.599	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	90.599	Anas_platyrhynchos
ENSDARG00000092644	ago1	91	97.187	ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.187	Anolis_carolinensis
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.262	ENSANAG00000037711	AGO1	100	96.503	Aotus_nancymaae
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.718	ENSACLG00000000890	ago1	100	98.718	Astatotilapia_calliptera
ENSDARG00000092644	ago1	80	99.563	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.563	Astyanax_mexicanus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.503	Bos_taurus
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.812	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	96.503	Callithrix_jacchus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	96.503	Canis_familiaris
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.122	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	97.778	Canis_lupus_dingo
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.458	ENSCHIG00000011848	-	100	95.713	Capra_hircus
ENSDARG00000092644	ago1	100	75.991	ENSTSYG00000032426	-	99	78.143	Carlito_syrichta
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.812	ENSTSYG00000009767	-	100	96.503	Carlito_syrichta
ENSDARG00000092644	ago1	89	92.531	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	Cavia_aperea
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.145	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.503	Cavia_porcellus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	96.503	Cebus_capucinus
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.154	ENSCATG00000031521	AGO1	100	97.315	Cercocebus_atys
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.812	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.503	Chinchilla_lanigera
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	96.503	Chlorocebus_sabaeus
ENSDARG00000092644	ago1	85	90.698	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	90.698	Choloepus_hoffmanni
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.387	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.387	Chrysemys_picta_bellii
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSCANG00000039798	AGO1	100	96.503	Colobus_angolensis_palliatus
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.471	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	96.503	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.812	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.812	Cricetulus_griseus_crigri
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.987	ENSCSEG00000001051	ago1	100	96.987	Cynoglossus_semilaevis
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.718	ENSCVAG00000018173	ago1	100	98.718	Cyprinodon_variegatus
ENSDARG00000092644	ago1	91	97.315	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	97.315	Dasypus_novemcinctus
ENSDARG00000092644	ago1	91	96.117	ENSDORG00000008494	Ago1	100	96.455	Dipodomys_ordii
ENSDARG00000092644	ago1	83	90.127	ENSETEG00000007626	AGO1	100	89.751	Echinops_telfairi
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.812	ENSEASG00005012086	AGO1	100	96.503	Equus_asinus_asinus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSECAG00000024353	AGO1	100	96.503	Equus_caballus
ENSDARG00000092644	ago1	92	88.945	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.945	Erinaceus_europaeus
ENSDARG00000092644	ago1	91	99.361	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.361	Esox_lucius
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	96.503	Felis_catus
ENSDARG00000092644	ago1	91	90.689	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.689	Ficedula_albicollis
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.620	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.620	Fukomys_damarensis
ENSDARG00000092644	ago1	99	94.929	ENSFHEG00000017927	ago1	100	94.929	Fundulus_heteroclitus
ENSDARG00000092644	ago1	87	86.248	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.248	Gadus_morhua
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.805	ENSGALG00000002249	AGO1	100	96.387	Gallus_gallus
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSGAFG00000009775	ago1	100	98.951	Gambusia_affinis
ENSDARG00000092644	ago1	87	99.201	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.201	Gasterosteus_aculeatus
ENSDARG00000092644	ago1	91	97.187	ENSGAGG00000012893	-	100	97.187	Gopherus_agassizii
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.037	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	96.503	Gorilla_gorilla
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.718	ENSHBUG00000010459	ago1	100	98.718	Haplochromis_burtoni
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.812	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	96.503	Heterocephalus_glaber_female
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.812	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	96.503	Heterocephalus_glaber_male
ENSDARG00000092644	ago1	99	99.057	ENSHCOG00000005708	ago1	100	99.057	Hippocampus_comes
ENSDARG00000092644	ago1	100	99.068	ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.068	Ictalurus_punctatus
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.136	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	96.503	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.503	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	96.503	Jaculus_jaculus
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSKMAG00000019464	ago1	100	98.951	Kryptolebias_marmoratus
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSLBEG00000007694	ago1	100	98.951	Labrus_bergylta
ENSDARG00000092644	ago1	99	91.176	ENSLACG00000017009	AGO1	99	91.176	Latimeria_chalumnae
ENSDARG00000092644	ago1	100	94.289	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.289	Lepisosteus_oculatus
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.471	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.471	Loxodonta_africana
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	96.503	Macaca_fascicularis
ENSDARG00000092644	ago1	99	91.589	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	92.289	Macaca_mulatta
ENSDARG00000092644	ago1	100	92.657	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	97.315	Macaca_nemestrina
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	96.503	Mandrillus_leucophaeus
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSMAMG00000008381	ago1	100	98.951	Mastacembelus_armatus
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.718	ENSMZEG00005007996	ago1	100	98.718	Maylandia_zebra
ENSDARG00000092644	ago1	99	90.941	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.941	Meleagris_gallopavo
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	96.503	Mesocricetus_auratus
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.262	ENSMICG00000016147	AGO1	100	96.503	Microcebus_murinus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.805	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	96.387	Microtus_ochrogaster
ENSDARG00000092644	ago1	78	99.552	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.552	Mola_mola
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.270	ENSMODG00000023335	AGO1	100	96.270	Monodelphis_domestica
ENSDARG00000092644	ago1	99	98.939	ENSMALG00000011057	ago1	100	98.939	Monopterus_albus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	Mus_caroli
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.011	Mus_musculus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.011	Mus_pahari
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.011	Mus_spretus
ENSDARG00000092644	ago1	84	97.911	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.911	Mustela_putorius_furo
ENSDARG00000092644	ago1	61	95.220	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	95.220	Myotis_lucifugus
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.387	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	96.387	Nannospalax_galili
ENSDARG00000092644	ago1	91	99.488	ENSNBRG00000010867	ago1	100	99.488	Neolamprologus_brichardi
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.503	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.503	Nomascus_leucogenys
ENSDARG00000092644	ago1	84	88.571	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	88.571	Notamacropus_eugenii
ENSDARG00000092644	ago1	93	98.176	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.176	Ochotona_princeps
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.812	ENSODEG00000005321	AGO1	100	96.503	Octodon_degus
ENSDARG00000092644	ago1	99	98.824	ENSONIG00000016345	ago1	100	98.824	Oreochromis_niloticus
ENSDARG00000092644	ago1	100	88.618	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.618	Ornithorhynchus_anatinus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.805	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	96.387	Oryctolagus_cuniculus
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSORLG00000014965	ago1	100	98.951	Oryzias_latipes
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSORLG00020018253	ago1	100	98.951	Oryzias_latipes_hni
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSORLG00015003287	ago1	100	98.951	Oryzias_latipes_hsok
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSOMEG00000020528	ago1	100	98.951	Oryzias_melastigma
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.253	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	96.253	Otolemur_garnettii
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSOARG00000019591	AGO1	100	96.503	Ovis_aries
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.037	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	96.503	Pan_paniscus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	96.503	Panthera_pardus
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.686	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	96.270	Panthera_tigris_altaica
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.037	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	96.503	Pan_troglodytes
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSPANG00000009060	AGO1	100	96.503	Papio_anubis
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.081	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	96.081	Pelodiscus_sinensis
ENSDARG00000092644	ago1	80	98.256	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.256	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSDARG00000092644	ago1	99	96.145	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.503	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSDARG00000092644	ago1	100	96.270	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	96.270	Phascolarctos_cinereus
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSPFOG00000005867	ago1	100	98.951	Poecilia_formosa
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSPLAG00000002824	ago1	100	98.951	Poecilia_latipinna
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSPMEG00000001787	ago1	100	98.951	Poecilia_mexicana
ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	ENSPREG00000006534	ago1	100	98.951	Poecilia_reticulata
ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	96.503	Pongo_abelii
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